More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_C6427 on replicon NC_007336
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_1337  coenzyme A transferase  66.67 
 
 		 526 aa  701    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.132649 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6427  propionate CoA-transferase  100 
 
 		 522 aa  1062    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.395247  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8049  coenzyme A transferase  62.69 
 
 		 530 aa  668    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.205109  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3280  coenzyme A transferase  67.12 
 
 		 522 aa  701    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4049  propionate CoA-transferase  43.64 
 
 		 542 aa  380  1e-104  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2599  propionate CoA-transferase  40.38 
 
 		 524 aa  374  1e-102  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0549  coenzyme A transferase  41.71 
 
 		 663 aa  364  2e-99  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0354  coenzyme A transferase  40.8 
 
 		 660 aa  358  9e-98  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0326072  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4273  coenzyme A transferase  38.93 
 
 		 673 aa  358  1.9999999999999998e-97  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.335745  normal  0.912388 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0457  propionate CoA-transferase  40.19 
 
 		 667 aa  355  8.999999999999999e-97  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.460217  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2031  coenzyme A transferase  40.42 
 
 		 660 aa  352  1e-95  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.287187 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1212  coenzyme A transferase  41.09 
 
 		 523 aa  352  1e-95  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0782  coenzyme A transferase  42.02 
 
 		 667 aa  351  2e-95  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2684  coenzyme A transferase  39.66 
 
 		 646 aa  349  7e-95  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3570  coenzyme A transferase  39.16 
 
 		 532 aa  349  8e-95  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.276988  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3022  coenzyme A transferase  39.46 
 
 		 521 aa  348  9e-95  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.119963 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2071  coenzyme A transferase  40.23 
 
 		 660 aa  349  9e-95  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.10059 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1937  coenzyme A transferase  39.39 
 
 		 531 aa  347  2e-94  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00260164 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1453  propionate CoA-transferase  40.2 
 
 		 531 aa  348  2e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.298558  normal  0.217975 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1986  propionate CoA-transferase  40.2 
 
 		 531 aa  348  2e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000465126 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1469  propionate CoA-transferase  40.2 
 
 		 531 aa  348  2e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.442461  normal  0.0256592 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01663  fused predicted acetyl-CoA:acetoacetyl-CoA transferase: alpha subunit/beta subunit  39.39 
 
 		 531 aa  347  3e-94  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2345  coenzyme A transferase  40.12 
 
 		 660 aa  347  3e-94  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.41755 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01652  hypothetical protein  39.39 
 
 		 531 aa  347  3e-94  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1815  propionate CoA-transferase  40.2 
 
 		 531 aa  347  3e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.590331  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1502  propionate CoA-transferase  39.39 
 
 		 531 aa  346  6e-94  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00752619 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1948  coenzyme A transferase  39.19 
 
 		 531 aa  346  7e-94  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0367833  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1488  propionate CoA-transferase  40 
 
 		 531 aa  346  7e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.361869  hitchhiker  0.00740492 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2410  propionate CoA-transferase  39.19 
 
 		 531 aa  344  2e-93  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.407987 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1595  coenzyme A transferase  38.71 
 
 		 663 aa  343  4e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0936861  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0767  coenzyme A transferase  40.53 
 
 		 650 aa  342  7e-93  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2401  coenzyme A transferase  40.57 
 
 		 670 aa  342  7e-93  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.706144 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1910  CoA-transferase  38.99 
 
 		 531 aa  342  1e-92  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2224  coenzyme A transferase  37.26 
 
 		 531 aa  342  1e-92  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.220629  normal  0.779665 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1555  coenzyme A transferase  39.51 
 
 		 532 aa  341  2e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.431711  normal  0.989893 
 
 
-
 
NC_004310  BR2047  acetyl-CoA-transferase subunit, putative  36.88 
 
 		 533 aa  340  2.9999999999999998e-92  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3173  coenzyme A transferase  37.67 
 
 		 539 aa  340  2.9999999999999998e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1897  propionate CoA-transferase  38.79 
 
 		 531 aa  340  2.9999999999999998e-92  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.951112  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2700  coenzyme A transferase  39.67 
 
 		 526 aa  340  4e-92  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.517315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0872  coenzyme A transferase  36.12 
 
 		 533 aa  339  9e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1387  coenzyme A transferase  38.31 
 
 		 531 aa  337  1.9999999999999998e-91  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1267  coenzyme A transferase  37.62 
 
 		 666 aa  332  8e-90  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0091  propionate CoA-transferase  38.46 
 
 		 516 aa  330  3e-89  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1494  propionate CoA-transferase  38.26 
 
 		 669 aa  329  7e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3438  coenzyme A transferase  40.23 
 
 		 633 aa  329  8e-89  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1375  coenzyme A transferase  36.76 
 
 		 539 aa  328  2.0000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1479  coenzyme A transferase  36.05 
 
 		 537 aa  326  6e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.241297  normal  0.56391 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2487  coenzyme A transferase  38.36 
 
 		 522 aa  324  2e-87  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1163  coenzyme A transferase  38.05 
 
 		 526 aa  323  4e-87  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.244215  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3933  coenzyme A transferase  38.05 
 
 		 526 aa  323  4e-87  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.60446  normal  0.509869 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1259  propionate CoA-transferase  37.55 
 
 		 527 aa  323  5e-87  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00406341 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0651  coenzyme A transferase  37.64 
 
 		 542 aa  322  9.999999999999999e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.364545  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3536  acetate/3-ketoacid CoA transferase  37.09 
 
 		 529 aa  320  3e-86  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0709  acyl CoA:acetate/3-ketoacid CoA transferase, alpha and beta subunit  39.92 
 
 		 648 aa  319  7e-86  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1859  propionate CoA-transferase  37.15 
 
 		 544 aa  317  3e-85  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.155788  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2996  coenzyme A transferase  38.27 
 
 		 663 aa  315  1.9999999999999998e-84  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1541  coenzyme A transferase  40.46 
 
 		 508 aa  310  4e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0883  coenzyme A transferase  39.22 
 
 		 509 aa  309  6.999999999999999e-83  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.021218  normal  0.461656 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3939  propionate CoA-transferase  37.02 
 
 		 523 aa  301  2e-80  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.438749 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0471  putative transferase protein  37.66 
 
 		 553 aa  298  1e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4180  coenzyme A transferase  38.05 
 
 		 520 aa  298  1e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.307102  hitchhiker  0.000449682 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2585  propionate CoA-transferase  36.92 
 
 		 547 aa  293  5e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.206611  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4742  CoA-transferase  36.26 
 
 		 513 aa  289  7e-77  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.213334  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0346  coenzyme A transferase  36.02 
 
 		 554 aa  289  8e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0361  coenzyme A transferase  36.25 
 
 		 554 aa  287  2.9999999999999996e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4678  CoA-transferase  35.95 
 
 		 513 aa  274  3e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.696656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4768  CoA-transferase  35.95 
 
 		 513 aa  273  4.0000000000000004e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0105899  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04073  putative acetyl-CoA:acetoacetyl-CoA transferase  35.76 
 
 		 513 aa  273  5.000000000000001e-72  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.544432  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04035  hypothetical protein  35.76 
 
 		 513 aa  273  5.000000000000001e-72  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.566302  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1547  coenzyme A transferase  36.82 
 
 		 433 aa  271  2e-71  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4451  CoA-transferase  35.56 
 
 		 513 aa  268  1e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000533967  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0263  coenzyme A transferase  36.09 
 
 		 544 aa  261  3e-68  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_21350  predicted protein  34.48 
 
 		 557 aa  256  6e-67  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00403963  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0887  coenzyme A transferase  36.35 
 
 		 543 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.499816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0421  coenzyme A transferase  35.1 
 
 		 543 aa  253  8.000000000000001e-66  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.521688  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0225  coenzyme A transferase  31.77 
 
 		 520 aa  235  1.0000000000000001e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0219  coenzyme A transferase  31.77 
 
 		 520 aa  235  1.0000000000000001e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1306  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  27.88 
 
 		 453 aa  95.5  2e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2696  3-oxoacid CoA-transferase B subunit  28.5 
 
 		 448 aa  86.3  0.000000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.494818  normal  0.507072 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_33142  3-oxoacid CoA-transferase Succinyl-CoA:alpha-ketoacid-CoA transferase  21.85 
 
 		 505 aa  74.3  0.000000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1021  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  25.06 
 
 		 463 aa  70.5  0.00000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1533  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  27.07 
 
 		 447 aa  69.7  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.172337 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2608  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  27.31 
 
 		 235 aa  68.6  0.0000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.357891 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0212  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  25.29 
 
 		 217 aa  68.2  0.0000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4337  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  27.24 
 
 		 269 aa  65.9  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0765282  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1406  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  28.78 
 
 		 255 aa  65.5  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000850531 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2658  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  26.8 
 
 		 272 aa  66.2  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1108  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase alpha subunit  26.95 
 
 		 234 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.356707  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1699  3-oxoacid CoA-transferase subunit A  26.95 
 
 		 234 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.288367  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1725  3-oxoacid CoA-transferase subunit A  26.95 
 
 		 234 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.796955  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0951  3-oxoacid CoA-transferase subunit A  26.95 
 
 		 234 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0890692  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0213  3-oxoacid CoA-transferase subunit A  26.95 
 
 		 234 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0677248  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1550  3-oxoacid CoA-transferase subunit A  26.95 
 
 		 234 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_23365  succinyl-coenzyme A:3-oxo-acid coenzyme a-transferase  23.62 
 
 		 511 aa  64.7  0.000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1984  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  24.9 
 
 		 233 aa  64.7  0.000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00015466 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1877  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase alpha subunit  26.95 
 
 		 234 aa  64.3  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0683608  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08500  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  26.07 
 
 		 259 aa  64.3  0.000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.494503 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3273  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  25 
 
 		 225 aa  63.5  0.000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09394  coenzyme A transferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G04030)  26.3 
 
 		 439 aa  62.8  0.00000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.504569  normal  0.0471262 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1570  fesuccinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase subunit A protein  26.56 
 
 		 232 aa  62.4  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>