282 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_8049 on replicon NC_011887
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_1337  coenzyme A transferase  64.04 
 
 		 526 aa  661    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.132649 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8049  coenzyme A transferase  100 
 
 		 530 aa  1075    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.205109  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6427  propionate CoA-transferase  62.69 
 
 		 522 aa  668    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.395247  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3280  coenzyme A transferase  64.37 
 
 		 522 aa  674    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4049  propionate CoA-transferase  42.72 
 
 		 542 aa  392  1e-108  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0767  coenzyme A transferase  43.23 
 
 		 650 aa  377  1e-103  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4273  coenzyme A transferase  40.22 
 
 		 673 aa  374  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.335745  normal  0.912388 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3022  coenzyme A transferase  39.81 
 
 		 521 aa  370  1e-101  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.119963 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0091  propionate CoA-transferase  39.92 
 
 		 516 aa  370  1e-101  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0457  propionate CoA-transferase  40.08 
 
 		 667 aa  367  1e-100  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.460217  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0782  coenzyme A transferase  40.42 
 
 		 667 aa  365  1e-100  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0549  coenzyme A transferase  40.76 
 
 		 663 aa  366  1e-100  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0354  coenzyme A transferase  41.11 
 
 		 660 aa  365  1e-100  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0326072  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2401  coenzyme A transferase  40.92 
 
 		 670 aa  360  2e-98  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.706144 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1595  coenzyme A transferase  40.53 
 
 		 663 aa  360  3e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0936861  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2487  coenzyme A transferase  40.38 
 
 		 522 aa  357  2.9999999999999997e-97  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2071  coenzyme A transferase  39.58 
 
 		 660 aa  356  5e-97  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.10059 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2345  coenzyme A transferase  39.58 
 
 		 660 aa  356  5e-97  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.41755 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2031  coenzyme A transferase  39.73 
 
 		 660 aa  356  5.999999999999999e-97  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.287187 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3570  coenzyme A transferase  40.57 
 
 		 532 aa  355  8.999999999999999e-97  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.276988  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2599  propionate CoA-transferase  38.85 
 
 		 524 aa  352  8e-96  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2684  coenzyme A transferase  38.55 
 
 		 646 aa  352  8.999999999999999e-96  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3173  coenzyme A transferase  40.61 
 
 		 539 aa  352  1e-95  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1267  coenzyme A transferase  38.23 
 
 		 666 aa  350  3e-95  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1494  propionate CoA-transferase  38.26 
 
 		 669 aa  350  4e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2047  acetyl-CoA-transferase subunit, putative  39.16 
 
 		 533 aa  348  1e-94  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1259  propionate CoA-transferase  38.88 
 
 		 527 aa  347  3e-94  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00406341 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2700  coenzyme A transferase  40 
 
 		 526 aa  347  4e-94  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.517315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0872  coenzyme A transferase  39.31 
 
 		 533 aa  344  2e-93  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2224  coenzyme A transferase  38.67 
 
 		 531 aa  342  1e-92  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.220629  normal  0.779665 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0709  acyl CoA:acetate/3-ketoacid CoA transferase, alpha and beta subunit  40.46 
 
 		 648 aa  339  5.9999999999999996e-92  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1859  propionate CoA-transferase  37.84 
 
 		 544 aa  337  3.9999999999999995e-91  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.155788  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1163  coenzyme A transferase  38.42 
 
 		 526 aa  335  1e-90  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.244215  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3933  coenzyme A transferase  38.42 
 
 		 526 aa  335  1e-90  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.60446  normal  0.509869 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1555  coenzyme A transferase  36.87 
 
 		 532 aa  334  2e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.431711  normal  0.989893 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1479  coenzyme A transferase  38.56 
 
 		 537 aa  330  4e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.241297  normal  0.56391 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1212  coenzyme A transferase  38.71 
 
 		 523 aa  328  1.0000000000000001e-88  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1375  coenzyme A transferase  39.43 
 
 		 539 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1815  propionate CoA-transferase  37.5 
 
 		 531 aa  324  2e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.590331  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1469  propionate CoA-transferase  37.5 
 
 		 531 aa  324  3e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.442461  normal  0.0256592 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1453  propionate CoA-transferase  37.5 
 
 		 531 aa  324  3e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.298558  normal  0.217975 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1986  propionate CoA-transferase  37.5 
 
 		 531 aa  324  3e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000465126 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1488  propionate CoA-transferase  37.5 
 
 		 531 aa  324  3e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.361869  hitchhiker  0.00740492 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1387  coenzyme A transferase  36.65 
 
 		 531 aa  322  9.999999999999999e-87  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1948  coenzyme A transferase  36.92 
 
 		 531 aa  321  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0367833  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01663  fused predicted acetyl-CoA:acetoacetyl-CoA transferase: alpha subunit/beta subunit  36.92 
 
 		 531 aa  320  3e-86  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01652  hypothetical protein  36.92 
 
 		 531 aa  320  3e-86  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1937  coenzyme A transferase  36.92 
 
 		 531 aa  320  3e-86  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00260164 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3438  coenzyme A transferase  38.93 
 
 		 633 aa  319  6e-86  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1502  propionate CoA-transferase  36.92 
 
 		 531 aa  319  7.999999999999999e-86  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00752619 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2410  propionate CoA-transferase  36.92 
 
 		 531 aa  319  7.999999999999999e-86  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.407987 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3536  acetate/3-ketoacid CoA transferase  36.53 
 
 		 529 aa  318  2e-85  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1910  CoA-transferase  36.05 
 
 		 531 aa  314  2.9999999999999996e-84  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1897  propionate CoA-transferase  36.35 
 
 		 531 aa  312  7.999999999999999e-84  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.951112  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4180  coenzyme A transferase  37.55 
 
 		 520 aa  311  2.9999999999999997e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.307102  hitchhiker  0.000449682 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0651  coenzyme A transferase  36.26 
 
 		 542 aa  310  5.9999999999999995e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.364545  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2996  coenzyme A transferase  37.24 
 
 		 663 aa  305  2.0000000000000002e-81  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0883  coenzyme A transferase  38.29 
 
 		 509 aa  302  1e-80  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.021218  normal  0.461656 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3939  propionate CoA-transferase  36.71 
 
 		 523 aa  300  4e-80  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.438749 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1547  coenzyme A transferase  36.88 
 
 		 433 aa  289  1e-76  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1541  coenzyme A transferase  38.54 
 
 		 508 aa  288  2e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4742  CoA-transferase  36.26 
 
 		 513 aa  288  2e-76  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.213334  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4768  CoA-transferase  33.52 
 
 		 513 aa  276  8e-73  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0105899  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4678  CoA-transferase  33.52 
 
 		 513 aa  275  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.696656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0421  coenzyme A transferase  36.04 
 
 		 543 aa  275  2.0000000000000002e-72  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.521688  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04073  putative acetyl-CoA:acetoacetyl-CoA transferase  33.33 
 
 		 513 aa  273  7e-72  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.544432  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04035  hypothetical protein  33.33 
 
 		 513 aa  273  7e-72  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.566302  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4451  CoA-transferase  33.15 
 
 		 513 aa  271  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000533967  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0471  putative transferase protein  33.81 
 
 		 553 aa  266  8e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2585  propionate CoA-transferase  32.85 
 
 		 547 aa  264  3e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.206611  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0346  coenzyme A transferase  33.27 
 
 		 554 aa  255  2.0000000000000002e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0361  coenzyme A transferase  33.51 
 
 		 554 aa  253  8.000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_21350  predicted protein  33.47 
 
 		 557 aa  246  4.9999999999999997e-64  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00403963  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0263  coenzyme A transferase  35.22 
 
 		 544 aa  246  6e-64  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0887  coenzyme A transferase  34.86 
 
 		 543 aa  234  4.0000000000000004e-60  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.499816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0219  coenzyme A transferase  29.73 
 
 		 520 aa  228  2e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0225  coenzyme A transferase  29.73 
 
 		 520 aa  228  2e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1306  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  25.1 
 
 		 453 aa  74.7  0.000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3273  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  27.02 
 
 		 225 aa  71.2  0.00000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1136  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  25.2 
 
 		 217 aa  70.1  0.00000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2696  3-oxoacid CoA-transferase B subunit  26.34 
 
 		 448 aa  68.6  0.0000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.494818  normal  0.507072 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1855  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  27.42 
 
 		 217 aa  68.6  0.0000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.945952 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1021  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  24.56 
 
 		 463 aa  66.2  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1856  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  28.4 
 
 		 222 aa  63.2  0.00000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05860  Succinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase, putative  25.62 
 
 		 561 aa  61.2  0.00000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.124065  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1471  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  28.63 
 
 		 219 aa  60.8  0.00000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.155964  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1472  butyryl-CoA:acetoacetate CoA-transferase alpha subunit  26.69 
 
 		 220 aa  59.3  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.146026  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4337  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  27.31 
 
 		 269 aa  59.7  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0765282  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3169  acetyl-CoA:acetoacetyl-CoA transferase subunit alpha  26.98 
 
 		 218 aa  58.9  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1914  3-ketoacid CoA transferase alpha subunit  27.2 
 
 		 232 aa  58.9  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.507414  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0564  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  27.2 
 
 		 232 aa  58.9  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2004  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  28.44 
 
 		 239 aa  59.3  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.725633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2340  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  27.54 
 
 		 234 aa  59.3  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1269  coenzyme A transferase  25.63 
 
 		 233 aa  58.2  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.703297  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5020  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  27.24 
 
 		 249 aa  58.5  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.363473  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2608  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase alpha subunit  26.64 
 
 		 302 aa  57.8  0.0000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1162  acetyl-CoA:acetoacetyl-CoA transferase subunit alpha  26.59 
 
 		 218 aa  57.4  0.0000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.893752  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5092  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  28.84 
 
 		 235 aa  57.4  0.0000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1108  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase alpha subunit  27.16 
 
 		 234 aa  57  0.0000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.356707  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0213  3-oxoacid CoA-transferase subunit A  27.16 
 
 		 234 aa  57  0.0000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0677248  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>