More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcHS_A2363 on replicon NC_009800
Organism: Escherichia coli HS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012892  B21_02108  hypothetical protein  100 
 
 
216 aa  441  1e-123  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.796966  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02149  acetyl-CoA:acetoacetyl-CoA transferase, beta subunit  100 
 
 
216 aa  441  1e-123  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.746207  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1436  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  100 
 
 
216 aa  441  1e-123  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.633734  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2371  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  100 
 
 
216 aa  441  1e-123  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0826912  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1428  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  100 
 
 
216 aa  441  1e-123  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.773263  hitchhiker  0.000356142 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2363  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  100 
 
 
216 aa  441  1e-123  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1161  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  70.81 
 
 
215 aa  308  4e-83  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3170  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  70.48 
 
 
215 aa  305  3e-82  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0211  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  58.49 
 
 
216 aa  251  8.000000000000001e-66  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2278  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  59.62 
 
 
208 aa  248  5e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1135  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  56.81 
 
 
214 aa  245  4e-64  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1382  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  59.24 
 
 
218 aa  244  6e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1909  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  55.02 
 
 
219 aa  244  9e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0867  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  56.73 
 
 
216 aa  242  3e-63  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1572  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  57.89 
 
 
213 aa  238  5.999999999999999e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.494559 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0830  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  57.55 
 
 
218 aa  235  4e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.127359 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1164  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  53.05 
 
 
229 aa  234  7e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2247  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  54.07 
 
 
219 aa  234  8e-61  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1471  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  56.81 
 
 
219 aa  234  9e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.155964  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2004  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  53.42 
 
 
239 aa  230  1e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.725633  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1076  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  52.58 
 
 
216 aa  230  1e-59  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1075  coenzyme A transferase, beta subunit  54.29 
 
 
220 aa  228  5e-59  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.425854 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0566  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  54.85 
 
 
219 aa  226  2e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2491  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  57.48 
 
 
219 aa  226  2e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000498099 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1011  coenzyme A transferase  54.07 
 
 
216 aa  226  3e-58  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.185512 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3848  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  52.91 
 
 
215 aa  225  3e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0238959  normal  0.733298 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0809  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  54.15 
 
 
209 aa  224  6e-58  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3297  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  50.24 
 
 
218 aa  223  1e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07040  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  55.07 
 
 
222 aa  223  2e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.238632 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18940  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  51.92 
 
 
217 aa  221  6e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0409943  normal  0.556426 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2350  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  51.69 
 
 
214 aa  221  7e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1306  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  53.88 
 
 
453 aa  221  9e-57  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1562  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  51.21 
 
 
213 aa  220  9.999999999999999e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_33142  3-oxoacid CoA-transferase Succinyl-CoA:alpha-ketoacid-CoA transferase  49.77 
 
 
505 aa  220  1.9999999999999999e-56  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2124  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  53.66 
 
 
211 aa  219  3e-56  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0490  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  51.16 
 
 
234 aa  219  3e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.906071  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0647  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  50.93 
 
 
227 aa  218  3.9999999999999997e-56  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1435  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  54.55 
 
 
216 aa  218  3.9999999999999997e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1705  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  51.23 
 
 
209 aa  218  6e-56  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2696  3-oxoacid CoA-transferase B subunit  54.68 
 
 
448 aa  218  6e-56  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.494818  normal  0.507072 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4634  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  54.07 
 
 
216 aa  218  7.999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17560  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  53.57 
 
 
202 aa  217  1e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1350  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  53.23 
 
 
228 aa  217  1e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.596228 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4284  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  53.88 
 
 
215 aa  217  1e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.18483 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0519  3-oxoacid CoA-transferase  51.02 
 
 
221 aa  217  1e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.216025 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3044  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  53.05 
 
 
241 aa  216  2e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1021  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  54.93 
 
 
463 aa  216  2e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12525  succinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase beta subunit scoB  52.58 
 
 
218 aa  216  2e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.288021  normal  0.0468104 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3949  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  54.76 
 
 
216 aa  216  2e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6829  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  55.83 
 
 
209 aa  216  2e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0752786  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4338  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  51.2 
 
 
222 aa  216  2e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0323675  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1141  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  51.16 
 
 
220 aa  216  2.9999999999999998e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.115046  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1459  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  53.59 
 
 
216 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.961201 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7913  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  52.66 
 
 
221 aa  216  2.9999999999999998e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4355  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  48.1 
 
 
218 aa  215  4e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1783  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  50.24 
 
 
213 aa  215  4e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2760  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  49.76 
 
 
213 aa  215  5e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0591  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  49.07 
 
 
217 aa  214  5e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2106  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  52.68 
 
 
215 aa  214  5.9999999999999996e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.422134  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51600  3-oxoacid CoA-transferase  48.57 
 
 
218 aa  214  5.9999999999999996e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03176  succinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase subunit B  53.69 
 
 
209 aa  214  7e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.303462  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1367  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  49.28 
 
 
213 aa  213  9.999999999999999e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1247  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  54.03 
 
 
216 aa  213  9.999999999999999e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.272064  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2128  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  50 
 
 
228 aa  213  1.9999999999999998e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4611  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  49.28 
 
 
213 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00383872  normal  0.923474 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5857  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  54.21 
 
 
221 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.336903  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2607  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase beta subunit  49.76 
 
 
213 aa  212  2.9999999999999995e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1134  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  50.25 
 
 
208 aa  212  2.9999999999999995e-54  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.530595  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3292  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  50.51 
 
 
219 aa  212  2.9999999999999995e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0655  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  50.51 
 
 
220 aa  212  2.9999999999999995e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.994657 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3468  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  50.51 
 
 
220 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3146  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  53.05 
 
 
219 aa  212  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.163127  normal  0.346959 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2920  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  53.05 
 
 
219 aa  212  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.911892  normal  0.370214 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4891  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  51.46 
 
 
211 aa  211  4.9999999999999996e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.690445  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1107  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase beta subunit  49.28 
 
 
213 aa  211  5.999999999999999e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.485565  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1726  3-oxoacid CoA-transferase subunit B  49.28 
 
 
213 aa  211  5.999999999999999e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.445298  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1878  succinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase subunit B  49.28 
 
 
213 aa  211  5.999999999999999e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0343592  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1700  succinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase subunit B  49.28 
 
 
213 aa  211  5.999999999999999e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.375649  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2503  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  55.96 
 
 
228 aa  211  5.999999999999999e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0825611  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1549  3-oxoacid CoA-transferase subunit B  49.28 
 
 
213 aa  211  5.999999999999999e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1391  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  49.76 
 
 
213 aa  211  5.999999999999999e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.755461  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0952  3-oxoacid CoA-transferase subunit B  49.28 
 
 
213 aa  211  5.999999999999999e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.334541  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0212  3-oxoacid CoA-transferase subunit B  49.28 
 
 
213 aa  211  5.999999999999999e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00734779  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1444  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  49.76 
 
 
213 aa  211  7.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.085725  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0984  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  49.76 
 
 
213 aa  211  7.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1466  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  49.76 
 
 
213 aa  211  7.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1669  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  50 
 
 
218 aa  211  9e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1476  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  48.33 
 
 
219 aa  210  1e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.038287  normal  0.12448 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2258  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  50.23 
 
 
226 aa  210  2e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.545318  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1351  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  49.28 
 
 
213 aa  210  2e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.897973  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1597  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase, beta subunit  47.14 
 
 
218 aa  209  3e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.237466  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2883  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  52.34 
 
 
236 aa  209  3e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.182423  normal  0.207239 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5437  3-oxoadipate CoA-transferase subunit B  52.36 
 
 
215 aa  209  3e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2432  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  47.62 
 
 
218 aa  209  3e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1533  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  50.72 
 
 
447 aa  209  3e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.172337 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0331  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  49.53 
 
 
214 aa  209  3e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3824  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  52.88 
 
 
212 aa  209  4e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2917  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  49.28 
 
 
219 aa  208  5e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000753738 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2059  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  47.85 
 
 
220 aa  208  5e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_23365  succinyl-coenzyme A:3-oxo-acid coenzyme a-transferase  50.23 
 
 
511 aa  208  6e-53  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>