More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1135 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009616  Tmel_1135  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  100 
 
 
214 aa  428  1e-119  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0211  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  84.11 
 
 
216 aa  377  1e-104  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1076  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  69.95 
 
 
216 aa  313  8e-85  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1471  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  69.81 
 
 
219 aa  308  2.9999999999999997e-83  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.155964  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2004  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  67.15 
 
 
239 aa  291  7e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.725633  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1382  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  68.12 
 
 
218 aa  290  1e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0830  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  64.49 
 
 
218 aa  288  3e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.127359 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2491  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  67.77 
 
 
219 aa  289  3e-77  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000498099 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2278  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  67.15 
 
 
208 aa  287  9e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1856  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  63.51 
 
 
222 aa  281  5.000000000000001e-75  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1909  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  61.01 
 
 
219 aa  272  2.0000000000000002e-72  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0867  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  63.64 
 
 
216 aa  271  7e-72  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1572  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  62.98 
 
 
213 aa  267  7e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.494559 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2247  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  61.24 
 
 
219 aa  265  2.9999999999999995e-70  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1075  coenzyme A transferase, beta subunit  61.24 
 
 
220 aa  254  8e-67  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.425854 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1161  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  59.53 
 
 
215 aa  253  1.0000000000000001e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3274  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  59.72 
 
 
218 aa  251  7e-66  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.948556 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3170  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  58.6 
 
 
215 aa  250  1e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1164  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  56.67 
 
 
229 aa  249  2e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4338  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  56.19 
 
 
222 aa  245  3e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0323675  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2371  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  56.81 
 
 
216 aa  245  4e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0826912  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02149  acetyl-CoA:acetoacetyl-CoA transferase, beta subunit  56.81 
 
 
216 aa  245  4e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.746207  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1436  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  56.81 
 
 
216 aa  245  4e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.633734  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1428  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  56.81 
 
 
216 aa  245  4e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.773263  hitchhiker  0.000356142 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2363  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  56.81 
 
 
216 aa  245  4e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02108  hypothetical protein  56.81 
 
 
216 aa  245  4e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.796966  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12525  succinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase beta subunit scoB  57.49 
 
 
218 aa  239  2e-62  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.288021  normal  0.0468104 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3297  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  54.07 
 
 
218 aa  239  2.9999999999999997e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1011  coenzyme A transferase  55.77 
 
 
216 aa  238  6.999999999999999e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.185512 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0887  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  56.13 
 
 
217 aa  233  1.0000000000000001e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03100  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase, beta subunit  55.66 
 
 
217 aa  231  5e-60  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2258  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  54.59 
 
 
226 aa  229  2e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.545318  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18940  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  52.13 
 
 
217 aa  229  3e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0409943  normal  0.556426 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2059  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  54.19 
 
 
220 aa  228  5e-59  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3123  3-oxoacid CoA-transferase subunit B  51.9 
 
 
218 aa  227  1e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.818708 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2277  CoA-transferase, beta subunit  51.42 
 
 
220 aa  226  1e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0952  3-oxoacid CoA-transferase subunit B  53.88 
 
 
213 aa  226  2e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.334541  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1107  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase beta subunit  53.88 
 
 
213 aa  226  2e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.485565  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2404  CoA-transferase, beta subunit  51.42 
 
 
220 aa  226  2e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1878  succinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase subunit B  53.88 
 
 
213 aa  226  2e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0343592  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01940  3-oxoacid CoA-transferase subunit B family enzyme  52.36 
 
 
217 aa  226  2e-58  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0468596  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1549  3-oxoacid CoA-transferase subunit B  53.88 
 
 
213 aa  226  2e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0212  3-oxoacid CoA-transferase subunit B  53.88 
 
 
213 aa  226  2e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00734779  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1684  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  51.89 
 
 
220 aa  226  2e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.49616  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1726  3-oxoacid CoA-transferase subunit B  53.88 
 
 
213 aa  226  2e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.445298  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0809  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  56.16 
 
 
209 aa  226  2e-58  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1700  succinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase subunit B  53.88 
 
 
213 aa  226  2e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.375649  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2330  CoA-transferase, beta subunit  50.94 
 
 
220 aa  226  3e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0269075  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2593  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  51.43 
 
 
218 aa  226  3e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3046  CoA-transferase, beta subunit  51.42 
 
 
220 aa  225  3e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2079  aetate CoA-transferase, beta subunit  50.94 
 
 
220 aa  225  4e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2321  CoA-transferase, beta subunit  50.94 
 
 
220 aa  225  4e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2734  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  51.43 
 
 
218 aa  225  4e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1389  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  56.4 
 
 
255 aa  224  5.0000000000000005e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2141  CoA-transferase subunit beta  50.94 
 
 
220 aa  224  6e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.356261  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2075  aetate CoA-transferase, beta subunit  50.94 
 
 
220 aa  224  6e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2296  CoA-transferase subunit beta  50.94 
 
 
220 aa  224  6e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.489848  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2432  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  51.43 
 
 
218 aa  224  6e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4355  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  53.81 
 
 
218 aa  224  7e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2350  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  54.63 
 
 
214 aa  224  7e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2607  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase beta subunit  53.4 
 
 
213 aa  224  8e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1783  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  53.4 
 
 
213 aa  223  1e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4611  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  53.4 
 
 
213 aa  223  1e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00383872  normal  0.923474 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2114  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  50.94 
 
 
220 aa  223  2e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.300708  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51600  3-oxoacid CoA-transferase  50.24 
 
 
218 aa  223  2e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07040  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  53.4 
 
 
222 aa  222  3e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.238632 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1562  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  54.19 
 
 
213 aa  222  3e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2106  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  52.68 
 
 
215 aa  222  3e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.422134  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1506  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  56.19 
 
 
218 aa  222  4e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.233777  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2344  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  54.27 
 
 
215 aa  221  6e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000606975  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1597  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase, beta subunit  53.11 
 
 
218 aa  221  7e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.237466  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3949  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  54.33 
 
 
216 aa  221  7e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2760  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  52.43 
 
 
213 aa  221  8e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1705  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  54.19 
 
 
209 aa  220  9.999999999999999e-57  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3238  3-oxoacid CoA-transferase  51.67 
 
 
218 aa  220  9.999999999999999e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.507702  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2917  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  54.81 
 
 
219 aa  220  9.999999999999999e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000753738 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1367  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  51.94 
 
 
213 aa  220  9.999999999999999e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6962  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  53.11 
 
 
219 aa  220  9.999999999999999e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.978999  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0331  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  54.59 
 
 
214 aa  220  9.999999999999999e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1444  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  52.43 
 
 
213 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.085725  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4634  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  54.33 
 
 
216 aa  219  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0984  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  52.43 
 
 
213 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3846  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  50 
 
 
223 aa  219  1.9999999999999999e-56  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1351  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  52.91 
 
 
213 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.897973  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1466  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  52.43 
 
 
213 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08490  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  53.77 
 
 
224 aa  219  1.9999999999999999e-56  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.506696 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3848  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  54.63 
 
 
215 aa  219  3e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0238959  normal  0.733298 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3456  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B family  51.2 
 
 
218 aa  219  3e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4284  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  54.85 
 
 
215 aa  219  3e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.18483 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4891  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  53.23 
 
 
211 aa  219  3e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.690445  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1391  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  52.43 
 
 
213 aa  218  3.9999999999999997e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.755461  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1459  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  53.85 
 
 
216 aa  218  3.9999999999999997e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.961201 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6829  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  56.1 
 
 
209 aa  218  3.9999999999999997e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0752786  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1435  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  53.85 
 
 
216 aa  218  5e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7913  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  51.46 
 
 
221 aa  218  6e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2883  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  53.73 
 
 
236 aa  217  8.999999999999998e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.182423  normal  0.207239 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0490  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  53.27 
 
 
234 aa  217  8.999999999999998e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.906071  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1429  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  53.43 
 
 
209 aa  217  1e-55  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.164203 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3294  putative CoA transferase, subunit B  51.71 
 
 
218 aa  217  1e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.15294  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1452  3-oxoacid CoA-transferase  53.66 
 
 
218 aa  217  1e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00341898  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>