More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_0549 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_2996  coenzyme A transferase  59.29 
 
 
663 aa  758    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3438  coenzyme A transferase  59.37 
 
 
633 aa  711    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2345  coenzyme A transferase  52.64 
 
 
660 aa  672    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.41755 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2071  coenzyme A transferase  52.64 
 
 
660 aa  671    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.10059 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0782  coenzyme A transferase  59.09 
 
 
667 aa  746    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2401  coenzyme A transferase  57.84 
 
 
670 aa  720    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.706144 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0457  propionate CoA-transferase  74.06 
 
 
667 aa  1023    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.460217  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2684  coenzyme A transferase  55.49 
 
 
646 aa  689    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1494  propionate CoA-transferase  68.07 
 
 
669 aa  880    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1595  coenzyme A transferase  65.49 
 
 
663 aa  867    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0936861  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4273  coenzyme A transferase  67.38 
 
 
673 aa  875    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.335745  normal  0.912388 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0549  coenzyme A transferase  100 
 
 
663 aa  1338    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0767  coenzyme A transferase  69.27 
 
 
650 aa  855    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4049  propionate CoA-transferase  70.43 
 
 
542 aa  749    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0354  coenzyme A transferase  54.08 
 
 
660 aa  680    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0326072  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0709  acyl CoA:acetate/3-ketoacid CoA transferase, alpha and beta subunit  59.09 
 
 
648 aa  714    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1267  coenzyme A transferase  66.87 
 
 
666 aa  878    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2031  coenzyme A transferase  52.95 
 
 
660 aa  674    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.287187 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2599  propionate CoA-transferase  59.2 
 
 
524 aa  624  1e-177  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1163  coenzyme A transferase  58.02 
 
 
526 aa  578  1e-164  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.244215  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3933  coenzyme A transferase  58.02 
 
 
526 aa  578  1e-164  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.60446  normal  0.509869 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0091  propionate CoA-transferase  56.16 
 
 
516 aa  574  1.0000000000000001e-162  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3536  acetate/3-ketoacid CoA transferase  53.17 
 
 
529 aa  555  1e-157  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2487  coenzyme A transferase  56.61 
 
 
522 aa  547  1e-154  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3022  coenzyme A transferase  53.88 
 
 
521 aa  542  9.999999999999999e-153  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.119963 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1259  propionate CoA-transferase  47.88 
 
 
527 aa  494  9.999999999999999e-139  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00406341 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1547  coenzyme A transferase  55.43 
 
 
433 aa  488  1e-136  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0361  coenzyme A transferase  49.28 
 
 
554 aa  462  1e-129  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0346  coenzyme A transferase  48.55 
 
 
554 aa  457  1e-127  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0471  putative transferase protein  48.29 
 
 
553 aa  452  1.0000000000000001e-126  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2585  propionate CoA-transferase  47.38 
 
 
547 aa  450  1e-125  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.206611  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1986  propionate CoA-transferase  45.75 
 
 
531 aa  446  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000465126 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1469  propionate CoA-transferase  45.75 
 
 
531 aa  446  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.442461  normal  0.0256592 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1453  propionate CoA-transferase  45.75 
 
 
531 aa  446  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.298558  normal  0.217975 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1815  propionate CoA-transferase  45.75 
 
 
531 aa  446  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.590331  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1387  coenzyme A transferase  45.07 
 
 
531 aa  447  1.0000000000000001e-124  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1488  propionate CoA-transferase  45.75 
 
 
531 aa  447  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.361869  hitchhiker  0.00740492 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1948  coenzyme A transferase  44.77 
 
 
531 aa  443  1e-123  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0367833  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1910  CoA-transferase  44.57 
 
 
531 aa  444  1e-123  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1937  coenzyme A transferase  44.57 
 
 
531 aa  442  1e-123  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00260164 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2410  propionate CoA-transferase  44.77 
 
 
531 aa  444  1e-123  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.407987 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1897  propionate CoA-transferase  44.57 
 
 
531 aa  443  1e-123  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.951112  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01663  fused predicted acetyl-CoA:acetoacetyl-CoA transferase: alpha subunit/beta subunit  44.57 
 
 
531 aa  442  9.999999999999999e-123  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1502  propionate CoA-transferase  44.57 
 
 
531 aa  441  9.999999999999999e-123  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00752619 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1212  coenzyme A transferase  48.2 
 
 
523 aa  441  9.999999999999999e-123  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01652  hypothetical protein  44.57 
 
 
531 aa  442  9.999999999999999e-123  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_21350  predicted protein  46.38 
 
 
557 aa  429  1e-118  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00403963  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2700  coenzyme A transferase  45.06 
 
 
526 aa  424  1e-117  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.517315  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4180  coenzyme A transferase  46.99 
 
 
520 aa  416  1e-114  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.307102  hitchhiker  0.000449682 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0651  coenzyme A transferase  43.47 
 
 
542 aa  397  1e-109  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.364545  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4742  CoA-transferase  45.19 
 
 
513 aa  393  1e-108  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.213334  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0883  coenzyme A transferase  45.8 
 
 
509 aa  392  1e-107  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.021218  normal  0.461656 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1555  coenzyme A transferase  44.4 
 
 
532 aa  382  1e-104  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.431711  normal  0.989893 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4768  CoA-transferase  45.38 
 
 
513 aa  382  1e-104  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0105899  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04035  hypothetical protein  45.19 
 
 
513 aa  379  1e-103  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.566302  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04073  putative acetyl-CoA:acetoacetyl-CoA transferase  45.19 
 
 
513 aa  379  1e-103  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.544432  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3173  coenzyme A transferase  42.46 
 
 
539 aa  379  1e-103  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3570  coenzyme A transferase  42.61 
 
 
532 aa  378  1e-103  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.276988  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4678  CoA-transferase  45 
 
 
513 aa  376  1e-103  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.696656  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4451  CoA-transferase  45 
 
 
513 aa  377  1e-103  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000533967  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1479  coenzyme A transferase  41.67 
 
 
537 aa  371  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.241297  normal  0.56391 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3280  coenzyme A transferase  42.31 
 
 
522 aa  370  1e-101  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8049  coenzyme A transferase  40.76 
 
 
530 aa  366  1e-100  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.205109  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6427  propionate CoA-transferase  41.71 
 
 
522 aa  364  2e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.395247  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0872  coenzyme A transferase  40.61 
 
 
533 aa  362  2e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2224  coenzyme A transferase  38.77 
 
 
531 aa  358  9.999999999999999e-98  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.220629  normal  0.779665 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3939  propionate CoA-transferase  40.64 
 
 
523 aa  357  2.9999999999999997e-97  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.438749 
 
 
-
 
NC_004310  BR2047  acetyl-CoA-transferase subunit, putative  40.8 
 
 
533 aa  357  3.9999999999999996e-97  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1375  coenzyme A transferase  41.1 
 
 
539 aa  357  3.9999999999999996e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1337  coenzyme A transferase  41.44 
 
 
526 aa  354  2.9999999999999997e-96  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.132649 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1859  propionate CoA-transferase  39.07 
 
 
544 aa  351  3e-95  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.155788  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1541  coenzyme A transferase  42.12 
 
 
508 aa  340  5.9999999999999996e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0263  coenzyme A transferase  39.01 
 
 
544 aa  331  3e-89  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0887  coenzyme A transferase  39.08 
 
 
543 aa  330  7e-89  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.499816  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0219  coenzyme A transferase  34.92 
 
 
520 aa  313  9e-84  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0225  coenzyme A transferase  34.92 
 
 
520 aa  313  9e-84  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0421  coenzyme A transferase  38.22 
 
 
543 aa  303  5.000000000000001e-81  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.521688  normal 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05860  Succinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase, putative  28.57 
 
 
561 aa  112  3e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.124065  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1306  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  28.89 
 
 
453 aa  108  4e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2696  3-oxoacid CoA-transferase B subunit  27.68 
 
 
448 aa  106  1e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.494818  normal  0.507072 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_33142  3-oxoacid CoA-transferase Succinyl-CoA:alpha-ketoacid-CoA transferase  25.86 
 
 
505 aa  100  8e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1533  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  27.57 
 
 
447 aa  90.1  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.172337 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7413  ScoB  28.61 
 
 
461 aa  83.2  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.811733  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0212  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  30.04 
 
 
217 aa  82.8  0.00000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1573  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  31.12 
 
 
215 aa  82.8  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.503951 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1136  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  27.35 
 
 
217 aa  81.6  0.00000000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2658  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  28.02 
 
 
272 aa  81.6  0.00000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_23365  succinyl-coenzyme A:3-oxo-acid coenzyme a-transferase  27.56 
 
 
511 aa  81.3  0.00000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1075  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  28.1 
 
 
218 aa  80.9  0.00000000000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1021  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  24.85 
 
 
463 aa  79.7  0.0000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1984  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  26.97 
 
 
233 aa  80.1  0.0000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00015466 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1570  fesuccinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase subunit A protein  27.71 
 
 
232 aa  79.7  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3273  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  28.86 
 
 
225 aa  79.7  0.0000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1594  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  28.35 
 
 
237 aa  78.6  0.0000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05669  succinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase (ScoT), putative (AFU_orthologue; AFUA_6G12250)  24.12 
 
 
519 aa  78.2  0.0000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1855  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  28.63 
 
 
217 aa  77.4  0.0000000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.945952 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0637  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  27.98 
 
 
216 aa  77  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3262  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  27.39 
 
 
267 aa  76.6  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.569935  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1910  butyryl-CoA:acetoacetate CoA-transferase alpha subunit  29.05 
 
 
218 aa  76.3  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1430  coenzyme A transferase  28.1 
 
 
237 aa  75.5  0.000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.920311  normal  0.272732 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>