76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_2059 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_2059  coenzyme A transferase  100 
 
 
245 aa  498  1e-140  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.581965  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1471  coenzyme A transferase  61.76 
 
 
239 aa  312  3.9999999999999997e-84  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.60655  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1889  putative glutaconate CoA-transferase, subunit B  30.81 
 
 
248 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.694614  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2970  coenzyme A transferase  29.51 
 
 
256 aa  99.8  3e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0885606  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1039  putative coenzyme A transferase, subunit B  30 
 
 
255 aa  96.3  4e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000541022  normal  0.887029 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1583  glutaconate CoA-transferase  31.42 
 
 
269 aa  95.5  8e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.485468  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2327  3-oxoadipate CoA-transferase  29.92 
 
 
253 aa  91.3  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.656893 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0300  coenzyme A transferase  31.43 
 
 
258 aa  90.1  3e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.67113  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4308  3-oxoadipate:succinyl-CoA transferase, subunit B  30.95 
 
 
259 aa  86.7  3e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12990  acyl CoA:acetate/3-ketoacid CoA transferase, beta subunit  34.3 
 
 
259 aa  86.7  3e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1204  putative CoA transferase, subunit B  29.2 
 
 
250 aa  87  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2284  coenzyme A transferase  35.25 
 
 
251 aa  86.3  5e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.229004  normal  0.263478 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3922  coenzyme A transferase  28.97 
 
 
271 aa  84.7  0.000000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1268  coenzyme A transferase  30.49 
 
 
259 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4012  glutaconate CoA-transferase  29.91 
 
 
259 aa  82.4  0.000000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0155612 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1222  coenzyme A transferase  27.7 
 
 
250 aa  82  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5133  coenzyme A transferase  26.46 
 
 
255 aa  81.6  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38210  3-oxoadipate:succinyl-CoA transferase, subunit B  28.33 
 
 
260 aa  81.6  0.00000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.305454  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1708  coenzyme A transferase  26.07 
 
 
273 aa  80.9  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.993873 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4843  glutaconate CoA-transferase  28.24 
 
 
286 aa  80.1  0.00000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.321655  normal  0.834327 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2836  coenzyme A transferase  31.75 
 
 
251 aa  79.3  0.00000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.478676  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1643  coenzyme A transferase  32.74 
 
 
261 aa  79.3  0.00000000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4599  putative CoA transferase, subunit B  27.31 
 
 
255 aa  78.2  0.0000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3047  coenzyme A transferase  32.45 
 
 
277 aa  78.2  0.0000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.292404  normal  0.618767 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2824  coenzyme A transferase  27.24 
 
 
274 aa  77.8  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3034  glutaconate CoA-transferase  26.07 
 
 
275 aa  78.2  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02770  putative CoA transferase, subunit B  29.07 
 
 
260 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0187646 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1077  CoA transferase, subunit B  27.96 
 
 
250 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.400148 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1388  coenzyme A transferase  26.85 
 
 
274 aa  77  0.0000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.939402 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5071  coenzyme A transferase  25.58 
 
 
278 aa  76.6  0.0000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.000546344  normal  0.377928 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0313  putative CoA transferase, subunit B  28.19 
 
 
260 aa  76.6  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3616  putative CoA transferase, subunit B  29.27 
 
 
291 aa  76.6  0.0000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0480669  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4812  glutaconate CoA-transferase  25.49 
 
 
275 aa  73.9  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0754543  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2824  coenzyme A transferase  29.5 
 
 
256 aa  73.6  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0404  glutaconate CoA-transferase  25.99 
 
 
269 aa  73.9  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00014468  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1891  glutaconate CoA-transferase  27.91 
 
 
291 aa  72  0.000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.514889  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0809  glutaconate CoA-transferase  25.53 
 
 
274 aa  70.9  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.402177 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2560  coenzyme A transferase  25.5 
 
 
264 aa  70.5  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2205  coenzyme A transferase  28.32 
 
 
599 aa  70.1  0.00000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.401277  normal  0.0481798 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4620  coenzyme A transferase  31.95 
 
 
255 aa  69.7  0.00000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2071  Acyl CoA:acetate/3-ketoacid CoA transferase beta subunit-like protein  25.58 
 
 
264 aa  68.9  0.00000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7929  3-oxoadipate CoA-transferase  27.11 
 
 
251 aa  68.2  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.331501  normal  0.318258 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1559  putative CoA transferase beta subunit  26.21 
 
 
266 aa  67  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1433  Acyl CoA-acetate/3-ketoacid CoA transferase beta subunit  26.05 
 
 
265 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.276307  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2355  putative CoA transferase beta subunit  28.69 
 
 
260 aa  65.5  0.0000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.168668  normal  0.0654278 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5086  Glutaconate CoA-transferase  27.71 
 
 
251 aa  65.1  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2752  putative acyl CoA-acetate/3-ketoacid CoA transferase beta subunit, AtoA-like  23.11 
 
 
312 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00379387  normal  0.241661 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2606  coenzyme A transferase  26.72 
 
 
243 aa  61.2  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1481  glutaconate CoA-transferase  25 
 
 
271 aa  60.8  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3752  Acyl CoA:acetate/3-ketoacid CoA transferase beta subunit-like protein  25.37 
 
 
263 aa  58.9  0.00000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2155  coenzyme A transferase  24.12 
 
 
276 aa  58.5  0.00000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1379  coenzyme A transferase  27.12 
 
 
252 aa  58.9  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.243531  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2745  putative CoA transferase beta subunit  26.84 
 
 
256 aa  58.9  0.00000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5070  putative CoA transferase beta subunit  31.36 
 
 
249 aa  58.5  0.00000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.214302  normal  0.392124 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4685  putative CoA transferase beta subunit  31.36 
 
 
249 aa  58.5  0.00000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4771  putative CoA transferase beta subunit  31.36 
 
 
249 aa  58.5  0.00000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.146762  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2697  coenzyme A transferase  26 
 
 
269 aa  58.2  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2805  coenzyme A transferase  29.24 
 
 
243 aa  57.8  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000176999 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1907  coenzyme A transferase  27.97 
 
 
270 aa  58.5  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0720648 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3983  coenzyme A transferase  29.17 
 
 
254 aa  58.5  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1132  glutaconate CoA-transferase  24.46 
 
 
260 aa  56.2  0.0000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0489191  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2127  Glutaconate CoA-transferase  26.76 
 
 
281 aa  56.2  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2063  acyl CoA:acetate  26.19 
 
 
286 aa  56.6  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4179  coenzyme A transferase  24.24 
 
 
257 aa  52.8  0.000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1488  putative CoA transferase beta subunit  26.64 
 
 
248 aa  49.7  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5268  putative CoA transferase beta subunit  27.05 
 
 
249 aa  49.3  0.00006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.249131 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3828  coenzyme A transferase  26.95 
 
 
247 aa  48.5  0.00009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0830  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  23.38 
 
 
218 aa  46.6  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.127359 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2004  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  24.3 
 
 
239 aa  46.2  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.725633  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0211  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  24.43 
 
 
216 aa  45.4  0.0007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0867  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  26.92 
 
 
216 aa  45.4  0.0007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1076  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  23.11 
 
 
216 aa  44.7  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1135  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  25.15 
 
 
214 aa  45.4  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13585  CoA-transferase subunit beta  26.74 
 
 
250 aa  42.4  0.007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0392184  normal  0.0501609 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3296  Acyl CoA:acetate/3-ketoacid CoA transferase beta subunit-like protein  21.13 
 
 
265 aa  42  0.009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.103743 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3170  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  20.39 
 
 
215 aa  42  0.01  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>