More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_4308 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_4308  3-oxoadipate:succinyl-CoA transferase, subunit B  100 
 
 		 259 aa  523  1e-147  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4012  glutaconate CoA-transferase  96.14 
 
 		 259 aa  502  1e-141  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0155612 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1268  coenzyme A transferase  92.28 
 
 		 259 aa  487  1e-137  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0313  putative CoA transferase, subunit B  86.17 
 
 		 260 aa  449  1e-125  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02770  putative CoA transferase, subunit B  86.17 
 
 		 260 aa  449  1e-125  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0187646 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38210  3-oxoadipate:succinyl-CoA transferase, subunit B  84.11 
 
 		 260 aa  446  1.0000000000000001e-124  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.305454  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1583  glutaconate CoA-transferase  63.92 
 
 		 269 aa  335  3.9999999999999995e-91  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.485468  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2824  coenzyme A transferase  61.6 
 
 		 256 aa  332  3e-90  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0300  coenzyme A transferase  62.65 
 
 		 258 aa  330  2e-89  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.67113  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12990  acyl CoA:acetate/3-ketoacid CoA transferase, beta subunit  63.52 
 
 		 259 aa  322  3e-87  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7929  3-oxoadipate CoA-transferase  65.29 
 
 		 251 aa  320  9.999999999999999e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.331501  normal  0.318258 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2327  3-oxoadipate CoA-transferase  62.3 
 
 		 253 aa  316  3e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.656893 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3047  coenzyme A transferase  58.02 
 
 		 277 aa  315  5e-85  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.292404  normal  0.618767 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2284  coenzyme A transferase  61.16 
 
 		 251 aa  308  5.9999999999999995e-83  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.229004  normal  0.263478 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2836  coenzyme A transferase  62.71 
 
 		 251 aa  297  1e-79  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.478676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5086  Glutaconate CoA-transferase  63.27 
 
 		 251 aa  290  2e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3922  coenzyme A transferase  48.96 
 
 		 271 aa  231  6e-60  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1891  glutaconate CoA-transferase  38.37 
 
 		 291 aa  189  4e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.514889  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2560  coenzyme A transferase  36.51 
 
 		 264 aa  171  1e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1643  coenzyme A transferase  39.84 
 
 		 261 aa  156  3e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1481  glutaconate CoA-transferase  36.44 
 
 		 271 aa  152  4e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1907  coenzyme A transferase  34.69 
 
 		 270 aa  152  8e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0720648 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1708  coenzyme A transferase  32.8 
 
 		 273 aa  143  3e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.993873 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0809  glutaconate CoA-transferase  33.99 
 
 		 274 aa  143  3e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.402177 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2127  Glutaconate CoA-transferase  36.13 
 
 		 281 aa  141  9.999999999999999e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0404  glutaconate CoA-transferase  31.98 
 
 		 269 aa  138  8.999999999999999e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00014468  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3034  glutaconate CoA-transferase  32 
 
 		 275 aa  137  1e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4179  coenzyme A transferase  33.73 
 
 		 257 aa  134  1.9999999999999998e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2970  coenzyme A transferase  35.25 
 
 		 256 aa  133  1.9999999999999998e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0885606  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1132  glutaconate CoA-transferase  32.93 
 
 		 260 aa  133  3e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0489191  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2824  coenzyme A transferase  31.15 
 
 		 274 aa  129  6e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1388  coenzyme A transferase  31.15 
 
 		 274 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.939402 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2697  coenzyme A transferase  33.6 
 
 		 269 aa  125  9e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1039  putative coenzyme A transferase, subunit B  35.22 
 
 		 255 aa  123  3e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000541022  normal  0.887029 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4812  glutaconate CoA-transferase  30.28 
 
 		 275 aa  103  2e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0754543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4843  glutaconate CoA-transferase  30.28 
 
 		 286 aa  101  1e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.321655  normal  0.834327 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2497  coenzyme A transferase  32.66 
 
 		 590 aa  99.8  4e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.501333  normal  0.32873 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2752  putative acyl CoA-acetate/3-ketoacid CoA transferase beta subunit, AtoA-like  32.03 
 
 		 312 aa  98.2  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00379387  normal  0.241661 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5071  coenzyme A transferase  28.9 
 
 		 278 aa  97.8  1e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.000546344  normal  0.377928 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2063  acyl CoA:acetate  32.95 
 
 		 286 aa  97.4  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2155  coenzyme A transferase  29.55 
 
 		 276 aa  95.9  5e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1433  Acyl CoA-acetate/3-ketoacid CoA transferase beta subunit  30.83 
 
 		 265 aa  95.1  9e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.276307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2606  coenzyme A transferase  29.55 
 
 		 243 aa  92.4  6e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2805  coenzyme A transferase  30.61 
 
 		 243 aa  92  9e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000176999 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2205  coenzyme A transferase  28.4 
 
 		 599 aa  89  7e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.401277  normal  0.0481798 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1559  putative CoA transferase beta subunit  32.68 
 
 		 266 aa  88.6  9e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2059  coenzyme A transferase  30.95 
 
 		 245 aa  86.7  4e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.581965  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4620  coenzyme A transferase  28.79 
 
 		 255 aa  85.1  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3828  coenzyme A transferase  31.01 
 
 		 247 aa  83.6  0.000000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3752  Acyl CoA:acetate/3-ketoacid CoA transferase beta subunit-like protein  29.13 
 
 		 263 aa  83.2  0.000000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3296  Acyl CoA:acetate/3-ketoacid CoA transferase beta subunit-like protein  29.01 
 
 		 265 aa  82.8  0.000000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.103743 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2745  putative CoA transferase beta subunit  26.54 
 
 		 256 aa  82.4  0.000000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1889  putative glutaconate CoA-transferase, subunit B  29.83 
 
 		 248 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.694614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4599  putative CoA transferase, subunit B  29.36 
 
 		 255 aa  80.5  0.00000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1471  coenzyme A transferase  33.33 
 
 		 239 aa  78.6  0.00000000000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.60655  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1379  coenzyme A transferase  26.95 
 
 		 252 aa  77.4  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.243531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0826  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  30.04 
 
 		 216 aa  76.3  0.0000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1222  coenzyme A transferase  32.03 
 
 		 250 aa  75.1  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5133  coenzyme A transferase  31.17 
 
 		 255 aa  74.7  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4771  putative CoA transferase beta subunit  26.19 
 
 		 249 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.146762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5070  putative CoA transferase beta subunit  26.19 
 
 		 249 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.214302  normal  0.392124 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4685  putative CoA transferase beta subunit  26.19 
 
 		 249 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1077  CoA transferase, subunit B  32.1 
 
 		 250 aa  73.6  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.400148 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1204  putative CoA transferase, subunit B  32.1 
 
 		 250 aa  73.2  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3983  coenzyme A transferase  27.19 
 
 		 254 aa  72.8  0.000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2634  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  30.57 
 
 		 212 aa  72  0.00000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.428059  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1013  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  28.38 
 
 		 216 aa  71.2  0.00000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.300705  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2075  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  28.45 
 
 		 221 aa  70.1  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3616  putative CoA transferase, subunit B  28.1 
 
 		 291 aa  69.7  0.00000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0480669  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2355  putative CoA transferase beta subunit  31.01 
 
 		 260 aa  69.3  0.00000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.168668  normal  0.0654278 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2071  Acyl CoA:acetate/3-ketoacid CoA transferase beta subunit-like protein  27.12 
 
 		 264 aa  69.3  0.00000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3238  3-oxoacid CoA-transferase  28.02 
 
 		 218 aa  68.9  0.00000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.507702  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08490  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  28.51 
 
 		 224 aa  68.9  0.00000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.506696 
 
 
-
 
NC_002950  PG1075  coenzyme A transferase, beta subunit  29 
 
 		 220 aa  68.9  0.00000000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.425854 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07040  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  29.28 
 
 		 222 aa  68.6  0.00000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.238632 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5268  putative CoA transferase beta subunit  24.71 
 
 		 249 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.249131 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1669  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  29.74 
 
 		 218 aa  67.8  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2004  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  30.38 
 
 		 239 aa  67.4  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.725633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0591  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  30.18 
 
 		 217 aa  67.8  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1488  putative CoA transferase beta subunit  24.71 
 
 		 248 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2432  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  28.02 
 
 		 218 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3456  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B family  28.45 
 
 		 218 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7913  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  31.47 
 
 		 221 aa  67  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51600  3-oxoacid CoA-transferase  28.88 
 
 		 218 aa  67  0.0000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1367  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  28.95 
 
 		 213 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1154  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  29.6 
 
 		 212 aa  65.9  0.0000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1906  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  30.43 
 
 		 211 aa  65.9  0.0000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.750884 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13585  CoA-transferase subunit beta  24.63 
 
 		 250 aa  65.9  0.0000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0392184  normal  0.0501609 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3123  3-oxoacid CoA-transferase subunit B  28.02 
 
 		 218 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.818708 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1983  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  29.15 
 
 		 212 aa  64.3  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000315327 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2734  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  27.16 
 
 		 218 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1494  propionate CoA-transferase  29.41 
 
 		 669 aa  64.3  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02904  glutaconate CoA transferase subunit B  60.38 
 
 		 67 aa  64.3  0.000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1982  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  27.8 
 
 		 211 aa  63.9  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3054  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  28.38 
 
 		 219 aa  64.3  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.178254 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1457  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  28.63 
 
 		 212 aa  63.9  0.000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0588304  normal  0.817341 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3848  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  27.56 
 
 		 215 aa  63.5  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0238959  normal  0.733298 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2593  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  28.02 
 
 		 218 aa  63.5  0.000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2760  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  28.51 
 
 		 213 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1652  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  27.8 
 
 		 211 aa  62.8  0.000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.200149  normal  0.0417322 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>