98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_1267 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_1267  coenzyme A transferase  100 
 
 		 285 aa  589  1e-167  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4013  glutaconate CoA-transferase  92.98 
 
 		 285 aa  551  1e-156  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0148032 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4309  3-oxoadipate:succinyl-CoA transferase, subunit A  91.93 
 
 		 285 aa  546  1e-154  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02760  putative CoA transferase, subunit A  88.89 
 
 		 283 aa  522  1e-147  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0433466 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0312  putative CoA transferase, subunit A  88.17 
 
 		 283 aa  517  1e-146  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38220  3-oxoadipate:succinyl-CoA transferase subunit A  86.27 
 
 		 289 aa  511  1e-144  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.722574  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2328  3-oxoadipate CoA-transferase  67.61 
 
 		 295 aa  404  1.0000000000000001e-112  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.504192 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12980  acyl CoA:acetate/3-ketoacid CoA transferase, alpha subunit  69.78 
 
 		 273 aa  403  1e-111  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0299  coenzyme A transferase  71.7 
 
 		 273 aa  402  1e-111  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7928  3-oxoadipate CoA-transferase  68.52 
 
 		 273 aa  398  9.999999999999999e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.386225  normal  0.327959 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2837  3-oxoadipate CoA-transferase  67.55 
 
 		 271 aa  385  1e-106  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.351609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3046  coenzyme A transferase  64.44 
 
 		 271 aa  381  1e-105  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.94721  normal  0.612276 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2285  coenzyme A transferase  68.05 
 
 		 276 aa  382  1e-105  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.275927  normal  0.260145 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1584  glutaconate CoA-transferase  67.77 
 
 		 286 aa  380  1e-104  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.803865  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5087  coenzyme A transferase  66.41 
 
 		 265 aa  367  1e-100  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.903463  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2823  coenzyme A transferase  63.51 
 
 		 285 aa  350  1e-95  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3923  3-oxoadipate CoA-transferase  51.07 
 
 		 304 aa  281  1e-74  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.99885  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4180  3-oxoadipate CoA-transferase  35.32 
 
 		 297 aa  166  5e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0811  coenzyme A transferase  36.52 
 
 		 332 aa  162  5.0000000000000005e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.255875 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2205  coenzyme A transferase  37.11 
 
 		 599 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.401277  normal  0.0481798 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1644  glutaconate CoA-transferase  32.25 
 
 		 317 aa  122  7e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0403  glutaconate CoA-transferase  30.77 
 
 		 326 aa  120  3e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.255219  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4842  coenzyme A transferase  30.71 
 
 		 305 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.130717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2751  putative acyl CoA-transferase subunit A  37.55 
 
 		 276 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000616772  normal  0.229124 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4813  coenzyme A transferase  30.71 
 
 		 305 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.168158  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2696  Glutaconate CoA-transferase  29.87 
 
 		 322 aa  113  3e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5072  coenzyme A transferase  28.57 
 
 		 329 aa  106  5e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.000990125  normal  0.375198 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2058  coenzyme A transferase  31.91 
 
 		 268 aa  105  8e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.599622  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1906  coenzyme A transferase  30.07 
 
 		 325 aa  104  1e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0723821 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2126  coenzyme A transferase  30.63 
 
 		 313 aa  101  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1888  putative coenzyme A transferase  32.67 
 
 		 276 aa  99.4  7e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.817278  normal  0.651618 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1134  coenzyme A transferase  29.05 
 
 		 299 aa  95.9  7e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.012829  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3827  coenzyme A transferase  29.56 
 
 		 290 aa  94.4  2e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2744  coenzyme A transferase  31.94 
 
 		 293 aa  94.4  2e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.933072  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2064  coenzyme A transferase  33.15 
 
 		 286 aa  93.2  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.852286  normal  0.684027 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0810  glutaconate CoA-transferase  28.23 
 
 		 325 aa  88.6  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.417423 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1472  coenzyme A transferase  30.24 
 
 		 251 aa  87.8  2e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3751  coenzyme A transferase  29.84 
 
 		 298 aa  87  4e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4619  coenzyme A transferase  28.26 
 
 		 281 aa  85.9  7e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2354  coenzyme A transferase  27.97 
 
 		 289 aa  85.1  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.20907  normal  0.0705771 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1558  coenzyme A transferase  30.63 
 
 		 296 aa  83.2  0.000000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1221  coenzyme A transferase  30.51 
 
 		 272 aa  83.6  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2154  coenzyme A transferase  27.49 
 
 		 291 aa  83.6  0.000000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1040  putative coenzyme A transferase, subunit A  29.48 
 
 		 302 aa  82.4  0.000000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000012559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1076  coenzyme A transferase  31.25 
 
 		 272 aa  80.9  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.616034 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4600  putative glutaconate CoA-transferase, subunit A  30.71 
 
 		 269 aa  80.5  0.00000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1387  coenzyme A transferase  28.42 
 
 		 320 aa  79.7  0.00000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2825  coenzyme A transferase  28.78 
 
 		 320 aa  79  0.00000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2804  coenzyme A transferase  27.62 
 
 		 280 aa  78.2  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000211937 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2561  coenzyme A transferase  26.83 
 
 		 331 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1709  coenzyme A transferase  26.62 
 
 		 321 aa  77.4  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1203  putative CoA transferase, subunit A  31.62 
 
 		 272 aa  77  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.917021 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2605  coenzyme A transferase  25.98 
 
 		 280 aa  76.6  0.0000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.315961  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1432  coenzyme A transferase  29.41 
 
 		 297 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.768493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3035  glutaconate CoA-transferase  28.26 
 
 		 321 aa  76.3  0.0000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3617  putative glutaconate CoA-transferase, subunit A  28.83 
 
 		 272 aa  75.9  0.0000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.32721  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5132  coenzyme A transferase  27.69 
 
 		 268 aa  68.9  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.914807  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2969  coenzyme A transferase  24.11 
 
 		 300 aa  68.9  0.00000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.177711  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2497  coenzyme A transferase  29.72 
 
 		 590 aa  68.2  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.501333  normal  0.32873 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1489  coenzyme A transferase  26.51 
 
 		 296 aa  67  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5069  coenzyme A transferase  29 
 
 		 295 aa  67  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.539559 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4770  coenzyme A transferase  27.72 
 
 		 295 aa  66.2  0.0000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0352343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4684  coenzyme A transferase  27.72 
 
 		 295 aa  66.2  0.0000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.537215  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13584  CoA-transferase subunit alpha  28.17 
 
 		 292 aa  65.9  0.0000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.972  normal  0.101355 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1380  coenzyme A transferase  27.59 
 
 		 261 aa  65.9  0.0000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.161573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2072  coenzyme A transferase  28.84 
 
 		 294 aa  63.5  0.000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5267  coenzyme A transferase  26.76 
 
 		 295 aa  63.2  0.000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.174288 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3982  coenzyme A transferase  25.9 
 
 		 297 aa  62.8  0.000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2658  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  27.88 
 
 		 272 aa  61.2  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2608  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  26.11 
 
 		 235 aa  60.1  0.00000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.357891 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3297  coenzyme A transferase  32.54 
 
 		 293 aa  59.7  0.00000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0965913 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3127  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  27.35 
 
 		 270 aa  55.8  0.0000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.400116  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3262  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  28.64 
 
 		 267 aa  55.5  0.0000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.569935  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1430  coenzyme A transferase  28.57 
 
 		 237 aa  52.8  0.000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.920311  normal  0.272732 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1594  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  28.08 
 
 		 237 aa  52.4  0.000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0491  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  29.07 
 
 		 246 aa  50.8  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1762  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  27.18 
 
 		 235 aa  48.9  0.00009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.14249  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1961  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  27.18 
 
 		 235 aa  48.9  0.00009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5436  3-oxoadipate CoA-transferase subunit A  26.77 
 
 		 235 aa  48.9  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18930  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  27.27 
 
 		 237 aa  47.4  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0745996  normal  0.773659 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1014  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  25.37 
 
 		 233 aa  47.4  0.0003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.233795  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2608  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase alpha subunit  26.5 
 
 		 302 aa  45.8  0.0007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2635  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  26.74 
 
 		 239 aa  45.8  0.0008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1983  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  27.01 
 
 		 233 aa  44.3  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1653  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  27.01 
 
 		 233 aa  44.3  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0697123  normal  0.0258223 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1456  3-oxoacid CoA-transferase  27.27 
 
 		 235 aa  45.1  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0699745  normal  0.879206 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0825  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  25 
 
 		 233 aa  44.3  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2340  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  26.37 
 
 		 234 aa  44.7  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1570  fesuccinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase subunit A protein  26.96 
 
 		 232 aa  43.9  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2873  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  27.71 
 
 		 231 aa  43.9  0.003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1036  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  28.87 
 
 		 233 aa  43.9  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.138374  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1269  coenzyme A transferase  26.47 
 
 		 233 aa  43.5  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.703297  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1573  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  27.18 
 
 		 215 aa  43.1  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.503951 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3550  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  27.27 
 
 		 231 aa  43.1  0.006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.520535  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1009  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  23.83 
 
 		 231 aa  42.7  0.007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.996272  normal  0.822208 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1905  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  25.86 
 
 		 235 aa  42.7  0.007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.506281 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1383  acetate CoA-transferase  35.37 
 
 		 217 aa  42.7  0.008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4266  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  25.64 
 
 		 235 aa  42  0.01  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.367586  normal  0.498 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>