More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_2491 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010524  Lcho_2491  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  100 
 
 
219 aa  432  1e-120  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000498099 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0830  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  72.9 
 
 
218 aa  306  2.0000000000000002e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.127359 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2004  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  71.96 
 
 
239 aa  306  2.0000000000000002e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.725633  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1471  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  70.56 
 
 
219 aa  297  8e-80  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.155964  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1135  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  67.77 
 
 
214 aa  289  3e-77  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0211  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  68.25 
 
 
216 aa  287  1e-76  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1382  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  70.56 
 
 
218 aa  286  2e-76  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0867  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  64.95 
 
 
216 aa  278  6e-74  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1856  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  67.29 
 
 
222 aa  277  8e-74  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2278  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  69.08 
 
 
208 aa  276  1e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1076  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  59.53 
 
 
216 aa  265  4e-70  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3274  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  64.02 
 
 
218 aa  256  2e-67  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.948556 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1572  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  63.77 
 
 
213 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.494559 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1909  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  55.92 
 
 
219 aa  241  3.9999999999999997e-63  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2247  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  58.45 
 
 
219 aa  238  6.999999999999999e-62  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4338  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  57.89 
 
 
222 aa  230  1e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0323675  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3170  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  56.6 
 
 
215 aa  228  4e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1161  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  55.66 
 
 
215 aa  228  5e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6962  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  56.34 
 
 
219 aa  228  5e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.978999  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1075  coenzyme A transferase, beta subunit  55.24 
 
 
220 aa  227  1e-58  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.425854 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2371  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  57.48 
 
 
216 aa  226  2e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0826912  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02149  acetyl-CoA:acetoacetyl-CoA transferase, beta subunit  57.48 
 
 
216 aa  226  2e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.746207  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1436  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  57.48 
 
 
216 aa  226  2e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.633734  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2363  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  57.48 
 
 
216 aa  226  2e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1428  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  57.48 
 
 
216 aa  226  2e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.773263  hitchhiker  0.000356142 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1164  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  55.5 
 
 
229 aa  226  2e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02108  hypothetical protein  57.48 
 
 
216 aa  226  2e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.796966  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03100  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase, beta subunit  54.42 
 
 
217 aa  224  7e-58  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1139  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  51.67 
 
 
218 aa  221  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.477496 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0887  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  53.59 
 
 
217 aa  221  8e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01940  3-oxoacid CoA-transferase subunit B family enzyme  51.67 
 
 
217 aa  221  8e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0468596  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0591  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  53.59 
 
 
217 aa  220  9.999999999999999e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3294  putative CoA transferase, subunit B  52.15 
 
 
218 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.15294  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2432  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  51.67 
 
 
218 aa  220  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38640  putative CoA transferase, subunit B  52.15 
 
 
218 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.426102  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1669  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  52.15 
 
 
218 aa  220  9.999999999999999e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51600  3-oxoacid CoA-transferase  52.15 
 
 
218 aa  219  1.9999999999999999e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4284  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  58.13 
 
 
215 aa  219  3e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.18483 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2917  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  52.53 
 
 
219 aa  219  3e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000753738 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3123  3-oxoacid CoA-transferase subunit B  51.2 
 
 
218 aa  218  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.818708 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2734  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  51.2 
 
 
218 aa  218  5e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2593  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  51.2 
 
 
218 aa  218  5e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3054  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  50.72 
 
 
219 aa  217  1e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.178254 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3238  3-oxoacid CoA-transferase  50.72 
 
 
218 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.507702  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2075  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  50.72 
 
 
221 aa  215  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3456  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B family  50.72 
 
 
218 aa  215  4e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2114  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  55.1 
 
 
220 aa  215  4e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.300708  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2277  CoA-transferase, beta subunit  53.57 
 
 
220 aa  214  8e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2141  CoA-transferase subunit beta  51.43 
 
 
220 aa  214  9e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.356261  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2075  aetate CoA-transferase, beta subunit  51.43 
 
 
220 aa  214  9e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2296  CoA-transferase subunit beta  51.43 
 
 
220 aa  214  9e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.489848  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2330  CoA-transferase, beta subunit  51.43 
 
 
220 aa  213  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0269075  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2079  aetate CoA-transferase, beta subunit  53.06 
 
 
220 aa  213  9.999999999999999e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2321  CoA-transferase, beta subunit  53.06 
 
 
220 aa  213  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1783  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  53.47 
 
 
213 aa  213  9.999999999999999e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3046  CoA-transferase, beta subunit  53.57 
 
 
220 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1684  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  52.43 
 
 
220 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.49616  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4355  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  52.5 
 
 
218 aa  212  2.9999999999999995e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07040  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  59.39 
 
 
222 aa  212  2.9999999999999995e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.238632 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2404  CoA-transferase, beta subunit  50.95 
 
 
220 aa  212  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1452  3-oxoacid CoA-transferase  50.24 
 
 
218 aa  212  3.9999999999999995e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00341898  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1351  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  52.97 
 
 
213 aa  211  9e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.897973  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2607  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase beta subunit  52.97 
 
 
213 aa  210  1e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1367  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  51.98 
 
 
213 aa  210  1e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2760  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  51.98 
 
 
213 aa  210  2e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1391  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  52.48 
 
 
213 aa  209  2e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.755461  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1011  coenzyme A transferase  53.03 
 
 
216 aa  209  3e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.185512 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2852  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  49.76 
 
 
218 aa  209  3e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3297  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  50.72 
 
 
218 aa  209  3e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2834  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  49.76 
 
 
218 aa  209  3e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2979  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  49.76 
 
 
218 aa  209  3e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1524  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  49.76 
 
 
218 aa  209  3e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2350  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  51.96 
 
 
214 aa  209  4e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12525  succinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase beta subunit scoB  55.45 
 
 
218 aa  208  6e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.288021  normal  0.0468104 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3848  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  53.54 
 
 
215 aa  208  6e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0238959  normal  0.733298 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1597  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase, beta subunit  49.28 
 
 
218 aa  207  7e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.237466  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1619  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  49.76 
 
 
218 aa  207  7e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3292  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  50.24 
 
 
219 aa  207  8e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0655  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  50.24 
 
 
220 aa  207  8e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.994657 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3468  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  50.24 
 
 
220 aa  207  9e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2804  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  49.28 
 
 
218 aa  207  1e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.753217  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0212  3-oxoacid CoA-transferase subunit B  52.48 
 
 
213 aa  207  1e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00734779  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1891  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase, beta subunit  49.28 
 
 
218 aa  207  1e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1107  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase beta subunit  52.48 
 
 
213 aa  207  1e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.485565  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0519  3-oxoacid CoA-transferase  49.76 
 
 
221 aa  207  1e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.216025 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1549  3-oxoacid CoA-transferase subunit B  52.48 
 
 
213 aa  207  1e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1878  succinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase subunit B  52.48 
 
 
213 aa  207  1e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0343592  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4611  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  51.5 
 
 
213 aa  207  1e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00383872  normal  0.923474 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3229  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  49.76 
 
 
218 aa  207  1e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0245093 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2576  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  49.76 
 
 
218 aa  207  1e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1700  succinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase subunit B  52.48 
 
 
213 aa  207  1e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.375649  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0952  3-oxoacid CoA-transferase subunit B  52.48 
 
 
213 aa  207  1e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.334541  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0809  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  53.47 
 
 
209 aa  207  1e-52  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1726  3-oxoacid CoA-transferase subunit B  52.48 
 
 
213 aa  207  1e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.445298  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1389  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  54.15 
 
 
255 aa  207  1e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4892  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  57.14 
 
 
218 aa  207  1e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1713  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  49.28 
 
 
218 aa  206  2e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1444  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  51.98 
 
 
213 aa  206  2e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.085725  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2400  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  49.28 
 
 
218 aa  206  2e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.724461  normal  0.313356 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1466  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  51.98 
 
 
213 aa  206  2e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>