298 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_3939 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004310  BR2047  acetyl-CoA-transferase subunit, putative  63.72 
 
 
533 aa  668    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3939  propionate CoA-transferase  100 
 
 
523 aa  1067    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.438749 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3570  coenzyme A transferase  64.88 
 
 
532 aa  707    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.276988  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1479  coenzyme A transferase  65.07 
 
 
537 aa  678    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.241297  normal  0.56391 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1375  coenzyme A transferase  65.26 
 
 
539 aa  656    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0872  coenzyme A transferase  63.72 
 
 
533 aa  675    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3173  coenzyme A transferase  64.42 
 
 
539 aa  685    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2224  coenzyme A transferase  58.45 
 
 
531 aa  630  1e-179  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.220629  normal  0.779665 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0651  coenzyme A transferase  62.19 
 
 
542 aa  627  1e-178  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.364545  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1859  propionate CoA-transferase  55.56 
 
 
544 aa  563  1.0000000000000001e-159  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.155788  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4049  propionate CoA-transferase  40.46 
 
 
542 aa  376  1e-103  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2487  coenzyme A transferase  42.94 
 
 
522 aa  371  1e-101  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0549  coenzyme A transferase  40.64 
 
 
663 aa  360  2e-98  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3022  coenzyme A transferase  39.01 
 
 
521 aa  358  9.999999999999999e-98  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.119963 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0457  propionate CoA-transferase  38.58 
 
 
667 aa  358  9.999999999999999e-98  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.460217  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0782  coenzyme A transferase  39.58 
 
 
667 aa  348  2e-94  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2599  propionate CoA-transferase  37.59 
 
 
524 aa  347  3e-94  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1595  coenzyme A transferase  39.85 
 
 
663 aa  347  3e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0936861  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2401  coenzyme A transferase  39.12 
 
 
670 aa  346  5e-94  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.706144 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4273  coenzyme A transferase  40.16 
 
 
673 aa  342  1e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.335745  normal  0.912388 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0767  coenzyme A transferase  38.76 
 
 
650 aa  341  1e-92  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1494  propionate CoA-transferase  41.34 
 
 
669 aa  339  8e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1267  coenzyme A transferase  36.96 
 
 
666 aa  339  8e-92  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2684  coenzyme A transferase  38.85 
 
 
646 aa  338  9.999999999999999e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0091  propionate CoA-transferase  40.61 
 
 
516 aa  338  1.9999999999999998e-91  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0354  coenzyme A transferase  39.08 
 
 
660 aa  337  2.9999999999999997e-91  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0326072  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2031  coenzyme A transferase  39.08 
 
 
660 aa  337  3.9999999999999995e-91  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.287187 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1555  coenzyme A transferase  39.43 
 
 
532 aa  336  5e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.431711  normal  0.989893 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2996  coenzyme A transferase  38.05 
 
 
663 aa  334  2e-90  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2345  coenzyme A transferase  38.89 
 
 
660 aa  334  2e-90  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.41755 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1541  coenzyme A transferase  38.1 
 
 
508 aa  334  2e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2071  coenzyme A transferase  38.89 
 
 
660 aa  335  2e-90  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.10059 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1259  propionate CoA-transferase  39.05 
 
 
527 aa  330  3e-89  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00406341 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1212  coenzyme A transferase  39.01 
 
 
523 aa  326  6e-88  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3438  coenzyme A transferase  38.51 
 
 
633 aa  325  1e-87  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0709  acyl CoA:acetate/3-ketoacid CoA transferase, alpha and beta subunit  39.01 
 
 
648 aa  325  1e-87  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4180  coenzyme A transferase  41.02 
 
 
520 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.307102  hitchhiker  0.000449682 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0883  coenzyme A transferase  39.64 
 
 
509 aa  320  5e-86  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.021218  normal  0.461656 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1163  coenzyme A transferase  35.86 
 
 
526 aa  319  7.999999999999999e-86  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.244215  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3933  coenzyme A transferase  35.86 
 
 
526 aa  319  7.999999999999999e-86  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.60446  normal  0.509869 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3536  acetate/3-ketoacid CoA transferase  36 
 
 
529 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4742  CoA-transferase  40.08 
 
 
513 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.213334  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1337  coenzyme A transferase  38.1 
 
 
526 aa  311  2.9999999999999997e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.132649 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6427  propionate CoA-transferase  37.02 
 
 
522 aa  310  2.9999999999999997e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.395247  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01663  fused predicted acetyl-CoA:acetoacetyl-CoA transferase: alpha subunit/beta subunit  35.44 
 
 
531 aa  309  6.999999999999999e-83  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01652  hypothetical protein  35.44 
 
 
531 aa  309  6.999999999999999e-83  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1948  coenzyme A transferase  35.25 
 
 
531 aa  309  8e-83  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0367833  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8049  coenzyme A transferase  37.5 
 
 
530 aa  309  9e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.205109  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1937  coenzyme A transferase  35.44 
 
 
531 aa  309  9e-83  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00260164 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1502  propionate CoA-transferase  35.44 
 
 
531 aa  308  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00752619 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2700  coenzyme A transferase  37.43 
 
 
526 aa  306  5.0000000000000004e-82  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.517315  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2410  propionate CoA-transferase  35.06 
 
 
531 aa  306  6e-82  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.407987 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1910  CoA-transferase  35.18 
 
 
531 aa  305  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3280  coenzyme A transferase  37.1 
 
 
522 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4678  CoA-transferase  40.08 
 
 
513 aa  305  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.696656  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4768  CoA-transferase  40.48 
 
 
513 aa  304  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0105899  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1453  propionate CoA-transferase  35.06 
 
 
531 aa  304  3.0000000000000004e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.298558  normal  0.217975 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1815  propionate CoA-transferase  35.06 
 
 
531 aa  303  3.0000000000000004e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.590331  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1387  coenzyme A transferase  35.96 
 
 
531 aa  304  3.0000000000000004e-81  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1469  propionate CoA-transferase  35.06 
 
 
531 aa  304  3.0000000000000004e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.442461  normal  0.0256592 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1986  propionate CoA-transferase  35.06 
 
 
531 aa  304  3.0000000000000004e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000465126 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4451  CoA-transferase  40.48 
 
 
513 aa  303  5.000000000000001e-81  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000533967  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1488  propionate CoA-transferase  35.06 
 
 
531 aa  303  6.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.361869  hitchhiker  0.00740492 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1897  propionate CoA-transferase  34.67 
 
 
531 aa  302  8.000000000000001e-81  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.951112  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04073  putative acetyl-CoA:acetoacetyl-CoA transferase  40.08 
 
 
513 aa  300  4e-80  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.544432  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04035  hypothetical protein  40.08 
 
 
513 aa  300  4e-80  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.566302  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0471  putative transferase protein  33.93 
 
 
553 aa  276  5e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2585  propionate CoA-transferase  33.99 
 
 
547 aa  273  6e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.206611  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0346  coenzyme A transferase  34.28 
 
 
554 aa  272  8.000000000000001e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0421  coenzyme A transferase  35.06 
 
 
543 aa  270  5.9999999999999995e-71  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.521688  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0361  coenzyme A transferase  34.64 
 
 
554 aa  265  1e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1547  coenzyme A transferase  36.73 
 
 
433 aa  265  2e-69  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0263  coenzyme A transferase  35.14 
 
 
544 aa  263  4.999999999999999e-69  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_21350  predicted protein  34.63 
 
 
557 aa  263  6e-69  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00403963  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0887  coenzyme A transferase  34.01 
 
 
543 aa  248  2e-64  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.499816  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0219  coenzyme A transferase  32 
 
 
520 aa  242  1e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0225  coenzyme A transferase  32 
 
 
520 aa  242  1e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2696  3-oxoacid CoA-transferase B subunit  26.44 
 
 
448 aa  95.1  3e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.494818  normal  0.507072 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1306  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  26.41 
 
 
453 aa  89  2e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_33142  3-oxoacid CoA-transferase Succinyl-CoA:alpha-ketoacid-CoA transferase  24.69 
 
 
505 aa  84  0.000000000000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09394  coenzyme A transferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G04030)  26.75 
 
 
439 aa  80.1  0.00000000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.504569  normal  0.0471262 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1533  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  25.95 
 
 
447 aa  77.8  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.172337 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10495  coenzyme A transferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G04120)  24.71 
 
 
506 aa  77.4  0.0000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00529511  normal  0.309681 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05860  Succinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase, putative  28.79 
 
 
561 aa  69.3  0.0000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.124065  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1846  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  28.4 
 
 
228 aa  67  0.0000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.257726  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1021  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  26.05 
 
 
463 aa  66.2  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2658  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  25 
 
 
272 aa  64.7  0.000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3273  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  28.03 
 
 
225 aa  62.4  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3262  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  24.62 
 
 
267 aa  62.8  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.569935  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1136  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  23.67 
 
 
217 aa  60.8  0.00000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2608  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  25.95 
 
 
235 aa  60.5  0.00000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.357891 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1855  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  26.1 
 
 
217 aa  60.5  0.00000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.945952 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3127  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  24.7 
 
 
270 aa  59.7  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.400116  normal 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_23365  succinyl-coenzyme A:3-oxo-acid coenzyme a-transferase  27.4 
 
 
511 aa  58.9  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2004  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  27.51 
 
 
239 aa  59.3  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.725633  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1075  coenzyme A transferase, beta subunit  26.64 
 
 
220 aa  58.5  0.0000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.425854 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3591  3-oxoadipate CoA-transferase, alpha subunit  23.94 
 
 
276 aa  58.2  0.0000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1653  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  25.86 
 
 
233 aa  58.5  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0697123  normal  0.0258223 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5885  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  27.2 
 
 
235 aa  58.2  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2123  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  28.57 
 
 
236 aa  58.2  0.0000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.678104  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>