More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_3274 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_3274  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  100 
 
 		 218 aa  442  1e-123  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.948556 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1856  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  69.27 
 
 		 222 aa  296  1e-79  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1471  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  62.39 
 
 		 219 aa  263  1e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.155964  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2004  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  63.43 
 
 		 239 aa  263  1e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.725633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1382  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  62.39 
 
 		 218 aa  263  2e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2491  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  64.02 
 
 		 219 aa  256  2e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000498099 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1135  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  59.72 
 
 		 214 aa  251  7e-66  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0211  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  60.58 
 
 		 216 aa  249  3e-65  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0830  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  60.09 
 
 		 218 aa  248  5e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.127359 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0867  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  59.72 
 
 		 216 aa  246  2e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1076  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  53.74 
 
 		 216 aa  235  4e-61  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1572  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  59.9 
 
 		 213 aa  235  5.0000000000000005e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.494559 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2278  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  60.39 
 
 		 208 aa  232  3e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0887  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  56.22 
 
 		 217 aa  228  4e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1075  coenzyme A transferase, beta subunit  55.02 
 
 		 220 aa  223  1e-57  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.425854 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1909  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  55.34 
 
 		 219 aa  223  2e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2247  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  54.29 
 
 		 219 aa  218  3.9999999999999997e-56  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6962  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  55.19 
 
 		 219 aa  217  8.999999999999998e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.978999  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03100  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase, beta subunit  52.61 
 
 		 217 aa  211  4.9999999999999996e-54  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1161  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  51.15 
 
 		 215 aa  208  5e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4338  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  52.86 
 
 		 222 aa  207  7e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0323675  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3170  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  51.15 
 
 		 215 aa  207  1e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2917  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  52.58 
 
 		 219 aa  205  3e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000753738 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0591  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  52.36 
 
 		 217 aa  205  5e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3123  3-oxoacid CoA-transferase subunit B  51.89 
 
 		 218 aa  204  8e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.818708 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2593  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  51.42 
 
 		 218 aa  202  2e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2432  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  51.89 
 
 		 218 aa  203  2e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2734  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  51.42 
 
 		 218 aa  202  3e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1164  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  50.47 
 
 		 229 aa  202  4e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3456  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B family  51.16 
 
 		 218 aa  201  6e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3294  putative CoA transferase, subunit B  51.4 
 
 		 218 aa  201  6e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.15294  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38640  putative CoA transferase, subunit B  51.4 
 
 		 218 aa  201  6e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.426102  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1452  3-oxoacid CoA-transferase  51.15 
 
 		 218 aa  201  9e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00341898  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2059  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  51.72 
 
 		 220 aa  199  1.9999999999999998e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3238  3-oxoacid CoA-transferase  50.69 
 
 		 218 aa  199  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.507702  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1669  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  51.94 
 
 		 218 aa  199  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3229  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  50.23 
 
 		 218 aa  197  7e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0245093 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51600  3-oxoacid CoA-transferase  50.94 
 
 		 218 aa  197  7e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1139  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  50 
 
 		 218 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.477496 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3297  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  48.13 
 
 		 218 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1356  3-oxoacid CoA-transferase  51.16 
 
 		 218 aa  196  3e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.684977 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2979  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  51.16 
 
 		 218 aa  196  3e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2804  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  50.23 
 
 		 218 aa  196  3e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.753217  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1524  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  51.16 
 
 		 218 aa  196  3e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2834  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  51.16 
 
 		 218 aa  196  3e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1891  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase, beta subunit  51.16 
 
 		 218 aa  195  4.0000000000000005e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1713  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  51.16 
 
 		 218 aa  195  4.0000000000000005e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2328  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  51.16 
 
 		 218 aa  195  4.0000000000000005e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.208746 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2400  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  51.16 
 
 		 218 aa  195  4.0000000000000005e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.724461  normal  0.313356 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1666  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  51.16 
 
 		 218 aa  195  4.0000000000000005e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2075  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  49.07 
 
 		 221 aa  194  6e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2576  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  49.77 
 
 		 218 aa  194  9e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1597  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase, beta subunit  50.23 
 
 		 218 aa  194  1e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.237466  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2852  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  50.7 
 
 		 218 aa  194  1e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3054  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  49.53 
 
 		 219 aa  194  1e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.178254 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2252  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  50 
 
 		 218 aa  193  2e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07040  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  51.94 
 
 		 222 aa  192  2e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.238632 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2350  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  50.75 
 
 		 214 aa  192  4e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01940  3-oxoacid CoA-transferase subunit B family enzyme  48.37 
 
 		 217 aa  191  8e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0468596  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02149  acetyl-CoA:acetoacetyl-CoA transferase, beta subunit  50.47 
 
 		 216 aa  191  1e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.746207  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1436  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  50.47 
 
 		 216 aa  191  1e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.633734  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1428  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  50.47 
 
 		 216 aa  191  1e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.773263  hitchhiker  0.000356142 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02108  hypothetical protein  50.47 
 
 		 216 aa  191  1e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.796966  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2363  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  50.47 
 
 		 216 aa  191  1e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2371  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  50.47 
 
 		 216 aa  191  1e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0826912  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7913  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  50.99 
 
 		 221 aa  189  2.9999999999999997e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0809  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  50.75 
 
 		 209 aa  189  2.9999999999999997e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1306  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  51.5 
 
 		 453 aa  189  2.9999999999999997e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2733  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  48.58 
 
 		 218 aa  187  9e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0519  3-oxoacid CoA-transferase  48.84 
 
 		 221 aa  187  9e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.216025 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2106  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  54.08 
 
 		 215 aa  186  2e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.422134  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3292  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  49.3 
 
 		 219 aa  186  2e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0655  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  49.3 
 
 		 220 aa  186  2e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.994657 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2696  3-oxoacid CoA-transferase B subunit  49.75 
 
 		 448 aa  186  2e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.494818  normal  0.507072 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3468  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  49.3 
 
 		 220 aa  186  2e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1571  succinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase subunit B protein  50.99 
 
 		 212 aa  184  7e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1011  coenzyme A transferase  46.73 
 
 		 216 aa  184  8e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.185512 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4891  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  49.03 
 
 		 211 aa  184  8e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.690445  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3846  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  51.98 
 
 		 223 aa  184  9e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2258  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  47.17 
 
 		 226 aa  183  1.0000000000000001e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.545318  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2079  aetate CoA-transferase, beta subunit  47 
 
 		 220 aa  183  1.0000000000000001e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2321  CoA-transferase, beta subunit  47 
 
 		 220 aa  183  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0331  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  50.51 
 
 		 214 aa  183  1.0000000000000001e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2141  CoA-transferase subunit beta  47 
 
 		 220 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.356261  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2075  aetate CoA-transferase, beta subunit  47 
 
 		 220 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1705  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  50 
 
 		 209 aa  182  2.0000000000000003e-45  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2296  CoA-transferase subunit beta  47 
 
 		 220 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.489848  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2114  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  45.15 
 
 		 220 aa  182  2.0000000000000003e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.300708  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2124  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  49 
 
 		 211 aa  182  3e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2330  CoA-transferase, beta subunit  46.5 
 
 		 220 aa  182  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0269075  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2760  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  50.25 
 
 		 213 aa  181  6e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4355  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  48.28 
 
 		 218 aa  181  8.000000000000001e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2277  CoA-transferase, beta subunit  44.66 
 
 		 220 aa  181  8.000000000000001e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2883  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  53.89 
 
 		 236 aa  180  1e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.182423  normal  0.207239 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1619  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  47.87 
 
 		 218 aa  180  1e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3046  CoA-transferase, beta subunit  44.66 
 
 		 220 aa  180  1e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1684  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  44.66 
 
 		 220 aa  181  1e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.49616  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4892  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  49.75 
 
 		 218 aa  180  2e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2404  CoA-transferase, beta subunit  46 
 
 		 220 aa  180  2e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1407  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  50.49 
 
 		 268 aa  179  2e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000217887 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>