More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_2004 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_2004  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  100 
 
 		 239 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.725633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1471  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  75.46 
 
 		 219 aa  323  1e-87  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.155964  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0830  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  73.15 
 
 		 218 aa  318  6e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.127359 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2491  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  71.96 
 
 		 219 aa  306  3e-82  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000498099 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1382  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  70.83 
 
 		 218 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0867  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  67.13 
 
 		 216 aa  296  2e-79  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0211  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  68.6 
 
 		 216 aa  294  1e-78  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1135  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  67.15 
 
 		 214 aa  291  8e-78  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2278  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  69.23 
 
 		 208 aa  282  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1856  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  64.25 
 
 		 222 aa  281  9e-75  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1076  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  61.24 
 
 		 216 aa  271  5.000000000000001e-72  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1572  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  65.38 
 
 		 213 aa  265  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.494559 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3274  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  63.43 
 
 		 218 aa  263  2e-69  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.948556 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1909  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  59.62 
 
 		 219 aa  253  3e-66  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1075  coenzyme A transferase, beta subunit  60.1 
 
 		 220 aa  252  4.0000000000000004e-66  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.425854 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2247  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  59.62 
 
 		 219 aa  250  1e-65  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1161  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  58.17 
 
 		 215 aa  248  6e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3170  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  56.68 
 
 		 215 aa  246  3e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4338  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  56.87 
 
 		 222 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0323675  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3297  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  55.45 
 
 		 218 aa  231  6e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2371  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  53.42 
 
 		 216 aa  230  2e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0826912  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02149  acetyl-CoA:acetoacetyl-CoA transferase, beta subunit  53.42 
 
 		 216 aa  230  2e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.746207  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1436  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  53.42 
 
 		 216 aa  230  2e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.633734  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1139  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  51.66 
 
 		 218 aa  229  2e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.477496 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1428  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  53.42 
 
 		 216 aa  230  2e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.773263  hitchhiker  0.000356142 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2363  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  53.42 
 
 		 216 aa  230  2e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02108  hypothetical protein  53.42 
 
 		 216 aa  230  2e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.796966  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0887  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  54.21 
 
 		 217 aa  229  2e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3294  putative CoA transferase, subunit B  52.13 
 
 		 218 aa  227  1e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.15294  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38640  putative CoA transferase, subunit B  52.13 
 
 		 218 aa  227  1e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.426102  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03100  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase, beta subunit  52.53 
 
 		 217 aa  226  2e-58  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1669  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  52.36 
 
 		 218 aa  226  2e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1164  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  52.8 
 
 		 229 aa  226  3e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1452  3-oxoacid CoA-transferase  52.13 
 
 		 218 aa  225  6e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00341898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1011  coenzyme A transferase  56.93 
 
 		 216 aa  224  7e-58  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.185512 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1726  3-oxoacid CoA-transferase subunit B  57.5 
 
 		 213 aa  224  1e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.445298  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0952  3-oxoacid CoA-transferase subunit B  57.5 
 
 		 213 aa  224  1e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.334541  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1107  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase beta subunit  57.5 
 
 		 213 aa  224  1e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.485565  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3238  3-oxoacid CoA-transferase  52.71 
 
 		 218 aa  224  1e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.507702  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0212  3-oxoacid CoA-transferase subunit B  57.5 
 
 		 213 aa  224  1e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00734779  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1878  succinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase subunit B  57.5 
 
 		 213 aa  224  1e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0343592  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2432  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  52.13 
 
 		 218 aa  224  1e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1549  3-oxoacid CoA-transferase subunit B  57.5 
 
 		 213 aa  224  1e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0591  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  52.63 
 
 		 217 aa  224  1e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1700  succinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase subunit B  57.5 
 
 		 213 aa  224  1e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.375649  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2059  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  58.13 
 
 		 220 aa  224  1e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3123  3-oxoacid CoA-transferase subunit B  52.13 
 
 		 218 aa  223  2e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.818708 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4284  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  58.25 
 
 		 215 aa  223  2e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.18483 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51600  3-oxoacid CoA-transferase  52.71 
 
 		 218 aa  223  2e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2075  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  50.47 
 
 		 221 aa  223  3e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2593  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  52.13 
 
 		 218 aa  222  3e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12525  succinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase beta subunit scoB  56.44 
 
 		 218 aa  222  4e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.288021  normal  0.0468104 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2734  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  52.13 
 
 		 218 aa  222  4e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2607  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase beta subunit  57 
 
 		 213 aa  221  4.9999999999999996e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1367  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  56.5 
 
 		 213 aa  221  6e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07040  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  58.13 
 
 		 222 aa  221  6e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.238632 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3456  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B family  52.22 
 
 		 218 aa  221  7e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2917  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  52.31 
 
 		 219 aa  221  7e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000753738 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3229  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  52.13 
 
 		 218 aa  221  8e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0245093 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2804  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  51.67 
 
 		 218 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.753217  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17560  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  57.65 
 
 		 202 aa  221  9.999999999999999e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1783  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  56.5 
 
 		 213 aa  220  9.999999999999999e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3046  CoA-transferase, beta subunit  53.47 
 
 		 220 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6962  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  51.85 
 
 		 219 aa  220  9.999999999999999e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.978999  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1356  3-oxoacid CoA-transferase  53.11 
 
 		 218 aa  220  9.999999999999999e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.684977 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2330  CoA-transferase, beta subunit  52.97 
 
 		 220 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0269075  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3054  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  49.76 
 
 		 219 aa  220  1.9999999999999999e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.178254 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0519  3-oxoacid CoA-transferase  52.63 
 
 		 221 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.216025 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4611  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  55.94 
 
 		 213 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00383872  normal  0.923474 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2760  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  56 
 
 		 213 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2277  CoA-transferase, beta subunit  52.97 
 
 		 220 aa  219  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3848  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  55.94 
 
 		 215 aa  219  3e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0238959  normal  0.733298 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2404  CoA-transferase, beta subunit  52.48 
 
 		 220 aa  218  5e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3292  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  51.89 
 
 		 219 aa  218  5e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0655  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  51.89 
 
 		 220 aa  218  5e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.994657 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1351  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  56.5 
 
 		 213 aa  218  5e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.897973  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3468  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  51.89 
 
 		 220 aa  218  5e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0331  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  56.72 
 
 		 214 aa  218  5e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1407  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  55.77 
 
 		 268 aa  218  6e-56  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000217887 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1597  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase, beta subunit  51.66 
 
 		 218 aa  217  1e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.237466  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1891  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase, beta subunit  52.63 
 
 		 218 aa  218  1e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1524  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  52.63 
 
 		 218 aa  217  1e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2576  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  50.71 
 
 		 218 aa  218  1e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1391  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  56 
 
 		 213 aa  217  1e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.755461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2979  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  52.63 
 
 		 218 aa  217  1e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2834  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  52.63 
 
 		 218 aa  217  1e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2852  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  52.63 
 
 		 218 aa  217  1e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2321  CoA-transferase, beta subunit  52.48 
 
 		 220 aa  217  2e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2258  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  53.43 
 
 		 226 aa  217  2e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.545318  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2141  CoA-transferase subunit beta  52.48 
 
 		 220 aa  217  2e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.356261  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2079  aetate CoA-transferase, beta subunit  52.48 
 
 		 220 aa  217  2e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2075  aetate CoA-transferase, beta subunit  52.48 
 
 		 220 aa  217  2e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1713  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  52.63 
 
 		 218 aa  216  2e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01940  3-oxoacid CoA-transferase subunit B family enzyme  51.67 
 
 		 217 aa  217  2e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0468596  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2296  CoA-transferase subunit beta  52.48 
 
 		 220 aa  217  2e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.489848  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1013  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  54.46 
 
 		 216 aa  217  2e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.300705  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2328  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  52.63 
 
 		 218 aa  216  2e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.208746 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2400  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  52.63 
 
 		 218 aa  216  2e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.724461  normal  0.313356 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1666  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  52.63 
 
 		 218 aa  216  2e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0809  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  55 
 
 		 209 aa  216  2.9999999999999998e-55  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>