More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3827 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_3827  coenzyme A transferase  100 
 
 		 290 aa  594  1e-169  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2605  coenzyme A transferase  67.86 
 
 		 280 aa  400  9.999999999999999e-111  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.315961  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2064  coenzyme A transferase  67.03 
 
 		 286 aa  394  1e-109  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.852286  normal  0.684027 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2804  coenzyme A transferase  66.43 
 
 		 280 aa  391  1e-108  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000211937 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2354  coenzyme A transferase  65.03 
 
 		 289 aa  394  1e-108  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.20907  normal  0.0705771 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2744  coenzyme A transferase  66.43 
 
 		 293 aa  387  1e-106  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.933072  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5267  coenzyme A transferase  61.69 
 
 		 295 aa  362  3e-99  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.174288 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1489  coenzyme A transferase  60.88 
 
 		 296 aa  357  9e-98  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4684  coenzyme A transferase  60.34 
 
 		 295 aa  352  2.9999999999999997e-96  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.537215  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4770  coenzyme A transferase  60.34 
 
 		 295 aa  352  2.9999999999999997e-96  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0352343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5069  coenzyme A transferase  60 
 
 		 295 aa  352  5e-96  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.539559 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1380  coenzyme A transferase  66.27 
 
 		 261 aa  349  3e-95  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.161573  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3982  coenzyme A transferase  60.75 
 
 		 297 aa  347  1e-94  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13584  CoA-transferase subunit alpha  59.93 
 
 		 292 aa  342  4e-93  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.972  normal  0.101355 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4619  coenzyme A transferase  58.42 
 
 		 281 aa  339  4e-92  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2072  coenzyme A transferase  57.04 
 
 		 294 aa  315  4e-85  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3751  coenzyme A transferase  57.51 
 
 		 298 aa  310  1e-83  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1558  coenzyme A transferase  53.43 
 
 		 296 aa  297  1e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1432  coenzyme A transferase  52.98 
 
 		 297 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.768493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3297  coenzyme A transferase  52.54 
 
 		 293 aa  274  1.0000000000000001e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0965913 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2154  coenzyme A transferase  48.74 
 
 		 291 aa  266  2e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4813  coenzyme A transferase  35.29 
 
 		 305 aa  138  1e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.168158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4842  coenzyme A transferase  34.32 
 
 		 305 aa  136  4e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.130717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5072  coenzyme A transferase  36.63 
 
 		 329 aa  134  1.9999999999999998e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.000990125  normal  0.375198 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2205  coenzyme A transferase  34.15 
 
 		 599 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.401277  normal  0.0481798 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2058  coenzyme A transferase  31.68 
 
 		 268 aa  113  3e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.599622  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2751  putative acyl CoA-transferase subunit A  32.68 
 
 		 276 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000616772  normal  0.229124 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1644  glutaconate CoA-transferase  33.59 
 
 		 317 aa  104  2e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1472  coenzyme A transferase  31.43 
 
 		 251 aa  98.6  1e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38220  3-oxoadipate:succinyl-CoA transferase subunit A  31.1 
 
 		 289 aa  98.2  1e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.722574  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2969  coenzyme A transferase  27.68 
 
 		 300 aa  98.6  1e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.177711  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0312  putative CoA transferase, subunit A  31.14 
 
 		 283 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4013  glutaconate CoA-transferase  30.31 
 
 		 285 aa  96.7  4e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0148032 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02760  putative CoA transferase, subunit A  30.04 
 
 		 283 aa  95.5  9e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0433466 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1267  coenzyme A transferase  29.56 
 
 		 285 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4309  3-oxoadipate:succinyl-CoA transferase, subunit A  29.69 
 
 		 285 aa  93.6  4e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1888  putative coenzyme A transferase  29.39 
 
 		 276 aa  90.9  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.817278  normal  0.651618 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2837  3-oxoadipate CoA-transferase  31.18 
 
 		 271 aa  90.9  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.351609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1040  putative coenzyme A transferase, subunit A  28.85 
 
 		 302 aa  90.5  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000012559  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3923  3-oxoadipate CoA-transferase  29.96 
 
 		 304 aa  88.6  1e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.99885  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0811  coenzyme A transferase  28.21 
 
 		 332 aa  88.2  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.255875 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2126  coenzyme A transferase  32.71 
 
 		 313 aa  87.8  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2497  coenzyme A transferase  29.53 
 
 		 590 aa  87.4  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.501333  normal  0.32873 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12980  acyl CoA:acetate/3-ketoacid CoA transferase, alpha subunit  30.94 
 
 		 273 aa  87  3e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2285  coenzyme A transferase  31.7 
 
 		 276 aa  86.3  6e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.275927  normal  0.260145 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1221  coenzyme A transferase  27.99 
 
 		 272 aa  83.6  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1134  coenzyme A transferase  28.84 
 
 		 299 aa  82.8  0.000000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.012829  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1076  coenzyme A transferase  27.84 
 
 		 272 aa  81.6  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.616034 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4180  3-oxoadipate CoA-transferase  26.28 
 
 		 297 aa  81.3  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2328  3-oxoadipate CoA-transferase  29.69 
 
 		 295 aa  79.3  0.00000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.504192 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7928  3-oxoadipate CoA-transferase  28.68 
 
 		 273 aa  78.6  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.386225  normal  0.327959 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1906  coenzyme A transferase  23.26 
 
 		 325 aa  77.4  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0723821 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4600  putative glutaconate CoA-transferase, subunit A  27.88 
 
 		 269 aa  77  0.0000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5087  coenzyme A transferase  30.59 
 
 		 265 aa  76.6  0.0000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.903463  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0403  glutaconate CoA-transferase  24.48 
 
 		 326 aa  75.5  0.0000000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.255219  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0491  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  30.77 
 
 		 246 aa  74.7  0.000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1203  putative CoA transferase, subunit A  26.22 
 
 		 272 aa  74.3  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.917021 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1584  glutaconate CoA-transferase  28.47 
 
 		 286 aa  74.7  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.803865  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1113  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  33.71 
 
 		 231 aa  73.6  0.000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0299  coenzyme A transferase  26.37 
 
 		 273 aa  72.8  0.000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18930  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  31.46 
 
 		 237 aa  72.4  0.000000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0745996  normal  0.773659 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2823  coenzyme A transferase  26.81 
 
 		 285 aa  72  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3617  putative glutaconate CoA-transferase, subunit A  27.5 
 
 		 272 aa  71.2  0.00000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.32721  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0649  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  29.23 
 
 		 238 aa  70.1  0.00000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2658  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  29.15 
 
 		 272 aa  69.3  0.00000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1430  coenzyme A transferase  30.23 
 
 		 237 aa  69.3  0.00000000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.920311  normal  0.272732 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2696  Glutaconate CoA-transferase  22.92 
 
 		 322 aa  68.9  0.00000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3848  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  28.64 
 
 		 233 aa  68.2  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3046  coenzyme A transferase  23.02 
 
 		 271 aa  67.8  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.94721  normal  0.612276 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2127  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  30.73 
 
 		 221 aa  67.4  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5132  coenzyme A transferase  27.35 
 
 		 268 aa  67.4  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.914807  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1594  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  30.23 
 
 		 237 aa  67.4  0.0000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0810  glutaconate CoA-transferase  22.92 
 
 		 325 aa  67  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.417423 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1984  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  29.74 
 
 		 233 aa  66.6  0.0000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00015466 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3127  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  29.38 
 
 		 270 aa  66.2  0.0000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.400116  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02148  acetyl-CoA:acetoacetyl-CoA transferase, alpha subunit  27.27 
 
 		 220 aa  65.1  0.000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.35571  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1437  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  27.27 
 
 		 220 aa  65.1  0.000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.364395  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02107  hypothetical protein  27.27 
 
 		 220 aa  65.1  0.000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.408134  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1570  fesuccinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase subunit A protein  29.15 
 
 		 232 aa  65.1  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6364  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  28.21 
 
 		 245 aa  65.5  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0311035  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1429  acetyl-CoA:acetoacetyl-CoA transferase subunit alpha  27.27 
 
 		 220 aa  65.1  0.000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00124064 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2608  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  26.63 
 
 		 235 aa  65.1  0.000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.357891 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1014  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  32.84 
 
 		 219 aa  65.1  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0138899  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3145  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  29.23 
 
 		 245 aa  64.3  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.367443  normal  0.262067 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1306  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  28.27 
 
 		 453 aa  64.3  0.000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2919  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  29.23 
 
 		 245 aa  64.3  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.522453 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3043  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  29.23 
 
 		 255 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2362  acetyl-CoA:acetoacetyl-CoA transferase subunit alpha  27.27 
 
 		 220 aa  63.9  0.000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5856  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  28.21 
 
 		 245 aa  63.9  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.857787  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3262  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  29.38 
 
 		 267 aa  63.9  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.569935  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4312  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  28.82 
 
 		 235 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.457397  normal  0.761681 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3086  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  32.09 
 
 		 221 aa  63.9  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0825  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  28.64 
 
 		 233 aa  64.3  0.000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2370  acetyl-CoA:acetoacetyl-CoA transferase subunit alpha  26.79 
 
 		 220 aa  63.5  0.000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0895417  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0637  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  27.27 
 
 		 216 aa  63.5  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2060  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  30.05 
 
 		 236 aa  63.2  0.000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3273  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  27.55 
 
 		 225 aa  63.2  0.000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4338  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  29.11 
 
 		 225 aa  62.8  0.000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.513534 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1269  coenzyme A transferase  27.03 
 
 		 233 aa  62.8  0.000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.703297  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4594  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  27.86 
 
 		 228 aa  62.4  0.000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>