211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_2560 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_2560  coenzyme A transferase  100 
 
 		 264 aa  544  1e-154  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1583  glutaconate CoA-transferase  41.37 
 
 		 269 aa  199  5e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.485468  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1891  glutaconate CoA-transferase  40.87 
 
 		 291 aa  186  4e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.514889  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12990  acyl CoA:acetate/3-ketoacid CoA transferase, beta subunit  39.3 
 
 		 259 aa  182  5.0000000000000004e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2284  coenzyme A transferase  37.35 
 
 		 251 aa  171  7.999999999999999e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.229004  normal  0.263478 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4308  3-oxoadipate:succinyl-CoA transferase, subunit B  36.51 
 
 		 259 aa  171  1e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4012  glutaconate CoA-transferase  36.9 
 
 		 259 aa  169  3e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0155612 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2327  3-oxoadipate CoA-transferase  36.22 
 
 		 253 aa  169  6e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.656893 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3922  coenzyme A transferase  36.29 
 
 		 271 aa  168  8e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7929  3-oxoadipate CoA-transferase  36.51 
 
 		 251 aa  167  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.331501  normal  0.318258 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2836  coenzyme A transferase  39.09 
 
 		 251 aa  167  2e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.478676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1268  coenzyme A transferase  36.11 
 
 		 259 aa  166  2e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38210  3-oxoadipate:succinyl-CoA transferase, subunit B  35.71 
 
 		 260 aa  164  2.0000000000000002e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.305454  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02770  putative CoA transferase, subunit B  36 
 
 		 260 aa  161  1e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0187646 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5086  Glutaconate CoA-transferase  37.75 
 
 		 251 aa  158  7e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0313  putative CoA transferase, subunit B  35.2 
 
 		 260 aa  158  9e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2824  coenzyme A transferase  33.6 
 
 		 256 aa  148  7e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0300  coenzyme A transferase  31.03 
 
 		 258 aa  148  8e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.67113  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1643  coenzyme A transferase  35.77 
 
 		 261 aa  147  1.0000000000000001e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3047  coenzyme A transferase  31.92 
 
 		 277 aa  147  2.0000000000000003e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.292404  normal  0.618767 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0809  glutaconate CoA-transferase  34.88 
 
 		 274 aa  144  1e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.402177 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2824  coenzyme A transferase  34.88 
 
 		 274 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4179  coenzyme A transferase  35.38 
 
 		 257 aa  140  1.9999999999999998e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2127  Glutaconate CoA-transferase  34.68 
 
 		 281 aa  140  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1708  coenzyme A transferase  35.27 
 
 		 273 aa  138  1e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.993873 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1388  coenzyme A transferase  34.11 
 
 		 274 aa  138  1e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.939402 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3034  glutaconate CoA-transferase  34.11 
 
 		 275 aa  137  1e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1907  coenzyme A transferase  33.95 
 
 		 270 aa  133  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0720648 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0404  glutaconate CoA-transferase  34.5 
 
 		 269 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00014468  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2697  coenzyme A transferase  34.57 
 
 		 269 aa  122  7e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1481  glutaconate CoA-transferase  32.7 
 
 		 271 aa  120  1.9999999999999998e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2970  coenzyme A transferase  32.56 
 
 		 256 aa  112  9e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0885606  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1132  glutaconate CoA-transferase  31.2 
 
 		 260 aa  108  1e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0489191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5071  coenzyme A transferase  27.92 
 
 		 278 aa  95.1  1e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.000546344  normal  0.377928 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1039  putative coenzyme A transferase, subunit B  29.18 
 
 		 255 aa  92.4  6e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000541022  normal  0.887029 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1222  coenzyme A transferase  32.95 
 
 		 250 aa  73.9  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3616  putative CoA transferase, subunit B  29.61 
 
 		 291 aa  73.6  0.000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0480669  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4843  glutaconate CoA-transferase  26.02 
 
 		 286 aa  73.2  0.000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.321655  normal  0.834327 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4812  glutaconate CoA-transferase  25.09 
 
 		 275 aa  72  0.000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0754543  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2059  coenzyme A transferase  25.5 
 
 		 245 aa  70.5  0.00000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.581965  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1204  putative CoA transferase, subunit B  30.43 
 
 		 250 aa  70.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1077  CoA transferase, subunit B  31.06 
 
 		 250 aa  68.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.400148 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2063  acyl CoA:acetate  27.94 
 
 		 286 aa  66.2  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4599  putative CoA transferase, subunit B  30 
 
 		 255 aa  64.7  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5133  coenzyme A transferase  26.88 
 
 		 255 aa  62.4  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1135  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  26.75 
 
 		 214 aa  60.8  0.00000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2497  coenzyme A transferase  28.57 
 
 		 590 aa  60.8  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.501333  normal  0.32873 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0211  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  26.89 
 
 		 216 aa  59.7  0.00000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2607  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase beta subunit  27.78 
 
 		 213 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2278  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  30.18 
 
 		 208 aa  59.3  0.00000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4620  coenzyme A transferase  26.95 
 
 		 255 aa  58.9  0.00000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1306  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  29.01 
 
 		 453 aa  58.2  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1783  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  27.38 
 
 		 213 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0830  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  24.39 
 
 		 218 aa  55.8  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.127359 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4611  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  28.23 
 
 		 213 aa  55.8  0.0000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00383872  normal  0.923474 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1572  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  31.13 
 
 		 213 aa  55.1  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.494559 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4552  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  27.81 
 
 		 209 aa  54.3  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.208312  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1379  coenzyme A transferase  29.27 
 
 		 252 aa  53.9  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.243531  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1107  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase beta subunit  26.59 
 
 		 213 aa  53.9  0.000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.485565  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1011  coenzyme A transferase  27.33 
 
 		 216 aa  53.5  0.000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.185512 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1878  succinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase subunit B  26.59 
 
 		 213 aa  53.9  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0343592  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1433  Acyl CoA-acetate/3-ketoacid CoA transferase beta subunit  27.17 
 
 		 265 aa  53.5  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.276307  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1549  3-oxoacid CoA-transferase subunit B  26.59 
 
 		 213 aa  53.9  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0212  3-oxoacid CoA-transferase subunit B  26.59 
 
 		 213 aa  53.9  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00734779  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1700  succinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase subunit B  26.59 
 
 		 213 aa  53.9  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.375649  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1726  3-oxoacid CoA-transferase subunit B  26.59 
 
 		 213 aa  53.9  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.445298  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0952  3-oxoacid CoA-transferase subunit B  26.59 
 
 		 213 aa  53.9  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.334541  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1391  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  27.53 
 
 		 213 aa  53.1  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.755461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1505  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  31.21 
 
 		 220 aa  53.1  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01940  3-oxoacid CoA-transferase subunit B family enzyme  29.11 
 
 		 217 aa  53.1  0.000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0468596  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0809  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  25.82 
 
 		 209 aa  53.1  0.000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0331  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  26.38 
 
 		 214 aa  53.5  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1444  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  28.23 
 
 		 213 aa  53.1  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.085725  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2004  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  26.79 
 
 		 239 aa  52.8  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.725633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0984  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  28.23 
 
 		 213 aa  53.1  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1466  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  28.23 
 
 		 213 aa  53.1  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02149  acetyl-CoA:acetoacetyl-CoA transferase, beta subunit  27.38 
 
 		 216 aa  52.8  0.000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.746207  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1436  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  27.38 
 
 		 216 aa  52.8  0.000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.633734  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3296  Acyl CoA:acetate/3-ketoacid CoA transferase beta subunit-like protein  26.24 
 
 		 265 aa  52.8  0.000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.103743 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0566  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  26.18 
 
 		 219 aa  52.8  0.000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2371  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  27.38 
 
 		 216 aa  52.8  0.000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0826912  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1367  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  26.27 
 
 		 213 aa  52.8  0.000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2363  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  27.38 
 
 		 216 aa  52.8  0.000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1428  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  27.38 
 
 		 216 aa  52.8  0.000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.773263  hitchhiker  0.000356142 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1350  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  26.92 
 
 		 228 aa  52.8  0.000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.596228 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2247  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  28.49 
 
 		 219 aa  52.8  0.000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02108  hypothetical protein  27.38 
 
 		 216 aa  52.8  0.000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.796966  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1889  putative glutaconate CoA-transferase, subunit B  26.01 
 
 		 248 aa  52.4  0.000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.694614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1164  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  25.29 
 
 		 229 aa  52.4  0.000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2760  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  27.02 
 
 		 213 aa  52.4  0.000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2124  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  24.6 
 
 		 211 aa  52.4  0.000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1533  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  26.78 
 
 		 447 aa  52  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.172337 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0591  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  27.81 
 
 		 217 aa  51.2  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07040  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  29.07 
 
 		 222 aa  51.6  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.238632 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1562  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  27.35 
 
 		 213 aa  51.6  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3848  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  27.75 
 
 		 215 aa  51.6  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0238959  normal  0.733298 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2491  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  27.68 
 
 		 219 aa  51.2  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000498099 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1571  succinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase subunit B protein  26.79 
 
 		 212 aa  51.2  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1471  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  27.27 
 
 		 219 aa  51.2  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.155964  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1909  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  27.38 
 
 		 219 aa  51.2  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>