More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_0421 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009954  Cmaq_0421  coenzyme A transferase  100 
 
 
543 aa  1103    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.521688  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0887  coenzyme A transferase  56.86 
 
 
543 aa  605  9.999999999999999e-173  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.499816  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0263  coenzyme A transferase  55.39 
 
 
544 aa  596  1e-169  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2599  propionate CoA-transferase  37.92 
 
 
524 aa  337  2.9999999999999997e-91  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2487  coenzyme A transferase  40.49 
 
 
522 aa  329  7e-89  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1267  coenzyme A transferase  38.87 
 
 
666 aa  328  2.0000000000000001e-88  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3536  acetate/3-ketoacid CoA transferase  37.66 
 
 
529 aa  326  5e-88  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3438  coenzyme A transferase  39.47 
 
 
633 aa  315  9.999999999999999e-85  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0457  propionate CoA-transferase  39.04 
 
 
667 aa  313  2.9999999999999996e-84  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.460217  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0767  coenzyme A transferase  38.82 
 
 
650 aa  311  2e-83  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0782  coenzyme A transferase  39.02 
 
 
667 aa  311  2e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1163  coenzyme A transferase  38.87 
 
 
526 aa  310  5e-83  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.244215  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3933  coenzyme A transferase  38.87 
 
 
526 aa  310  5e-83  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.60446  normal  0.509869 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1494  propionate CoA-transferase  39.75 
 
 
669 aa  306  6e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4273  coenzyme A transferase  37.7 
 
 
673 aa  306  7e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.335745  normal  0.912388 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0354  coenzyme A transferase  36.5 
 
 
660 aa  306  8.000000000000001e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0326072  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4049  propionate CoA-transferase  38.13 
 
 
542 aa  305  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0549  coenzyme A transferase  38.22 
 
 
663 aa  303  4.0000000000000003e-81  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1259  propionate CoA-transferase  37.01 
 
 
527 aa  302  1e-80  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00406341 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2684  coenzyme A transferase  36.6 
 
 
646 aa  302  1e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2071  coenzyme A transferase  36.4 
 
 
660 aa  300  5e-80  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.10059 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2401  coenzyme A transferase  37.52 
 
 
670 aa  298  2e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.706144 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2345  coenzyme A transferase  36.21 
 
 
660 aa  297  3e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.41755 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1595  coenzyme A transferase  37.11 
 
 
663 aa  296  6e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0936861  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2996  coenzyme A transferase  35.89 
 
 
663 aa  294  3e-78  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2031  coenzyme A transferase  35.65 
 
 
660 aa  293  4e-78  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.287187 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0091  propionate CoA-transferase  36.71 
 
 
516 aa  292  1e-77  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3022  coenzyme A transferase  35.07 
 
 
521 aa  291  2e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.119963 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1387  coenzyme A transferase  34.39 
 
 
531 aa  290  7e-77  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1986  propionate CoA-transferase  34.64 
 
 
531 aa  288  2e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000465126 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1453  propionate CoA-transferase  34.64 
 
 
531 aa  288  2e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.298558  normal  0.217975 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1469  propionate CoA-transferase  34.64 
 
 
531 aa  288  2e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.442461  normal  0.0256592 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1815  propionate CoA-transferase  34.64 
 
 
531 aa  288  2e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.590331  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0709  acyl CoA:acetate/3-ketoacid CoA transferase, alpha and beta subunit  36.26 
 
 
648 aa  286  5e-76  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2410  propionate CoA-transferase  34.45 
 
 
531 aa  286  8e-76  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.407987 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1488  propionate CoA-transferase  34.45 
 
 
531 aa  286  8e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.361869  hitchhiker  0.00740492 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1937  coenzyme A transferase  34.26 
 
 
531 aa  285  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00260164 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1948  coenzyme A transferase  34.08 
 
 
531 aa  285  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0367833  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1502  propionate CoA-transferase  34.08 
 
 
531 aa  284  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00752619 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01663  fused predicted acetyl-CoA:acetoacetyl-CoA transferase: alpha subunit/beta subunit  34.08 
 
 
531 aa  283  4.0000000000000003e-75  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01652  hypothetical protein  34.08 
 
 
531 aa  283  4.0000000000000003e-75  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1910  CoA-transferase  34.26 
 
 
531 aa  281  2e-74  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1859  propionate CoA-transferase  35.55 
 
 
544 aa  281  2e-74  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.155788  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2224  coenzyme A transferase  34.2 
 
 
531 aa  281  3e-74  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.220629  normal  0.779665 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1897  propionate CoA-transferase  34.08 
 
 
531 aa  280  3e-74  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.951112  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0872  coenzyme A transferase  34.96 
 
 
533 aa  276  5e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2047  acetyl-CoA-transferase subunit, putative  34.94 
 
 
533 aa  276  8e-73  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8049  coenzyme A transferase  36.04 
 
 
530 aa  275  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.205109  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1479  coenzyme A transferase  33.77 
 
 
537 aa  273  7e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.241297  normal  0.56391 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1375  coenzyme A transferase  37.67 
 
 
539 aa  271  2e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3173  coenzyme A transferase  34.78 
 
 
539 aa  270  7e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0651  coenzyme A transferase  33.64 
 
 
542 aa  270  7e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.364545  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3939  propionate CoA-transferase  35.06 
 
 
523 aa  268  2e-70  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.438749 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3570  coenzyme A transferase  34.14 
 
 
532 aa  258  1e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.276988  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1212  coenzyme A transferase  37.07 
 
 
523 aa  257  4e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_21350  predicted protein  34.55 
 
 
557 aa  255  1.0000000000000001e-66  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00403963  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1337  coenzyme A transferase  35.89 
 
 
526 aa  256  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.132649 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3280  coenzyme A transferase  36.03 
 
 
522 aa  254  3e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6427  propionate CoA-transferase  35.1 
 
 
522 aa  253  9.000000000000001e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.395247  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2700  coenzyme A transferase  36.16 
 
 
526 aa  252  1e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.517315  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1555  coenzyme A transferase  34.72 
 
 
532 aa  251  2e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.431711  normal  0.989893 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4742  CoA-transferase  36.53 
 
 
513 aa  250  5e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.213334  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2585  propionate CoA-transferase  32.68 
 
 
547 aa  244  1.9999999999999999e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.206611  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0346  coenzyme A transferase  31.67 
 
 
554 aa  239  8e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4678  CoA-transferase  36.4 
 
 
513 aa  236  9e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.696656  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4451  CoA-transferase  35.97 
 
 
513 aa  235  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000533967  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4768  CoA-transferase  36.4 
 
 
513 aa  236  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0105899  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04073  putative acetyl-CoA:acetoacetyl-CoA transferase  36.21 
 
 
513 aa  234  3e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.544432  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0361  coenzyme A transferase  31.63 
 
 
554 aa  234  3e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04035  hypothetical protein  36.21 
 
 
513 aa  234  3e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.566302  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0471  putative transferase protein  31.85 
 
 
553 aa  230  6e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4180  coenzyme A transferase  32.77 
 
 
520 aa  226  1e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.307102  hitchhiker  0.000449682 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0883  coenzyme A transferase  32.95 
 
 
509 aa  224  4e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.021218  normal  0.461656 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1547  coenzyme A transferase  33.86 
 
 
433 aa  218  2e-55  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1541  coenzyme A transferase  32.04 
 
 
508 aa  210  5e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0225  coenzyme A transferase  29.26 
 
 
520 aa  203  5e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0219  coenzyme A transferase  29.26 
 
 
520 aa  203  5e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2696  3-oxoacid CoA-transferase B subunit  26.85 
 
 
448 aa  85.9  0.000000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.494818  normal  0.507072 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_33142  3-oxoacid CoA-transferase Succinyl-CoA:alpha-ketoacid-CoA transferase  22.65 
 
 
505 aa  81.6  0.00000000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05669  succinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase (ScoT), putative (AFU_orthologue; AFUA_6G12250)  23.62 
 
 
519 aa  80.5  0.00000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1021  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  24.43 
 
 
463 aa  74.3  0.000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1075  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  26.8 
 
 
218 aa  71.6  0.00000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2004  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  30.17 
 
 
239 aa  70.1  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.725633  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1714  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  23.97 
 
 
234 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2732  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  24.71 
 
 
234 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1471  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  29.72 
 
 
219 aa  68.2  0.0000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.155964  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1306  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  24.43 
 
 
453 aa  68.2  0.0000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2658  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  27.71 
 
 
272 aa  67.8  0.0000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2575  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  25.09 
 
 
233 aa  67.8  0.0000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1892  acetate CoA-transferase, subunit A  23.6 
 
 
234 aa  67  0.0000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0590  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  24.43 
 
 
232 aa  67.4  0.0000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2608  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  26.29 
 
 
235 aa  67  0.0000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.357891 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0830  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  31.33 
 
 
218 aa  67  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.127359 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2327  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  23.6 
 
 
234 aa  67  0.0000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.409856 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2399  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  23.6 
 
 
234 aa  67  0.0000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.619037  normal  0.301135 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1525  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  23.6 
 
 
234 aa  66.2  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05860  Succinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase, putative  23.29 
 
 
561 aa  66.2  0.000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.124065  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2851  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  23.6 
 
 
234 aa  66.2  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3228  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  23.97 
 
 
234 aa  66.2  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.761635  normal  0.0239407 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1667  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  23.6 
 
 
234 aa  66.6  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>