206 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_1891 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_1891  glutaconate CoA-transferase  100 
 
 		 291 aa  602  1.0000000000000001e-171  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.514889  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12990  acyl CoA:acetate/3-ketoacid CoA transferase, beta subunit  44.98 
 
 		 259 aa  221  9e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2327  3-oxoadipate CoA-transferase  40.89 
 
 		 253 aa  207  2e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.656893 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1583  glutaconate CoA-transferase  41.87 
 
 		 269 aa  204  2e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.485468  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2284  coenzyme A transferase  42.91 
 
 		 251 aa  200  3e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.229004  normal  0.263478 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7929  3-oxoadipate CoA-transferase  40.98 
 
 		 251 aa  192  6e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.331501  normal  0.318258 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3922  coenzyme A transferase  41 
 
 		 271 aa  192  6e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1907  coenzyme A transferase  41.2 
 
 		 270 aa  191  1e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0720648 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4308  3-oxoadipate:succinyl-CoA transferase, subunit B  38.37 
 
 		 259 aa  189  5e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2836  coenzyme A transferase  41.42 
 
 		 251 aa  186  3e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.478676  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2560  coenzyme A transferase  40.87 
 
 		 264 aa  186  5e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4012  glutaconate CoA-transferase  38.37 
 
 		 259 aa  186  6e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0155612 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1268  coenzyme A transferase  38.37 
 
 		 259 aa  183  3e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38210  3-oxoadipate:succinyl-CoA transferase, subunit B  37.7 
 
 		 260 aa  178  9e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.305454  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3034  glutaconate CoA-transferase  37.69 
 
 		 275 aa  177  2e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2824  coenzyme A transferase  37.36 
 
 		 274 aa  177  2e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0809  glutaconate CoA-transferase  39.26 
 
 		 274 aa  176  3e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.402177 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1388  coenzyme A transferase  36.84 
 
 		 274 aa  176  4e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.939402 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0404  glutaconate CoA-transferase  38.4 
 
 		 269 aa  176  5e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00014468  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02770  putative CoA transferase, subunit B  36.84 
 
 		 260 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0187646 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0313  putative CoA transferase, subunit B  36.84 
 
 		 260 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4179  coenzyme A transferase  38.43 
 
 		 257 aa  172  3.9999999999999995e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1708  coenzyme A transferase  38.08 
 
 		 273 aa  172  5.999999999999999e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.993873 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5086  Glutaconate CoA-transferase  39.34 
 
 		 251 aa  168  1e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0300  coenzyme A transferase  36.59 
 
 		 258 aa  167  1e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.67113  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2824  coenzyme A transferase  35.51 
 
 		 256 aa  168  1e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1481  glutaconate CoA-transferase  38.93 
 
 		 271 aa  166  5.9999999999999996e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3047  coenzyme A transferase  32.95 
 
 		 277 aa  157  2e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.292404  normal  0.618767 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2697  coenzyme A transferase  36.33 
 
 		 269 aa  156  3e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1132  glutaconate CoA-transferase  36.76 
 
 		 260 aa  155  7e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0489191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1643  coenzyme A transferase  35.91 
 
 		 261 aa  154  2e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2127  Glutaconate CoA-transferase  36.4 
 
 		 281 aa  144  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2970  coenzyme A transferase  35.22 
 
 		 256 aa  132  5e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0885606  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5071  coenzyme A transferase  33.71 
 
 		 278 aa  128  1.0000000000000001e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.000546344  normal  0.377928 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4843  glutaconate CoA-transferase  33.07 
 
 		 286 aa  117  3e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.321655  normal  0.834327 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1039  putative coenzyme A transferase, subunit B  33.33 
 
 		 255 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000541022  normal  0.887029 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4812  glutaconate CoA-transferase  33.46 
 
 		 275 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0754543  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2497  coenzyme A transferase  30.2 
 
 		 590 aa  87  4e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.501333  normal  0.32873 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5133  coenzyme A transferase  31.07 
 
 		 255 aa  85.1  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3616  putative CoA transferase, subunit B  29.02 
 
 		 291 aa  84  0.000000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0480669  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1433  Acyl CoA-acetate/3-ketoacid CoA transferase beta subunit  27 
 
 		 265 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.276307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3752  Acyl CoA:acetate/3-ketoacid CoA transferase beta subunit-like protein  28.11 
 
 		 263 aa  81.3  0.00000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4599  putative CoA transferase, subunit B  29.32 
 
 		 255 aa  79.3  0.00000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3296  Acyl CoA:acetate/3-ketoacid CoA transferase beta subunit-like protein  27.1 
 
 		 265 aa  77  0.0000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.103743 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1379  coenzyme A transferase  27.69 
 
 		 252 aa  76.3  0.0000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.243531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2155  coenzyme A transferase  28.72 
 
 		 276 aa  76.3  0.0000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2805  coenzyme A transferase  27.45 
 
 		 243 aa  72.8  0.000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000176999 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2059  coenzyme A transferase  27.91 
 
 		 245 aa  72  0.00000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.581965  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1222  coenzyme A transferase  27.96 
 
 		 250 aa  71.2  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2606  coenzyme A transferase  27.27 
 
 		 243 aa  70.9  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1559  putative CoA transferase beta subunit  28.74 
 
 		 266 aa  69.3  0.00000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4620  coenzyme A transferase  30.38 
 
 		 255 aa  68.6  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1204  putative CoA transferase, subunit B  26.14 
 
 		 250 aa  68.2  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2745  putative CoA transferase beta subunit  31.41 
 
 		 256 aa  67.8  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2063  acyl CoA:acetate  29.68 
 
 		 286 aa  67  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1077  CoA transferase, subunit B  25.57 
 
 		 250 aa  67.4  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.400148 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07040  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  28.19 
 
 		 222 aa  61.6  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.238632 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2205  coenzyme A transferase  26.28 
 
 		 599 aa  61.2  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.401277  normal  0.0481798 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1306  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  26.36 
 
 		 453 aa  60.5  0.00000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2752  putative acyl CoA-acetate/3-ketoacid CoA transferase beta subunit, AtoA-like  25.1 
 
 		 312 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00379387  normal  0.241661 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_33142  3-oxoacid CoA-transferase Succinyl-CoA:alpha-ketoacid-CoA transferase  26.92 
 
 		 505 aa  59.3  0.00000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1164  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  25.9 
 
 		 229 aa  58.5  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3828  coenzyme A transferase  31.01 
 
 		 247 aa  58.2  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2760  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  25.65 
 
 		 213 aa  55.8  0.0000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2355  putative CoA transferase beta subunit  28.83 
 
 		 260 aa  55.8  0.0000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.168668  normal  0.0654278 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1367  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  25.65 
 
 		 213 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1889  putative glutaconate CoA-transferase, subunit B  27.98 
 
 		 248 aa  55.8  0.0000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.694614  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0350  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  26.34 
 
 		 223 aa  55.1  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0790399 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3983  coenzyme A transferase  26.86 
 
 		 254 aa  55.5  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1652  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  26.13 
 
 		 211 aa  55.1  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.200149  normal  0.0417322 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4284  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  26.09 
 
 		 215 aa  55.1  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.18483 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1982  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  26.13 
 
 		 211 aa  54.7  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2071  Acyl CoA:acetate/3-ketoacid CoA transferase beta subunit-like protein  26.44 
 
 		 264 aa  54.3  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2350  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  23.91 
 
 		 214 aa  54.3  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1350  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  27.06 
 
 		 228 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.596228 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1407  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  26.97 
 
 		 268 aa  53.9  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000217887 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1571  succinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase subunit B protein  26.67 
 
 		 212 aa  53.1  0.000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4552  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  27.06 
 
 		 209 aa  53.1  0.000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.208312  normal  1 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_23365  succinyl-coenzyme A:3-oxo-acid coenzyme a-transferase  25 
 
 		 511 aa  52.8  0.000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1572  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  24.66 
 
 		 213 aa  52.8  0.000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.494559 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2059  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  23.53 
 
 		 220 aa  52.8  0.000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2696  3-oxoacid CoA-transferase B subunit  28.18 
 
 		 448 aa  52.8  0.000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.494818  normal  0.507072 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1369  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  27.48 
 
 		 229 aa  52.4  0.000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1387  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  27.48 
 
 		 229 aa  52.4  0.000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.104007  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2114  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  27.16 
 
 		 220 aa  52.4  0.000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.300708  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4165  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  23.73 
 
 		 211 aa  52.4  0.000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.829628  normal  0.185202 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4265  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  24.77 
 
 		 212 aa  52.4  0.000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0745238  normal  0.356459 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0867  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  24.23 
 
 		 216 aa  52.4  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1476  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  23.4 
 
 		 219 aa  52  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.038287  normal  0.12448 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1962  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  24.77 
 
 		 212 aa  52  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1763  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  24.77 
 
 		 212 aa  52  0.00001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.255353  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12525  succinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase beta subunit scoB  25.22 
 
 		 218 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.288021  normal  0.0468104 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2124  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  24.11 
 
 		 211 aa  51.6  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1906  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  23.87 
 
 		 211 aa  50.4  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.750884 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1533  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  25.33 
 
 		 447 aa  50.4  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.172337 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1403  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  27.8 
 
 		 229 aa  50.8  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4355  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  24.46 
 
 		 218 aa  50.8  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2075  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  23.43 
 
 		 221 aa  50.1  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0809  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  26.22 
 
 		 209 aa  50.4  0.00004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0518  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  26.24 
 
 		 210 aa  49.7  0.00005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.19694 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>