91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_4013 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_4013  glutaconate CoA-transferase  100 
 
 		 285 aa  588  1e-167  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0148032 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4309  3-oxoadipate:succinyl-CoA transferase, subunit A  98.25 
 
 		 285 aa  580  1e-164  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1267  coenzyme A transferase  92.98 
 
 		 285 aa  551  1e-156  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02760  putative CoA transferase, subunit A  87.46 
 
 		 283 aa  519  1e-146  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0433466 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0312  putative CoA transferase, subunit A  86.74 
 
 		 283 aa  515  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38220  3-oxoadipate:succinyl-CoA transferase subunit A  86.48 
 
 		 289 aa  512  1e-144  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.722574  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2328  3-oxoadipate CoA-transferase  67.25 
 
 		 295 aa  402  1e-111  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.504192 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12980  acyl CoA:acetate/3-ketoacid CoA transferase, alpha subunit  68.91 
 
 		 273 aa  400  9.999999999999999e-111  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0299  coenzyme A transferase  70.94 
 
 		 273 aa  397  1e-109  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7928  3-oxoadipate CoA-transferase  68.68 
 
 		 273 aa  395  1e-109  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.386225  normal  0.327959 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2285  coenzyme A transferase  67.67 
 
 		 276 aa  384  1e-105  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.275927  normal  0.260145 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2837  3-oxoadipate CoA-transferase  67.17 
 
 		 271 aa  381  1e-105  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.351609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1584  glutaconate CoA-transferase  65.71 
 
 		 286 aa  379  1e-104  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.803865  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3046  coenzyme A transferase  61.85 
 
 		 271 aa  376  1e-103  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.94721  normal  0.612276 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5087  coenzyme A transferase  65.13 
 
 		 265 aa  364  1e-100  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.903463  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2823  coenzyme A transferase  63.64 
 
 		 285 aa  353  2e-96  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3923  3-oxoadipate CoA-transferase  50.71 
 
 		 304 aa  281  1e-74  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.99885  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4180  3-oxoadipate CoA-transferase  35.42 
 
 		 297 aa  166  2.9999999999999998e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0811  coenzyme A transferase  35.13 
 
 		 332 aa  153  2.9999999999999998e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.255875 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0403  glutaconate CoA-transferase  31.1 
 
 		 326 aa  123  4e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.255219  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2696  Glutaconate CoA-transferase  30.87 
 
 		 322 aa  122  6e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1644  glutaconate CoA-transferase  33.09 
 
 		 317 aa  122  9e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2205  coenzyme A transferase  36.8 
 
 		 599 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.401277  normal  0.0481798 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4842  coenzyme A transferase  31.11 
 
 		 305 aa  118  9.999999999999999e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.130717  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4813  coenzyme A transferase  31.95 
 
 		 305 aa  115  6.9999999999999995e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.168158  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2751  putative acyl CoA-transferase subunit A  37.12 
 
 		 276 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000616772  normal  0.229124 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1906  coenzyme A transferase  30.82 
 
 		 325 aa  109  5e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0723821 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1888  putative coenzyme A transferase  33.47 
 
 		 276 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.817278  normal  0.651618 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5072  coenzyme A transferase  31.17 
 
 		 329 aa  103  3e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.000990125  normal  0.375198 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2126  coenzyme A transferase  31.93 
 
 		 313 aa  102  6e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2058  coenzyme A transferase  30.33 
 
 		 268 aa  101  1e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.599622  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2064  coenzyme A transferase  30.66 
 
 		 286 aa  100  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.852286  normal  0.684027 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1134  coenzyme A transferase  30.17 
 
 		 299 aa  97.8  2e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.012829  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3827  coenzyme A transferase  30.31 
 
 		 290 aa  96.7  4e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0810  glutaconate CoA-transferase  29 
 
 		 325 aa  95.9  7e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.417423 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2354  coenzyme A transferase  29.75 
 
 		 289 aa  92  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.20907  normal  0.0705771 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2744  coenzyme A transferase  32.22 
 
 		 293 aa  90.5  3e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.933072  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4619  coenzyme A transferase  28.03 
 
 		 281 aa  90.1  4e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1472  coenzyme A transferase  30.74 
 
 		 251 aa  90.1  4e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2804  coenzyme A transferase  30.03 
 
 		 280 aa  84.7  0.000000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000211937 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3751  coenzyme A transferase  29.48 
 
 		 298 aa  85.1  0.000000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2605  coenzyme A transferase  28.67 
 
 		 280 aa  84.3  0.000000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.315961  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1387  coenzyme A transferase  29.31 
 
 		 320 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4600  putative glutaconate CoA-transferase, subunit A  32.09 
 
 		 269 aa  83.6  0.000000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2825  coenzyme A transferase  28.97 
 
 		 320 aa  84  0.000000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1221  coenzyme A transferase  30.51 
 
 		 272 aa  84  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2154  coenzyme A transferase  28.17 
 
 		 291 aa  84  0.000000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1558  coenzyme A transferase  31.02 
 
 		 296 aa  83.2  0.000000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1040  putative coenzyme A transferase, subunit A  28.41 
 
 		 302 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000012559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1709  coenzyme A transferase  26.98 
 
 		 321 aa  81.6  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3035  glutaconate CoA-transferase  28.62 
 
 		 321 aa  82  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1432  coenzyme A transferase  31 
 
 		 297 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.768493  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1203  putative CoA transferase, subunit A  31.99 
 
 		 272 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.917021 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1076  coenzyme A transferase  31.62 
 
 		 272 aa  80.1  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.616034 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3617  putative glutaconate CoA-transferase, subunit A  28.83 
 
 		 272 aa  76.6  0.0000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.32721  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2561  coenzyme A transferase  26.71 
 
 		 331 aa  76.6  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5132  coenzyme A transferase  30.17 
 
 		 268 aa  73.2  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.914807  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2497  coenzyme A transferase  29.96 
 
 		 590 aa  72.8  0.000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.501333  normal  0.32873 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2969  coenzyme A transferase  24.81 
 
 		 300 aa  72.4  0.000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.177711  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1489  coenzyme A transferase  27.54 
 
 		 296 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5267  coenzyme A transferase  28.2 
 
 		 295 aa  70.9  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.174288 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13584  CoA-transferase subunit alpha  29.97 
 
 		 292 aa  70.9  0.00000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.972  normal  0.101355 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5069  coenzyme A transferase  27.57 
 
 		 295 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.539559 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4770  coenzyme A transferase  26.89 
 
 		 295 aa  66.6  0.0000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0352343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4684  coenzyme A transferase  26.89 
 
 		 295 aa  66.6  0.0000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.537215  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1380  coenzyme A transferase  27.49 
 
 		 261 aa  66.2  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.161573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2072  coenzyme A transferase  31.17 
 
 		 294 aa  65.9  0.0000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3982  coenzyme A transferase  26.69 
 
 		 297 aa  60.8  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3297  coenzyme A transferase  31.36 
 
 		 293 aa  57  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0965913 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2658  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  28.78 
 
 		 272 aa  56.6  0.0000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2608  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  26.83 
 
 		 235 aa  55.5  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.357891 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3262  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  28.17 
 
 		 267 aa  53.9  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.569935  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3127  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  28.22 
 
 		 270 aa  51.6  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.400116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1430  coenzyme A transferase  27.64 
 
 		 237 aa  50.1  0.00004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.920311  normal  0.272732 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1594  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  27.14 
 
 		 237 aa  50.1  0.00005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0491  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  27.33 
 
 		 246 aa  47.8  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5436  3-oxoadipate CoA-transferase subunit A  26.26 
 
 		 235 aa  47.4  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18930  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  23.89 
 
 		 237 aa  47.4  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0745996  normal  0.773659 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1762  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  26.9 
 
 		 235 aa  46.6  0.0004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.14249  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1961  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  26.9 
 
 		 235 aa  46.6  0.0004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1383  acetate CoA-transferase  37.8 
 
 		 217 aa  45.4  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1573  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  27.8 
 
 		 215 aa  45.1  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.503951 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_23365  succinyl-coenzyme A:3-oxo-acid coenzyme a-transferase  27.4 
 
 		 511 aa  44.7  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2635  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  25.58 
 
 		 239 aa  44.7  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1653  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  26.44 
 
 		 233 aa  43.1  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0697123  normal  0.0258223 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1983  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  26.44 
 
 		 233 aa  43.1  0.006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1142  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  24.86 
 
 		 235 aa  43.1  0.006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.282183  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1014  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  23.88 
 
 		 233 aa  43.1  0.006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.233795  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2608  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase alpha subunit  25.5 
 
 		 302 aa  42.7  0.007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1456  3-oxoacid CoA-transferase  25.57 
 
 		 235 aa  42.4  0.009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0699745  normal  0.879206 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1570  fesuccinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase subunit A protein  26.6 
 
 		 232 aa  42.4  0.01  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>