291 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_4684 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008705  Mkms_4770  coenzyme A transferase  100 
 
 
295 aa  608  1e-173  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0352343  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4684  coenzyme A transferase  100 
 
 
295 aa  608  1e-173  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.537215  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5069  coenzyme A transferase  99.32 
 
 
295 aa  604  9.999999999999999e-173  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.539559 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1489  coenzyme A transferase  90.14 
 
 
296 aa  560  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5267  coenzyme A transferase  89.49 
 
 
295 aa  561  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.174288 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13584  CoA-transferase subunit alpha  78.82 
 
 
292 aa  481  1e-135  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.972  normal  0.101355 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3982  coenzyme A transferase  64.26 
 
 
297 aa  389  1e-107  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3827  coenzyme A transferase  60.34 
 
 
290 aa  352  4e-96  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2744  coenzyme A transferase  59.73 
 
 
293 aa  335  7e-91  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.933072  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2605  coenzyme A transferase  58.8 
 
 
280 aa  330  2e-89  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.315961  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2804  coenzyme A transferase  58.1 
 
 
280 aa  327  1.0000000000000001e-88  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000211937 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2354  coenzyme A transferase  57.82 
 
 
289 aa  322  5e-87  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.20907  normal  0.0705771 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2064  coenzyme A transferase  56.9 
 
 
286 aa  322  7e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.852286  normal  0.684027 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4619  coenzyme A transferase  54.32 
 
 
281 aa  308  8e-83  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1380  coenzyme A transferase  58.59 
 
 
261 aa  294  1e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.161573  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2072  coenzyme A transferase  48.24 
 
 
294 aa  254  8e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3751  coenzyme A transferase  48.2 
 
 
298 aa  248  8e-65  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1558  coenzyme A transferase  46.98 
 
 
296 aa  236  3e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3297  coenzyme A transferase  48.21 
 
 
293 aa  235  6e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0965913 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1432  coenzyme A transferase  45.96 
 
 
297 aa  231  1e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.768493  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2154  coenzyme A transferase  43.46 
 
 
291 aa  228  9e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4813  coenzyme A transferase  35.62 
 
 
305 aa  139  4.999999999999999e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.168158  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4842  coenzyme A transferase  33.92 
 
 
305 aa  133  3e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.130717  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5072  coenzyme A transferase  35.22 
 
 
329 aa  119  6e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.000990125  normal  0.375198 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2751  putative acyl CoA-transferase subunit A  33.72 
 
 
276 aa  100  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000616772  normal  0.229124 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2058  coenzyme A transferase  29.1 
 
 
268 aa  100  4e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.599622  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1040  putative coenzyme A transferase, subunit A  29.76 
 
 
302 aa  99  8e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000012559  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1888  putative coenzyme A transferase  28.86 
 
 
276 aa  98.2  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.817278  normal  0.651618 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1644  glutaconate CoA-transferase  29.87 
 
 
317 aa  97.1  3e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2205  coenzyme A transferase  29.23 
 
 
599 aa  94  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.401277  normal  0.0481798 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2969  coenzyme A transferase  26.74 
 
 
300 aa  88.6  1e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.177711  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1472  coenzyme A transferase  30.5 
 
 
251 aa  87  3e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2126  coenzyme A transferase  30.31 
 
 
313 aa  84.7  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4180  3-oxoadipate CoA-transferase  29.86 
 
 
297 aa  84  0.000000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3923  3-oxoadipate CoA-transferase  29.05 
 
 
304 aa  79.7  0.00000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.99885  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0811  coenzyme A transferase  24.66 
 
 
332 aa  77.8  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.255875 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3848  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  29.84 
 
 
233 aa  74.3  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0810  glutaconate CoA-transferase  25 
 
 
325 aa  72.8  0.000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.417423 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02760  putative CoA transferase, subunit A  28.62 
 
 
283 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0433466 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0888  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  27.66 
 
 
233 aa  70.9  0.00000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5092  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  28.4 
 
 
235 aa  69.7  0.00000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0403  glutaconate CoA-transferase  22.97 
 
 
326 aa  69.3  0.00000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.255219  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2497  coenzyme A transferase  30.86 
 
 
590 aa  68.9  0.00000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.501333  normal  0.32873 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38220  3-oxoadipate:succinyl-CoA transferase subunit A  27.39 
 
 
289 aa  68.2  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.722574  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1406  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  28.29 
 
 
255 aa  68.6  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000850531 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6120  3-oxoadipate CoA-transferase subunit A  28.29 
 
 
235 aa  67.8  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.756785  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4457  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  27.43 
 
 
233 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.33812 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4312  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  26.97 
 
 
235 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.457397  normal  0.761681 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0312  putative CoA transferase, subunit A  27.33 
 
 
283 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3720  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  29.44 
 
 
235 aa  67.4  0.0000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4594  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  28.94 
 
 
228 aa  67  0.0000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2837  3-oxoadipate CoA-transferase  29.92 
 
 
271 aa  67  0.0000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.351609  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3086  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  29.24 
 
 
221 aa  66.6  0.0000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4013  glutaconate CoA-transferase  26.89 
 
 
285 aa  66.6  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0148032 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1267  coenzyme A transferase  27.72 
 
 
285 aa  66.2  0.0000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1113  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  28.63 
 
 
231 aa  66.6  0.0000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1134  coenzyme A transferase  25.93 
 
 
299 aa  66.6  0.0000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.012829  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4309  3-oxoadipate:succinyl-CoA transferase, subunit A  26.89 
 
 
285 aa  66.2  0.0000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3037  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  27.92 
 
 
228 aa  65.9  0.0000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.625654  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2127  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  28.07 
 
 
221 aa  65.1  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0046  3-oxoadipate CoA-transferase, alpha subunit  26.81 
 
 
237 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0643  3-oxoadipate CoA-transferase subunit A (pcaI)  27.71 
 
 
233 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.371061  normal  0.0641252 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4338  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  26.75 
 
 
225 aa  65.5  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.513534 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4285  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  28.39 
 
 
250 aa  64.3  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.191358 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5087  coenzyme A transferase  33.75 
 
 
265 aa  64.3  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.903463  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0299  coenzyme A transferase  27.2 
 
 
273 aa  64.7  0.000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2696  Glutaconate CoA-transferase  23.13 
 
 
322 aa  64.7  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5132  coenzyme A transferase  26.64 
 
 
268 aa  63.9  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.914807  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0046  3-oxoadipate CoA-transferase, alpha subunit  27.16 
 
 
237 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2285  coenzyme A transferase  31.52 
 
 
276 aa  63.9  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.275927  normal  0.260145 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1552  3-oxoadipate CoA-transferase subunit A  27.16 
 
 
237 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1906  coenzyme A transferase  22.26 
 
 
325 aa  63.9  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0723821 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4893  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  27.54 
 
 
254 aa  63.9  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0054  3-oxoadipate CoA-transferase, A subunit  27.27 
 
 
282 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.876381  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1584  glutaconate CoA-transferase  27.76 
 
 
286 aa  63.9  0.000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.803865  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1483  3-oxoadipate CoA-transferase, alpha subunit  27.27 
 
 
282 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0056  3-oxoadipate CoA-transferase, alpha subunit  27.27 
 
 
282 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.16571  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1200  3-oxoadipate CoA-transferase, alpha subunit  27.27 
 
 
282 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.407177  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4600  putative glutaconate CoA-transferase, subunit A  28.23 
 
 
269 aa  63.9  0.000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1262  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  26.52 
 
 
230 aa  63.5  0.000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12980  acyl CoA:acetate/3-ketoacid CoA transferase, alpha subunit  29.94 
 
 
273 aa  63.5  0.000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0067  3-oxoadipate CoA-transferase, A subunit  26.84 
 
 
282 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.200296  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4072  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  27.97 
 
 
219 aa  63.2  0.000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7928  3-oxoadipate CoA-transferase  28.67 
 
 
273 aa  62.8  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.386225  normal  0.327959 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1014  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  28.32 
 
 
219 aa  62.8  0.000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0138899  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2597  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  26.97 
 
 
230 aa  62.4  0.000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.260319 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0526  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  26.43 
 
 
232 aa  62.4  0.000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2608  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase alpha subunit  26.58 
 
 
302 aa  62.4  0.000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3550  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  28.03 
 
 
231 aa  62  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.520535  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0600  3-oxoadipate CoA-transferase, alpha subunit  29.44 
 
 
235 aa  62  0.00000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2873  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  28.03 
 
 
231 aa  62.4  0.00000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0649  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  26.5 
 
 
238 aa  62  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07030  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  25.96 
 
 
255 aa  62  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.228018 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3046  coenzyme A transferase  25.41 
 
 
271 aa  62  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.94721  normal  0.612276 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3951  3-oxoadipate CoA-transferase, subunit A  26.72 
 
 
231 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.383973 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7914  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  28.78 
 
 
240 aa  61.2  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1746  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  25.99 
 
 
232 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1680  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  25.99 
 
 
232 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.514841  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3667  3-oxoacid CoA-transferase subunit A  27.19 
 
 
221 aa  61.2  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1388  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  27.04 
 
 
274 aa  60.8  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>