180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2205 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_2205  coenzyme A transferase  100 
 
 		 599 aa  1241    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.401277  normal  0.0481798 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2497  coenzyme A transferase  29.42 
 
 		 590 aa  172  1e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.501333  normal  0.32873 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1644  glutaconate CoA-transferase  35.63 
 
 		 317 aa  149  1.0000000000000001e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5072  coenzyme A transferase  35.62 
 
 		 329 aa  144  4e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.000990125  normal  0.375198 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1040  putative coenzyme A transferase, subunit A  36.05 
 
 		 302 aa  142  3e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000012559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4813  coenzyme A transferase  36.4 
 
 		 305 aa  140  8.999999999999999e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.168158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4842  coenzyme A transferase  32.52 
 
 		 305 aa  138  3.0000000000000003e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.130717  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2058  coenzyme A transferase  34.29 
 
 		 268 aa  132  2.0000000000000002e-29  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.599622  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2804  coenzyme A transferase  36.36 
 
 		 280 aa  132  2.0000000000000002e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000211937 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2969  coenzyme A transferase  31.06 
 
 		 300 aa  130  6e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.177711  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2154  coenzyme A transferase  32.66 
 
 		 291 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2605  coenzyme A transferase  32.49 
 
 		 280 aa  129  2.0000000000000002e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.315961  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1267  coenzyme A transferase  37.11 
 
 		 285 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1472  coenzyme A transferase  40.21 
 
 		 251 aa  127  8.000000000000001e-28  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4619  coenzyme A transferase  33.22 
 
 		 281 aa  125  3e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4309  3-oxoadipate:succinyl-CoA transferase, subunit A  37.23 
 
 		 285 aa  123  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2328  3-oxoadipate CoA-transferase  35.93 
 
 		 295 aa  123  9.999999999999999e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.504192 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1432  coenzyme A transferase  32.88 
 
 		 297 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.768493  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2837  3-oxoadipate CoA-transferase  37.67 
 
 		 271 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.351609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3751  coenzyme A transferase  33.56 
 
 		 298 aa  122  1.9999999999999998e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4013  glutaconate CoA-transferase  36.8 
 
 		 285 aa  121  3e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0148032 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2752  putative acyl CoA-acetate/3-ketoacid CoA transferase beta subunit, AtoA-like  33.1 
 
 		 312 aa  121  3e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00379387  normal  0.241661 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02760  putative CoA transferase, subunit A  36.44 
 
 		 283 aa  121  3e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0433466 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0312  putative CoA transferase, subunit A  36.03 
 
 		 283 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3827  coenzyme A transferase  34.15 
 
 		 290 aa  120  4.9999999999999996e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38220  3-oxoadipate:succinyl-CoA transferase subunit A  35.22 
 
 		 289 aa  120  7e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.722574  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0811  coenzyme A transferase  32.2 
 
 		 332 aa  120  7.999999999999999e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.255875 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1558  coenzyme A transferase  34.26 
 
 		 296 aa  119  9.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2285  coenzyme A transferase  36.11 
 
 		 276 aa  119  9.999999999999999e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.275927  normal  0.260145 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2751  putative acyl CoA-transferase subunit A  33.9 
 
 		 276 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000616772  normal  0.229124 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3923  3-oxoadipate CoA-transferase  35.45 
 
 		 304 aa  115  2.0000000000000002e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.99885  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3046  coenzyme A transferase  34.58 
 
 		 271 aa  115  2.0000000000000002e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.94721  normal  0.612276 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7928  3-oxoadipate CoA-transferase  34.88 
 
 		 273 aa  114  4.0000000000000004e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.386225  normal  0.327959 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2696  Glutaconate CoA-transferase  29.41 
 
 		 322 aa  113  1.0000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2072  coenzyme A transferase  32.06 
 
 		 294 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12980  acyl CoA:acetate/3-ketoacid CoA transferase, alpha subunit  35.19 
 
 		 273 aa  112  2.0000000000000002e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2744  coenzyme A transferase  31.54 
 
 		 293 aa  112  3e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.933072  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1888  putative coenzyme A transferase  32.79 
 
 		 276 aa  111  4.0000000000000004e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.817278  normal  0.651618 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2126  coenzyme A transferase  27.92 
 
 		 313 aa  110  6e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5087  coenzyme A transferase  35.41 
 
 		 265 aa  110  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.903463  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1380  coenzyme A transferase  32.11 
 
 		 261 aa  108  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.161573  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0299  coenzyme A transferase  32.47 
 
 		 273 aa  108  3e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3297  coenzyme A transferase  31.62 
 
 		 293 aa  107  5e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0965913 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2064  coenzyme A transferase  32.64 
 
 		 286 aa  105  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.852286  normal  0.684027 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2354  coenzyme A transferase  34.7 
 
 		 289 aa  105  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.20907  normal  0.0705771 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4180  3-oxoadipate CoA-transferase  28.46 
 
 		 297 aa  104  5e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1906  coenzyme A transferase  27.96 
 
 		 325 aa  103  9e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0723821 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1584  glutaconate CoA-transferase  38.81 
 
 		 286 aa  103  1e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.803865  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0810  glutaconate CoA-transferase  28.24 
 
 		 325 aa  103  1e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.417423 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1134  coenzyme A transferase  29.2 
 
 		 299 aa  101  4e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.012829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0404  glutaconate CoA-transferase  28 
 
 		 269 aa  100  8e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00014468  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2561  coenzyme A transferase  30.86 
 
 		 331 aa  100  8e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5069  coenzyme A transferase  29.93 
 
 		 295 aa  97.8  5e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.539559 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4600  putative glutaconate CoA-transferase, subunit A  31.85 
 
 		 269 aa  97.4  6e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0403  glutaconate CoA-transferase  27.54 
 
 		 326 aa  97.4  6e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.255219  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2823  coenzyme A transferase  34.22 
 
 		 285 aa  95.1  3e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4684  coenzyme A transferase  29.23 
 
 		 295 aa  94  6e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.537215  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4770  coenzyme A transferase  29.23 
 
 		 295 aa  94  6e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0352343  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2697  coenzyme A transferase  27.5 
 
 		 269 aa  93.6  9e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1489  coenzyme A transferase  29.12 
 
 		 296 aa  93.2  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4012  glutaconate CoA-transferase  29.88 
 
 		 259 aa  90.9  6e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0155612 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1481  glutaconate CoA-transferase  27.37 
 
 		 271 aa  90.9  7e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4308  3-oxoadipate:succinyl-CoA transferase, subunit B  28.4 
 
 		 259 aa  89  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2970  coenzyme A transferase  29.23 
 
 		 256 aa  89  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0885606  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3982  coenzyme A transferase  28.87 
 
 		 297 aa  89.4  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1907  coenzyme A transferase  24.82 
 
 		 270 aa  88.6  3e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0720648 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5267  coenzyme A transferase  28.52 
 
 		 295 aa  87.4  6e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.174288 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1709  coenzyme A transferase  27.03 
 
 		 321 aa  87  8e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38210  3-oxoadipate:succinyl-CoA transferase, subunit B  28.4 
 
 		 260 aa  87  8e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.305454  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1583  glutaconate CoA-transferase  27.63 
 
 		 269 aa  86.7  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.485468  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1268  coenzyme A transferase  28.4 
 
 		 259 aa  85.9  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2825  coenzyme A transferase  26.91 
 
 		 320 aa  85.5  0.000000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1039  putative coenzyme A transferase, subunit B  29.39 
 
 		 255 aa  84.7  0.000000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000541022  normal  0.887029 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0300  coenzyme A transferase  28.25 
 
 		 258 aa  84.7  0.000000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.67113  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1387  coenzyme A transferase  26.58 
 
 		 320 aa  84  0.000000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3752  Acyl CoA:acetate/3-ketoacid CoA transferase beta subunit-like protein  29.39 
 
 		 263 aa  83.6  0.00000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0313  putative CoA transferase, subunit B  28.46 
 
 		 260 aa  82.8  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02770  putative CoA transferase, subunit B  28.46 
 
 		 260 aa  82.4  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0187646 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3035  glutaconate CoA-transferase  28.46 
 
 		 321 aa  81.6  0.00000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2127  Glutaconate CoA-transferase  28.4 
 
 		 281 aa  81.6  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1471  coenzyme A transferase  28.9 
 
 		 239 aa  81.3  0.00000000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.60655  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3922  coenzyme A transferase  27.41 
 
 		 271 aa  80.9  0.00000000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3047  coenzyme A transferase  27.74 
 
 		 277 aa  80.1  0.0000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.292404  normal  0.618767 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1708  coenzyme A transferase  25.72 
 
 		 273 aa  79  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.993873 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2824  coenzyme A transferase  26.09 
 
 		 274 aa  79  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5132  coenzyme A transferase  29.87 
 
 		 268 aa  78.6  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.914807  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1388  coenzyme A transferase  26.45 
 
 		 274 aa  78.6  0.0000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.939402 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1076  coenzyme A transferase  31.98 
 
 		 272 aa  76.6  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.616034 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4179  coenzyme A transferase  28.68 
 
 		 257 aa  77  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3034  glutaconate CoA-transferase  25.72 
 
 		 275 aa  76.6  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0809  glutaconate CoA-transferase  25.28 
 
 		 274 aa  75.9  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.402177 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2836  coenzyme A transferase  28.86 
 
 		 251 aa  75.5  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.478676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13584  CoA-transferase subunit alpha  27.27 
 
 		 292 aa  75.9  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.972  normal  0.101355 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3617  putative glutaconate CoA-transferase, subunit A  29 
 
 		 272 aa  75.1  0.000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.32721  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2284  coenzyme A transferase  28.8 
 
 		 251 aa  74.7  0.000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.229004  normal  0.263478 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1203  putative CoA transferase, subunit A  34.81 
 
 		 272 aa  70.9  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.917021 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2059  coenzyme A transferase  28.32 
 
 		 245 aa  70.1  0.0000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.581965  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7929  3-oxoadipate CoA-transferase  27.8 
 
 		 251 aa  70.1  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.331501  normal  0.318258 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12990  acyl CoA:acetate/3-ketoacid CoA transferase, beta subunit  28.12 
 
 		 259 aa  69.3  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1221  coenzyme A transferase  30.13 
 
 		 272 aa  68.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>