More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4891 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_4891  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  100 
 
 
211 aa  423  1e-118  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.690445  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07040  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  77.67 
 
 
222 aa  321  6e-87  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.238632 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4338  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  71.5 
 
 
222 aa  313  9.999999999999999e-85  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0323675  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7913  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  73.91 
 
 
221 aa  312  1.9999999999999998e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2344  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  76.81 
 
 
215 aa  311  3.9999999999999997e-84  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000606975  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12525  succinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase beta subunit scoB  72.2 
 
 
218 aa  311  5.999999999999999e-84  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.288021  normal  0.0468104 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4284  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  76 
 
 
215 aa  306  1.0000000000000001e-82  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.18483 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0331  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  71.92 
 
 
214 aa  305  4.0000000000000004e-82  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1389  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  69.81 
 
 
255 aa  303  9.000000000000001e-82  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08490  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  70 
 
 
224 aa  300  1e-80  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.506696 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1387  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  70.05 
 
 
229 aa  299  2e-80  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.104007  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1369  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  70.05 
 
 
229 aa  299  2e-80  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1403  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  70.05 
 
 
229 aa  298  4e-80  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2503  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  74.04 
 
 
228 aa  298  4e-80  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0825611  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0809  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  70.19 
 
 
209 aa  298  5e-80  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07620  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  71.15 
 
 
221 aa  297  9e-80  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1350  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  66.35 
 
 
228 aa  296  1e-79  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.596228 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1407  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  66.98 
 
 
268 aa  295  3e-79  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000217887 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4163  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  66.67 
 
 
215 aa  293  1e-78  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1270  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  68.9 
 
 
212 aa  290  1e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1367  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  66.67 
 
 
213 aa  288  4e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03176  succinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase subunit B  69.46 
 
 
209 aa  287  8e-77  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.303462  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0518  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  68.97 
 
 
210 aa  287  8e-77  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.19694 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4892  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  71.08 
 
 
218 aa  286  2e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2760  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  66.18 
 
 
213 aa  284  5.999999999999999e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1983  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  70.53 
 
 
212 aa  284  7e-76  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000315327 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1705  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  65.38 
 
 
209 aa  283  1.0000000000000001e-75  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1562  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  66.67 
 
 
213 aa  283  1.0000000000000001e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17560  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  70.15 
 
 
202 aa  282  2.0000000000000002e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1476  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  63.41 
 
 
219 aa  282  2.0000000000000002e-75  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.038287  normal  0.12448 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0490  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  68.57 
 
 
234 aa  282  3.0000000000000004e-75  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.906071  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1571  succinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase subunit B protein  68.12 
 
 
212 aa  280  1e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0647  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  65.77 
 
 
227 aa  280  1e-74  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4355  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  65.02 
 
 
218 aa  280  2e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18940  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  69.35 
 
 
217 aa  279  2e-74  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0409943  normal  0.556426 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0952  3-oxoacid CoA-transferase subunit B  65.7 
 
 
213 aa  278  4e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.334541  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1107  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase beta subunit  65.7 
 
 
213 aa  278  4e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.485565  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1878  succinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase subunit B  65.7 
 
 
213 aa  278  4e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0343592  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0212  3-oxoacid CoA-transferase subunit B  65.7 
 
 
213 aa  278  4e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00734779  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1726  3-oxoacid CoA-transferase subunit B  65.7 
 
 
213 aa  278  4e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.445298  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1549  3-oxoacid CoA-transferase subunit B  65.7 
 
 
213 aa  278  4e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1700  succinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase subunit B  65.7 
 
 
213 aa  278  4e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.375649  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2883  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  68.29 
 
 
236 aa  278  4e-74  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.182423  normal  0.207239 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2059  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  67 
 
 
220 aa  278  5e-74  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2607  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase beta subunit  65.7 
 
 
213 aa  277  6e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1154  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  68.12 
 
 
212 aa  278  6e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3297  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  63.41 
 
 
218 aa  276  2e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1783  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  64.73 
 
 
213 aa  275  4e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1351  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  65.7 
 
 
213 aa  275  4e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.897973  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0826  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  65.4 
 
 
216 aa  274  7e-73  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4611  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  64.73 
 
 
213 aa  274  7e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00383872  normal  0.923474 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1391  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  65.22 
 
 
213 aa  273  9e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.755461  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2124  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  62.32 
 
 
211 aa  273  1.0000000000000001e-72  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1013  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  64.93 
 
 
216 aa  272  2.0000000000000002e-72  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.300705  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3824  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  66.51 
 
 
212 aa  272  3e-72  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1593  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  62.8 
 
 
209 aa  272  3e-72  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1444  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  64.73 
 
 
213 aa  271  5.000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.085725  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1011  coenzyme A transferase  64.42 
 
 
216 aa  271  5.000000000000001e-72  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.185512 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0984  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  64.73 
 
 
213 aa  271  5.000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1466  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  64.73 
 
 
213 aa  271  5.000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1429  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  63.55 
 
 
209 aa  271  6e-72  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.164203 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3848  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  62.32 
 
 
215 aa  269  2e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0238959  normal  0.733298 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1134  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  62.32 
 
 
208 aa  268  5e-71  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.530595  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1435  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  63.51 
 
 
216 aa  266  1e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4634  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  63.51 
 
 
216 aa  266  2e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2350  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  62.8 
 
 
214 aa  266  2e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2106  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  65.33 
 
 
215 aa  266  2e-70  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.422134  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3846  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  65.07 
 
 
223 aa  265  5e-70  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2607  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  65.22 
 
 
213 aa  264  5.999999999999999e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.348685 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1459  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  63.03 
 
 
216 aa  264  7e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.961201 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3949  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  63.51 
 
 
216 aa  264  7e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0566  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  60.49 
 
 
219 aa  264  8e-70  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1652  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  65.22 
 
 
211 aa  263  1e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.200149  normal  0.0417322 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1247  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  62.09 
 
 
216 aa  263  1e-69  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.272064  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1982  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  65.22 
 
 
211 aa  263  1e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2634  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  64.25 
 
 
212 aa  262  2e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.428059  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2657  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  64.73 
 
 
212 aa  261  4e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1457  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  63.68 
 
 
212 aa  260  8e-69  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0588304  normal  0.817341 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1164  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  61.81 
 
 
229 aa  260  8.999999999999999e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6962  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  60.78 
 
 
219 aa  260  1e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.978999  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1501  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  67.84 
 
 
218 aa  259  2e-68  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1962  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  63.03 
 
 
212 aa  259  2e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1506  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  64.88 
 
 
218 aa  259  2e-68  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.233777  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1763  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  63.03 
 
 
212 aa  259  2e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.255353  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2363  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  67.34 
 
 
219 aa  258  4e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0158273  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2341  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  61.35 
 
 
208 aa  258  5.0000000000000005e-68  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2970  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  63.46 
 
 
220 aa  257  8e-68  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.421723 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2258  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  61.06 
 
 
226 aa  256  1e-67  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.545318  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4888  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  63.16 
 
 
220 aa  256  1e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.544225  normal  0.033457 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1596  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  67.34 
 
 
218 aa  257  1e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3261  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  62.56 
 
 
212 aa  256  2e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.812552  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0519  3-oxoacid CoA-transferase  55.39 
 
 
221 aa  255  4e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.216025 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3294  putative CoA transferase, subunit B  58.33 
 
 
218 aa  254  5e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.15294  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38640  putative CoA transferase, subunit B  58.33 
 
 
218 aa  254  5e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.426102  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3044  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  60.47 
 
 
241 aa  254  6e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3109  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  60.87 
 
 
209 aa  254  7e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0179198  normal  0.0278919 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2734  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  56.86 
 
 
218 aa  253  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1005  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  60.98 
 
 
207 aa  253  1.0000000000000001e-66  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.282605  normal  0.384251 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0563  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  60.87 
 
 
209 aa  253  1.0000000000000001e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1139  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  56.86 
 
 
218 aa  253  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.477496 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>