More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_12525 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_12525  succinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase beta subunit scoB  100 
 
 
218 aa  441  1e-123  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.288021  normal  0.0468104 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07040  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  73.21 
 
 
222 aa  317  1e-85  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.238632 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4338  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  73.56 
 
 
222 aa  313  9.999999999999999e-85  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0323675  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4891  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  72.2 
 
 
211 aa  311  6.999999999999999e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.690445  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4284  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  75.36 
 
 
215 aa  307  1.0000000000000001e-82  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.18483 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7913  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  70.59 
 
 
221 aa  306  1.0000000000000001e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1407  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  70.09 
 
 
268 aa  306  1.0000000000000001e-82  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000217887 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1389  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  70.56 
 
 
255 aa  305  3e-82  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0331  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  69.9 
 
 
214 aa  301  7.000000000000001e-81  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1367  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  67.32 
 
 
213 aa  297  1e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0809  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  68.66 
 
 
209 aa  295  3e-79  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2760  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  67.32 
 
 
213 aa  295  5e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4892  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  70.33 
 
 
218 aa  293  2e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1154  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  67.62 
 
 
212 aa  292  2e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2503  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  69.95 
 
 
228 aa  291  4e-78  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0825611  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1783  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  66.83 
 
 
213 aa  291  4e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1270  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  66.67 
 
 
212 aa  291  6e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1571  succinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase subunit B protein  68.29 
 
 
212 aa  290  8e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07620  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  69.52 
 
 
221 aa  290  1e-77  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03176  succinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase subunit B  68.16 
 
 
209 aa  290  2e-77  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.303462  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2607  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase beta subunit  66.83 
 
 
213 aa  290  2e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1562  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  66.83 
 
 
213 aa  290  2e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1700  succinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase subunit B  64.93 
 
 
213 aa  288  5.0000000000000004e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.375649  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1726  3-oxoacid CoA-transferase subunit B  64.93 
 
 
213 aa  288  5.0000000000000004e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.445298  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1107  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase beta subunit  64.93 
 
 
213 aa  288  5.0000000000000004e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.485565  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0212  3-oxoacid CoA-transferase subunit B  64.93 
 
 
213 aa  288  5.0000000000000004e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00734779  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1878  succinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase subunit B  64.93 
 
 
213 aa  288  5.0000000000000004e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0343592  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0952  3-oxoacid CoA-transferase subunit B  64.93 
 
 
213 aa  288  5.0000000000000004e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.334541  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1549  3-oxoacid CoA-transferase subunit B  64.93 
 
 
213 aa  288  5.0000000000000004e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4611  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  65.85 
 
 
213 aa  287  7e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00383872  normal  0.923474 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1391  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  65.37 
 
 
213 aa  286  2e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.755461  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2344  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  69.15 
 
 
215 aa  286  2e-76  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000606975  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0518  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  66.99 
 
 
210 aa  285  2.9999999999999996e-76  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.19694 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1983  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  67.32 
 
 
212 aa  285  4e-76  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000315327 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1444  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  65.85 
 
 
213 aa  285  5e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.085725  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0984  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  65.85 
 
 
213 aa  285  5e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1466  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  65.85 
 
 
213 aa  285  5e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1351  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  64.39 
 
 
213 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.897973  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1013  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  64.11 
 
 
216 aa  282  3.0000000000000004e-75  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.300705  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1387  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  63.41 
 
 
229 aa  282  3.0000000000000004e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.104007  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1369  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  63.41 
 
 
229 aa  282  3.0000000000000004e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08490  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  66.18 
 
 
224 aa  281  5.000000000000001e-75  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.506696 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1403  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  63.41 
 
 
229 aa  281  5.000000000000001e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3297  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  65.2 
 
 
218 aa  281  6.000000000000001e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1652  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  67.32 
 
 
211 aa  280  1e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.200149  normal  0.0417322 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1982  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  67.32 
 
 
211 aa  280  2e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4163  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  63.59 
 
 
215 aa  278  6e-74  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0647  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  61.75 
 
 
227 aa  277  8e-74  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0826  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  63.16 
 
 
216 aa  277  9e-74  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1705  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  64.68 
 
 
209 aa  277  1e-73  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2883  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  66.5 
 
 
236 aa  276  2e-73  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.182423  normal  0.207239 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2106  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  62.93 
 
 
215 aa  276  2e-73  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.422134  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1593  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  65.17 
 
 
209 aa  276  2e-73  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1619  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  62.5 
 
 
218 aa  276  2e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1350  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  62.44 
 
 
228 aa  275  3e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.596228 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3261  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  65.24 
 
 
212 aa  275  3e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.812552  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1476  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  61.88 
 
 
219 aa  275  3e-73  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.038287  normal  0.12448 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1429  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  64.68 
 
 
209 aa  275  4e-73  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.164203 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18940  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  65.99 
 
 
217 aa  273  1.0000000000000001e-72  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0409943  normal  0.556426 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17560  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  65.5 
 
 
202 aa  273  1.0000000000000001e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3848  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  62.75 
 
 
215 aa  273  2.0000000000000002e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0238959  normal  0.733298 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1164  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  62.98 
 
 
229 aa  272  3e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2607  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  64.76 
 
 
213 aa  272  4.0000000000000004e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.348685 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0490  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  63.29 
 
 
234 aa  271  4.0000000000000004e-72  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.906071  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3824  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  66.5 
 
 
212 aa  270  1e-71  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0566  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  62.25 
 
 
219 aa  269  2e-71  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2657  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  64.39 
 
 
212 aa  267  8e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2350  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  61.58 
 
 
214 aa  266  1e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3846  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  62.2 
 
 
223 aa  266  1e-70  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1134  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  59.22 
 
 
208 aa  266  2e-70  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.530595  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1763  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  63.33 
 
 
212 aa  266  2e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.255353  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1962  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  63.33 
 
 
212 aa  266  2e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2124  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  61.58 
 
 
211 aa  265  4e-70  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2634  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  62.44 
 
 
212 aa  265  5e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.428059  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2059  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  63.11 
 
 
220 aa  265  5e-70  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3126  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  64.88 
 
 
213 aa  264  5.999999999999999e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.859515  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2576  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  57.77 
 
 
218 aa  263  1e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1139  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  58.25 
 
 
218 aa  263  1e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.477496 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1011  coenzyme A transferase  62.44 
 
 
216 aa  263  1e-69  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.185512 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4355  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  60.78 
 
 
218 aa  263  1e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51600  3-oxoacid CoA-transferase  57.69 
 
 
218 aa  263  1e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1891  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase, beta subunit  58.17 
 
 
218 aa  262  2e-69  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6962  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  61.58 
 
 
219 aa  262  2e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.978999  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1596  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  66.02 
 
 
218 aa  263  2e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2733  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  57.77 
 
 
218 aa  263  2e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2075  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  57.21 
 
 
221 aa  262  4e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3229  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  57.69 
 
 
218 aa  261  4e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0245093 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2328  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  58.17 
 
 
218 aa  261  6.999999999999999e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.208746 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2400  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  58.17 
 
 
218 aa  261  6.999999999999999e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.724461  normal  0.313356 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01940  3-oxoacid CoA-transferase subunit B family enzyme  59.62 
 
 
217 aa  261  6.999999999999999e-69  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0468596  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1666  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  58.17 
 
 
218 aa  261  6.999999999999999e-69  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1356  3-oxoacid CoA-transferase  58.25 
 
 
218 aa  261  8e-69  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.684977 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2252  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  58.25 
 
 
218 aa  261  8e-69  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4265  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  62.38 
 
 
212 aa  260  8.999999999999999e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0745238  normal  0.356459 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1457  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  62.68 
 
 
212 aa  260  1e-68  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0588304  normal  0.817341 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4165  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  60.29 
 
 
211 aa  260  1e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.829628  normal  0.185202 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1713  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  57.69 
 
 
218 aa  259  2e-68  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4684  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  61.35 
 
 
214 aa  259  2e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.453333 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2804  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  57.28 
 
 
218 aa  259  3e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.753217  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1524  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  57.77 
 
 
218 aa  258  4e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>