More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_1375 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_2224  coenzyme A transferase  67.49 
 
 
531 aa  756    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.220629  normal  0.779665 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1375  coenzyme A transferase  100 
 
 
539 aa  1100    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR2047  acetyl-CoA-transferase subunit, putative  85.9 
 
 
533 aa  933    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1479  coenzyme A transferase  92.92 
 
 
537 aa  991    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.241297  normal  0.56391 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0872  coenzyme A transferase  86.84 
 
 
533 aa  942    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3939  propionate CoA-transferase  65.26 
 
 
523 aa  685    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.438749 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3173  coenzyme A transferase  84.04 
 
 
539 aa  934    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0651  coenzyme A transferase  64.22 
 
 
542 aa  659    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.364545  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3570  coenzyme A transferase  65.78 
 
 
532 aa  711    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.276988  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1859  propionate CoA-transferase  59.66 
 
 
544 aa  632  1e-180  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.155788  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4049  propionate CoA-transferase  42.02 
 
 
542 aa  398  1e-109  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2487  coenzyme A transferase  43.21 
 
 
522 aa  394  1e-108  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3022  coenzyme A transferase  43.02 
 
 
521 aa  390  1e-107  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.119963 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1267  coenzyme A transferase  40.49 
 
 
666 aa  371  1e-101  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01663  fused predicted acetyl-CoA:acetoacetyl-CoA transferase: alpha subunit/beta subunit  39.5 
 
 
531 aa  368  1e-100  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1948  coenzyme A transferase  39.5 
 
 
531 aa  366  1e-100  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0367833  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1986  propionate CoA-transferase  39.12 
 
 
531 aa  365  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000465126 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0457  propionate CoA-transferase  40.11 
 
 
667 aa  367  1e-100  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.460217  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1910  CoA-transferase  39.81 
 
 
531 aa  367  1e-100  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0549  coenzyme A transferase  41.1 
 
 
663 aa  369  1e-100  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2410  propionate CoA-transferase  39.5 
 
 
531 aa  367  1e-100  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.407987 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0767  coenzyme A transferase  40.64 
 
 
650 aa  366  1e-100  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1937  coenzyme A transferase  39.5 
 
 
531 aa  367  1e-100  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00260164 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01652  hypothetical protein  39.5 
 
 
531 aa  368  1e-100  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1453  propionate CoA-transferase  39.12 
 
 
531 aa  365  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.298558  normal  0.217975 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1469  propionate CoA-transferase  39.12 
 
 
531 aa  365  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.442461  normal  0.0256592 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1502  propionate CoA-transferase  39.5 
 
 
531 aa  366  1e-100  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00752619 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1815  propionate CoA-transferase  39.12 
 
 
531 aa  365  1e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.590331  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1488  propionate CoA-transferase  39.12 
 
 
531 aa  365  1e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.361869  hitchhiker  0.00740492 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3438  coenzyme A transferase  40 
 
 
633 aa  364  2e-99  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1897  propionate CoA-transferase  39.31 
 
 
531 aa  363  5.0000000000000005e-99  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.951112  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0782  coenzyme A transferase  41.78 
 
 
667 aa  361  1e-98  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0091  propionate CoA-transferase  40.5 
 
 
516 aa  362  1e-98  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0354  coenzyme A transferase  40.2 
 
 
660 aa  361  2e-98  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0326072  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2345  coenzyme A transferase  40.5 
 
 
660 aa  360  4e-98  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.41755 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2031  coenzyme A transferase  40.46 
 
 
660 aa  359  8e-98  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.287187 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2071  coenzyme A transferase  40.5 
 
 
660 aa  359  8e-98  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.10059 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1387  coenzyme A transferase  38.48 
 
 
531 aa  357  3.9999999999999996e-97  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2996  coenzyme A transferase  39.31 
 
 
663 aa  356  6.999999999999999e-97  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1595  coenzyme A transferase  39.66 
 
 
663 aa  355  1e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0936861  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1555  coenzyme A transferase  39.07 
 
 
532 aa  354  2.9999999999999997e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.431711  normal  0.989893 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4273  coenzyme A transferase  38.48 
 
 
673 aa  354  2.9999999999999997e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.335745  normal  0.912388 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2401  coenzyme A transferase  40.15 
 
 
670 aa  353  4e-96  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.706144 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1259  propionate CoA-transferase  39.17 
 
 
527 aa  353  5.9999999999999994e-96  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00406341 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1163  coenzyme A transferase  40 
 
 
526 aa  352  8e-96  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.244215  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3933  coenzyme A transferase  40 
 
 
526 aa  352  8e-96  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.60446  normal  0.509869 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2684  coenzyme A transferase  40.39 
 
 
646 aa  350  5e-95  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1494  propionate CoA-transferase  39.92 
 
 
669 aa  349  8e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2599  propionate CoA-transferase  37.9 
 
 
524 aa  349  9e-95  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0709  acyl CoA:acetate/3-ketoacid CoA transferase, alpha and beta subunit  39.66 
 
 
648 aa  345  1e-93  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1337  coenzyme A transferase  39.09 
 
 
526 aa  345  1e-93  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.132649 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8049  coenzyme A transferase  40 
 
 
530 aa  345  2e-93  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.205109  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3280  coenzyme A transferase  39.09 
 
 
522 aa  343  4e-93  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6427  propionate CoA-transferase  37.33 
 
 
522 aa  343  5e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.395247  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2700  coenzyme A transferase  38.43 
 
 
526 aa  341  2e-92  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.517315  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3536  acetate/3-ketoacid CoA transferase  36.5 
 
 
529 aa  339  9e-92  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1212  coenzyme A transferase  39 
 
 
523 aa  336  5e-91  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1541  coenzyme A transferase  38.77 
 
 
508 aa  334  3e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4742  CoA-transferase  39.62 
 
 
513 aa  325  1e-87  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.213334  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4180  coenzyme A transferase  39.92 
 
 
520 aa  318  2e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.307102  hitchhiker  0.000449682 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4768  CoA-transferase  39.42 
 
 
513 aa  311  2e-83  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0105899  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0883  coenzyme A transferase  37.98 
 
 
509 aa  311  2e-83  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.021218  normal  0.461656 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4678  CoA-transferase  39.42 
 
 
513 aa  310  5e-83  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.696656  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04073  putative acetyl-CoA:acetoacetyl-CoA transferase  39.23 
 
 
513 aa  309  8e-83  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.544432  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04035  hypothetical protein  39.23 
 
 
513 aa  309  8e-83  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.566302  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4451  CoA-transferase  39.23 
 
 
513 aa  309  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000533967  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0346  coenzyme A transferase  35.51 
 
 
554 aa  298  2e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0263  coenzyme A transferase  37.2 
 
 
544 aa  297  4e-79  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2585  propionate CoA-transferase  34.18 
 
 
547 aa  291  2e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.206611  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0361  coenzyme A transferase  35.26 
 
 
554 aa  291  2e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0471  putative transferase protein  34.72 
 
 
553 aa  288  2e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0421  coenzyme A transferase  34.69 
 
 
543 aa  285  1.0000000000000001e-75  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.521688  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0219  coenzyme A transferase  35.04 
 
 
520 aa  283  8.000000000000001e-75  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0225  coenzyme A transferase  35.04 
 
 
520 aa  283  8.000000000000001e-75  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0887  coenzyme A transferase  34.48 
 
 
543 aa  273  8.000000000000001e-72  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.499816  normal 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_21350  predicted protein  35.44 
 
 
557 aa  271  2e-71  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00403963  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1547  coenzyme A transferase  36.05 
 
 
433 aa  269  8.999999999999999e-71  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09394  coenzyme A transferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G04030)  27.67 
 
 
439 aa  92  2e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.504569  normal  0.0471262 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1855  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  30.12 
 
 
217 aa  80.9  0.00000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.945952 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2696  3-oxoacid CoA-transferase B subunit  24.19 
 
 
448 aa  80.5  0.00000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.494818  normal  0.507072 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1306  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  25.1 
 
 
453 aa  78.6  0.0000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_33142  3-oxoacid CoA-transferase Succinyl-CoA:alpha-ketoacid-CoA transferase  22.47 
 
 
505 aa  78.6  0.0000000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1533  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  27.02 
 
 
447 aa  75.9  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.172337 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1021  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  22.84 
 
 
463 aa  75.1  0.000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3273  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  27.82 
 
 
225 aa  70.9  0.00000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5020  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  27.69 
 
 
249 aa  70.1  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.363473  normal 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05860  Succinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase, putative  24.44 
 
 
561 aa  69.3  0.0000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.124065  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10495  coenzyme A transferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G04120)  22.97 
 
 
506 aa  67.8  0.0000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00529511  normal  0.309681 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1136  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  26.38 
 
 
217 aa  67  0.0000000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02107  hypothetical protein  25.4 
 
 
220 aa  65.5  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.408134  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02148  acetyl-CoA:acetoacetyl-CoA transferase, alpha subunit  25.4 
 
 
220 aa  65.5  0.000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.35571  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1437  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  25.4 
 
 
220 aa  65.5  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.364395  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1429  acetyl-CoA:acetoacetyl-CoA transferase subunit alpha  25.4 
 
 
220 aa  65.5  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00124064 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2362  acetyl-CoA:acetoacetyl-CoA transferase subunit alpha  25.4 
 
 
220 aa  65.5  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1910  butyryl-CoA:acetoacetate CoA-transferase alpha subunit  27.31 
 
 
218 aa  65.1  0.000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1471  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  29.29 
 
 
219 aa  65.1  0.000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.155964  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5059  acetyl-CoA:acetoacetyl-CoA transferase subunit alpha  28.8 
 
 
226 aa  64.7  0.000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00434544  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3086  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  27.89 
 
 
221 aa  63.5  0.000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2370  acetyl-CoA:acetoacetyl-CoA transferase subunit alpha  25 
 
 
220 aa  63.2  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0895417  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2658  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  25.48 
 
 
272 aa  63.5  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>