More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_1212 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_1212  coenzyme A transferase  100 
 
 		 523 aa  1057    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2700  coenzyme A transferase  77.54 
 
 		 526 aa  793    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.517315  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0883  coenzyme A transferase  51.39 
 
 		 509 aa  491  1e-137  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.021218  normal  0.461656 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4180  coenzyme A transferase  50.99 
 
 		 520 aa  486  1e-136  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.307102  hitchhiker  0.000449682 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4742  CoA-transferase  47.09 
 
 		 513 aa  462  1e-129  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.213334  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4049  propionate CoA-transferase  47.95 
 
 		 542 aa  456  1e-127  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0457  propionate CoA-transferase  46.83 
 
 		 667 aa  457  1e-127  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.460217  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04073  putative acetyl-CoA:acetoacetyl-CoA transferase  47.09 
 
 		 513 aa  452  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.544432  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04035  hypothetical protein  47.09 
 
 		 513 aa  452  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.566302  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4768  CoA-transferase  47.09 
 
 		 513 aa  453  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0105899  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4678  CoA-transferase  47.66 
 
 		 513 aa  454  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.696656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4451  CoA-transferase  46.9 
 
 		 513 aa  451  1e-125  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000533967  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0549  coenzyme A transferase  48.4 
 
 		 663 aa  447  1.0000000000000001e-124  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1494  propionate CoA-transferase  47.22 
 
 		 669 aa  439  9.999999999999999e-123  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0767  coenzyme A transferase  47.04 
 
 		 650 aa  441  9.999999999999999e-123  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1488  propionate CoA-transferase  43.48 
 
 		 531 aa  426  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.361869  hitchhiker  0.00740492 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3438  coenzyme A transferase  48.05 
 
 		 633 aa  424  1e-117  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1469  propionate CoA-transferase  43.28 
 
 		 531 aa  422  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.442461  normal  0.0256592 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1815  propionate CoA-transferase  43.28 
 
 		 531 aa  422  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.590331  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1453  propionate CoA-transferase  43.28 
 
 		 531 aa  422  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.298558  normal  0.217975 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1986  propionate CoA-transferase  43.28 
 
 		 531 aa  422  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000465126 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1267  coenzyme A transferase  44.36 
 
 		 666 aa  425  1e-117  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1163  coenzyme A transferase  46.17 
 
 		 526 aa  422  1e-117  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.244215  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3933  coenzyme A transferase  46.17 
 
 		 526 aa  422  1e-117  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.60446  normal  0.509869 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1910  CoA-transferase  42.72 
 
 		 531 aa  420  1e-116  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4273  coenzyme A transferase  43.67 
 
 		 673 aa  419  1e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.335745  normal  0.912388 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0782  coenzyme A transferase  47.19 
 
 		 667 aa  419  1e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2599  propionate CoA-transferase  42.78 
 
 		 524 aa  419  1e-116  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1387  coenzyme A transferase  42.41 
 
 		 531 aa  421  1e-116  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01663  fused predicted acetyl-CoA:acetoacetyl-CoA transferase: alpha subunit/beta subunit  42.29 
 
 		 531 aa  415  9.999999999999999e-116  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1948  coenzyme A transferase  42.29 
 
 		 531 aa  416  9.999999999999999e-116  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0367833  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2410  propionate CoA-transferase  42.49 
 
 		 531 aa  417  9.999999999999999e-116  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.407987 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01652  hypothetical protein  42.29 
 
 		 531 aa  415  9.999999999999999e-116  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1502  propionate CoA-transferase  42.49 
 
 		 531 aa  415  9.999999999999999e-116  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00752619 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1937  coenzyme A transferase  42.29 
 
 		 531 aa  415  1e-114  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00260164 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1897  propionate CoA-transferase  42.29 
 
 		 531 aa  414  1e-114  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.951112  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0091  propionate CoA-transferase  41.36 
 
 		 516 aa  414  1e-114  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1595  coenzyme A transferase  45.72 
 
 		 663 aa  413  1e-114  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0936861  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3536  acetate/3-ketoacid CoA transferase  42.35 
 
 		 529 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2487  coenzyme A transferase  43.38 
 
 		 522 aa  406  1.0000000000000001e-112  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2684  coenzyme A transferase  44.73 
 
 		 646 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0354  coenzyme A transferase  43.82 
 
 		 660 aa  403  1e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0326072  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0709  acyl CoA:acetate/3-ketoacid CoA transferase, alpha and beta subunit  46.98 
 
 		 648 aa  402  1e-111  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2401  coenzyme A transferase  45.38 
 
 		 670 aa  402  9.999999999999999e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.706144 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1259  propionate CoA-transferase  42.38 
 
 		 527 aa  401  9.999999999999999e-111  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00406341 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2345  coenzyme A transferase  42.86 
 
 		 660 aa  396  1e-109  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.41755 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2071  coenzyme A transferase  42.86 
 
 		 660 aa  397  1e-109  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.10059 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2031  coenzyme A transferase  43.24 
 
 		 660 aa  397  1e-109  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.287187 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3022  coenzyme A transferase  42.47 
 
 		 521 aa  395  1e-108  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.119963 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2996  coenzyme A transferase  42.83 
 
 		 663 aa  391  1e-107  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6427  propionate CoA-transferase  40.49 
 
 		 522 aa  356  6.999999999999999e-97  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.395247  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1555  coenzyme A transferase  40.58 
 
 		 532 aa  352  1e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.431711  normal  0.989893 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3280  coenzyme A transferase  40.84 
 
 		 522 aa  347  2e-94  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1337  coenzyme A transferase  41.33 
 
 		 526 aa  346  6e-94  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.132649 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0872  coenzyme A transferase  38.81 
 
 		 533 aa  345  1e-93  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3570  coenzyme A transferase  38.46 
 
 		 532 aa  343  4e-93  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.276988  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0651  coenzyme A transferase  38.11 
 
 		 542 aa  339  5.9999999999999996e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.364545  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2047  acetyl-CoA-transferase subunit, putative  39.01 
 
 		 533 aa  339  7e-92  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2224  coenzyme A transferase  37.43 
 
 		 531 aa  338  9.999999999999999e-92  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.220629  normal  0.779665 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3173  coenzyme A transferase  38.54 
 
 		 539 aa  336  5.999999999999999e-91  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8049  coenzyme A transferase  38.71 
 
 		 530 aa  333  7.000000000000001e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.205109  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1547  coenzyme A transferase  40 
 
 		 433 aa  327  2.0000000000000001e-88  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0361  coenzyme A transferase  40.33 
 
 		 554 aa  326  6e-88  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1375  coenzyme A transferase  38.55 
 
 		 539 aa  326  6e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1479  coenzyme A transferase  37.48 
 
 		 537 aa  325  1e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.241297  normal  0.56391 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1541  coenzyme A transferase  39.96 
 
 		 508 aa  321  1.9999999999999998e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1859  propionate CoA-transferase  38.54 
 
 		 544 aa  321  1.9999999999999998e-86  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.155788  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0346  coenzyme A transferase  39.23 
 
 		 554 aa  318  1e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3939  propionate CoA-transferase  38.15 
 
 		 523 aa  318  1e-85  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.438749 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2585  propionate CoA-transferase  38.24 
 
 		 547 aa  314  1.9999999999999998e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.206611  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0471  putative transferase protein  38.87 
 
 		 553 aa  305  1.0000000000000001e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_21350  predicted protein  38.57 
 
 		 557 aa  304  2.0000000000000002e-81  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00403963  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0219  coenzyme A transferase  32.43 
 
 		 520 aa  277  3e-73  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0225  coenzyme A transferase  32.43 
 
 		 520 aa  277  3e-73  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0263  coenzyme A transferase  34.99 
 
 		 544 aa  272  1e-71  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0887  coenzyme A transferase  36.5 
 
 		 543 aa  263  4e-69  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.499816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0421  coenzyme A transferase  34.02 
 
 		 543 aa  259  1e-67  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.521688  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2696  3-oxoacid CoA-transferase B subunit  26.61 
 
 		 448 aa  108  2e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.494818  normal  0.507072 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1306  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  26.73 
 
 		 453 aa  96.7  1e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05860  Succinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase, putative  26.24 
 
 		 561 aa  85.1  0.000000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.124065  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1533  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  25.89 
 
 		 447 aa  83.6  0.000000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.172337 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1136  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  31.64 
 
 		 217 aa  83.2  0.00000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1021  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  25.71 
 
 		 463 aa  78.2  0.0000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7413  ScoB  27.5 
 
 		 461 aa  78.2  0.0000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.811733  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1855  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  28.87 
 
 		 217 aa  77.4  0.0000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.945952 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3273  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  27.97 
 
 		 225 aa  77.4  0.0000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0212  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  27.39 
 
 		 217 aa  75.5  0.000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02148  acetyl-CoA:acetoacetyl-CoA transferase, alpha subunit  26.1 
 
 		 220 aa  73.2  0.00000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.35571  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1437  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  26.1 
 
 		 220 aa  73.2  0.00000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.364395  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1429  acetyl-CoA:acetoacetyl-CoA transferase subunit alpha  26.1 
 
 		 220 aa  73.2  0.00000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00124064 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02107  hypothetical protein  26.1 
 
 		 220 aa  73.2  0.00000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.408134  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2362  acetyl-CoA:acetoacetyl-CoA transferase subunit alpha  26.1 
 
 		 220 aa  72.8  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2370  acetyl-CoA:acetoacetyl-CoA transferase subunit alpha  26.1 
 
 		 220 aa  71.2  0.00000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0895417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2127  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  31.58 
 
 		 221 aa  70.9  0.00000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1570  fesuccinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase subunit A protein  27.69 
 
 		 232 aa  70.5  0.00000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1075  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  25.82 
 
 		 218 aa  69.7  0.0000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3847  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  28.23 
 
 		 236 aa  69.3  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0584651  normal  0.485272 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_33142  3-oxoacid CoA-transferase Succinyl-CoA:alpha-ketoacid-CoA transferase  22.22 
 
 		 505 aa  68.2  0.0000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1472  butyryl-CoA:acetoacetate CoA-transferase alpha subunit  26.86 
 
 		 220 aa  67.8  0.0000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.146026  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2658  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  28.19 
 
 		 272 aa  67  0.0000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>