More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_1652 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_1652  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  100 
 
 
211 aa  423  1e-117  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.200149  normal  0.0417322 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1982  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  99.05 
 
 
211 aa  420  1e-117  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4265  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  90.52 
 
 
212 aa  385  1e-106  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0745238  normal  0.356459 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3126  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  89.57 
 
 
213 aa  383  1e-105  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.859515  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1571  succinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase subunit B protein  88.21 
 
 
212 aa  380  1e-105  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1763  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  89.57 
 
 
212 aa  381  1e-105  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.255353  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1962  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  89.57 
 
 
212 aa  381  1e-105  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1906  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  87.68 
 
 
211 aa  377  1e-104  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.750884 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3261  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  87.2 
 
 
212 aa  370  1e-102  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.812552  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2607  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  86.32 
 
 
213 aa  368  1e-101  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.348685 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2657  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  86.32 
 
 
212 aa  367  1e-101  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1154  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  83.49 
 
 
212 aa  362  3e-99  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1270  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  84.91 
 
 
212 aa  360  1e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2634  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  84.83 
 
 
212 aa  359  2e-98  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.428059  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1457  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  84.83 
 
 
212 aa  356  9.999999999999999e-98  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0588304  normal  0.817341 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1983  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  81.04 
 
 
212 aa  348  4e-95  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000315327 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0826  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  79.81 
 
 
216 aa  342  2e-93  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1013  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  79.81 
 
 
216 aa  342  2e-93  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.300705  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1367  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  78.67 
 
 
213 aa  328  4e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2760  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  78.67 
 
 
213 aa  326  1.0000000000000001e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1391  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  79.62 
 
 
213 aa  326  2.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.755461  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4611  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  78.67 
 
 
213 aa  323  1e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00383872  normal  0.923474 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1351  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  78.67 
 
 
213 aa  323  1e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.897973  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1783  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  78.67 
 
 
213 aa  322  2e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1562  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  78.2 
 
 
213 aa  322  2e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1726  3-oxoacid CoA-transferase subunit B  78.2 
 
 
213 aa  321  5e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.445298  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0212  3-oxoacid CoA-transferase subunit B  78.2 
 
 
213 aa  321  5e-87  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00734779  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1107  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase beta subunit  78.2 
 
 
213 aa  321  5e-87  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.485565  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0952  3-oxoacid CoA-transferase subunit B  78.2 
 
 
213 aa  321  5e-87  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.334541  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1878  succinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase subunit B  78.2 
 
 
213 aa  321  5e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0343592  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1700  succinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase subunit B  78.2 
 
 
213 aa  321  5e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.375649  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1549  3-oxoacid CoA-transferase subunit B  78.2 
 
 
213 aa  321  5e-87  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1444  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  78.2 
 
 
213 aa  320  9.999999999999999e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.085725  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0984  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  78.2 
 
 
213 aa  320  9.999999999999999e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1466  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  78.2 
 
 
213 aa  320  9.999999999999999e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2607  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase beta subunit  77.73 
 
 
213 aa  319  1.9999999999999998e-86  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0809  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  74.88 
 
 
209 aa  317  7.999999999999999e-86  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03176  succinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase subunit B  75.83 
 
 
209 aa  312  1.9999999999999998e-84  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.303462  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0518  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  73.11 
 
 
210 aa  311  4.999999999999999e-84  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.19694 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17560  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  76.24 
 
 
202 aa  299  2e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1593  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  70.62 
 
 
209 aa  293  1e-78  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1429  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  69.81 
 
 
209 aa  292  3e-78  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.164203 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1705  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  70.14 
 
 
209 aa  292  3e-78  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1134  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  70.05 
 
 
208 aa  288  5.0000000000000004e-77  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.530595  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1476  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  68.69 
 
 
219 aa  286  1e-76  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.038287  normal  0.12448 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2341  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  69.42 
 
 
208 aa  285  2e-76  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5857  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  70.48 
 
 
221 aa  281  5.000000000000001e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.336903  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12525  succinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase beta subunit scoB  67.32 
 
 
218 aa  280  1e-74  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.288021  normal  0.0468104 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0566  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  65.09 
 
 
219 aa  279  2e-74  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2124  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  66.82 
 
 
211 aa  278  6e-74  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3848  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  66.99 
 
 
215 aa  277  9e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0238959  normal  0.733298 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18940  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  68.6 
 
 
217 aa  274  6e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0409943  normal  0.556426 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3044  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  68.57 
 
 
241 aa  273  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6365  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  69.05 
 
 
221 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0457042  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3824  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  70.28 
 
 
212 aa  272  3e-72  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2350  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  66.67 
 
 
214 aa  271  4.0000000000000004e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2920  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  68.1 
 
 
219 aa  271  5.000000000000001e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.911892  normal  0.370214 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1011  coenzyme A transferase  65.71 
 
 
216 aa  271  5.000000000000001e-72  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.185512 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0331  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  66.18 
 
 
214 aa  271  6e-72  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2258  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  66.05 
 
 
226 aa  271  6e-72  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.545318  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3146  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  67.62 
 
 
219 aa  271  7e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.163127  normal  0.346959 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5000  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  69.52 
 
 
220 aa  269  2e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.54991  hitchhiker  0.00178091 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4355  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  64.45 
 
 
218 aa  269  2.9999999999999997e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08490  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  67.79 
 
 
224 aa  269  2.9999999999999997e-71  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.506696 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7913  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  63.51 
 
 
221 aa  268  4e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0563  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  69.08 
 
 
209 aa  268  5e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1005  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  69.76 
 
 
207 aa  268  5e-71  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.282605  normal  0.384251 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1141  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  70.48 
 
 
220 aa  268  5.9999999999999995e-71  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.115046  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1913  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  69.08 
 
 
209 aa  267  1e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.160848  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3109  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  69.08 
 
 
209 aa  266  1e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0179198  normal  0.0278919 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3297  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  64.45 
 
 
218 aa  266  2e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2883  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  65.7 
 
 
236 aa  265  4e-70  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.182423  normal  0.207239 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2106  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  64.45 
 
 
215 aa  264  7e-70  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.422134  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07620  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  64.62 
 
 
221 aa  264  8e-70  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4684  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  69.76 
 
 
214 aa  263  1e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.453333 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4891  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  65.22 
 
 
211 aa  263  1e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.690445  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5437  3-oxoadipate CoA-transferase subunit B  66.03 
 
 
215 aa  263  1e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07040  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  66.99 
 
 
222 aa  263  2e-69  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.238632 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0490  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  67.45 
 
 
234 aa  263  2e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.906071  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0958  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  67.45 
 
 
216 aa  262  3e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.223277  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0647  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  65.74 
 
 
227 aa  261  4e-69  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1452  3-oxoacid CoA-transferase  59.91 
 
 
218 aa  258  3e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00341898  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2503  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  66.82 
 
 
228 aa  259  3e-68  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0825611  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2804  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  59.91 
 
 
218 aa  258  4e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.753217  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4888  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  67.62 
 
 
220 aa  257  8e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.544225  normal  0.033457 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2059  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  63.77 
 
 
220 aa  256  2e-67  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2432  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  60.38 
 
 
218 aa  256  2e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1139  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  60.85 
 
 
218 aa  256  2e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.477496 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1435  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  67.62 
 
 
216 aa  255  3e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1669  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  60.29 
 
 
218 aa  255  4e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2075  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  59.91 
 
 
221 aa  254  5e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4634  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  67.62 
 
 
216 aa  254  6e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2970  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  67.14 
 
 
220 aa  254  7e-67  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.421723 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6962  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  59.91 
 
 
219 aa  254  7e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.978999  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2576  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  58.02 
 
 
218 aa  254  8e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3229  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  58.02 
 
 
218 aa  254  8e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0245093 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1387  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  59.42 
 
 
229 aa  253  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.104007  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4165  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  60.28 
 
 
211 aa  253  1.0000000000000001e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.829628  normal  0.185202 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4284  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  62.26 
 
 
215 aa  253  1.0000000000000001e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.18483 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1369  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  59.42 
 
 
229 aa  253  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>