More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0211 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009718  Fnod_0211  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  100 
 
 
216 aa  432  1e-120  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1135  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  84.11 
 
 
214 aa  377  1e-104  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1471  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  70.09 
 
 
219 aa  309  2e-83  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.155964  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1076  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  66.98 
 
 
216 aa  301  6.000000000000001e-81  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2278  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  71.01 
 
 
208 aa  296  2e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1382  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  71.01 
 
 
218 aa  295  3e-79  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2004  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  68.6 
 
 
239 aa  294  8e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.725633  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0830  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  67.3 
 
 
218 aa  292  3e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.127359 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2491  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  68.25 
 
 
219 aa  287  1e-76  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000498099 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1909  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  63.26 
 
 
219 aa  273  2.0000000000000002e-72  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1572  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  64.9 
 
 
213 aa  272  3e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.494559 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1856  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  63.64 
 
 
222 aa  272  3e-72  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0867  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  62.56 
 
 
216 aa  269  2.9999999999999997e-71  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1164  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  62.86 
 
 
229 aa  266  2.9999999999999995e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2247  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  62.62 
 
 
219 aa  264  8e-70  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1075  coenzyme A transferase, beta subunit  62.2 
 
 
220 aa  261  8e-69  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.425854 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1161  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  60 
 
 
215 aa  258  6e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3170  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  59.53 
 
 
215 aa  255  4e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02149  acetyl-CoA:acetoacetyl-CoA transferase, beta subunit  58.49 
 
 
216 aa  251  8.000000000000001e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.746207  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1436  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  58.49 
 
 
216 aa  251  8.000000000000001e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.633734  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2363  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  58.49 
 
 
216 aa  251  8.000000000000001e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02108  hypothetical protein  58.49 
 
 
216 aa  251  8.000000000000001e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.796966  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1428  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  58.49 
 
 
216 aa  251  8.000000000000001e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.773263  hitchhiker  0.000356142 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2371  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  58.49 
 
 
216 aa  251  8.000000000000001e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0826912  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3274  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  60.58 
 
 
218 aa  249  3e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.948556 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2258  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  56.81 
 
 
226 aa  242  3e-63  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.545318  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3297  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  54.07 
 
 
218 aa  239  2e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4338  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  56.6 
 
 
222 aa  234  7e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0323675  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0952  3-oxoacid CoA-transferase subunit B  57.28 
 
 
213 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.334541  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1549  3-oxoacid CoA-transferase subunit B  57.28 
 
 
213 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1107  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase beta subunit  57.28 
 
 
213 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.485565  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18940  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  57.21 
 
 
217 aa  234  1.0000000000000001e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0409943  normal  0.556426 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1011  coenzyme A transferase  57.21 
 
 
216 aa  233  1.0000000000000001e-60  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.185512 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1878  succinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase subunit B  57.28 
 
 
213 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0343592  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1700  succinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase subunit B  57.28 
 
 
213 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.375649  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0212  3-oxoacid CoA-transferase subunit B  57.28 
 
 
213 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00734779  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1726  3-oxoacid CoA-transferase subunit B  57.28 
 
 
213 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.445298  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2059  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  56.65 
 
 
220 aa  232  3e-60  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0887  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  58.54 
 
 
217 aa  232  3e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2607  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase beta subunit  56.8 
 
 
213 aa  232  3e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2760  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  56.8 
 
 
213 aa  231  7.000000000000001e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1783  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  56.8 
 
 
213 aa  231  7.000000000000001e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0809  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  58.54 
 
 
209 aa  231  9e-60  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4611  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  55.83 
 
 
213 aa  230  1e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00383872  normal  0.923474 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1367  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  56.31 
 
 
213 aa  230  1e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12525  succinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase beta subunit scoB  56.52 
 
 
218 aa  230  1e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.288021  normal  0.0468104 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1351  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  57.28 
 
 
213 aa  230  1e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.897973  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1562  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  56.31 
 
 
213 aa  230  1e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51600  3-oxoacid CoA-transferase  54.07 
 
 
218 aa  229  2e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0519  3-oxoacid CoA-transferase  56.94 
 
 
221 aa  229  2e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.216025 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1391  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  56.8 
 
 
213 aa  229  2e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.755461  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1705  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  57.14 
 
 
209 aa  228  4e-59  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1684  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  52.34 
 
 
220 aa  228  5e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.49616  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3294  putative CoA transferase, subunit B  55.02 
 
 
218 aa  228  6e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.15294  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38640  putative CoA transferase, subunit B  55.02 
 
 
218 aa  228  6e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.426102  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0984  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  55.83 
 
 
213 aa  228  7e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1466  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  55.83 
 
 
213 aa  228  7e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1444  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  55.83 
 
 
213 aa  228  7e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.085725  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3123  3-oxoacid CoA-transferase subunit B  53.77 
 
 
218 aa  228  8e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.818708 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0591  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  56.1 
 
 
217 aa  228  8e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1506  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  59.05 
 
 
218 aa  227  1e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.233777  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03100  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase, beta subunit  55.83 
 
 
217 aa  226  2e-58  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2593  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  53.3 
 
 
218 aa  226  2e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2277  CoA-transferase, beta subunit  52.56 
 
 
220 aa  226  2e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4634  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  58.17 
 
 
216 aa  226  2e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2734  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  53.3 
 
 
218 aa  226  2e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01940  3-oxoacid CoA-transferase subunit B family enzyme  53.59 
 
 
217 aa  226  2e-58  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0468596  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3046  CoA-transferase, beta subunit  52.56 
 
 
220 aa  226  3e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1459  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  57.69 
 
 
216 aa  225  3e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.961201 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3848  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  57.56 
 
 
215 aa  225  3e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0238959  normal  0.733298 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2330  CoA-transferase, beta subunit  51.63 
 
 
220 aa  225  4e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0269075  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07040  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  57.28 
 
 
222 aa  225  4e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.238632 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6829  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  60 
 
 
209 aa  225  4e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0752786  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17560  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  58.16 
 
 
202 aa  225  4e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1141  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  57.35 
 
 
220 aa  225  4e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.115046  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2106  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  56.1 
 
 
215 aa  225  5.0000000000000005e-58  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.422134  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1435  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  57.69 
 
 
216 aa  225  5.0000000000000005e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2432  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  53.81 
 
 
218 aa  225  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1139  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  53.11 
 
 
218 aa  224  6e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.477496 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2075  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  53.59 
 
 
221 aa  224  6e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2114  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  53.02 
 
 
220 aa  224  6e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.300708  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3292  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  56.46 
 
 
219 aa  224  6e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0655  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  56.46 
 
 
220 aa  224  7e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.994657 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3468  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  56.46 
 
 
220 aa  224  7e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2079  aetate CoA-transferase, beta subunit  51.63 
 
 
220 aa  224  8e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4355  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  53.33 
 
 
218 aa  224  8e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2321  CoA-transferase, beta subunit  51.63 
 
 
220 aa  224  8e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1619  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  54.07 
 
 
218 aa  224  8e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2350  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  56.04 
 
 
214 aa  224  9e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2404  CoA-transferase, beta subunit  51.63 
 
 
220 aa  224  9e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6962  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  55.98 
 
 
219 aa  224  1e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.978999  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03176  succinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase subunit B  58.29 
 
 
209 aa  224  1e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.303462  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2141  CoA-transferase subunit beta  51.63 
 
 
220 aa  224  1e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.356261  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2075  aetate CoA-transferase, beta subunit  51.63 
 
 
220 aa  224  1e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2296  CoA-transferase subunit beta  51.63 
 
 
220 aa  224  1e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.489848  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3949  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  57.21 
 
 
216 aa  224  1e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3229  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  56.46 
 
 
218 aa  224  1e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0245093 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1669  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  55.02 
 
 
218 aa  224  1e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2883  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  58.21 
 
 
236 aa  223  2e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.182423  normal  0.207239 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2804  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  55.02 
 
 
218 aa  222  3e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.753217  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>