More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_3173 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_0651  coenzyme A transferase  63.95 
 
 		 542 aa  651    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.364545  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2047  acetyl-CoA-transferase subunit, putative  85.44 
 
 		 533 aa  924    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3570  coenzyme A transferase  67.05 
 
 		 532 aa  728    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.276988  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0872  coenzyme A transferase  85.82 
 
 		 533 aa  929    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1479  coenzyme A transferase  83.55 
 
 		 537 aa  908    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.241297  normal  0.56391 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2224  coenzyme A transferase  68.93 
 
 		 531 aa  758    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.220629  normal  0.779665 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3939  propionate CoA-transferase  64.42 
 
 		 523 aa  688    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.438749 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3173  coenzyme A transferase  100 
 
 		 539 aa  1098    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1375  coenzyme A transferase  84.04 
 
 		 539 aa  898    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1859  propionate CoA-transferase  60.34 
 
 		 544 aa  630  1e-179  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.155788  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2487  coenzyme A transferase  44.36 
 
 		 522 aa  410  1e-113  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3022  coenzyme A transferase  43.76 
 
 		 521 aa  396  1e-109  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.119963 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4049  propionate CoA-transferase  40.34 
 
 		 542 aa  390  1e-107  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0549  coenzyme A transferase  42.46 
 
 		 663 aa  382  1e-105  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0767  coenzyme A transferase  42.21 
 
 		 650 aa  380  1e-104  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1267  coenzyme A transferase  40.26 
 
 		 666 aa  380  1e-104  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0457  propionate CoA-transferase  40.34 
 
 		 667 aa  378  1e-103  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.460217  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0354  coenzyme A transferase  40.49 
 
 		 660 aa  370  1e-101  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0326072  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1595  coenzyme A transferase  40.91 
 
 		 663 aa  372  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0936861  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1494  propionate CoA-transferase  40.79 
 
 		 669 aa  365  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1259  propionate CoA-transferase  40.58 
 
 		 527 aa  366  1e-100  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00406341 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4273  coenzyme A transferase  39.59 
 
 		 673 aa  366  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.335745  normal  0.912388 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0091  propionate CoA-transferase  40.58 
 
 		 516 aa  366  1e-100  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0782  coenzyme A transferase  42.34 
 
 		 667 aa  366  1e-100  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2345  coenzyme A transferase  39.73 
 
 		 660 aa  365  2e-99  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.41755 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2401  coenzyme A transferase  42.15 
 
 		 670 aa  365  2e-99  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.706144 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2071  coenzyme A transferase  39.73 
 
 		 660 aa  364  3e-99  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.10059 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2031  coenzyme A transferase  39.35 
 
 		 660 aa  363  5.0000000000000005e-99  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.287187 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3438  coenzyme A transferase  40.95 
 
 		 633 aa  358  1.9999999999999998e-97  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2684  coenzyme A transferase  39.5 
 
 		 646 aa  357  2.9999999999999997e-97  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1163  coenzyme A transferase  41.41 
 
 		 526 aa  356  6.999999999999999e-97  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.244215  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3933  coenzyme A transferase  41.41 
 
 		 526 aa  356  6.999999999999999e-97  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.60446  normal  0.509869 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1937  coenzyme A transferase  38.45 
 
 		 531 aa  355  8.999999999999999e-97  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00260164 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01652  hypothetical protein  38.45 
 
 		 531 aa  355  1e-96  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01663  fused predicted acetyl-CoA:acetoacetyl-CoA transferase: alpha subunit/beta subunit  38.45 
 
 		 531 aa  355  1e-96  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1948  coenzyme A transferase  38.26 
 
 		 531 aa  354  2e-96  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0367833  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2410  propionate CoA-transferase  38.26 
 
 		 531 aa  354  2e-96  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.407987 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1910  CoA-transferase  38.37 
 
 		 531 aa  354  2e-96  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1897  propionate CoA-transferase  38.07 
 
 		 531 aa  353  2.9999999999999997e-96  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.951112  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8049  coenzyme A transferase  40.61 
 
 		 530 aa  353  2.9999999999999997e-96  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.205109  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1555  coenzyme A transferase  38.75 
 
 		 532 aa  353  5e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.431711  normal  0.989893 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1469  propionate CoA-transferase  37.88 
 
 		 531 aa  353  5.9999999999999994e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.442461  normal  0.0256592 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1453  propionate CoA-transferase  37.88 
 
 		 531 aa  353  5.9999999999999994e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.298558  normal  0.217975 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1986  propionate CoA-transferase  37.88 
 
 		 531 aa  353  5.9999999999999994e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000465126 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1815  propionate CoA-transferase  37.88 
 
 		 531 aa  352  7e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.590331  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1502  propionate CoA-transferase  38.07 
 
 		 531 aa  352  7e-96  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00752619 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1488  propionate CoA-transferase  37.88 
 
 		 531 aa  352  8e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.361869  hitchhiker  0.00740492 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1387  coenzyme A transferase  37.78 
 
 		 531 aa  352  8.999999999999999e-96  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2599  propionate CoA-transferase  37.92 
 
 		 524 aa  349  7e-95  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0709  acyl CoA:acetate/3-ketoacid CoA transferase, alpha and beta subunit  41.41 
 
 		 648 aa  349  8e-95  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2996  coenzyme A transferase  39.01 
 
 		 663 aa  347  3e-94  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1337  coenzyme A transferase  39.58 
 
 		 526 aa  346  5e-94  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.132649 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6427  propionate CoA-transferase  37.67 
 
 		 522 aa  342  1e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.395247  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3280  coenzyme A transferase  39.24 
 
 		 522 aa  338  9.999999999999999e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1541  coenzyme A transferase  38.8 
 
 		 508 aa  337  2.9999999999999997e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2700  coenzyme A transferase  37.92 
 
 		 526 aa  337  2.9999999999999997e-91  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.517315  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1212  coenzyme A transferase  38.54 
 
 		 523 aa  335  1e-90  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3536  acetate/3-ketoacid CoA transferase  36.12 
 
 		 529 aa  329  1.0000000000000001e-88  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4742  CoA-transferase  39.38 
 
 		 513 aa  323  6e-87  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.213334  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4180  coenzyme A transferase  40.59 
 
 		 520 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.307102  hitchhiker  0.000449682 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4678  CoA-transferase  39.96 
 
 		 513 aa  313  3.9999999999999997e-84  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.696656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0883  coenzyme A transferase  38.96 
 
 		 509 aa  313  4.999999999999999e-84  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.021218  normal  0.461656 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4768  CoA-transferase  39.77 
 
 		 513 aa  311  2e-83  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0105899  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04073  putative acetyl-CoA:acetoacetyl-CoA transferase  39.58 
 
 		 513 aa  309  9e-83  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.544432  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04035  hypothetical protein  39.58 
 
 		 513 aa  309  9e-83  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.566302  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4451  CoA-transferase  39.58 
 
 		 513 aa  308  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000533967  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0225  coenzyme A transferase  34.42 
 
 		 520 aa  288  2e-76  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0219  coenzyme A transferase  34.42 
 
 		 520 aa  288  2e-76  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1547  coenzyme A transferase  37.19 
 
 		 433 aa  287  2.9999999999999996e-76  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0263  coenzyme A transferase  37.34 
 
 		 544 aa  286  5.999999999999999e-76  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0361  coenzyme A transferase  35.08 
 
 		 554 aa  285  1.0000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0346  coenzyme A transferase  34.72 
 
 		 554 aa  283  6.000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_21350  predicted protein  37.14 
 
 		 557 aa  280  6e-74  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00403963  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0471  putative transferase protein  34.41 
 
 		 553 aa  279  8e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2585  propionate CoA-transferase  34.36 
 
 		 547 aa  279  1e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.206611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0421  coenzyme A transferase  34.78 
 
 		 543 aa  277  3e-73  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.521688  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0887  coenzyme A transferase  36.04 
 
 		 543 aa  268  2e-70  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.499816  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09394  coenzyme A transferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G04030)  27.43 
 
 		 439 aa  96.7  1e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.504569  normal  0.0471262 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2696  3-oxoacid CoA-transferase B subunit  25.18 
 
 		 448 aa  87.8  5e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.494818  normal  0.507072 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1306  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  25.3 
 
 		 453 aa  80.5  0.00000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5020  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  28.11 
 
 		 249 aa  79  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.363473  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1533  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  25.31 
 
 		 447 aa  78.2  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.172337 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1855  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  29.15 
 
 		 217 aa  75.1  0.000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.945952 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1136  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  26.42 
 
 		 217 aa  73.2  0.00000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2362  acetyl-CoA:acetoacetyl-CoA transferase subunit alpha  25.4 
 
 		 220 aa  72.8  0.00000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10495  coenzyme A transferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G04120)  22.99 
 
 		 506 aa  72.4  0.00000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00529511  normal  0.309681 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02148  acetyl-CoA:acetoacetyl-CoA transferase, alpha subunit  25.4 
 
 		 220 aa  72.8  0.00000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.35571  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1437  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  25.4 
 
 		 220 aa  72.8  0.00000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.364395  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1429  acetyl-CoA:acetoacetyl-CoA transferase subunit alpha  25.4 
 
 		 220 aa  72.8  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00124064 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5059  acetyl-CoA:acetoacetyl-CoA transferase subunit alpha  30.89 
 
 		 226 aa  72  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00434544  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02107  hypothetical protein  25.4 
 
 		 220 aa  72.8  0.00000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.408134  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3273  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  28.74 
 
 		 225 aa  71.2  0.00000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1021  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  23.19 
 
 		 463 aa  71.2  0.00000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2370  acetyl-CoA:acetoacetyl-CoA transferase subunit alpha  25 
 
 		 220 aa  70.5  0.00000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0895417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0212  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  27.64 
 
 		 217 aa  69.7  0.0000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1375  3-oxoacid CoA-transferase  30.04 
 
 		 214 aa  68.9  0.0000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.375962  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1075  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  24.6 
 
 		 218 aa  68.6  0.0000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2608  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  26.09 
 
 		 235 aa  68.6  0.0000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.357891 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5885  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  27.49 
 
 		 235 aa  68.2  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_33142  3-oxoacid CoA-transferase Succinyl-CoA:alpha-ketoacid-CoA transferase  22.03 
 
 		 505 aa  68.6  0.0000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>