More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2284 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_2284  coenzyme A transferase  100 
 
 
251 aa  495  1e-139  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.229004  normal  0.263478 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7929  3-oxoadipate CoA-transferase  76.4 
 
 
251 aa  370  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.331501  normal  0.318258 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12990  acyl CoA:acetate/3-ketoacid CoA transferase, beta subunit  72.51 
 
 
259 aa  365  1e-100  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1583  glutaconate CoA-transferase  70.2 
 
 
269 aa  352  4e-96  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.485468  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5086  Glutaconate CoA-transferase  74.69 
 
 
251 aa  337  9e-92  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2327  3-oxoadipate CoA-transferase  67.77 
 
 
253 aa  336  2.9999999999999997e-91  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.656893 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2836  coenzyme A transferase  69.49 
 
 
251 aa  327  1.0000000000000001e-88  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.478676  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4308  3-oxoadipate:succinyl-CoA transferase, subunit B  61.16 
 
 
259 aa  308  5e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4012  glutaconate CoA-transferase  61.57 
 
 
259 aa  305  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0155612 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1268  coenzyme A transferase  61.16 
 
 
259 aa  303  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02770  putative CoA transferase, subunit B  61.16 
 
 
260 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0187646 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0300  coenzyme A transferase  59.92 
 
 
258 aa  302  4.0000000000000003e-81  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.67113  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0313  putative CoA transferase, subunit B  61.16 
 
 
260 aa  302  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38210  3-oxoadipate:succinyl-CoA transferase, subunit B  60.33 
 
 
260 aa  299  3e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.305454  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2824  coenzyme A transferase  57.44 
 
 
256 aa  292  3e-78  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3047  coenzyme A transferase  55.91 
 
 
277 aa  290  2e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.292404  normal  0.618767 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3922  coenzyme A transferase  53.53 
 
 
271 aa  236  3e-61  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1891  glutaconate CoA-transferase  42.91 
 
 
291 aa  200  1.9999999999999998e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.514889  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1643  coenzyme A transferase  42.97 
 
 
261 aa  179  4.999999999999999e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2560  coenzyme A transferase  37.35 
 
 
264 aa  171  6.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1132  glutaconate CoA-transferase  39.43 
 
 
260 aa  155  6e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0489191  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0404  glutaconate CoA-transferase  36.18 
 
 
269 aa  154  2e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00014468  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2824  coenzyme A transferase  36.44 
 
 
274 aa  153  2e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2127  Glutaconate CoA-transferase  41.25 
 
 
281 aa  152  5e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1388  coenzyme A transferase  35.63 
 
 
274 aa  150  2e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.939402 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3034  glutaconate CoA-transferase  36.59 
 
 
275 aa  150  2e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0809  glutaconate CoA-transferase  36.61 
 
 
274 aa  150  2e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.402177 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1907  coenzyme A transferase  35.51 
 
 
270 aa  148  9e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0720648 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1481  glutaconate CoA-transferase  36.4 
 
 
271 aa  147  2.0000000000000003e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4179  coenzyme A transferase  38.34 
 
 
257 aa  144  1e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1708  coenzyme A transferase  35.22 
 
 
273 aa  144  1e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.993873 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2697  coenzyme A transferase  36.14 
 
 
269 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1039  putative coenzyme A transferase, subunit B  35.37 
 
 
255 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000541022  normal  0.887029 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2970  coenzyme A transferase  35.92 
 
 
256 aa  131  1.0000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0885606  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4812  glutaconate CoA-transferase  38.4 
 
 
275 aa  128  1.0000000000000001e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0754543  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4843  glutaconate CoA-transferase  38.15 
 
 
286 aa  122  5e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.321655  normal  0.834327 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5071  coenzyme A transferase  34.78 
 
 
278 aa  115  6.9999999999999995e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.000546344  normal  0.377928 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2063  acyl CoA:acetate  37.64 
 
 
286 aa  107  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2497  coenzyme A transferase  33.47 
 
 
590 aa  101  1e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.501333  normal  0.32873 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1077  CoA transferase, subunit B  40.74 
 
 
250 aa  98.2  1e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.400148 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3616  putative CoA transferase, subunit B  38.27 
 
 
291 aa  97.4  2e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0480669  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2745  putative CoA transferase beta subunit  33.73 
 
 
256 aa  96.3  4e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1222  coenzyme A transferase  39.51 
 
 
250 aa  95.9  6e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4599  putative CoA transferase, subunit B  34.45 
 
 
255 aa  93.2  4e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1889  putative glutaconate CoA-transferase, subunit B  32.8 
 
 
248 aa  92.4  6e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.694614  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2606  coenzyme A transferase  34.29 
 
 
243 aa  92  9e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1204  putative CoA transferase, subunit B  38.89 
 
 
250 aa  90.9  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3828  coenzyme A transferase  40.38 
 
 
247 aa  89.4  4e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2805  coenzyme A transferase  34.02 
 
 
243 aa  89.7  4e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000176999 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2155  coenzyme A transferase  30.71 
 
 
276 aa  87  3e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5133  coenzyme A transferase  36.2 
 
 
255 aa  86.3  5e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2059  coenzyme A transferase  35.25 
 
 
245 aa  86.3  5e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.581965  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1433  Acyl CoA-acetate/3-ketoacid CoA transferase beta subunit  31.75 
 
 
265 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.276307  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2752  putative acyl CoA-acetate/3-ketoacid CoA transferase beta subunit, AtoA-like  30.59 
 
 
312 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00379387  normal  0.241661 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0826  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  30.87 
 
 
216 aa  83.2  0.000000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4620  coenzyme A transferase  33.87 
 
 
255 aa  82.8  0.000000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1379  coenzyme A transferase  29.02 
 
 
252 aa  81.6  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.243531  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1367  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  30.34 
 
 
213 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3296  Acyl CoA:acetate/3-ketoacid CoA transferase beta subunit-like protein  32.42 
 
 
265 aa  79  0.00000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.103743 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3983  coenzyme A transferase  36.67 
 
 
254 aa  79  0.00000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2760  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  30.04 
 
 
213 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1154  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  30.6 
 
 
212 aa  77  0.0000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1013  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  28.7 
 
 
216 aa  75.9  0.0000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.300705  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3126  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  29.57 
 
 
213 aa  75.9  0.0000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.859515  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1559  putative CoA transferase beta subunit  33.33 
 
 
266 aa  75.5  0.0000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1962  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  31.6 
 
 
212 aa  75.1  0.000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2205  coenzyme A transferase  28.8 
 
 
599 aa  74.7  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.401277  normal  0.0481798 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1763  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  31.6 
 
 
212 aa  75.1  0.000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.255353  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1571  succinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase subunit B protein  30.43 
 
 
212 aa  74.3  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2657  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  28.44 
 
 
212 aa  74.3  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3261  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  29.18 
 
 
212 aa  74.3  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.812552  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1982  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  28.38 
 
 
211 aa  73.9  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1983  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  30.57 
 
 
212 aa  73.9  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000315327 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1562  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  29.96 
 
 
213 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1471  coenzyme A transferase  32.58 
 
 
239 aa  73.9  0.000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.60655  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13585  CoA-transferase subunit beta  27.45 
 
 
250 aa  73.6  0.000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0392184  normal  0.0501609 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1783  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  29.18 
 
 
213 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0809  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  30.64 
 
 
209 aa  73.2  0.000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4611  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  28.76 
 
 
213 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00383872  normal  0.923474 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1391  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  29.18 
 
 
213 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.755461  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2071  Acyl CoA:acetate/3-ketoacid CoA transferase beta subunit-like protein  36.24 
 
 
264 aa  72.4  0.000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1652  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  28.38 
 
 
211 aa  72.4  0.000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.200149  normal  0.0417322 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2355  putative CoA transferase beta subunit  33.33 
 
 
260 aa  72.4  0.000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.168668  normal  0.0654278 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1351  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  29.18 
 
 
213 aa  72.4  0.000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.897973  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1488  putative CoA transferase beta subunit  26.59 
 
 
248 aa  72  0.000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4771  putative CoA transferase beta subunit  35.33 
 
 
249 aa  71.2  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.146762  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1726  3-oxoacid CoA-transferase subunit B  28.76 
 
 
213 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.445298  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1549  3-oxoacid CoA-transferase subunit B  28.76 
 
 
213 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1107  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase beta subunit  28.76 
 
 
213 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.485565  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1878  succinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase subunit B  28.76 
 
 
213 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0343592  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0952  3-oxoacid CoA-transferase subunit B  28.76 
 
 
213 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.334541  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1700  succinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase subunit B  28.76 
 
 
213 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.375649  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4685  putative CoA transferase beta subunit  35.33 
 
 
249 aa  71.2  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5070  putative CoA transferase beta subunit  35.33 
 
 
249 aa  71.2  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.214302  normal  0.392124 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0212  3-oxoacid CoA-transferase subunit B  28.76 
 
 
213 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00734779  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4265  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  30.13 
 
 
212 aa  70.9  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0745238  normal  0.356459 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2607  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase beta subunit  28.76 
 
 
213 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1444  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  29.18 
 
 
213 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.085725  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0984  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  29.18 
 
 
213 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1466  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  29.18 
 
 
213 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>