More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4888 on replicon NC_009508
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009508  Swit_4888  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  100 
 
 
220 aa  445  1.0000000000000001e-124  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.544225  normal  0.033457 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3848  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  77.62 
 
 
215 aa  339  2e-92  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0238959  normal  0.733298 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2124  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  75.36 
 
 
211 aa  325  3e-88  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3824  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  80.86 
 
 
212 aa  325  5e-88  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0809  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  75.6 
 
 
209 aa  320  7e-87  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1011  coenzyme A transferase  72.6 
 
 
216 aa  318  3e-86  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.185512 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0566  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  72.2 
 
 
219 aa  310  1e-83  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1562  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  70.23 
 
 
213 aa  308  2.9999999999999997e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3146  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  74.76 
 
 
219 aa  307  8e-83  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.163127  normal  0.346959 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3044  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  74.76 
 
 
241 aa  307  9e-83  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2920  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  74.29 
 
 
219 aa  306  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.911892  normal  0.370214 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2350  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  67.62 
 
 
214 aa  306  1.0000000000000001e-82  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5857  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  73.81 
 
 
221 aa  306  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.336903  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2258  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  69.71 
 
 
226 aa  302  2.0000000000000002e-81  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.545318  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1435  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  73.56 
 
 
216 aa  302  2.0000000000000002e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4634  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  73.56 
 
 
216 aa  301  5.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1141  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  74.52 
 
 
220 aa  300  1e-80  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.115046  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5437  3-oxoadipate CoA-transferase subunit B  72.3 
 
 
215 aa  300  1e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0826  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  71.3 
 
 
216 aa  299  3e-80  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1459  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  72.6 
 
 
216 aa  299  3e-80  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.961201 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3949  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  72.6 
 
 
216 aa  298  3e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1247  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  72.82 
 
 
216 aa  298  3e-80  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.272064  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5000  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  74.06 
 
 
220 aa  299  3e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.54991  hitchhiker  0.00178091 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1476  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  70.53 
 
 
219 aa  299  3e-80  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.038287  normal  0.12448 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1783  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  68.22 
 
 
213 aa  298  4e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6365  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  71.7 
 
 
221 aa  297  7e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0457042  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1367  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  67.76 
 
 
213 aa  297  9e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2760  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  67.76 
 
 
213 aa  296  2e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1013  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  70.37 
 
 
216 aa  295  4e-79  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.300705  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2607  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase beta subunit  67.29 
 
 
213 aa  294  7e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4611  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  67.29 
 
 
213 aa  292  2e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00383872  normal  0.923474 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1391  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  67.29 
 
 
213 aa  292  2e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.755461  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2970  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  74.04 
 
 
220 aa  292  3e-78  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.421723 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0212  3-oxoacid CoA-transferase subunit B  66.98 
 
 
213 aa  291  4e-78  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00734779  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1571  succinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase subunit B protein  69.05 
 
 
212 aa  291  4e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1700  succinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase subunit B  66.98 
 
 
213 aa  291  4e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.375649  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1726  3-oxoacid CoA-transferase subunit B  66.98 
 
 
213 aa  291  4e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.445298  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1107  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase beta subunit  66.98 
 
 
213 aa  291  4e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.485565  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1878  succinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase subunit B  66.98 
 
 
213 aa  291  4e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0343592  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0952  3-oxoacid CoA-transferase subunit B  66.98 
 
 
213 aa  291  4e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.334541  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1351  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  66.82 
 
 
213 aa  291  4e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.897973  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1549  3-oxoacid CoA-transferase subunit B  66.98 
 
 
213 aa  291  4e-78  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1705  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  67.14 
 
 
209 aa  290  1e-77  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1444  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  66.82 
 
 
213 aa  290  1e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.085725  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0984  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  66.82 
 
 
213 aa  290  1e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1466  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  66.82 
 
 
213 aa  290  1e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0573  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  67.63 
 
 
211 aa  290  2e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.109491  normal  0.423863 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1270  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  69.19 
 
 
212 aa  288  3e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6829  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  74.63 
 
 
209 aa  288  5.0000000000000004e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0752786  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0518  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  69.42 
 
 
210 aa  288  6e-77  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.19694 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1134  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  67.46 
 
 
208 aa  287  8e-77  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.530595  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4165  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  65.7 
 
 
211 aa  287  1e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.829628  normal  0.185202 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1429  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  66.67 
 
 
209 aa  286  2e-76  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.164203 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1593  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  66.67 
 
 
209 aa  286  2e-76  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1154  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  70 
 
 
212 aa  286  2e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2341  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  67.94 
 
 
208 aa  285  2.9999999999999996e-76  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0563  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  70.81 
 
 
209 aa  285  5e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03176  succinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase subunit B  69.42 
 
 
209 aa  284  7e-76  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.303462  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1983  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  69.05 
 
 
212 aa  283  1.0000000000000001e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000315327 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1913  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  70.81 
 
 
209 aa  283  1.0000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.160848  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4684  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  71.5 
 
 
214 aa  283  1.0000000000000001e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.453333 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0958  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  74.15 
 
 
216 aa  283  2.0000000000000002e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.223277  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3109  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  70.33 
 
 
209 aa  282  3.0000000000000004e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0179198  normal  0.0278919 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18940  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  67.66 
 
 
217 aa  281  6.000000000000001e-75  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0409943  normal  0.556426 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2634  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  68.1 
 
 
212 aa  281  7.000000000000001e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.428059  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07040  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  64.9 
 
 
222 aa  280  1e-74  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.238632 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7913  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  63.81 
 
 
221 aa  280  2e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3261  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  67.77 
 
 
212 aa  280  2e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.812552  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3846  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  65.55 
 
 
223 aa  280  2e-74  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2883  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  63.13 
 
 
236 aa  278  4e-74  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.182423  normal  0.207239 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2657  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  67.14 
 
 
212 aa  278  5e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17560  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  69.31 
 
 
202 aa  278  5e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2106  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  66.34 
 
 
215 aa  277  1e-73  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.422134  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1407  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  63.77 
 
 
268 aa  276  2e-73  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000217887 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51600  3-oxoacid CoA-transferase  65.37 
 
 
218 aa  275  3e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0490  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  65.26 
 
 
234 aa  275  3e-73  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.906071  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1982  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  67.62 
 
 
211 aa  275  4e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4355  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  64.56 
 
 
218 aa  275  4e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1005  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  69.08 
 
 
207 aa  275  4e-73  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.282605  normal  0.384251 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1164  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  65.35 
 
 
229 aa  275  4e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1652  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  67.62 
 
 
211 aa  274  6e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.200149  normal  0.0417322 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1457  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  66.2 
 
 
212 aa  274  7e-73  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0588304  normal  0.817341 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2607  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  66.19 
 
 
213 aa  274  7e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.348685 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4891  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  63.16 
 
 
211 aa  274  7e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.690445  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1763  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  65.73 
 
 
212 aa  274  9e-73  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.255353  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1962  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  65.73 
 
 
212 aa  274  9e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4163  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  59.91 
 
 
215 aa  273  1.0000000000000001e-72  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1350  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  61.72 
 
 
228 aa  273  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.596228 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3297  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  66.18 
 
 
218 aa  273  2.0000000000000002e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3126  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  67.62 
 
 
213 aa  273  2.0000000000000002e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.859515  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0647  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  63.59 
 
 
227 aa  273  2.0000000000000002e-72  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2075  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  64.39 
 
 
221 aa  270  1e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2576  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  64.39 
 
 
218 aa  270  1e-71  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1669  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  65.84 
 
 
218 aa  270  2e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3229  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  64.88 
 
 
218 aa  269  2e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0245093 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1891  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase, beta subunit  63.9 
 
 
218 aa  269  2e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1389  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  63.29 
 
 
255 aa  269  2e-71  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12525  succinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase beta subunit scoB  61.84 
 
 
218 aa  268  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.288021  normal  0.0468104 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2834  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  63.9 
 
 
218 aa  269  2.9999999999999997e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2979  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  63.9 
 
 
218 aa  269  2.9999999999999997e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>