69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_3617 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_3617  putative glutaconate CoA-transferase, subunit A  100 
 
 
272 aa  540  9.999999999999999e-153  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.32721  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5132  coenzyme A transferase  67.05 
 
 
268 aa  367  1e-101  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.914807  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4600  putative glutaconate CoA-transferase, subunit A  70.87 
 
 
269 aa  359  3e-98  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1221  coenzyme A transferase  58.56 
 
 
272 aa  304  1.0000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1076  coenzyme A transferase  60.08 
 
 
272 aa  291  9e-78  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.616034 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1203  putative CoA transferase, subunit A  59.32 
 
 
272 aa  268  5e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.917021 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4842  coenzyme A transferase  35.32 
 
 
305 aa  119  3.9999999999999996e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.130717  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4813  coenzyme A transferase  35.06 
 
 
305 aa  113  3e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.168158  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2058  coenzyme A transferase  33.48 
 
 
268 aa  107  3e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.599622  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1472  coenzyme A transferase  32.34 
 
 
251 aa  101  2e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2751  putative acyl CoA-transferase subunit A  35.93 
 
 
276 aa  99.8  4e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000616772  normal  0.229124 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2605  coenzyme A transferase  32.63 
 
 
280 aa  99  8e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.315961  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1888  putative coenzyme A transferase  32.79 
 
 
276 aa  97.4  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.817278  normal  0.651618 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2328  3-oxoadipate CoA-transferase  32.69 
 
 
295 aa  95.1  9e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.504192 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2126  coenzyme A transferase  32.07 
 
 
313 aa  91.7  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3046  coenzyme A transferase  29.96 
 
 
271 aa  91.7  1e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.94721  normal  0.612276 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2696  Glutaconate CoA-transferase  31.76 
 
 
322 aa  90.9  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2804  coenzyme A transferase  32.24 
 
 
280 aa  90.1  3e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000211937 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4180  3-oxoadipate CoA-transferase  28.63 
 
 
297 aa  89.7  4e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5072  coenzyme A transferase  31.93 
 
 
329 aa  88.6  9e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.000990125  normal  0.375198 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2154  coenzyme A transferase  30.71 
 
 
291 aa  87.4  2e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0299  coenzyme A transferase  28.47 
 
 
273 aa  86.3  5e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0312  putative CoA transferase, subunit A  30.66 
 
 
283 aa  85.9  6e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12980  acyl CoA:acetate/3-ketoacid CoA transferase, alpha subunit  31 
 
 
273 aa  85.9  6e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3923  3-oxoadipate CoA-transferase  29.63 
 
 
304 aa  85.5  9e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.99885  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2969  coenzyme A transferase  30.87 
 
 
300 aa  85.1  0.000000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.177711  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2285  coenzyme A transferase  31.34 
 
 
276 aa  85.1  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.275927  normal  0.260145 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7928  3-oxoadipate CoA-transferase  30.04 
 
 
273 aa  84  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.386225  normal  0.327959 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02760  putative CoA transferase, subunit A  29.93 
 
 
283 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0433466 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1432  coenzyme A transferase  31.82 
 
 
297 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.768493  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2744  coenzyme A transferase  33 
 
 
293 aa  83.2  0.000000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.933072  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1558  coenzyme A transferase  30.93 
 
 
296 aa  82.4  0.000000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3751  coenzyme A transferase  29.82 
 
 
298 aa  81.3  0.00000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38220  3-oxoadipate:succinyl-CoA transferase subunit A  30.3 
 
 
289 aa  81.3  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.722574  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2072  coenzyme A transferase  31.32 
 
 
294 aa  80.1  0.00000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0811  coenzyme A transferase  30.26 
 
 
332 aa  79.7  0.00000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.255875 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2837  3-oxoadipate CoA-transferase  31.8 
 
 
271 aa  77.8  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.351609  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5087  coenzyme A transferase  33.19 
 
 
265 aa  77.4  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.903463  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1644  glutaconate CoA-transferase  28.28 
 
 
317 aa  77.4  0.0000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4013  glutaconate CoA-transferase  28.83 
 
 
285 aa  76.6  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0148032 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1267  coenzyme A transferase  28.83 
 
 
285 aa  75.9  0.0000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1584  glutaconate CoA-transferase  30.88 
 
 
286 aa  75.9  0.0000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.803865  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2205  coenzyme A transferase  29 
 
 
599 aa  75.1  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.401277  normal  0.0481798 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4309  3-oxoadipate:succinyl-CoA transferase, subunit A  28.47 
 
 
285 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1380  coenzyme A transferase  30.09 
 
 
261 aa  74.7  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.161573  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3297  coenzyme A transferase  30.13 
 
 
293 aa  73.9  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0965913 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2354  coenzyme A transferase  30.34 
 
 
289 aa  73.6  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.20907  normal  0.0705771 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1040  putative coenzyme A transferase, subunit A  30.13 
 
 
302 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000012559  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3827  coenzyme A transferase  27.5 
 
 
290 aa  71.2  0.00000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1906  coenzyme A transferase  26.85 
 
 
325 aa  68.2  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0723821 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4619  coenzyme A transferase  27.43 
 
 
281 aa  67.8  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2823  coenzyme A transferase  28.76 
 
 
285 aa  67.8  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2064  coenzyme A transferase  27.35 
 
 
286 aa  67.8  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.852286  normal  0.684027 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0810  glutaconate CoA-transferase  29.41 
 
 
325 aa  67  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.417423 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1709  coenzyme A transferase  28.85 
 
 
321 aa  64.3  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13584  CoA-transferase subunit alpha  28.51 
 
 
292 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.972  normal  0.101355 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3982  coenzyme A transferase  27.8 
 
 
297 aa  64.7  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0403  glutaconate CoA-transferase  26.19 
 
 
326 aa  62  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.255219  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2497  coenzyme A transferase  33.16 
 
 
590 aa  60.8  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.501333  normal  0.32873 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5069  coenzyme A transferase  26.12 
 
 
295 aa  60.5  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.539559 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1489  coenzyme A transferase  27.05 
 
 
296 aa  60.1  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4684  coenzyme A transferase  26.02 
 
 
295 aa  58.9  0.00000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.537215  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4770  coenzyme A transferase  26.02 
 
 
295 aa  58.9  0.00000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0352343  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5267  coenzyme A transferase  26.64 
 
 
295 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.174288 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3035  glutaconate CoA-transferase  26.76 
 
 
321 aa  53.9  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2825  coenzyme A transferase  28.17 
 
 
320 aa  52.4  0.000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1387  coenzyme A transferase  27.78 
 
 
320 aa  51.6  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2561  coenzyme A transferase  25.32 
 
 
331 aa  51.6  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1134  coenzyme A transferase  27.66 
 
 
299 aa  44.7  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.012829  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>