More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc1571 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003295  RSc1571  succinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase subunit B protein  100 
 
 
212 aa  427  1e-119  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1270  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  90.09 
 
 
212 aa  385  1e-106  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1652  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  88.21 
 
 
211 aa  380  1e-105  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.200149  normal  0.0417322 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1154  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  87.26 
 
 
212 aa  380  1e-105  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1982  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  87.26 
 
 
211 aa  377  1e-104  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1983  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  84.36 
 
 
212 aa  366  1e-100  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000315327 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2607  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  82.55 
 
 
213 aa  357  7e-98  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.348685 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2634  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  81.99 
 
 
212 aa  353  6.999999999999999e-97  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.428059  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0826  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  80.29 
 
 
216 aa  353  1e-96  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1763  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  83.49 
 
 
212 aa  352  2e-96  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.255353  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1962  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  83.49 
 
 
212 aa  352  2e-96  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1013  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  80.29 
 
 
216 aa  352  2e-96  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.300705  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1367  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  82.94 
 
 
213 aa  352  2.9999999999999997e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4265  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  83.02 
 
 
212 aa  351  4e-96  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0745238  normal  0.356459 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2657  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  81.13 
 
 
212 aa  351  5e-96  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2760  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  82.94 
 
 
213 aa  350  7e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1457  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  82.46 
 
 
212 aa  349  1e-95  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0588304  normal  0.817341 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1562  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  82.94 
 
 
213 aa  347  5e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0809  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  80.09 
 
 
209 aa  347  8e-95  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3126  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  81.13 
 
 
213 aa  346  2e-94  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.859515  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1391  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  81.99 
 
 
213 aa  345  3e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.755461  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1351  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  81.52 
 
 
213 aa  344  5e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.897973  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1906  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  79.25 
 
 
211 aa  343  7e-94  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.750884 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3261  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  80.19 
 
 
212 aa  343  1e-93  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.812552  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0952  3-oxoacid CoA-transferase subunit B  81.04 
 
 
213 aa  342  2e-93  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.334541  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1700  succinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase subunit B  81.04 
 
 
213 aa  342  2e-93  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.375649  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1107  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase beta subunit  81.04 
 
 
213 aa  342  2e-93  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.485565  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1878  succinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase subunit B  81.04 
 
 
213 aa  342  2e-93  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0343592  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4611  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  81.04 
 
 
213 aa  342  2e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00383872  normal  0.923474 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1726  3-oxoacid CoA-transferase subunit B  81.04 
 
 
213 aa  342  2e-93  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.445298  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1549  3-oxoacid CoA-transferase subunit B  81.04 
 
 
213 aa  342  2e-93  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1783  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  81.04 
 
 
213 aa  343  2e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0212  3-oxoacid CoA-transferase subunit B  81.04 
 
 
213 aa  342  2e-93  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00734779  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2607  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase beta subunit  81.04 
 
 
213 aa  341  5.999999999999999e-93  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0984  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  80.57 
 
 
213 aa  339  2e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1444  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  80.57 
 
 
213 aa  339  2e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.085725  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1466  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  80.57 
 
 
213 aa  339  2e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0518  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  77.36 
 
 
210 aa  333  2e-90  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.19694 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03176  succinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase subunit B  78.2 
 
 
209 aa  327  6e-89  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.303462  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17560  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  78.71 
 
 
202 aa  319  1.9999999999999998e-86  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1705  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  72.51 
 
 
209 aa  313  9.999999999999999e-85  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1593  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  71.56 
 
 
209 aa  306  2.0000000000000002e-82  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1429  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  70.75 
 
 
209 aa  305  3e-82  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.164203 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5857  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  70.48 
 
 
221 aa  301  6.000000000000001e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.336903  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1476  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  71.01 
 
 
219 aa  301  6.000000000000001e-81  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.038287  normal  0.12448 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2124  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  68.22 
 
 
211 aa  300  1e-80  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3044  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  70 
 
 
241 aa  295  3e-79  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6365  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  71.9 
 
 
221 aa  295  4e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0457042  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3146  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  69.52 
 
 
219 aa  294  8e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.163127  normal  0.346959 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0566  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  66.04 
 
 
219 aa  293  9e-79  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2920  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  69.05 
 
 
219 aa  293  1e-78  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.911892  normal  0.370214 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3848  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  67.46 
 
 
215 aa  292  2e-78  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0238959  normal  0.733298 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1134  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  66.67 
 
 
208 aa  290  7e-78  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.530595  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12525  succinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase beta subunit scoB  68.29 
 
 
218 aa  290  8e-78  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.288021  normal  0.0468104 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2350  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  66.2 
 
 
214 aa  288  4e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5000  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  69.52 
 
 
220 aa  288  5.0000000000000004e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.54991  hitchhiker  0.00178091 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1011  coenzyme A transferase  65.24 
 
 
216 aa  288  5.0000000000000004e-77  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.185512 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3824  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  74.06 
 
 
212 aa  288  5.0000000000000004e-77  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18940  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  68.6 
 
 
217 aa  285  4e-76  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0409943  normal  0.556426 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3297  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  65.88 
 
 
218 aa  284  5.999999999999999e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7913  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  66.35 
 
 
221 aa  284  7e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1141  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  70.48 
 
 
220 aa  284  8e-76  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.115046  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0331  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  69.08 
 
 
214 aa  283  2.0000000000000002e-75  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07040  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  69.9 
 
 
222 aa  283  2.0000000000000002e-75  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.238632 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4891  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  68.12 
 
 
211 aa  280  1e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.690445  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2258  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  65.74 
 
 
226 aa  280  1e-74  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.545318  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4355  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  63.98 
 
 
218 aa  279  2e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0647  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  67.59 
 
 
227 aa  279  3e-74  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2503  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  70.62 
 
 
228 aa  278  4e-74  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0825611  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1164  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  64.42 
 
 
229 aa  278  4e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4284  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  66.04 
 
 
215 aa  278  6e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.18483 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0490  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  68.4 
 
 
234 aa  276  1e-73  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.906071  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2970  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  69.05 
 
 
220 aa  276  2e-73  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.421723 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4163  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  63.77 
 
 
215 aa  276  2e-73  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1435  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  67.62 
 
 
216 aa  275  3e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4634  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  67.62 
 
 
216 aa  275  5e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5437  3-oxoadipate CoA-transferase subunit B  67.94 
 
 
215 aa  275  5e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2106  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  64.93 
 
 
215 aa  274  6e-73  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.422134  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2883  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  65.7 
 
 
236 aa  273  1.0000000000000001e-72  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.182423  normal  0.207239 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1387  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  62.8 
 
 
229 aa  273  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.104007  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2075  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  61.32 
 
 
221 aa  273  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1369  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  62.8 
 
 
229 aa  273  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0958  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  68.87 
 
 
216 aa  273  2.0000000000000002e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.223277  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1350  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  62.5 
 
 
228 aa  273  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.596228 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3949  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  67.14 
 
 
216 aa  273  2.0000000000000002e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1403  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  62.8 
 
 
229 aa  273  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2341  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  65.7 
 
 
208 aa  273  2.0000000000000002e-72  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2804  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  60.38 
 
 
218 aa  272  3e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.753217  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1459  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  67.14 
 
 
216 aa  272  3e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.961201 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1247  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  66.67 
 
 
216 aa  271  5.000000000000001e-72  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.272064  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1891  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase, beta subunit  59.43 
 
 
218 aa  271  7e-72  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08490  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  67.31 
 
 
224 aa  271  7e-72  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.506696 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1713  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  59.91 
 
 
218 aa  270  8.000000000000001e-72  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2834  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  59.43 
 
 
218 aa  270  1e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1005  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  67.32 
 
 
207 aa  270  1e-71  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.282605  normal  0.384251 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2852  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  59.43 
 
 
218 aa  270  1e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2979  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  59.43 
 
 
218 aa  270  1e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1524  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  59.43 
 
 
218 aa  270  1e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1389  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  62.15 
 
 
255 aa  270  1e-71  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1666  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  59.43 
 
 
218 aa  269  2e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>