More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_1541 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_1541  coenzyme A transferase  100 
 
 		 508 aa  1005    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1555  coenzyme A transferase  44.44 
 
 		 532 aa  395  1e-108  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.431711  normal  0.989893 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0549  coenzyme A transferase  42.12 
 
 		 663 aa  349  6e-95  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2599  propionate CoA-transferase  39.2 
 
 		 524 aa  348  2e-94  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0767  coenzyme A transferase  42.59 
 
 		 650 aa  345  1e-93  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1267  coenzyme A transferase  40.84 
 
 		 666 aa  344  2e-93  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2996  coenzyme A transferase  40.96 
 
 		 663 aa  342  8e-93  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0091  propionate CoA-transferase  39.69 
 
 		 516 aa  340  5e-92  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3173  coenzyme A transferase  38.8 
 
 		 539 aa  339  7e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0872  coenzyme A transferase  39.19 
 
 		 533 aa  339  7e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3570  coenzyme A transferase  40.23 
 
 		 532 aa  338  9.999999999999999e-92  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.276988  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2047  acetyl-CoA-transferase subunit, putative  38.79 
 
 		 533 aa  337  2.9999999999999997e-91  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2224  coenzyme A transferase  38.07 
 
 		 531 aa  337  2.9999999999999997e-91  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.220629  normal  0.779665 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0457  propionate CoA-transferase  39.5 
 
 		 667 aa  336  5e-91  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.460217  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2401  coenzyme A transferase  42.55 
 
 		 670 aa  335  2e-90  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.706144 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2684  coenzyme A transferase  40.35 
 
 		 646 aa  332  7.000000000000001e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3939  propionate CoA-transferase  38.1 
 
 		 523 aa  332  1e-89  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.438749 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3438  coenzyme A transferase  42.44 
 
 		 633 aa  331  2e-89  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1494  propionate CoA-transferase  41.49 
 
 		 669 aa  330  4e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1479  coenzyme A transferase  37.91 
 
 		 537 aa  330  5.0000000000000004e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.241297  normal  0.56391 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0782  coenzyme A transferase  41.55 
 
 		 667 aa  330  5.0000000000000004e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1163  coenzyme A transferase  40.58 
 
 		 526 aa  329  8e-89  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.244215  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3933  coenzyme A transferase  40.58 
 
 		 526 aa  329  8e-89  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.60446  normal  0.509869 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0883  coenzyme A transferase  41.39 
 
 		 509 aa  328  1.0000000000000001e-88  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.021218  normal  0.461656 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0354  coenzyme A transferase  38.9 
 
 		 660 aa  328  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0326072  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3022  coenzyme A transferase  36.87 
 
 		 521 aa  327  4.0000000000000003e-88  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.119963 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1859  propionate CoA-transferase  38.89 
 
 		 544 aa  327  4.0000000000000003e-88  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.155788  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2487  coenzyme A transferase  43.12 
 
 		 522 aa  326  5e-88  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4273  coenzyme A transferase  40.49 
 
 		 673 aa  325  1e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.335745  normal  0.912388 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2071  coenzyme A transferase  38.33 
 
 		 660 aa  325  1e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.10059 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1595  coenzyme A transferase  40.69 
 
 		 663 aa  325  2e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0936861  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6427  propionate CoA-transferase  40.46 
 
 		 522 aa  324  3e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.395247  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2345  coenzyme A transferase  38.14 
 
 		 660 aa  323  6e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.41755 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1375  coenzyme A transferase  38.27 
 
 		 539 aa  322  8e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2031  coenzyme A transferase  37.95 
 
 		 660 aa  322  9.000000000000001e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.287187 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0651  coenzyme A transferase  38.81 
 
 		 542 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.364545  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0709  acyl CoA:acetate/3-ketoacid CoA transferase, alpha and beta subunit  41.75 
 
 		 648 aa  320  3.9999999999999996e-86  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1212  coenzyme A transferase  40.45 
 
 		 523 aa  319  7e-86  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1259  propionate CoA-transferase  37.38 
 
 		 527 aa  318  2e-85  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00406341 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4049  propionate CoA-transferase  39.34 
 
 		 542 aa  316  8e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4180  coenzyme A transferase  40.98 
 
 		 520 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.307102  hitchhiker  0.000449682 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3536  acetate/3-ketoacid CoA transferase  37.09 
 
 		 529 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3280  coenzyme A transferase  38.95 
 
 		 522 aa  309  5.9999999999999995e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1337  coenzyme A transferase  39.15 
 
 		 526 aa  309  8e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.132649 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2700  coenzyme A transferase  39.09 
 
 		 526 aa  305  1.0000000000000001e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.517315  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4742  CoA-transferase  38.93 
 
 		 513 aa  303  3.0000000000000004e-81  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.213334  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1948  coenzyme A transferase  36.28 
 
 		 531 aa  300  3e-80  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0367833  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8049  coenzyme A transferase  38.54 
 
 		 530 aa  300  3e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.205109  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1502  propionate CoA-transferase  36.28 
 
 		 531 aa  300  4e-80  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00752619 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2410  propionate CoA-transferase  36.28 
 
 		 531 aa  300  4e-80  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.407987 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1937  coenzyme A transferase  36.08 
 
 		 531 aa  299  9e-80  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00260164 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01663  fused predicted acetyl-CoA:acetoacetyl-CoA transferase: alpha subunit/beta subunit  36.08 
 
 		 531 aa  298  1e-79  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01652  hypothetical protein  36.08 
 
 		 531 aa  298  1e-79  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1815  propionate CoA-transferase  35.82 
 
 		 531 aa  297  3e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.590331  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1986  propionate CoA-transferase  35.82 
 
 		 531 aa  296  4e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000465126 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1469  propionate CoA-transferase  35.82 
 
 		 531 aa  296  4e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.442461  normal  0.0256592 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1453  propionate CoA-transferase  35.82 
 
 		 531 aa  296  4e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.298558  normal  0.217975 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1897  propionate CoA-transferase  35.89 
 
 		 531 aa  296  6e-79  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.951112  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1910  CoA-transferase  35.89 
 
 		 531 aa  296  7e-79  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1488  propionate CoA-transferase  35.63 
 
 		 531 aa  295  2e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.361869  hitchhiker  0.00740492 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1387  coenzyme A transferase  35.32 
 
 		 531 aa  293  4e-78  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4451  CoA-transferase  39.55 
 
 		 513 aa  288  2e-76  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000533967  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4678  CoA-transferase  38.93 
 
 		 513 aa  287  4e-76  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.696656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4768  CoA-transferase  39.34 
 
 		 513 aa  287  4e-76  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0105899  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04073  putative acetyl-CoA:acetoacetyl-CoA transferase  39.14 
 
 		 513 aa  285  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.544432  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04035  hypothetical protein  39.14 
 
 		 513 aa  285  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.566302  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_21350  predicted protein  37.19 
 
 		 557 aa  277  3e-73  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00403963  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0471  putative transferase protein  37.55 
 
 		 553 aa  267  4e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0346  coenzyme A transferase  37.39 
 
 		 554 aa  267  4e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0361  coenzyme A transferase  36.82 
 
 		 554 aa  251  2e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1547  coenzyme A transferase  38.61 
 
 		 433 aa  250  4e-65  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2585  propionate CoA-transferase  36.12 
 
 		 547 aa  242  9e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.206611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0421  coenzyme A transferase  32.72 
 
 		 543 aa  223  4.9999999999999996e-57  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.521688  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0887  coenzyme A transferase  32.68 
 
 		 543 aa  218  2e-55  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.499816  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0263  coenzyme A transferase  33.14 
 
 		 544 aa  215  9.999999999999999e-55  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0219  coenzyme A transferase  32.27 
 
 		 520 aa  197  4.0000000000000005e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0225  coenzyme A transferase  32.27 
 
 		 520 aa  197  4.0000000000000005e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2696  3-oxoacid CoA-transferase B subunit  25.96 
 
 		 448 aa  89.4  2e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.494818  normal  0.507072 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1306  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  27.33 
 
 		 453 aa  79.7  0.0000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09394  coenzyme A transferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G04030)  25.58 
 
 		 439 aa  72.4  0.00000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.504569  normal  0.0471262 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1533  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  26.69 
 
 		 447 aa  72  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.172337 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1856  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  31.65 
 
 		 222 aa  70.9  0.00000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1075  coenzyme A transferase, beta subunit  30.67 
 
 		 220 aa  68.9  0.0000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.425854 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_33142  3-oxoacid CoA-transferase Succinyl-CoA:alpha-ketoacid-CoA transferase  23.32 
 
 		 505 aa  68.2  0.0000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02149  acetyl-CoA:acetoacetyl-CoA transferase, beta subunit  28.86 
 
 		 216 aa  63.2  0.00000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.746207  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1436  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  28.86 
 
 		 216 aa  63.2  0.00000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.633734  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1428  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  28.86 
 
 		 216 aa  63.2  0.00000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.773263  hitchhiker  0.000356142 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05860  Succinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase, putative  26.34 
 
 		 561 aa  63.2  0.00000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.124065  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1021  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  27.94 
 
 		 463 aa  63.2  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2371  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  28.86 
 
 		 216 aa  63.2  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0826912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2363  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  28.86 
 
 		 216 aa  63.2  0.00000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02108  hypothetical protein  28.86 
 
 		 216 aa  63.2  0.00000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.796966  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4028  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  29.67 
 
 		 224 aa  62  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4140  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  29.67 
 
 		 224 aa  62  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.700414  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3848  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  28.05 
 
 		 233 aa  62.4  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1161  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  30.35 
 
 		 215 aa  62  0.00000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0830  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  30.3 
 
 		 218 aa  61.6  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.127359 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4594  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  30 
 
 		 228 aa  60.8  0.00000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3170  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  30.24 
 
 		 215 aa  60.8  0.00000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0211  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  29.28 
 
 		 216 aa  60.1  0.0000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>