174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_2127 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_2127  Glutaconate CoA-transferase  100 
 
 
281 aa  558  1e-158  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3922  coenzyme A transferase  42.62 
 
 
271 aa  181  9.000000000000001e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1907  coenzyme A transferase  37.7 
 
 
270 aa  154  1e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0720648 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2284  coenzyme A transferase  41.25 
 
 
251 aa  152  5.9999999999999996e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.229004  normal  0.263478 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1643  coenzyme A transferase  40.08 
 
 
261 aa  152  5.9999999999999996e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1583  glutaconate CoA-transferase  39.08 
 
 
269 aa  150  2e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.485468  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2836  coenzyme A transferase  39.22 
 
 
251 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.478676  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1891  glutaconate CoA-transferase  36.4 
 
 
291 aa  144  2e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.514889  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7929  3-oxoadipate CoA-transferase  39.83 
 
 
251 aa  143  4e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.331501  normal  0.318258 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38210  3-oxoadipate:succinyl-CoA transferase, subunit B  35.15 
 
 
260 aa  142  6e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.305454  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4308  3-oxoadipate:succinyl-CoA transferase, subunit B  36.13 
 
 
259 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4012  glutaconate CoA-transferase  36.13 
 
 
259 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0155612 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1268  coenzyme A transferase  34.43 
 
 
259 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3047  coenzyme A transferase  36.4 
 
 
277 aa  141  9.999999999999999e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.292404  normal  0.618767 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0300  coenzyme A transferase  36.67 
 
 
258 aa  141  9.999999999999999e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.67113  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5086  Glutaconate CoA-transferase  41.42 
 
 
251 aa  140  1.9999999999999998e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2560  coenzyme A transferase  34.68 
 
 
264 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2327  3-oxoadipate CoA-transferase  39.51 
 
 
253 aa  140  1.9999999999999998e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.656893 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3034  glutaconate CoA-transferase  35.29 
 
 
275 aa  139  3.9999999999999997e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12990  acyl CoA:acetate/3-ketoacid CoA transferase, beta subunit  38.4 
 
 
259 aa  139  4.999999999999999e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0809  glutaconate CoA-transferase  33.59 
 
 
274 aa  139  6e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.402177 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02770  putative CoA transferase, subunit B  36.4 
 
 
260 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0187646 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1708  coenzyme A transferase  33.59 
 
 
273 aa  136  4e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.993873 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2697  coenzyme A transferase  34.24 
 
 
269 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0313  putative CoA transferase, subunit B  35.56 
 
 
260 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1481  glutaconate CoA-transferase  34.63 
 
 
271 aa  132  6e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2824  coenzyme A transferase  32.71 
 
 
274 aa  132  7.999999999999999e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1388  coenzyme A transferase  33.09 
 
 
274 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.939402 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1132  glutaconate CoA-transferase  35.52 
 
 
260 aa  130  3e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0489191  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0404  glutaconate CoA-transferase  33.2 
 
 
269 aa  130  3e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00014468  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2824  coenzyme A transferase  33.33 
 
 
256 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4179  coenzyme A transferase  37.01 
 
 
257 aa  125  1e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1039  putative coenzyme A transferase, subunit B  35.1 
 
 
255 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000541022  normal  0.887029 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2970  coenzyme A transferase  33.61 
 
 
256 aa  108  9.000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0885606  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2497  coenzyme A transferase  31.45 
 
 
590 aa  90.9  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.501333  normal  0.32873 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5071  coenzyme A transferase  32.18 
 
 
278 aa  89.4  6e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.000546344  normal  0.377928 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2205  coenzyme A transferase  28.4 
 
 
599 aa  81.6  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.401277  normal  0.0481798 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2752  putative acyl CoA-acetate/3-ketoacid CoA transferase beta subunit, AtoA-like  31.34 
 
 
312 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00379387  normal  0.241661 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4843  glutaconate CoA-transferase  32.95 
 
 
286 aa  66.6  0.0000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.321655  normal  0.834327 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4599  putative CoA transferase, subunit B  28.52 
 
 
255 aa  66.2  0.0000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4812  glutaconate CoA-transferase  33.47 
 
 
275 aa  65.1  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0754543  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2063  acyl CoA:acetate  34.62 
 
 
286 aa  63.9  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1204  putative CoA transferase, subunit B  30.72 
 
 
250 aa  63.5  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3616  putative CoA transferase, subunit B  28.31 
 
 
291 aa  63.2  0.000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0480669  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1471  coenzyme A transferase  28.57 
 
 
239 aa  62.8  0.000000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.60655  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1379  coenzyme A transferase  27 
 
 
252 aa  61.2  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.243531  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4620  coenzyme A transferase  26.16 
 
 
255 aa  61.2  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1077  CoA transferase, subunit B  29.41 
 
 
250 aa  57.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.400148 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2155  coenzyme A transferase  27.17 
 
 
276 aa  57.8  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2606  coenzyme A transferase  30.91 
 
 
243 aa  57.8  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38640  putative CoA transferase, subunit B  29.65 
 
 
218 aa  57  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.426102  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3294  putative CoA transferase, subunit B  29.65 
 
 
218 aa  57  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.15294  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2059  coenzyme A transferase  26.76 
 
 
245 aa  56.2  0.0000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.581965  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1889  putative glutaconate CoA-transferase, subunit B  29.19 
 
 
248 aa  54.7  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.694614  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1222  coenzyme A transferase  27.71 
 
 
250 aa  55.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5133  coenzyme A transferase  27.71 
 
 
255 aa  55.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1433  Acyl CoA-acetate/3-ketoacid CoA transferase beta subunit  27.73 
 
 
265 aa  54.7  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.276307  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4552  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  29.78 
 
 
209 aa  54.7  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.208312  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2760  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  26.75 
 
 
213 aa  54.7  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2432  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  30.84 
 
 
218 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2805  coenzyme A transferase  29.7 
 
 
243 aa  53.9  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000176999 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2734  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  30.4 
 
 
218 aa  53.5  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3123  3-oxoacid CoA-transferase subunit B  30.4 
 
 
218 aa  53.1  0.000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.818708 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1013  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  28.26 
 
 
216 aa  53.1  0.000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.300705  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0591  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  28.19 
 
 
217 aa  52.8  0.000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1306  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  31.28 
 
 
453 aa  52.8  0.000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2593  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  30.4 
 
 
218 aa  52.8  0.000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0826  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  28.44 
 
 
216 aa  53.1  0.000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2071  Acyl CoA:acetate/3-ketoacid CoA transferase beta subunit-like protein  26.77 
 
 
264 aa  52.8  0.000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1367  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  26.09 
 
 
213 aa  52.8  0.000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01940  3-oxoacid CoA-transferase subunit B family enzyme  27.56 
 
 
217 aa  52.4  0.000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0468596  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1350  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  27.98 
 
 
228 aa  52.4  0.000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.596228 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1562  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  25.33 
 
 
213 aa  52  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0809  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  28.83 
 
 
209 aa  52  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2745  putative CoA transferase beta subunit  29.19 
 
 
256 aa  52  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4892  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  27.66 
 
 
218 aa  52  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51600  3-oxoacid CoA-transferase  27.88 
 
 
218 aa  52  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1559  putative CoA transferase beta subunit  30.2 
 
 
266 aa  51.2  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3456  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B family  28.82 
 
 
218 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3238  3-oxoacid CoA-transferase  28.07 
 
 
218 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.507702  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1369  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  29.2 
 
 
229 aa  50.8  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1387  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  29.2 
 
 
229 aa  50.8  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.104007  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1139  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  28.76 
 
 
218 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.477496 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4685  putative CoA transferase beta subunit  30.97 
 
 
249 aa  50.4  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4771  putative CoA transferase beta subunit  30.97 
 
 
249 aa  50.4  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.146762  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5070  putative CoA transferase beta subunit  30.97 
 
 
249 aa  50.4  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.214302  normal  0.392124 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2075  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  26.99 
 
 
221 aa  49.7  0.00005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4355  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  25.32 
 
 
218 aa  49.7  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2696  3-oxoacid CoA-transferase B subunit  31.34 
 
 
448 aa  48.9  0.00009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.494818  normal  0.507072 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05669  succinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase (ScoT), putative (AFU_orthologue; AFUA_6G12250)  27.12 
 
 
519 aa  48.5  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09394  coenzyme A transferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G04030)  37.61 
 
 
439 aa  48.9  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.504569  normal  0.0471262 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07620  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  27.39 
 
 
221 aa  48.1  0.0001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2141  CoA-transferase subunit beta  25.83 
 
 
220 aa  48.5  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.356261  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2079  aetate CoA-transferase, beta subunit  25.83 
 
 
220 aa  48.5  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2075  aetate CoA-transferase, beta subunit  25.83 
 
 
220 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2296  CoA-transferase subunit beta  25.83 
 
 
220 aa  48.5  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.489848  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2634  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  26.87 
 
 
212 aa  48.9  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.428059  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2321  CoA-transferase, beta subunit  25.83 
 
 
220 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1403  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  28.76 
 
 
229 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3274  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  31.54 
 
 
218 aa  48.1  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.948556 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>