More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_1669 on replicon NC_009801
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009801  EcE24377A_1669  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  100 
 
 
218 aa  442  1e-123  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3294  putative CoA transferase, subunit B  88.43 
 
 
218 aa  396  1e-109  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.15294  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38640  putative CoA transferase, subunit B  88.43 
 
 
218 aa  396  1e-109  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.426102  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2075  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  86.11 
 
 
221 aa  390  1e-108  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0591  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  88.02 
 
 
217 aa  391  1e-108  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1139  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  86.11 
 
 
218 aa  387  1e-107  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.477496 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3123  3-oxoacid CoA-transferase subunit B  86.11 
 
 
218 aa  383  1e-105  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.818708 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2593  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  86.11 
 
 
218 aa  383  1e-105  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2432  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  85.65 
 
 
218 aa  381  1e-105  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2734  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  85.65 
 
 
218 aa  382  1e-105  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3054  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  82.87 
 
 
219 aa  377  1e-104  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.178254 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3238  3-oxoacid CoA-transferase  83.8 
 
 
218 aa  377  1e-104  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.507702  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3456  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B family  83.8 
 
 
218 aa  375  1e-103  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51600  3-oxoacid CoA-transferase  83.8 
 
 
218 aa  376  1e-103  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1356  3-oxoacid CoA-transferase  81.48 
 
 
218 aa  366  1e-100  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.684977 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2834  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  81.48 
 
 
218 aa  366  1e-100  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1713  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  81.02 
 
 
218 aa  363  1e-100  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2852  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  81.48 
 
 
218 aa  367  1e-100  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1524  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  81.48 
 
 
218 aa  366  1e-100  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2979  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  81.48 
 
 
218 aa  366  1e-100  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3292  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  80.18 
 
 
219 aa  363  1e-100  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0655  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  80.18 
 
 
220 aa  363  1e-100  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.994657 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1891  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase, beta subunit  80.56 
 
 
218 aa  363  1e-99  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3468  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  79.72 
 
 
220 aa  362  2e-99  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2328  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  80.56 
 
 
218 aa  362  3e-99  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.208746 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2400  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  80.56 
 
 
218 aa  362  3e-99  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.724461  normal  0.313356 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1666  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  80.56 
 
 
218 aa  362  3e-99  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0519  3-oxoacid CoA-transferase  79.72 
 
 
221 aa  361  4e-99  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.216025 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2252  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  81.02 
 
 
218 aa  361  5.0000000000000005e-99  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2733  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  80.09 
 
 
218 aa  361  6e-99  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2576  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  80.09 
 
 
218 aa  360  7.0000000000000005e-99  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3229  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  80.09 
 
 
218 aa  360  1e-98  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0245093 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2804  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  80.09 
 
 
218 aa  360  1e-98  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.753217  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1452  3-oxoacid CoA-transferase  79.17 
 
 
218 aa  357  6e-98  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00341898  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1597  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase, beta subunit  75.93 
 
 
218 aa  345  3e-94  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.237466  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01940  3-oxoacid CoA-transferase subunit B family enzyme  73.73 
 
 
217 aa  339  2e-92  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0468596  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1619  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  73.49 
 
 
218 aa  333  1e-90  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2917  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  67.59 
 
 
219 aa  301  7.000000000000001e-81  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000753738 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6962  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  65.44 
 
 
219 aa  292  3e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.978999  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03100  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase, beta subunit  64.06 
 
 
217 aa  287  7e-77  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0887  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  64.19 
 
 
217 aa  286  1e-76  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0809  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  64.56 
 
 
209 aa  284  9e-76  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0518  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  63.59 
 
 
210 aa  273  1.0000000000000001e-72  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.19694 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3297  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  60.19 
 
 
218 aa  273  2.0000000000000002e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03176  succinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase subunit B  64 
 
 
209 aa  272  2.0000000000000002e-72  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.303462  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3848  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  65.84 
 
 
215 aa  271  8.000000000000001e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0238959  normal  0.733298 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2760  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  59.71 
 
 
213 aa  269  2.9999999999999997e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1571  succinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase subunit B protein  60.77 
 
 
212 aa  268  4e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1407  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  59.33 
 
 
268 aa  268  4e-71  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000217887 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1593  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  63.5 
 
 
209 aa  268  4e-71  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7913  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  59.42 
 
 
221 aa  268  7e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1367  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  59.71 
 
 
213 aa  267  8.999999999999999e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1429  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  63 
 
 
209 aa  267  1e-70  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.164203 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1705  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  61.76 
 
 
209 aa  267  1e-70  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1270  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  60.29 
 
 
212 aa  266  2e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1389  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  59.33 
 
 
255 aa  266  2e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0566  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  62.87 
 
 
219 aa  265  5.999999999999999e-70  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1562  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  59.8 
 
 
213 aa  263  1e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1783  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  59.71 
 
 
213 aa  263  2e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1154  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  60.29 
 
 
212 aa  262  2e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1476  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  57.67 
 
 
219 aa  262  3e-69  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.038287  normal  0.12448 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0826  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  60.29 
 
 
216 aa  262  4e-69  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18940  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  60.1 
 
 
217 aa  261  6e-69  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0409943  normal  0.556426 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1134  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  63.32 
 
 
208 aa  260  8.999999999999999e-69  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.530595  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4338  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  56.94 
 
 
222 aa  260  1e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0323675  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2607  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase beta subunit  59.22 
 
 
213 aa  260  1e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2124  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  63.37 
 
 
211 aa  259  2e-68  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4355  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  56.04 
 
 
218 aa  259  3e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4611  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  58.82 
 
 
213 aa  258  4e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00383872  normal  0.923474 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1391  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  58.74 
 
 
213 aa  258  4e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.755461  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07040  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  57.49 
 
 
222 aa  258  5.0000000000000005e-68  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.238632 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1164  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  56.07 
 
 
229 aa  258  5.0000000000000005e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1013  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  59.61 
 
 
216 aa  258  7e-68  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.300705  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1444  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  58.74 
 
 
213 aa  258  7e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.085725  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0984  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  58.74 
 
 
213 aa  258  7e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1466  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  58.74 
 
 
213 aa  258  7e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1549  3-oxoacid CoA-transferase subunit B  58.74 
 
 
213 aa  257  8e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1700  succinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase subunit B  58.74 
 
 
213 aa  257  8e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.375649  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1107  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase beta subunit  58.74 
 
 
213 aa  257  8e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.485565  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1878  succinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase subunit B  58.74 
 
 
213 aa  257  8e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0343592  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0212  3-oxoacid CoA-transferase subunit B  58.74 
 
 
213 aa  257  8e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00734779  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1726  3-oxoacid CoA-transferase subunit B  58.74 
 
 
213 aa  257  8e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.445298  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0952  3-oxoacid CoA-transferase subunit B  58.74 
 
 
213 aa  257  8e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.334541  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4284  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  59.13 
 
 
215 aa  257  1e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.18483 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5437  3-oxoadipate CoA-transferase subunit B  61.43 
 
 
215 aa  256  1e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12525  succinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase beta subunit scoB  57.28 
 
 
218 aa  256  2e-67  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.288021  normal  0.0468104 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1351  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  57.77 
 
 
213 aa  256  2e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.897973  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2350  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  60.1 
 
 
214 aa  256  3e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17560  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  61.22 
 
 
202 aa  256  3e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1652  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  60.29 
 
 
211 aa  255  4e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.200149  normal  0.0417322 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08490  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  57.21 
 
 
224 aa  254  5e-67  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.506696 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2634  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  57.69 
 
 
212 aa  254  5e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.428059  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4888  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  65.84 
 
 
220 aa  253  1.0000000000000001e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.544225  normal  0.033457 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1596  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  60.47 
 
 
218 aa  253  1.0000000000000001e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1501  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  60.47 
 
 
218 aa  253  1.0000000000000001e-66  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1350  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  56.46 
 
 
228 aa  253  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.596228 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1982  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  59.81 
 
 
211 aa  253  2.0000000000000002e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1983  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  59.31 
 
 
212 aa  252  2.0000000000000002e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000315327 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2883  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  60.7 
 
 
236 aa  252  3e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.182423  normal  0.207239 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2363  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  60 
 
 
219 aa  252  3e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0158273  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>