171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B1888 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007952  Bxe_B1888  putative coenzyme A transferase  100 
 
 
276 aa  568  1e-161  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.817278  normal  0.651618 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4813  coenzyme A transferase  37.41 
 
 
305 aa  170  3e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.168158  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2058  coenzyme A transferase  33.07 
 
 
268 aa  161  9e-39  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.599622  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4842  coenzyme A transferase  37.05 
 
 
305 aa  160  2e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.130717  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1472  coenzyme A transferase  35.34 
 
 
251 aa  157  2e-37  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5072  coenzyme A transferase  33.88 
 
 
329 aa  153  2.9999999999999998e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.000990125  normal  0.375198 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1644  glutaconate CoA-transferase  32.45 
 
 
317 aa  142  6e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1558  coenzyme A transferase  35.6 
 
 
296 aa  129  4.0000000000000003e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1432  coenzyme A transferase  35.2 
 
 
297 aa  127  3e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.768493  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2751  putative acyl CoA-transferase subunit A  33.2 
 
 
276 aa  124  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000616772  normal  0.229124 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3751  coenzyme A transferase  32.26 
 
 
298 aa  122  7e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2969  coenzyme A transferase  30.31 
 
 
300 aa  120  3e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.177711  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1040  putative coenzyme A transferase, subunit A  32.03 
 
 
302 aa  116  3e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000012559  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2154  coenzyme A transferase  30.68 
 
 
291 aa  116  3.9999999999999997e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2126  coenzyme A transferase  33.86 
 
 
313 aa  114  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3297  coenzyme A transferase  32.55 
 
 
293 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0965913 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1380  coenzyme A transferase  30.28 
 
 
261 aa  113  4.0000000000000004e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.161573  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4600  putative glutaconate CoA-transferase, subunit A  33.47 
 
 
269 aa  112  6e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0299  coenzyme A transferase  34.05 
 
 
273 aa  112  7.000000000000001e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2561  coenzyme A transferase  33.86 
 
 
331 aa  112  9e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2328  3-oxoadipate CoA-transferase  35.42 
 
 
295 aa  112  9e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.504192 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5132  coenzyme A transferase  35.29 
 
 
268 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.914807  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2205  coenzyme A transferase  32.79 
 
 
599 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.401277  normal  0.0481798 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0312  putative CoA transferase, subunit A  34.66 
 
 
283 aa  110  3e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02760  putative CoA transferase, subunit A  34.66 
 
 
283 aa  110  3e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0433466 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4619  coenzyme A transferase  31.5 
 
 
281 aa  109  5e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4309  3-oxoadipate:succinyl-CoA transferase, subunit A  33.86 
 
 
285 aa  109  6e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4013  glutaconate CoA-transferase  33.47 
 
 
285 aa  108  1e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0148032 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38220  3-oxoadipate:succinyl-CoA transferase subunit A  33.47 
 
 
289 aa  107  1e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.722574  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1134  coenzyme A transferase  27.69 
 
 
299 aa  108  1e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.012829  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2072  coenzyme A transferase  29.89 
 
 
294 aa  108  1e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2837  3-oxoadipate CoA-transferase  36.8 
 
 
271 aa  107  2e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.351609  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1221  coenzyme A transferase  31.8 
 
 
272 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3046  coenzyme A transferase  34.02 
 
 
271 aa  107  2e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.94721  normal  0.612276 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0811  coenzyme A transferase  33.47 
 
 
332 aa  106  3e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.255875 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2804  coenzyme A transferase  31.82 
 
 
280 aa  105  9e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000211937 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2605  coenzyme A transferase  31.4 
 
 
280 aa  104  1e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.315961  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3923  3-oxoadipate CoA-transferase  33.86 
 
 
304 aa  103  3e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.99885  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0403  glutaconate CoA-transferase  26.25 
 
 
326 aa  103  3e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.255219  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2744  coenzyme A transferase  30.31 
 
 
293 aa  102  8e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.933072  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12980  acyl CoA:acetate/3-ketoacid CoA transferase, alpha subunit  34.69 
 
 
273 aa  101  1e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5267  coenzyme A transferase  31.3 
 
 
295 aa  100  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.174288 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1489  coenzyme A transferase  31.3 
 
 
296 aa  101  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2285  coenzyme A transferase  32.49 
 
 
276 aa  100  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.275927  normal  0.260145 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2354  coenzyme A transferase  31 
 
 
289 aa  100  4e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.20907  normal  0.0705771 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2064  coenzyme A transferase  28.8 
 
 
286 aa  99.4  5e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.852286  normal  0.684027 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1267  coenzyme A transferase  32.67 
 
 
285 aa  99.4  6e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1584  glutaconate CoA-transferase  34.66 
 
 
286 aa  99.4  6e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.803865  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5087  coenzyme A transferase  34.05 
 
 
265 aa  99  7e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.903463  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5069  coenzyme A transferase  28.86 
 
 
295 aa  98.6  1e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.539559 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4684  coenzyme A transferase  28.86 
 
 
295 aa  97.8  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.537215  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0810  glutaconate CoA-transferase  28.62 
 
 
325 aa  97.4  2e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.417423 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4770  coenzyme A transferase  28.86 
 
 
295 aa  97.8  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0352343  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3617  putative glutaconate CoA-transferase, subunit A  32.79 
 
 
272 aa  97.4  2e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.32721  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1076  coenzyme A transferase  31.02 
 
 
272 aa  97.1  3e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.616034 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2497  coenzyme A transferase  31.05 
 
 
590 aa  97.1  3e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.501333  normal  0.32873 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2696  Glutaconate CoA-transferase  26.69 
 
 
322 aa  96.3  5e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7928  3-oxoadipate CoA-transferase  32.77 
 
 
273 aa  95.9  6e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.386225  normal  0.327959 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4180  3-oxoadipate CoA-transferase  34.03 
 
 
297 aa  95.5  8e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3827  coenzyme A transferase  29.39 
 
 
290 aa  90.9  2e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1203  putative CoA transferase, subunit A  30.15 
 
 
272 aa  90.5  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.917021 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2823  coenzyme A transferase  30.47 
 
 
285 aa  90.1  4e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13584  CoA-transferase subunit alpha  29.37 
 
 
292 aa  87.4  2e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.972  normal  0.101355 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3982  coenzyme A transferase  28.27 
 
 
297 aa  83.6  0.000000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1709  coenzyme A transferase  27.82 
 
 
321 aa  79  0.00000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3035  glutaconate CoA-transferase  25.58 
 
 
321 aa  79  0.00000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1906  coenzyme A transferase  21.92 
 
 
325 aa  77.4  0.0000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0723821 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2825  coenzyme A transferase  26.39 
 
 
320 aa  75.1  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1387  coenzyme A transferase  26.02 
 
 
320 aa  73.6  0.000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2277  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  28.12 
 
 
218 aa  67.4  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3037  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  27.59 
 
 
228 aa  67.4  0.0000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.625654  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1472  butyryl-CoA:acetoacetate CoA-transferase alpha subunit  27.31 
 
 
220 aa  66.6  0.0000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.146026  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2254  3-oxoadipate CoA-transferase subunit A protein  30.57 
 
 
229 aa  63.5  0.000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0955089  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1573  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  30.14 
 
 
215 aa  63.5  0.000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.503951 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1383  acetate CoA-transferase  31 
 
 
217 aa  62.8  0.000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2003  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  26.58 
 
 
220 aa  62  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.881736  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4312  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  28.82 
 
 
235 aa  62  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.457397  normal  0.761681 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0643  3-oxoadipate CoA-transferase subunit A (pcaI)  28 
 
 
233 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.371061  normal  0.0641252 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2490  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  28.71 
 
 
220 aa  60.1  0.00000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000124934 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2459  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  29.09 
 
 
231 aa  60.1  0.00000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.695651  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2066  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  29.09 
 
 
231 aa  60.1  0.00000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0689657  normal  0.794727 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4356  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  28.31 
 
 
229 aa  59.3  0.00000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4457  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  28.7 
 
 
233 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.33812 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3129  3-oxoadipate CoA-transferase  29.82 
 
 
237 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5288  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  29.52 
 
 
237 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.595074  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5113  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  29.39 
 
 
238 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.885555  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4477  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  29.39 
 
 
238 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5746  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  29.39 
 
 
238 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0503398 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0046  3-oxoadipate CoA-transferase, alpha subunit  28.82 
 
 
237 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2290  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  29.82 
 
 
219 aa  57  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3273  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  26.18 
 
 
225 aa  57  0.0000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4285  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  28.46 
 
 
250 aa  57  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.191358 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3720  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  27.31 
 
 
235 aa  56.6  0.0000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3086  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  29.2 
 
 
221 aa  56.6  0.0000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1406  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  26.05 
 
 
255 aa  56.6  0.0000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000850531 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6799  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  26.2 
 
 
235 aa  55.8  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.704148  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1855  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  26.6 
 
 
217 aa  55.8  0.0000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.945952 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0046  3-oxoadipate CoA-transferase, alpha subunit  28.32 
 
 
237 aa  55.5  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1552  3-oxoadipate CoA-transferase subunit A  28.32 
 
 
237 aa  55.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2060  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  25.93 
 
 
236 aa  55.1  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>