More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_3238 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007005  Psyr_3238  3-oxoacid CoA-transferase  100 
 
 
218 aa  441  1e-123  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.507702  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3456  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B family  97.25 
 
 
218 aa  430  1e-120  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51600  3-oxoacid CoA-transferase  91.74 
 
 
218 aa  413  9.999999999999999e-116  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2432  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  92.2 
 
 
218 aa  412  1e-114  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3123  3-oxoacid CoA-transferase subunit B  90.83 
 
 
218 aa  407  1e-113  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.818708 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2075  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  89.45 
 
 
221 aa  409  1e-113  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2593  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  90.83 
 
 
218 aa  407  1e-113  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2734  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  91.28 
 
 
218 aa  408  1e-113  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3294  putative CoA transferase, subunit B  89.91 
 
 
218 aa  402  1e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.15294  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38640  putative CoA transferase, subunit B  89.91 
 
 
218 aa  402  1e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.426102  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1139  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  88.07 
 
 
218 aa  395  1e-109  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.477496 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3054  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  85.78 
 
 
219 aa  390  1e-108  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.178254 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0591  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  87.96 
 
 
217 aa  390  1e-107  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1669  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  83.8 
 
 
218 aa  377  1e-104  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1452  3-oxoacid CoA-transferase  83.94 
 
 
218 aa  374  1e-103  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00341898  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3229  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  84.86 
 
 
218 aa  376  1e-103  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0245093 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1356  3-oxoacid CoA-transferase  82.57 
 
 
218 aa  370  1e-102  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.684977 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0519  3-oxoacid CoA-transferase  81.65 
 
 
221 aa  370  1e-101  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.216025 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2804  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  83.03 
 
 
218 aa  370  1e-101  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.753217  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2576  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  82.11 
 
 
218 aa  368  1e-101  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2852  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  81.65 
 
 
218 aa  363  1e-100  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1891  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase, beta subunit  81.65 
 
 
218 aa  364  1e-100  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2834  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  82.11 
 
 
218 aa  365  1e-100  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2979  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  82.11 
 
 
218 aa  365  1e-100  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1713  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  82.11 
 
 
218 aa  365  1e-100  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2252  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  80.73 
 
 
218 aa  366  1e-100  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1666  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  81.65 
 
 
218 aa  363  1e-100  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2328  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  81.65 
 
 
218 aa  363  1e-100  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.208746 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3292  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  81.19 
 
 
219 aa  364  1e-100  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0655  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  81.19 
 
 
220 aa  364  1e-100  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.994657 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2400  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  81.65 
 
 
218 aa  363  1e-100  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.724461  normal  0.313356 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2733  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  80.28 
 
 
218 aa  365  1e-100  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1524  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  82.11 
 
 
218 aa  365  1e-100  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1597  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase, beta subunit  81.19 
 
 
218 aa  363  1e-99  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.237466  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3468  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  80.73 
 
 
220 aa  363  1e-99  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01940  3-oxoacid CoA-transferase subunit B family enzyme  76.39 
 
 
217 aa  345  4e-94  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0468596  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1619  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  75.93 
 
 
218 aa  337  5.9999999999999996e-92  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03100  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase, beta subunit  67.13 
 
 
217 aa  292  3e-78  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6962  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  65.14 
 
 
219 aa  290  2e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.978999  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0887  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  63.08 
 
 
217 aa  277  9e-74  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3297  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  59.17 
 
 
218 aa  276  2e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2917  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  63.72 
 
 
219 aa  275  3e-73  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000753738 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1593  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  63.55 
 
 
209 aa  275  3e-73  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1429  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  62.02 
 
 
209 aa  274  7e-73  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.164203 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0809  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  60.77 
 
 
209 aa  273  1.0000000000000001e-72  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03176  succinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase subunit B  62.07 
 
 
209 aa  271  5.000000000000001e-72  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.303462  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0518  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  60.59 
 
 
210 aa  268  5e-71  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.19694 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2760  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  59.9 
 
 
213 aa  268  5.9999999999999995e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1367  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  60.39 
 
 
213 aa  267  8.999999999999999e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4338  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  57.34 
 
 
222 aa  267  8.999999999999999e-71  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0323675  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1705  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  59.9 
 
 
209 aa  266  2.9999999999999995e-70  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3848  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  62.44 
 
 
215 aa  265  2.9999999999999995e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0238959  normal  0.733298 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7913  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  58.85 
 
 
221 aa  265  4e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1013  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  61.35 
 
 
216 aa  265  4e-70  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.300705  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1154  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  60.85 
 
 
212 aa  264  7e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1164  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  55.81 
 
 
229 aa  263  1e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1476  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  57.67 
 
 
219 aa  263  1e-69  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.038287  normal  0.12448 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4355  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  56.04 
 
 
218 aa  262  2e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1270  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  59.91 
 
 
212 aa  263  2e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4611  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  59.9 
 
 
213 aa  262  2e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00383872  normal  0.923474 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1571  succinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase subunit B protein  59.43 
 
 
212 aa  262  3e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1444  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  59.81 
 
 
213 aa  262  3e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.085725  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1391  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  60.29 
 
 
213 aa  262  3e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.755461  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0984  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  59.81 
 
 
213 aa  262  3e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1466  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  59.81 
 
 
213 aa  262  3e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1783  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  59.81 
 
 
213 aa  261  4.999999999999999e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1549  3-oxoacid CoA-transferase subunit B  59.42 
 
 
213 aa  260  1e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1726  3-oxoacid CoA-transferase subunit B  59.42 
 
 
213 aa  260  1e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.445298  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1107  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase beta subunit  59.42 
 
 
213 aa  260  1e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.485565  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1878  succinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase subunit B  59.42 
 
 
213 aa  260  1e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0343592  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0212  3-oxoacid CoA-transferase subunit B  59.42 
 
 
213 aa  260  1e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00734779  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1700  succinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase subunit B  59.42 
 
 
213 aa  260  1e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.375649  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1351  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  59.33 
 
 
213 aa  260  1e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.897973  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0952  3-oxoacid CoA-transferase subunit B  59.42 
 
 
213 aa  260  1e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.334541  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2607  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase beta subunit  59.33 
 
 
213 aa  259  3e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1562  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  58.94 
 
 
213 aa  259  3e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0826  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  60.39 
 
 
216 aa  258  3e-68  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12525  succinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase beta subunit scoB  56.25 
 
 
218 aa  258  6e-68  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.288021  normal  0.0468104 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1501  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  58.99 
 
 
218 aa  256  2e-67  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1596  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  58.99 
 
 
218 aa  256  2e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2607  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  58.96 
 
 
213 aa  255  4e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.348685 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2634  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  58.29 
 
 
212 aa  255  4e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.428059  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2363  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  58.53 
 
 
219 aa  254  5e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0158273  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1407  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  55.19 
 
 
268 aa  254  7e-67  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000217887 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17560  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  59.9 
 
 
202 aa  253  1.0000000000000001e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4284  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  56.67 
 
 
215 aa  253  1.0000000000000001e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.18483 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08490  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  55.3 
 
 
224 aa  253  1.0000000000000001e-66  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.506696 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18940  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  57.55 
 
 
217 aa  253  2.0000000000000002e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0409943  normal  0.556426 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07040  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  55.56 
 
 
222 aa  252  3e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.238632 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1011  coenzyme A transferase  59.05 
 
 
216 aa  252  4.0000000000000004e-66  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.185512 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2657  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  58.02 
 
 
212 aa  252  4.0000000000000004e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1983  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  57 
 
 
212 aa  251  5.000000000000001e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000315327 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1134  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  59.13 
 
 
208 aa  251  8.000000000000001e-66  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.530595  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0566  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  58.45 
 
 
219 aa  250  1e-65  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1457  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  59.42 
 
 
212 aa  249  2e-65  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0588304  normal  0.817341 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1906  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  58.49 
 
 
211 aa  248  3e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.750884 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2124  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  58.57 
 
 
211 aa  249  3e-65  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0331  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  56.73 
 
 
214 aa  248  4e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3261  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  57.55 
 
 
212 aa  248  4e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.812552  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1389  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  53.99 
 
 
255 aa  247  8e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>