More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_0518 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_0518  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  100 
 
 
210 aa  422  1e-117  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.19694 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03176  succinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase subunit B  87.44 
 
 
209 aa  369  1e-101  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.303462  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0809  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  83.25 
 
 
209 aa  339  2e-92  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2760  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  79.9 
 
 
213 aa  336  9.999999999999999e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1367  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  78.92 
 
 
213 aa  334  5.999999999999999e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1571  succinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase subunit B protein  77.36 
 
 
212 aa  333  2e-90  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1593  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  77.99 
 
 
209 aa  330  1e-89  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1154  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  77.36 
 
 
212 aa  330  1e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1429  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  77.51 
 
 
209 aa  329  2e-89  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.164203 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1783  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  78.43 
 
 
213 aa  325  2.0000000000000001e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1705  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  78.05 
 
 
209 aa  325  3e-88  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4611  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  77.94 
 
 
213 aa  325  3e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00383872  normal  0.923474 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1562  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  77.94 
 
 
213 aa  325  4.0000000000000003e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1270  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  76.89 
 
 
212 aa  324  5e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2607  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  75.59 
 
 
213 aa  324  7e-88  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.348685 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2607  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase beta subunit  78.43 
 
 
213 aa  324  7e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0952  3-oxoacid CoA-transferase subunit B  76.96 
 
 
213 aa  322  2e-87  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.334541  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0212  3-oxoacid CoA-transferase subunit B  76.96 
 
 
213 aa  322  2e-87  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00734779  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1726  3-oxoacid CoA-transferase subunit B  76.96 
 
 
213 aa  322  2e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.445298  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1107  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase beta subunit  76.96 
 
 
213 aa  322  2e-87  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.485565  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1878  succinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase subunit B  76.96 
 
 
213 aa  322  2e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0343592  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1444  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  77.94 
 
 
213 aa  323  2e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.085725  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1700  succinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase subunit B  76.96 
 
 
213 aa  322  2e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.375649  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1549  3-oxoacid CoA-transferase subunit B  76.96 
 
 
213 aa  322  2e-87  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0984  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  77.94 
 
 
213 aa  323  2e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1466  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  77.94 
 
 
213 aa  323  2e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1391  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  77.45 
 
 
213 aa  321  4e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.755461  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1983  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  76.3 
 
 
212 aa  320  7e-87  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000315327 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1351  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  76.96 
 
 
213 aa  320  9.000000000000001e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.897973  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2634  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  74.41 
 
 
212 aa  313  9.999999999999999e-85  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.428059  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2657  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  72.64 
 
 
212 aa  311  3.9999999999999997e-84  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1652  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  73.11 
 
 
211 aa  311  4.999999999999999e-84  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.200149  normal  0.0417322 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1457  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  73.46 
 
 
212 aa  309  2e-83  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0588304  normal  0.817341 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1982  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  72.64 
 
 
211 aa  309  2e-83  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3261  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  72.3 
 
 
212 aa  306  1.0000000000000001e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.812552  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4265  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  72.77 
 
 
212 aa  306  1.0000000000000001e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0745238  normal  0.356459 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1013  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  71.15 
 
 
216 aa  306  2.0000000000000002e-82  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.300705  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17560  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  75.25 
 
 
202 aa  306  2.0000000000000002e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0826  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  71.15 
 
 
216 aa  304  6e-82  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1906  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  71.23 
 
 
211 aa  302  3.0000000000000004e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.750884 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3126  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  72.43 
 
 
213 aa  301  4.0000000000000003e-81  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.859515  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18940  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  70 
 
 
217 aa  297  6e-80  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0409943  normal  0.556426 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1962  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  70.89 
 
 
212 aa  297  6e-80  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1763  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  70.89 
 
 
212 aa  297  6e-80  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.255353  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1476  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  69.08 
 
 
219 aa  297  9e-80  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.038287  normal  0.12448 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0331  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  67.62 
 
 
214 aa  291  3e-78  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7913  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  68.47 
 
 
221 aa  291  7e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3848  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  67.94 
 
 
215 aa  289  2e-77  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0238959  normal  0.733298 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2258  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  68.72 
 
 
226 aa  288  3e-77  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.545318  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2350  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  66.99 
 
 
214 aa  288  3e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2883  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  69.95 
 
 
236 aa  288  5.0000000000000004e-77  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.182423  normal  0.207239 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1134  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  65.87 
 
 
208 aa  288  6e-77  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.530595  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4891  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  68.97 
 
 
211 aa  287  8e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.690445  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2106  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  70.44 
 
 
215 aa  287  9e-77  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.422134  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0647  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  67.59 
 
 
227 aa  286  2e-76  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12525  succinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase beta subunit scoB  66.99 
 
 
218 aa  285  2.9999999999999996e-76  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.288021  normal  0.0468104 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2124  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  64.76 
 
 
211 aa  285  2.9999999999999996e-76  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1350  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  67.65 
 
 
228 aa  283  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.596228 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0490  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  69.34 
 
 
234 aa  283  1.0000000000000001e-75  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.906071  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0566  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  64.59 
 
 
219 aa  283  2.0000000000000002e-75  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08490  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  65.7 
 
 
224 aa  282  2.0000000000000002e-75  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.506696 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4355  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  67.16 
 
 
218 aa  281  6.000000000000001e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3294  putative CoA transferase, subunit B  64.53 
 
 
218 aa  281  6.000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.15294  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38640  putative CoA transferase, subunit B  64.53 
 
 
218 aa  281  6.000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.426102  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1011  coenzyme A transferase  65.71 
 
 
216 aa  280  8.000000000000001e-75  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.185512 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07040  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  68.81 
 
 
222 aa  280  1e-74  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.238632 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2075  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  63.05 
 
 
221 aa  279  2e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3824  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  70.19 
 
 
212 aa  278  5e-74  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2503  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  66.99 
 
 
228 aa  276  1e-73  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0825611  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5437  3-oxoadipate CoA-transferase subunit B  67.94 
 
 
215 aa  276  1e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4284  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  66.83 
 
 
215 aa  276  1e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.18483 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3297  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  66.5 
 
 
218 aa  276  2e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2970  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  69.63 
 
 
220 aa  276  2e-73  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.421723 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51600  3-oxoacid CoA-transferase  62.56 
 
 
218 aa  275  4e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3146  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  65.9 
 
 
219 aa  274  6e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.163127  normal  0.346959 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2920  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  65.44 
 
 
219 aa  274  7e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.911892  normal  0.370214 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1164  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  62.75 
 
 
229 aa  274  8e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1669  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  63.59 
 
 
218 aa  273  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2734  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  62.56 
 
 
218 aa  273  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3044  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  65.89 
 
 
241 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2593  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  62.56 
 
 
218 aa  272  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4163  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  63.64 
 
 
215 aa  273  2.0000000000000002e-72  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5857  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  66.67 
 
 
221 aa  272  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.336903  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3123  3-oxoacid CoA-transferase subunit B  62.56 
 
 
218 aa  272  3e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.818708 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1435  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  68.1 
 
 
216 aa  272  3e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2341  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  64.9 
 
 
208 aa  272  3e-72  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4634  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  68.1 
 
 
216 aa  270  8.000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0563  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  67.31 
 
 
209 aa  270  1e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4165  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  61.9 
 
 
211 aa  270  1e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.829628  normal  0.185202 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4684  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  68.93 
 
 
214 aa  270  1e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.453333 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1387  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  65.02 
 
 
229 aa  270  1e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.104007  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0573  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  63.9 
 
 
211 aa  270  1e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.109491  normal  0.423863 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1139  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  62.07 
 
 
218 aa  270  1e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.477496 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1369  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  65.02 
 
 
229 aa  270  1e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1403  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  65.02 
 
 
229 aa  270  1e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3109  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  66.83 
 
 
209 aa  270  1e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0179198  normal  0.0278919 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0591  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  63 
 
 
217 aa  269  2e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5000  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  66.51 
 
 
220 aa  269  2e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.54991  hitchhiker  0.00178091 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1913  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  67.31 
 
 
209 aa  269  2e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.160848  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2432  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  61.58 
 
 
218 aa  269  2e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>