More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4165 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_4165  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  100 
 
 
211 aa  424  1e-118  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.829628  normal  0.185202 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0573  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  73.21 
 
 
211 aa  319  9.999999999999999e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.109491  normal  0.423863 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2124  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  69.52 
 
 
211 aa  317  1e-85  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0566  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  67.46 
 
 
219 aa  309  2.9999999999999997e-83  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5437  3-oxoadipate CoA-transferase subunit B  69.86 
 
 
215 aa  295  3e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3848  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  66.99 
 
 
215 aa  293  1e-78  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0238959  normal  0.733298 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2350  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  63.16 
 
 
214 aa  291  7e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0958  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  68.42 
 
 
216 aa  290  1e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.223277  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2258  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  66.35 
 
 
226 aa  285  4e-76  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.545318  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1011  coenzyme A transferase  66.19 
 
 
216 aa  283  1.0000000000000001e-75  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.185512 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1476  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  65.07 
 
 
219 aa  278  3e-74  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.038287  normal  0.12448 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3824  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  66.18 
 
 
212 aa  276  1e-73  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03176  succinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase subunit B  65.07 
 
 
209 aa  276  1e-73  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.303462  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5857  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  65.89 
 
 
221 aa  274  6e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.336903  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3949  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  68.1 
 
 
216 aa  273  1.0000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0809  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  63.64 
 
 
209 aa  273  1.0000000000000001e-72  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1367  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  62.32 
 
 
213 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2760  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  62.32 
 
 
213 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1435  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  67.14 
 
 
216 aa  271  7e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4634  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  66.67 
 
 
216 aa  270  1e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1141  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  65.71 
 
 
220 aa  270  1e-71  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.115046  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0518  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  61.9 
 
 
210 aa  270  1e-71  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.19694 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4888  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  65.7 
 
 
220 aa  270  2e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.544225  normal  0.033457 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1783  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  61.84 
 
 
213 aa  269  2e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1391  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  62.32 
 
 
213 aa  269  2.9999999999999997e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.755461  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2106  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  63.9 
 
 
215 aa  268  4e-71  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.422134  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1459  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  66.67 
 
 
216 aa  268  4e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.961201 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2607  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase beta subunit  61.84 
 
 
213 aa  268  5e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4611  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  61.84 
 
 
213 aa  267  7e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00383872  normal  0.923474 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0212  3-oxoacid CoA-transferase subunit B  61.35 
 
 
213 aa  267  8.999999999999999e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00734779  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1107  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase beta subunit  61.35 
 
 
213 aa  267  8.999999999999999e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.485565  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0952  3-oxoacid CoA-transferase subunit B  61.35 
 
 
213 aa  267  8.999999999999999e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.334541  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1726  3-oxoacid CoA-transferase subunit B  61.35 
 
 
213 aa  267  8.999999999999999e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.445298  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1878  succinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase subunit B  61.35 
 
 
213 aa  267  8.999999999999999e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0343592  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1549  3-oxoacid CoA-transferase subunit B  61.35 
 
 
213 aa  267  8.999999999999999e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1700  succinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase subunit B  61.35 
 
 
213 aa  267  8.999999999999999e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.375649  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6365  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  65.42 
 
 
221 aa  266  2e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0457042  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1351  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  61.84 
 
 
213 aa  266  2e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.897973  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1164  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  60.68 
 
 
229 aa  265  2.9999999999999995e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2920  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  63.72 
 
 
219 aa  265  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.911892  normal  0.370214 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1571  succinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase subunit B protein  60.75 
 
 
212 aa  265  4e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3146  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  63.72 
 
 
219 aa  265  4e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.163127  normal  0.346959 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4700  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  68.42 
 
 
213 aa  265  5e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.230797  normal  0.520807 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1562  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  61.35 
 
 
213 aa  264  5.999999999999999e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1593  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  62.44 
 
 
209 aa  264  5.999999999999999e-70  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3044  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  62.62 
 
 
241 aa  264  5.999999999999999e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1154  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  61.21 
 
 
212 aa  264  7e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1134  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  60.95 
 
 
208 aa  264  8e-70  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.530595  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18940  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  63.64 
 
 
217 aa  264  8e-70  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0409943  normal  0.556426 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1444  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  61.35 
 
 
213 aa  264  8.999999999999999e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.085725  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0984  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  61.35 
 
 
213 aa  264  8.999999999999999e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1466  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  61.35 
 
 
213 aa  264  8.999999999999999e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1429  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  61.95 
 
 
209 aa  263  1e-69  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.164203 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2883  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  62.8 
 
 
236 aa  262  3e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.182423  normal  0.207239 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1247  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  63.33 
 
 
216 aa  261  4.999999999999999e-69  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.272064  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2657  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  63.43 
 
 
212 aa  260  8e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12525  succinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase beta subunit scoB  60.29 
 
 
218 aa  260  1e-68  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.288021  normal  0.0468104 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2607  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  61.21 
 
 
213 aa  259  2e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.348685 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7913  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  62.32 
 
 
221 aa  258  4e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1270  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  60.28 
 
 
212 aa  257  7e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1705  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  58.85 
 
 
209 aa  257  8e-68  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3846  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  61.9 
 
 
223 aa  257  9e-68  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2341  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  62.38 
 
 
208 aa  257  9e-68  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07040  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  62.14 
 
 
222 aa  256  2e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.238632 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6829  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  66.01 
 
 
209 aa  254  4e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0752786  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2970  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  63.51 
 
 
220 aa  254  5e-67  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.421723 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1982  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  60.28 
 
 
211 aa  254  5e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0826  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  61.14 
 
 
216 aa  254  5e-67  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1407  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  60.1 
 
 
268 aa  254  9e-67  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000217887 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07620  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  62.98 
 
 
221 aa  253  1.0000000000000001e-66  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1652  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  60.28 
 
 
211 aa  253  1.0000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.200149  normal  0.0417322 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17560  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  63 
 
 
202 aa  253  1.0000000000000001e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1021  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  64.88 
 
 
463 aa  253  2.0000000000000002e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1983  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  60.48 
 
 
212 aa  253  2.0000000000000002e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000315327 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4355  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  59.33 
 
 
218 aa  253  2.0000000000000002e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0647  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  59.26 
 
 
227 aa  253  2.0000000000000002e-66  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3109  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  62.38 
 
 
209 aa  251  4.0000000000000004e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0179198  normal  0.0278919 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5000  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  62.33 
 
 
220 aa  251  7e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.54991  hitchhiker  0.00178091 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0490  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  59.91 
 
 
234 aa  250  9.000000000000001e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.906071  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1013  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  59.72 
 
 
216 aa  250  1e-65  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.300705  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1350  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  58.45 
 
 
228 aa  249  1e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.596228 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2503  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  62.68 
 
 
228 aa  249  2e-65  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0825611  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1389  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  57.62 
 
 
255 aa  249  3e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0563  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  61.9 
 
 
209 aa  248  3e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1913  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  61.9 
 
 
209 aa  248  6e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.160848  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4891  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  59.9 
 
 
211 aa  248  6e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.690445  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1005  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  62.02 
 
 
207 aa  247  8e-65  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.282605  normal  0.384251 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4265  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  60.28 
 
 
212 aa  247  1e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0745238  normal  0.356459 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1387  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  59.42 
 
 
229 aa  246  1e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.104007  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51600  3-oxoacid CoA-transferase  57.62 
 
 
218 aa  247  1e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1369  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  59.42 
 
 
229 aa  246  1e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4338  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  59.42 
 
 
222 aa  246  2e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0323675  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2075  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  56.19 
 
 
221 aa  246  2e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2634  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  57.75 
 
 
212 aa  246  2e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.428059  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4684  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  62.2 
 
 
214 aa  246  2e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.453333 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2432  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  57.14 
 
 
218 aa  246  2e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1906  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  60.28 
 
 
211 aa  245  3e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.750884 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0331  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  58.1 
 
 
214 aa  245  4e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3261  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  59.35 
 
 
212 aa  244  4.9999999999999997e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.812552  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3126  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  60.28 
 
 
213 aa  244  4.9999999999999997e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.859515  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>