More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_0867 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007964  Nham_0867  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  100 
 
 
216 aa  429  1e-119  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2278  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  72.95 
 
 
208 aa  319  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1572  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  70.05 
 
 
213 aa  300  9e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.494559 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2004  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  67.13 
 
 
239 aa  296  2e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.725633  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2491  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  64.95 
 
 
219 aa  278  6e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000498099 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0830  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  63.43 
 
 
218 aa  275  3e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.127359 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1471  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  64.98 
 
 
219 aa  273  1.0000000000000001e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.155964  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1135  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  63.64 
 
 
214 aa  271  7e-72  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1382  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  62.04 
 
 
218 aa  270  1e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0211  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  62.56 
 
 
216 aa  269  2.9999999999999997e-71  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1856  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  60.65 
 
 
222 aa  268  5e-71  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2247  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  56.74 
 
 
219 aa  251  7e-66  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1076  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  54.84 
 
 
216 aa  248  5e-65  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3274  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  59.72 
 
 
218 aa  246  2e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.948556 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1909  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  54.88 
 
 
219 aa  243  1.9999999999999999e-63  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02149  acetyl-CoA:acetoacetyl-CoA transferase, beta subunit  56.73 
 
 
216 aa  242  3e-63  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.746207  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1436  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  56.73 
 
 
216 aa  242  3e-63  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.633734  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02108  hypothetical protein  56.73 
 
 
216 aa  242  3e-63  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.796966  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1428  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  56.73 
 
 
216 aa  242  3e-63  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.773263  hitchhiker  0.000356142 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2371  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  56.73 
 
 
216 aa  242  3e-63  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0826912  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2363  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  56.73 
 
 
216 aa  242  3e-63  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1161  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  58.65 
 
 
215 aa  241  5e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0519  3-oxoacid CoA-transferase  54.55 
 
 
221 aa  239  2e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.216025 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3170  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  56.68 
 
 
215 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3292  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  55.02 
 
 
219 aa  237  1e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0655  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  55.02 
 
 
220 aa  237  1e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.994657 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3468  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  55.02 
 
 
220 aa  237  1e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2075  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  53.55 
 
 
221 aa  235  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1713  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  55.5 
 
 
218 aa  234  6e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3123  3-oxoacid CoA-transferase subunit B  54.07 
 
 
218 aa  234  7e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.818708 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1597  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase, beta subunit  53.55 
 
 
218 aa  234  7e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.237466  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2328  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  55.5 
 
 
218 aa  234  7e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.208746 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2400  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  55.5 
 
 
218 aa  234  7e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.724461  normal  0.313356 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1666  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  55.5 
 
 
218 aa  234  7e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2432  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  54.07 
 
 
218 aa  234  8e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1891  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase, beta subunit  55.5 
 
 
218 aa  234  9e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2834  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  55.5 
 
 
218 aa  233  1.0000000000000001e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1524  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  55.5 
 
 
218 aa  233  1.0000000000000001e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2979  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  55.5 
 
 
218 aa  233  1.0000000000000001e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2852  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  55.5 
 
 
218 aa  233  1.0000000000000001e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0887  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  54.98 
 
 
217 aa  233  2.0000000000000002e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2734  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  53.59 
 
 
218 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2593  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  53.59 
 
 
218 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1452  3-oxoacid CoA-transferase  54.03 
 
 
218 aa  232  3e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00341898  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51600  3-oxoacid CoA-transferase  54.55 
 
 
218 aa  232  3e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1669  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  54.03 
 
 
218 aa  232  3e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1356  3-oxoacid CoA-transferase  53.49 
 
 
218 aa  232  3e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.684977 
 
 
-
 
NC_002950  PG1075  coenzyme A transferase, beta subunit  53.99 
 
 
220 aa  232  4.0000000000000004e-60  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.425854 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2733  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  55.02 
 
 
218 aa  231  4.0000000000000004e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3294  putative CoA transferase, subunit B  54.03 
 
 
218 aa  231  8.000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.15294  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38640  putative CoA transferase, subunit B  54.03 
 
 
218 aa  231  8.000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.426102  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2804  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  53.55 
 
 
218 aa  230  1e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.753217  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2576  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  53.08 
 
 
218 aa  230  1e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1619  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  53.55 
 
 
218 aa  230  1e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3054  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  52.15 
 
 
219 aa  229  2e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.178254 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3229  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  52.56 
 
 
218 aa  229  2e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0245093 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2917  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  54.29 
 
 
219 aa  229  3e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000753738 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0591  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  54.03 
 
 
217 aa  229  3e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3238  3-oxoacid CoA-transferase  52.61 
 
 
218 aa  228  4e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.507702  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6962  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  54.5 
 
 
219 aa  228  6e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.978999  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1139  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  52.13 
 
 
218 aa  228  7e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.477496 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3456  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B family  53.11 
 
 
218 aa  226  2e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03100  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase, beta subunit  53.55 
 
 
217 aa  226  2e-58  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2252  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  54.07 
 
 
218 aa  226  2e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4338  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  55.92 
 
 
222 aa  224  7e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0323675  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1011  coenzyme A transferase  53.47 
 
 
216 aa  222  3e-57  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.185512 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01940  3-oxoacid CoA-transferase subunit B family enzyme  50.23 
 
 
217 aa  222  4e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0468596  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3848  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  55.94 
 
 
215 aa  221  8e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0238959  normal  0.733298 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1164  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  50 
 
 
229 aa  221  8e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4284  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  55.34 
 
 
215 aa  219  1.9999999999999999e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.18483 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3297  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  51.18 
 
 
218 aa  217  1e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2696  3-oxoacid CoA-transferase B subunit  54.23 
 
 
448 aa  217  1e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.494818  normal  0.507072 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0809  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  52.97 
 
 
209 aa  217  1e-55  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1407  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  53.55 
 
 
268 aa  216  2e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000217887 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2258  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  50.48 
 
 
226 aa  214  9e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.545318  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1367  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  53 
 
 
213 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1306  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  55.12 
 
 
453 aa  213  1.9999999999999998e-54  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1562  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  52.5 
 
 
213 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3044  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  52.63 
 
 
241 aa  212  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2079  aetate CoA-transferase, beta subunit  51.49 
 
 
220 aa  211  4.9999999999999996e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1783  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  53.5 
 
 
213 aa  211  4.9999999999999996e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2321  CoA-transferase, beta subunit  51.49 
 
 
220 aa  211  4.9999999999999996e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2141  CoA-transferase subunit beta  51.49 
 
 
220 aa  211  5.999999999999999e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.356261  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2075  aetate CoA-transferase, beta subunit  51.49 
 
 
220 aa  211  5.999999999999999e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2296  CoA-transferase subunit beta  51.49 
 
 
220 aa  211  5.999999999999999e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.489848  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4355  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  51.9 
 
 
218 aa  210  1e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07620  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  54.9 
 
 
221 aa  210  1e-53  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1571  succinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase subunit B protein  51.22 
 
 
212 aa  209  2e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2607  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase beta subunit  53 
 
 
213 aa  210  2e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2760  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  52.5 
 
 
213 aa  209  2e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0566  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  51.69 
 
 
219 aa  210  2e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1389  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  53.08 
 
 
255 aa  209  2e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07040  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  50.24 
 
 
222 aa  209  3e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.238632 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0952  3-oxoacid CoA-transferase subunit B  52.5 
 
 
213 aa  209  3e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.334541  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1107  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase beta subunit  52.5 
 
 
213 aa  209  3e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.485565  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18940  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  54.27 
 
 
217 aa  209  3e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0409943  normal  0.556426 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0212  3-oxoacid CoA-transferase subunit B  52.5 
 
 
213 aa  209  3e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00734779  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1878  succinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase subunit B  52.5 
 
 
213 aa  209  3e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0343592  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1700  succinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase subunit B  52.5 
 
 
213 aa  209  3e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.375649  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1549  3-oxoacid CoA-transferase subunit B  52.5 
 
 
213 aa  209  3e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>