More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1306 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_2696  3-oxoacid CoA-transferase B subunit  77.18 
 
 
448 aa  703    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.494818  normal  0.507072 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1533  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  75.45 
 
 
447 aa  635    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.172337 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1306  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  100 
 
 
453 aa  907    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1021  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  50 
 
 
463 aa  384  1e-105  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_33142  3-oxoacid CoA-transferase Succinyl-CoA:alpha-ketoacid-CoA transferase  41.76 
 
 
505 aa  353  5e-96  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05669  succinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase (ScoT), putative (AFU_orthologue; AFUA_6G12250)  42.25 
 
 
519 aa  349  6e-95  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05860  Succinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase, putative  41.91 
 
 
561 aa  345  1e-93  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.124065  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_23365  succinyl-coenzyme A:3-oxo-acid coenzyme a-transferase  42.83 
 
 
511 aa  335  1e-90  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10495  coenzyme A transferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G04120)  40.99 
 
 
506 aa  311  2e-83  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00529511  normal  0.309681 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09394  coenzyme A transferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G04030)  42.49 
 
 
439 aa  285  1.0000000000000001e-75  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.504569  normal  0.0471262 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7413  ScoB  38.86 
 
 
461 aa  252  1e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.811733  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2350  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  54.76 
 
 
214 aa  226  6e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02149  acetyl-CoA:acetoacetyl-CoA transferase, beta subunit  53.88 
 
 
216 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.746207  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1436  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  53.88 
 
 
216 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.633734  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2363  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  53.88 
 
 
216 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1428  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  53.88 
 
 
216 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.773263  hitchhiker  0.000356142 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2371  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  53.88 
 
 
216 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0826912  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4163  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  55.5 
 
 
215 aa  221  1.9999999999999999e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02108  hypothetical protein  53.88 
 
 
216 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.796966  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2128  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  56.5 
 
 
228 aa  219  7.999999999999999e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2059  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  53.27 
 
 
220 aa  219  1e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2278  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  55.12 
 
 
208 aa  219  1e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2883  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  59.7 
 
 
236 aa  217  2.9999999999999998e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.182423  normal  0.207239 
 
 
-
 
NC_002950  PG1075  coenzyme A transferase, beta subunit  53.14 
 
 
220 aa  216  7e-55  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.425854 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1572  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  56.06 
 
 
213 aa  215  9.999999999999999e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.494559 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18940  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  56.65 
 
 
217 aa  214  1.9999999999999998e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0409943  normal  0.556426 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2079  aetate CoA-transferase, beta subunit  50.49 
 
 
220 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3848  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  53.88 
 
 
215 aa  213  3.9999999999999995e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0238959  normal  0.733298 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2321  CoA-transferase, beta subunit  50.49 
 
 
220 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4552  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  53.96 
 
 
209 aa  214  3.9999999999999995e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.208312  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0809  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  53.43 
 
 
209 aa  213  4.9999999999999996e-54  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2141  CoA-transferase subunit beta  50.49 
 
 
220 aa  213  5.999999999999999e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.356261  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2075  aetate CoA-transferase, beta subunit  50.49 
 
 
220 aa  213  5.999999999999999e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2296  CoA-transferase subunit beta  50.49 
 
 
220 aa  213  5.999999999999999e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.489848  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0867  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  55.12 
 
 
216 aa  213  5.999999999999999e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2106  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  55.02 
 
 
215 aa  213  7.999999999999999e-54  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.422134  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0647  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  53.24 
 
 
227 aa  212  1e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2344  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  58.85 
 
 
215 aa  212  1e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000606975  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1471  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  56 
 
 
219 aa  212  1e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.155964  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2330  CoA-transferase, beta subunit  50 
 
 
220 aa  211  2e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0269075  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4284  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  53.55 
 
 
215 aa  211  3e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.18483 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2277  CoA-transferase, beta subunit  50.49 
 
 
220 aa  211  3e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1382  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  53.66 
 
 
218 aa  210  3e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3846  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  55.67 
 
 
223 aa  210  4e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1135  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  54.5 
 
 
214 aa  210  4e-53  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3046  CoA-transferase, beta subunit  50.49 
 
 
220 aa  210  4e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0211  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  55.72 
 
 
216 aa  209  6e-53  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1407  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  53.81 
 
 
268 aa  209  7e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000217887 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2404  CoA-transferase, beta subunit  49.51 
 
 
220 aa  209  1e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4891  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  54.59 
 
 
211 aa  208  1e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.690445  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0566  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  50.23 
 
 
219 aa  208  2e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7913  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  53.33 
 
 
221 aa  208  2e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2127  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  56.28 
 
 
221 aa  208  2e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2114  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  50.49 
 
 
220 aa  207  3e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.300708  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2247  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  49.51 
 
 
219 aa  207  3e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0490  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  54.07 
 
 
234 aa  207  3e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.906071  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1684  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  49.51 
 
 
220 aa  207  4e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.49616  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2258  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  52.91 
 
 
226 aa  206  5e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.545318  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1909  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  48.78 
 
 
219 aa  206  7e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2291  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  51.67 
 
 
226 aa  206  7e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1350  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  52.83 
 
 
228 aa  206  7e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.596228 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3170  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  50.73 
 
 
215 aa  206  9e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1011  coenzyme A transferase  52.43 
 
 
216 aa  205  1e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.185512 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07620  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  54.55 
 
 
221 aa  205  1e-51  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07040  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  54.68 
 
 
222 aa  205  1e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.238632 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1134  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  51.74 
 
 
208 aa  205  1e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.530595  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1389  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  53.33 
 
 
255 aa  204  2e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03175  succinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase subunit A  49.32 
 
 
244 aa  204  3e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.840369  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4338  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  52.74 
 
 
222 aa  204  3e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0323675  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1164  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  50.24 
 
 
229 aa  204  3e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2124  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  51.22 
 
 
211 aa  204  3e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1161  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  50.24 
 
 
215 aa  204  3e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3297  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  50 
 
 
218 aa  203  4e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2491  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  53.66 
 
 
219 aa  203  4e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000498099 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4355  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  49.06 
 
 
218 aa  202  8e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03176  succinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase subunit B  52.71 
 
 
209 aa  201  1.9999999999999998e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.303462  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1476  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  49.26 
 
 
219 aa  201  1.9999999999999998e-50  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.038287  normal  0.12448 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0591  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  51.72 
 
 
217 aa  200  6e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2760  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  49.02 
 
 
213 aa  199  7e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51600  3-oxoacid CoA-transferase  50.49 
 
 
218 aa  199  7.999999999999999e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1369  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  51.42 
 
 
229 aa  199  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1387  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  51.42 
 
 
229 aa  199  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.104007  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2608  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  47.22 
 
 
235 aa  197  2.0000000000000003e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.357891 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4892  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  52.4 
 
 
218 aa  198  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01940  3-oxoacid CoA-transferase subunit B family enzyme  48.53 
 
 
217 aa  198  2.0000000000000003e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0468596  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1403  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  51.42 
 
 
229 aa  198  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1141  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  53.14 
 
 
220 aa  198  2.0000000000000003e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.115046  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1076  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  47.26 
 
 
216 aa  197  3e-49  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2658  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  47.69 
 
 
272 aa  197  3e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1562  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  49.02 
 
 
213 aa  197  3e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17560  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  51.01 
 
 
202 aa  197  4.0000000000000005e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1269  coenzyme A transferase  44.4 
 
 
233 aa  197  4.0000000000000005e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.703297  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1784  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  48.56 
 
 
234 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2608  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase alpha subunit  48.56 
 
 
302 aa  196  6e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4165  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  53.17 
 
 
211 aa  196  6e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.829628  normal  0.185202 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1570  fesuccinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase subunit A protein  46.05 
 
 
232 aa  196  7e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2004  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  52.5 
 
 
239 aa  196  7e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.725633  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1367  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  48.53 
 
 
213 aa  196  7e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0830  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  50.72 
 
 
218 aa  196  8.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.127359 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0331  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  50.5 
 
 
214 aa  196  8.000000000000001e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>