61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_4599 on replicon NC_008688
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008688  Pden_4599  putative CoA transferase, subunit B  100 
 
 		 255 aa  510  1e-144  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5133  coenzyme A transferase  72.98 
 
 		 255 aa  367  1e-101  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1222  coenzyme A transferase  69.76 
 
 		 250 aa  330  2e-89  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1077  CoA transferase, subunit B  67.33 
 
 		 250 aa  318  6e-86  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.400148 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1204  putative CoA transferase, subunit B  66.53 
 
 		 250 aa  316  3e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3616  putative CoA transferase, subunit B  70.56 
 
 		 291 aa  313  1.9999999999999998e-84  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0480669  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2970  coenzyme A transferase  33.2 
 
 		 256 aa  104  1e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0885606  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2284  coenzyme A transferase  34.45 
 
 		 251 aa  93.2  4e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.229004  normal  0.263478 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0313  putative CoA transferase, subunit B  31.96 
 
 		 260 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02770  putative CoA transferase, subunit B  31.96 
 
 		 260 aa  90.1  3e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0187646 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1471  coenzyme A transferase  30.77 
 
 		 239 aa  89  7e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.60655  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38210  3-oxoadipate:succinyl-CoA transferase, subunit B  30.28 
 
 		 260 aa  87.8  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.305454  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0404  glutaconate CoA-transferase  30.34 
 
 		 269 aa  87.4  2e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00014468  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1889  putative glutaconate CoA-transferase, subunit B  30.94 
 
 		 248 aa  85.9  6e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.694614  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3922  coenzyme A transferase  35.53 
 
 		 271 aa  85.5  7e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1268  coenzyme A transferase  30.73 
 
 		 259 aa  85.5  8e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1039  putative coenzyme A transferase, subunit B  32.24 
 
 		 255 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000541022  normal  0.887029 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0300  coenzyme A transferase  33.99 
 
 		 258 aa  84.3  0.000000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.67113  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4012  glutaconate CoA-transferase  29.82 
 
 		 259 aa  83.2  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0155612 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1907  coenzyme A transferase  31.71 
 
 		 270 aa  82.4  0.000000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0720648 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5071  coenzyme A transferase  32.75 
 
 		 278 aa  80.9  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.000546344  normal  0.377928 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4812  glutaconate CoA-transferase  35.8 
 
 		 275 aa  80.9  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0754543  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4308  3-oxoadipate:succinyl-CoA transferase, subunit B  29.36 
 
 		 259 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1583  glutaconate CoA-transferase  32.1 
 
 		 269 aa  80.1  0.00000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.485468  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7929  3-oxoadipate CoA-transferase  35.8 
 
 		 251 aa  79.3  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.331501  normal  0.318258 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1891  glutaconate CoA-transferase  29.32 
 
 		 291 aa  79.3  0.00000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.514889  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2836  coenzyme A transferase  31.78 
 
 		 251 aa  79  0.00000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.478676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4843  glutaconate CoA-transferase  34.57 
 
 		 286 aa  78.6  0.0000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.321655  normal  0.834327 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2059  coenzyme A transferase  27.31 
 
 		 245 aa  78.2  0.0000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.581965  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2824  coenzyme A transferase  28.31 
 
 		 256 aa  78.6  0.0000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0809  glutaconate CoA-transferase  32.02 
 
 		 274 aa  76.3  0.0000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.402177 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2327  3-oxoadipate CoA-transferase  33.13 
 
 		 253 aa  76.3  0.0000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.656893 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3034  glutaconate CoA-transferase  27.31 
 
 		 275 aa  76.6  0.0000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2497  coenzyme A transferase  27.24 
 
 		 590 aa  75.1  0.0000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.501333  normal  0.32873 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12990  acyl CoA:acetate/3-ketoacid CoA transferase, beta subunit  29.58 
 
 		 259 aa  75.1  0.000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1643  coenzyme A transferase  27.08 
 
 		 261 aa  74.7  0.000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2697  coenzyme A transferase  26.88 
 
 		 269 aa  72.4  0.000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4179  coenzyme A transferase  29.51 
 
 		 257 aa  72  0.000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2824  coenzyme A transferase  25.3 
 
 		 274 aa  71.2  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1708  coenzyme A transferase  25.3 
 
 		 273 aa  69.7  0.00000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.993873 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1388  coenzyme A transferase  27.93 
 
 		 274 aa  70.1  0.00000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.939402 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1379  coenzyme A transferase  29.17 
 
 		 252 aa  69.7  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.243531  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2745  putative CoA transferase beta subunit  31.61 
 
 		 256 aa  67  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1481  glutaconate CoA-transferase  29.88 
 
 		 271 aa  66.6  0.0000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2127  Glutaconate CoA-transferase  28.52 
 
 		 281 aa  66.2  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2560  coenzyme A transferase  30 
 
 		 264 aa  64.7  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3047  coenzyme A transferase  29.09 
 
 		 277 aa  65.1  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.292404  normal  0.618767 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2805  coenzyme A transferase  32.26 
 
 		 243 aa  62.4  0.000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000176999 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1132  glutaconate CoA-transferase  26.32 
 
 		 260 aa  59.7  0.00000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0489191  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5086  Glutaconate CoA-transferase  33.33 
 
 		 251 aa  58.9  0.00000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2063  acyl CoA:acetate  31.01 
 
 		 286 aa  58.9  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3828  coenzyme A transferase  33.33 
 
 		 247 aa  58.5  0.00000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2606  coenzyme A transferase  31.37 
 
 		 243 aa  55.5  0.0000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4620  coenzyme A transferase  26.22 
 
 		 255 aa  50.8  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2155  coenzyme A transferase  28.32 
 
 		 276 aa  50.1  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3752  Acyl CoA:acetate/3-ketoacid CoA transferase beta subunit-like protein  25.83 
 
 		 263 aa  49.3  0.00006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2355  putative CoA transferase beta subunit  28.7 
 
 		 260 aa  47.8  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.168668  normal  0.0654278 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2071  Acyl CoA:acetate/3-ketoacid CoA transferase beta subunit-like protein  29.81 
 
 		 264 aa  43.5  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1541  coenzyme A transferase  32.28 
 
 		 508 aa  42.7  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1433  Acyl CoA-acetate/3-ketoacid CoA transferase beta subunit  26.79 
 
 		 265 aa  42.7  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.276307  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2487  coenzyme A transferase  32.35 
 
 		 522 aa  42  0.01  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>