134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_0404 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_0404  glutaconate CoA-transferase  100 
 
 		 269 aa  556  1e-157  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00014468  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1481  glutaconate CoA-transferase  75 
 
 		 271 aa  416  9.999999999999999e-116  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1907  coenzyme A transferase  69.78 
 
 		 270 aa  389  1e-107  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0720648 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2697  coenzyme A transferase  68.03 
 
 		 269 aa  377  1e-103  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3034  glutaconate CoA-transferase  62.55 
 
 		 275 aa  363  2e-99  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1708  coenzyme A transferase  64.15 
 
 		 273 aa  362  4e-99  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.993873 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2824  coenzyme A transferase  62.12 
 
 		 274 aa  354  8.999999999999999e-97  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0809  glutaconate CoA-transferase  60.97 
 
 		 274 aa  351  7e-96  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.402177 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1388  coenzyme A transferase  61.36 
 
 		 274 aa  350  1e-95  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.939402 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1891  glutaconate CoA-transferase  38.4 
 
 		 291 aa  176  5e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.514889  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1583  glutaconate CoA-transferase  37.12 
 
 		 269 aa  172  5e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.485468  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3922  coenzyme A transferase  35.11 
 
 		 271 aa  169  4e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2327  3-oxoadipate CoA-transferase  36.07 
 
 		 253 aa  167  2e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.656893 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4179  coenzyme A transferase  38.35 
 
 		 257 aa  163  3e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1132  glutaconate CoA-transferase  40 
 
 		 260 aa  159  6e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0489191  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2284  coenzyme A transferase  36.18 
 
 		 251 aa  154  2e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.229004  normal  0.263478 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12990  acyl CoA:acetate/3-ketoacid CoA transferase, beta subunit  35.74 
 
 		 259 aa  152  4e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5086  Glutaconate CoA-transferase  36.65 
 
 		 251 aa  149  4e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7929  3-oxoadipate CoA-transferase  34 
 
 		 251 aa  147  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.331501  normal  0.318258 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0300  coenzyme A transferase  33.46 
 
 		 258 aa  145  5e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.67113  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02770  putative CoA transferase, subunit B  32.79 
 
 		 260 aa  144  2e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0187646 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0313  putative CoA transferase, subunit B  32.39 
 
 		 260 aa  142  6e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1643  coenzyme A transferase  35.32 
 
 		 261 aa  142  8e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38210  3-oxoadipate:succinyl-CoA transferase, subunit B  31.52 
 
 		 260 aa  140  1.9999999999999998e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.305454  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4308  3-oxoadipate:succinyl-CoA transferase, subunit B  31.98 
 
 		 259 aa  138  1e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2836  coenzyme A transferase  33.33 
 
 		 251 aa  137  1e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.478676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4012  glutaconate CoA-transferase  31.98 
 
 		 259 aa  136  4e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0155612 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1268  coenzyme A transferase  31.98 
 
 		 259 aa  135  9e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2824  coenzyme A transferase  31.69 
 
 		 256 aa  135  9e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2560  coenzyme A transferase  34.5 
 
 		 264 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2127  Glutaconate CoA-transferase  33.2 
 
 		 281 aa  130  3e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3047  coenzyme A transferase  28.9 
 
 		 277 aa  125  8.000000000000001e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.292404  normal  0.618767 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1039  putative coenzyme A transferase, subunit B  31.5 
 
 		 255 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000541022  normal  0.887029 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2970  coenzyme A transferase  31.18 
 
 		 256 aa  111  1.0000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0885606  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3616  putative CoA transferase, subunit B  36.21 
 
 		 291 aa  108  1e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0480669  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2205  coenzyme A transferase  28 
 
 		 599 aa  100  3e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.401277  normal  0.0481798 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1204  putative CoA transferase, subunit B  33.89 
 
 		 250 aa  97.1  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2745  putative CoA transferase beta subunit  29.55 
 
 		 256 aa  92.8  5e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5071  coenzyme A transferase  29.66 
 
 		 278 aa  92.8  6e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.000546344  normal  0.377928 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1222  coenzyme A transferase  31.98 
 
 		 250 aa  90.9  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1889  putative glutaconate CoA-transferase, subunit B  28.74 
 
 		 248 aa  90.1  4e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.694614  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1077  CoA transferase, subunit B  31.84 
 
 		 250 aa  87.4  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.400148 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4599  putative CoA transferase, subunit B  30.34 
 
 		 255 aa  87.4  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1471  coenzyme A transferase  28.12 
 
 		 239 aa  87.4  2e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.60655  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4843  glutaconate CoA-transferase  26.15 
 
 		 286 aa  87  3e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.321655  normal  0.834327 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3983  coenzyme A transferase  30.9 
 
 		 254 aa  84.7  0.000000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3828  coenzyme A transferase  33.74 
 
 		 247 aa  83.2  0.000000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5133  coenzyme A transferase  28.41 
 
 		 255 aa  82.8  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4812  glutaconate CoA-transferase  26.54 
 
 		 275 aa  82.4  0.000000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0754543  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2063  acyl CoA:acetate  29.46 
 
 		 286 aa  80.9  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2805  coenzyme A transferase  29.08 
 
 		 243 aa  79.3  0.00000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000176999 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2606  coenzyme A transferase  29.96 
 
 		 243 aa  78.6  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1379  coenzyme A transferase  28.8 
 
 		 252 aa  76.3  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.243531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1488  putative CoA transferase beta subunit  32.58 
 
 		 248 aa  75.1  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2059  coenzyme A transferase  25.99 
 
 		 245 aa  73.9  0.000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.581965  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13585  CoA-transferase subunit beta  30.34 
 
 		 250 aa  72.8  0.000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0392184  normal  0.0501609 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2752  putative acyl CoA-acetate/3-ketoacid CoA transferase beta subunit, AtoA-like  26.71 
 
 		 312 aa  72.4  0.000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00379387  normal  0.241661 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4685  putative CoA transferase beta subunit  30.34 
 
 		 249 aa  72  0.000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4771  putative CoA transferase beta subunit  30.34 
 
 		 249 aa  72  0.000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.146762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5070  putative CoA transferase beta subunit  30.34 
 
 		 249 aa  72  0.000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.214302  normal  0.392124 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2155  coenzyme A transferase  26.59 
 
 		 276 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5268  putative CoA transferase beta subunit  31.46 
 
 		 249 aa  70.5  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.249131 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2071  Acyl CoA:acetate/3-ketoacid CoA transferase beta subunit-like protein  26.72 
 
 		 264 aa  70.1  0.00000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4620  coenzyme A transferase  31.71 
 
 		 255 aa  67.8  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1433  Acyl CoA-acetate/3-ketoacid CoA transferase beta subunit  25.38 
 
 		 265 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.276307  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3730  glutaconate CoA-transferase subunit B  42.86 
 
 		 71 aa  62.4  0.000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2497  coenzyme A transferase  24.9 
 
 		 590 aa  62  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.501333  normal  0.32873 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3752  Acyl CoA:acetate/3-ketoacid CoA transferase beta subunit-like protein  24.23 
 
 		 263 aa  59.3  0.00000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1559  putative CoA transferase beta subunit  25.49 
 
 		 266 aa  58.2  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2355  putative CoA transferase beta subunit  25.28 
 
 		 260 aa  53.5  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.168668  normal  0.0654278 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0350  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  26.36 
 
 		 223 aa  51.6  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0790399 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4049  propionate CoA-transferase  28.41 
 
 		 542 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2996  coenzyme A transferase  32.64 
 
 		 663 aa  49.3  0.00006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3296  Acyl CoA:acetate/3-ketoacid CoA transferase beta subunit-like protein  24.71 
 
 		 265 aa  49.3  0.00007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.103743 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0346  coenzyme A transferase  27 
 
 		 554 aa  49.3  0.00007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1306  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  26.43 
 
 		 453 aa  48.1  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1572  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  24.79 
 
 		 213 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.494559 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0549  coenzyme A transferase  29.28 
 
 		 663 aa  47.4  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2585  propionate CoA-transferase  27.16 
 
 		 547 aa  47.4  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.206611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1555  coenzyme A transferase  26.64 
 
 		 532 aa  47.4  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.431711  normal  0.989893 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3022  coenzyme A transferase  28.76 
 
 		 521 aa  47.4  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.119963 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03176  succinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase subunit B  28.77 
 
 		 209 aa  47.4  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.303462  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1533  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  27.23 
 
 		 447 aa  46.2  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.172337 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0471  putative transferase protein  25.32 
 
 		 553 aa  46.6  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1859  propionate CoA-transferase  25.69 
 
 		 544 aa  46.2  0.0005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.155788  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0883  coenzyme A transferase  29.86 
 
 		 509 aa  46.2  0.0006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.021218  normal  0.461656 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2684  coenzyme A transferase  31.16 
 
 		 646 aa  45.8  0.0007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0361  coenzyme A transferase  26.52 
 
 		 554 aa  45.8  0.0007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0867  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  25 
 
 		 216 aa  45.1  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1982  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  22.94 
 
 		 211 aa  45.1  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2487  coenzyme A transferase  29.61 
 
 		 522 aa  45.4  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_21350  predicted protein  30.66 
 
 		 557 aa  45.1  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00403963  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1571  succinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase subunit B protein  23.38 
 
 		 212 aa  44.3  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1382  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  25.83 
 
 		 218 aa  44.3  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0091  propionate CoA-transferase  31.33 
 
 		 516 aa  44.7  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1267  coenzyme A transferase  28.57 
 
 		 666 aa  44.3  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1541  coenzyme A transferase  35.23 
 
 		 508 aa  44.3  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1212  coenzyme A transferase  28.57 
 
 		 523 aa  44.3  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2696  3-oxoacid CoA-transferase B subunit  23.58 
 
 		 448 aa  44.3  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.494818  normal  0.507072 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1164  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  24.5 
 
 		 229 aa  43.5  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>