More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2836 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_2836  coenzyme A transferase  100 
 
 		 251 aa  495  1e-139  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.478676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12990  acyl CoA:acetate/3-ketoacid CoA transferase, beta subunit  73.49 
 
 		 259 aa  377  1e-103  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2284  coenzyme A transferase  68.83 
 
 		 251 aa  338  2.9999999999999998e-92  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.229004  normal  0.263478 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2327  3-oxoadipate CoA-transferase  69.01 
 
 		 253 aa  331  8e-90  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.656893 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7929  3-oxoadipate CoA-transferase  69.64 
 
 		 251 aa  330  1e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.331501  normal  0.318258 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1583  glutaconate CoA-transferase  67.21 
 
 		 269 aa  327  9e-89  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.485468  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5086  Glutaconate CoA-transferase  66.94 
 
 		 251 aa  311  5.999999999999999e-84  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4012  glutaconate CoA-transferase  62.9 
 
 		 259 aa  308  4e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0155612 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1268  coenzyme A transferase  63.31 
 
 		 259 aa  308  5e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4308  3-oxoadipate:succinyl-CoA transferase, subunit B  62.5 
 
 		 259 aa  308  5.9999999999999995e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02770  putative CoA transferase, subunit B  62.7 
 
 		 260 aa  306  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0187646 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0313  putative CoA transferase, subunit B  62.7 
 
 		 260 aa  305  3e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38210  3-oxoadipate:succinyl-CoA transferase, subunit B  60.16 
 
 		 260 aa  299  3e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.305454  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2824  coenzyme A transferase  56.85 
 
 		 256 aa  285  7e-76  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0300  coenzyme A transferase  58.13 
 
 		 258 aa  283  2.0000000000000002e-75  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.67113  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3047  coenzyme A transferase  55.04 
 
 		 277 aa  279  3e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.292404  normal  0.618767 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3922  coenzyme A transferase  48.55 
 
 		 271 aa  214  9e-55  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1891  glutaconate CoA-transferase  41.06 
 
 		 291 aa  191  1e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.514889  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1643  coenzyme A transferase  43.72 
 
 		 261 aa  177  1e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2560  coenzyme A transferase  39.22 
 
 		 264 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2127  Glutaconate CoA-transferase  40.08 
 
 		 281 aa  153  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1481  glutaconate CoA-transferase  36.07 
 
 		 271 aa  142  4e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0404  glutaconate CoA-transferase  33.2 
 
 		 269 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00014468  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1907  coenzyme A transferase  34.02 
 
 		 270 aa  140  3e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0720648 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2824  coenzyme A transferase  35.08 
 
 		 274 aa  139  6e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1388  coenzyme A transferase  34.68 
 
 		 274 aa  137  1e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.939402 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2697  coenzyme A transferase  36.8 
 
 		 269 aa  136  3.0000000000000003e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0809  glutaconate CoA-transferase  33.99 
 
 		 274 aa  136  4e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.402177 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3034  glutaconate CoA-transferase  35.08 
 
 		 275 aa  135  6.0000000000000005e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4179  coenzyme A transferase  37.26 
 
 		 257 aa  132  6.999999999999999e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1708  coenzyme A transferase  34.55 
 
 		 273 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.993873 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1132  glutaconate CoA-transferase  34.15 
 
 		 260 aa  130  3e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0489191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1039  putative coenzyme A transferase, subunit B  34.94 
 
 		 255 aa  124  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000541022  normal  0.887029 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2970  coenzyme A transferase  34.82 
 
 		 256 aa  122  5e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0885606  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2497  coenzyme A transferase  37.96 
 
 		 590 aa  117  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.501333  normal  0.32873 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5071  coenzyme A transferase  34.23 
 
 		 278 aa  113  3e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.000546344  normal  0.377928 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4812  glutaconate CoA-transferase  34.54 
 
 		 275 aa  109  4.0000000000000004e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0754543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4843  glutaconate CoA-transferase  33.73 
 
 		 286 aa  104  2e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.321655  normal  0.834327 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2606  coenzyme A transferase  34.27 
 
 		 243 aa  90.5  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4620  coenzyme A transferase  36.5 
 
 		 255 aa  90.1  3e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2063  acyl CoA:acetate  35.89 
 
 		 286 aa  89.7  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2745  putative CoA transferase beta subunit  34.51 
 
 		 256 aa  89  6e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2805  coenzyme A transferase  35.77 
 
 		 243 aa  89  6e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000176999 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3616  putative CoA transferase, subunit B  32.79 
 
 		 291 aa  86.7  3e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0480669  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2155  coenzyme A transferase  29.25 
 
 		 276 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1222  coenzyme A transferase  32.37 
 
 		 250 aa  84.3  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1889  putative glutaconate CoA-transferase, subunit B  31.33 
 
 		 248 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.694614  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1379  coenzyme A transferase  29.84 
 
 		 252 aa  84.3  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.243531  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4599  putative CoA transferase, subunit B  31.93 
 
 		 255 aa  82.4  0.000000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3828  coenzyme A transferase  32.45 
 
 		 247 aa  79.7  0.00000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2059  coenzyme A transferase  30.41 
 
 		 245 aa  79.3  0.00000000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.581965  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1077  CoA transferase, subunit B  36.14 
 
 		 250 aa  79.3  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.400148 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2752  putative acyl CoA-acetate/3-ketoacid CoA transferase beta subunit, AtoA-like  32.17 
 
 		 312 aa  79.3  0.00000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00379387  normal  0.241661 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5133  coenzyme A transferase  30.08 
 
 		 255 aa  79.3  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1433  Acyl CoA-acetate/3-ketoacid CoA transferase beta subunit  30 
 
 		 265 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.276307  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1367  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  29.31 
 
 		 213 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2205  coenzyme A transferase  28.86 
 
 		 599 aa  75.9  0.0000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.401277  normal  0.0481798 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1559  putative CoA transferase beta subunit  33.6 
 
 		 266 aa  75.5  0.0000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2760  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  28.88 
 
 		 213 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1471  coenzyme A transferase  31.19 
 
 		 239 aa  74.7  0.000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.60655  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1204  putative CoA transferase, subunit B  36.36 
 
 		 250 aa  74.7  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0651  coenzyme A transferase  27.76 
 
 		 542 aa  70.1  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.364545  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2355  putative CoA transferase beta subunit  31.53 
 
 		 260 aa  70.5  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.168668  normal  0.0654278 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3752  Acyl CoA:acetate/3-ketoacid CoA transferase beta subunit-like protein  26.88 
 
 		 263 aa  69.7  0.00000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4338  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  31.82 
 
 		 222 aa  69.7  0.00000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0323675  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1783  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  27.16 
 
 		 213 aa  69.3  0.00000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1488  putative CoA transferase beta subunit  27.56 
 
 		 248 aa  69.3  0.00000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4888  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  29.69 
 
 		 220 aa  69.3  0.00000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.544225  normal  0.033457 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13585  CoA-transferase subunit beta  27.63 
 
 		 250 aa  68.9  0.00000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0392184  normal  0.0501609 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0457  propionate CoA-transferase  29.52 
 
 		 667 aa  68.2  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.460217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2607  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase beta subunit  27.16 
 
 		 213 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1391  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  27.59 
 
 		 213 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.755461  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1351  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  27.59 
 
 		 213 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.897973  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7913  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  31.9 
 
 		 221 aa  67.4  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0826  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  29.31 
 
 		 216 aa  67.4  0.0000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1595  coenzyme A transferase  29.26 
 
 		 663 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0936861  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0549  coenzyme A transferase  29.73 
 
 		 663 aa  67.4  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3824  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  29.87 
 
 		 212 aa  66.6  0.0000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4049  propionate CoA-transferase  30.63 
 
 		 542 aa  66.2  0.0000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1013  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  28.45 
 
 		 216 aa  66.2  0.0000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.300705  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4611  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  27.16 
 
 		 213 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00383872  normal  0.923474 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07040  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  29 
 
 		 222 aa  66.2  0.0000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.238632 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2258  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  29.52 
 
 		 226 aa  66.2  0.0000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.545318  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1075  coenzyme A transferase, beta subunit  26.38 
 
 		 220 aa  65.9  0.0000000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.425854 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17560  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  28.7 
 
 		 202 aa  65.9  0.0000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1962  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  28.81 
 
 		 212 aa  64.7  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1562  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  29.26 
 
 		 213 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3983  coenzyme A transferase  30.77 
 
 		 254 aa  65.1  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1763  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  28.81 
 
 		 212 aa  64.7  0.000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.255353  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4273  coenzyme A transferase  29.63 
 
 		 673 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.335745  normal  0.912388 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4165  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  30.9 
 
 		 211 aa  64.7  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.829628  normal  0.185202 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1726  3-oxoacid CoA-transferase subunit B  25.86 
 
 		 213 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.445298  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4284  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  30.87 
 
 		 215 aa  63.9  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.18483 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0952  3-oxoacid CoA-transferase subunit B  25.86 
 
 		 213 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.334541  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1878  succinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase subunit B  25.86 
 
 		 213 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0343592  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0212  3-oxoacid CoA-transferase subunit B  25.86 
 
 		 213 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00734779  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1700  succinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase subunit B  25.86 
 
 		 213 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.375649  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1444  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  27.16 
 
 		 213 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.085725  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1549  3-oxoacid CoA-transferase subunit B  25.86 
 
 		 213 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1466  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  27.16 
 
 		 213 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>