More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_21350 on replicon NC_011680
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011680  PHATRDRAFT_21350  predicted protein  100 
 
 		 557 aa  1148    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00403963  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0782  coenzyme A transferase  47.83 
 
 		 667 aa  435  1e-120  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2401  coenzyme A transferase  47.11 
 
 		 670 aa  432  1e-120  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.706144 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0549  coenzyme A transferase  46.38 
 
 		 663 aa  429  1e-119  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1267  coenzyme A transferase  46.01 
 
 		 666 aa  430  1e-119  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0457  propionate CoA-transferase  46.83 
 
 		 667 aa  423  1e-117  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.460217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0767  coenzyme A transferase  46.96 
 
 		 650 aa  424  1e-117  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2684  coenzyme A transferase  45.98 
 
 		 646 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4273  coenzyme A transferase  44.6 
 
 		 673 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.335745  normal  0.912388 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0709  acyl CoA:acetate/3-ketoacid CoA transferase, alpha and beta subunit  46.88 
 
 		 648 aa  400  9.999999999999999e-111  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1494  propionate CoA-transferase  44.44 
 
 		 669 aa  398  1e-109  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1595  coenzyme A transferase  43.85 
 
 		 663 aa  399  1e-109  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0936861  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2345  coenzyme A transferase  44.31 
 
 		 660 aa  392  1e-108  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.41755 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2071  coenzyme A transferase  44.31 
 
 		 660 aa  392  1e-107  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.10059 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4049  propionate CoA-transferase  43.22 
 
 		 542 aa  390  1e-107  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2031  coenzyme A transferase  44.1 
 
 		 660 aa  389  1e-107  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.287187 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0354  coenzyme A transferase  44.51 
 
 		 660 aa  391  1e-107  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0326072  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2996  coenzyme A transferase  43.36 
 
 		 663 aa  383  1e-105  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3438  coenzyme A transferase  45.15 
 
 		 633 aa  379  1e-103  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3022  coenzyme A transferase  43.36 
 
 		 521 aa  377  1e-103  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.119963 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2599  propionate CoA-transferase  42.18 
 
 		 524 aa  376  1e-103  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0091  propionate CoA-transferase  41.91 
 
 		 516 aa  370  1e-101  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2487  coenzyme A transferase  42.56 
 
 		 522 aa  366  1e-100  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1259  propionate CoA-transferase  41.08 
 
 		 527 aa  359  7e-98  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00406341 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1163  coenzyme A transferase  42.8 
 
 		 526 aa  351  3e-95  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.244215  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3933  coenzyme A transferase  42.8 
 
 		 526 aa  351  3e-95  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.60446  normal  0.509869 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3536  acetate/3-ketoacid CoA transferase  39.51 
 
 		 529 aa  343  5e-93  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1387  coenzyme A transferase  38.54 
 
 		 531 aa  323  7e-87  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1555  coenzyme A transferase  40.33 
 
 		 532 aa  318  2e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.431711  normal  0.989893 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0346  coenzyme A transferase  39.6 
 
 		 554 aa  318  2e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1469  propionate CoA-transferase  38.11 
 
 		 531 aa  317  3e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.442461  normal  0.0256592 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1986  propionate CoA-transferase  38.11 
 
 		 531 aa  317  3e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000465126 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1453  propionate CoA-transferase  38.11 
 
 		 531 aa  317  3e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.298558  normal  0.217975 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1815  propionate CoA-transferase  38.11 
 
 		 531 aa  317  3e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.590331  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1488  propionate CoA-transferase  38.11 
 
 		 531 aa  317  4e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.361869  hitchhiker  0.00740492 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01663  fused predicted acetyl-CoA:acetoacetyl-CoA transferase: alpha subunit/beta subunit  37.91 
 
 		 531 aa  315  9.999999999999999e-85  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01652  hypothetical protein  37.91 
 
 		 531 aa  315  9.999999999999999e-85  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1937  coenzyme A transferase  37.91 
 
 		 531 aa  315  9.999999999999999e-85  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00260164 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1948  coenzyme A transferase  37.7 
 
 		 531 aa  315  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0367833  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2410  propionate CoA-transferase  37.7 
 
 		 531 aa  315  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.407987 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1502  propionate CoA-transferase  37.5 
 
 		 531 aa  313  4.999999999999999e-84  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00752619 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0361  coenzyme A transferase  39.1 
 
 		 554 aa  313  5.999999999999999e-84  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1897  propionate CoA-transferase  37.3 
 
 		 531 aa  310  4e-83  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.951112  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1910  CoA-transferase  37.3 
 
 		 531 aa  310  4e-83  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1212  coenzyme A transferase  38.24 
 
 		 523 aa  301  2e-80  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0471  putative transferase protein  37.82 
 
 		 553 aa  298  1e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1547  coenzyme A transferase  37.98 
 
 		 433 aa  298  2e-79  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3570  coenzyme A transferase  38.73 
 
 		 532 aa  295  2e-78  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.276988  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4180  coenzyme A transferase  39.58 
 
 		 520 aa  293  4e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.307102  hitchhiker  0.000449682 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4742  CoA-transferase  38.45 
 
 		 513 aa  293  5e-78  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.213334  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2585  propionate CoA-transferase  36.56 
 
 		 547 aa  291  2e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.206611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2700  coenzyme A transferase  36.03 
 
 		 526 aa  287  4e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.517315  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2047  acetyl-CoA-transferase subunit, putative  37.14 
 
 		 533 aa  283  7.000000000000001e-75  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0651  coenzyme A transferase  37.94 
 
 		 542 aa  283  8.000000000000001e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.364545  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0872  coenzyme A transferase  36.73 
 
 		 533 aa  281  3e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4678  CoA-transferase  38.65 
 
 		 513 aa  280  5e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.696656  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2224  coenzyme A transferase  35.31 
 
 		 531 aa  279  9e-74  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.220629  normal  0.779665 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4768  CoA-transferase  38.45 
 
 		 513 aa  278  1e-73  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0105899  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4451  CoA-transferase  38.45 
 
 		 513 aa  278  2e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000533967  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04073  putative acetyl-CoA:acetoacetyl-CoA transferase  38.45 
 
 		 513 aa  278  2e-73  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.544432  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0883  coenzyme A transferase  37.78 
 
 		 509 aa  278  2e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.021218  normal  0.461656 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04035  hypothetical protein  38.45 
 
 		 513 aa  278  2e-73  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.566302  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3173  coenzyme A transferase  37.14 
 
 		 539 aa  274  3e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1859  propionate CoA-transferase  35.51 
 
 		 544 aa  273  6e-72  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.155788  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0263  coenzyme A transferase  36.18 
 
 		 544 aa  272  1e-71  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1479  coenzyme A transferase  36.46 
 
 		 537 aa  271  2e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.241297  normal  0.56391 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1541  coenzyme A transferase  37.47 
 
 		 508 aa  269  8e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3280  coenzyme A transferase  35.43 
 
 		 522 aa  266  7e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0887  coenzyme A transferase  35.44 
 
 		 543 aa  261  2e-68  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.499816  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1337  coenzyme A transferase  35.94 
 
 		 526 aa  261  3e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.132649 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1375  coenzyme A transferase  35.44 
 
 		 539 aa  257  4e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6427  propionate CoA-transferase  34.48 
 
 		 522 aa  256  6e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.395247  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0421  coenzyme A transferase  34.55 
 
 		 543 aa  255  1.0000000000000001e-66  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.521688  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3939  propionate CoA-transferase  34.63 
 
 		 523 aa  253  5.000000000000001e-66  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.438749 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8049  coenzyme A transferase  33.47 
 
 		 530 aa  246  4.9999999999999997e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.205109  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0225  coenzyme A transferase  31.82 
 
 		 520 aa  219  1e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0219  coenzyme A transferase  31.82 
 
 		 520 aa  219  1e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2696  3-oxoacid CoA-transferase B subunit  25.57 
 
 		 448 aa  89.7  1e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.494818  normal  0.507072 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1306  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  25.32 
 
 		 453 aa  87.8  4e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1021  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  23.93 
 
 		 463 aa  79.3  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05860  Succinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase, putative  23.96 
 
 		 561 aa  77  0.0000000000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.124065  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_33142  3-oxoacid CoA-transferase Succinyl-CoA:alpha-ketoacid-CoA transferase  23.23 
 
 		 505 aa  75.5  0.000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1533  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  26.54 
 
 		 447 aa  74.3  0.000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.172337 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1136  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  25.59 
 
 		 217 aa  70.9  0.00000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1075  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  25.77 
 
 		 218 aa  67.4  0.0000000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2343  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  28.57 
 
 		 252 aa  65.5  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000394864  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4337  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  27.91 
 
 		 269 aa  65.1  0.000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0765282  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_23365  succinyl-coenzyme A:3-oxo-acid coenzyme a-transferase  25.81 
 
 		 511 aa  62.8  0.00000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5020  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  26.14 
 
 		 249 aa  61.2  0.00000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.363473  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1856  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  27.88 
 
 		 222 aa  60.8  0.00000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2277  CoA-transferase, beta subunit  29.57 
 
 		 220 aa  59.7  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2504  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  26.89 
 
 		 263 aa  59.7  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.361118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1684  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  28.72 
 
 		 220 aa  59.7  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.49616  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1066  butyrate-acetoacetate CoA-transferase, subunit A  25.9 
 
 		 214 aa  59.3  0.0000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.25272 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2491  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  29.14 
 
 		 219 aa  59.3  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000498099 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2258  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  30.68 
 
 		 226 aa  58.5  0.0000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.545318  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08500  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  26.82 
 
 		 259 aa  58.2  0.0000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.494503 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1855  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  25.2 
 
 		 217 aa  58.2  0.0000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.945952 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1910  butyryl-CoA:acetoacetate CoA-transferase alpha subunit  25.3 
 
 		 218 aa  58.2  0.0000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1075  coenzyme A transferase, beta subunit  29.53 
 
 		 220 aa  57.8  0.0000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.425854 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>