More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_4552 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_4552  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  100 
 
 
209 aa  419  1e-116  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.208312  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4163  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  62.2 
 
 
215 aa  273  2.0000000000000002e-72  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17560  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  64 
 
 
202 aa  260  1e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0809  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  59.42 
 
 
209 aa  259  3e-68  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1562  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  58.94 
 
 
213 aa  254  7e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1387  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  61.24 
 
 
229 aa  254  9e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.104007  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1369  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  61.24 
 
 
229 aa  254  9e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18940  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  61.08 
 
 
217 aa  253  1.0000000000000001e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0409943  normal  0.556426 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1403  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  60.77 
 
 
229 aa  252  3e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1367  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  58.94 
 
 
213 aa  252  3e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07040  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  60.19 
 
 
222 aa  251  4.0000000000000004e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.238632 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1350  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  58.94 
 
 
228 aa  251  7e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.596228 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4891  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  61.35 
 
 
211 aa  251  8.000000000000001e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.690445  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7913  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  59.42 
 
 
221 aa  248  5e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2760  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  57.49 
 
 
213 aa  248  6e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4338  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  57.49 
 
 
222 aa  247  9e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0323675  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1571  succinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase subunit B protein  56.13 
 
 
212 aa  245  3e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03176  succinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase subunit B  58.33 
 
 
209 aa  244  6e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.303462  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1270  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  56.6 
 
 
212 aa  242  1.9999999999999999e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2344  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  61.84 
 
 
215 aa  242  1.9999999999999999e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000606975  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4355  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  54.41 
 
 
218 aa  241  3.9999999999999997e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1154  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  57.08 
 
 
212 aa  241  6e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1429  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  54.07 
 
 
209 aa  241  7e-63  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.164203 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4611  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  57 
 
 
213 aa  240  9e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00383872  normal  0.923474 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1783  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  57 
 
 
213 aa  240  9e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1391  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  57 
 
 
213 aa  240  1e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.755461  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1726  3-oxoacid CoA-transferase subunit B  56.52 
 
 
213 aa  239  2e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.445298  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0952  3-oxoacid CoA-transferase subunit B  56.52 
 
 
213 aa  239  2e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.334541  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1107  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase beta subunit  56.52 
 
 
213 aa  239  2e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.485565  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1878  succinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase subunit B  56.52 
 
 
213 aa  239  2e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0343592  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1700  succinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase subunit B  56.52 
 
 
213 aa  239  2e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.375649  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2607  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase beta subunit  56.52 
 
 
213 aa  239  2e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1549  3-oxoacid CoA-transferase subunit B  56.52 
 
 
213 aa  239  2e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07620  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  56.46 
 
 
221 aa  239  2e-62  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1705  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  55.67 
 
 
209 aa  239  2e-62  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0212  3-oxoacid CoA-transferase subunit B  56.52 
 
 
213 aa  239  2e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00734779  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2657  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  55.66 
 
 
212 aa  239  2.9999999999999997e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1013  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  55.92 
 
 
216 aa  238  4e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.300705  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1444  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  57 
 
 
213 aa  238  5e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.085725  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1593  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  55.17 
 
 
209 aa  238  5e-62  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0984  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  57 
 
 
213 aa  238  5e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1351  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  56.04 
 
 
213 aa  238  5e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.897973  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1466  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  57 
 
 
213 aa  238  5e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2883  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  59.02 
 
 
236 aa  238  5e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.182423  normal  0.207239 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2075  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  55.77 
 
 
221 aa  236  1e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2607  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  55.19 
 
 
213 aa  236  1e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.348685 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3261  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  54.46 
 
 
212 aa  236  2e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.812552  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1597  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase, beta subunit  56.65 
 
 
218 aa  236  2e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.237466  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3085  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  58.45 
 
 
222 aa  236  2e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2432  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  56.25 
 
 
218 aa  236  2e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0518  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  54.81 
 
 
210 aa  236  3e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.19694 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6962  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  57.14 
 
 
219 aa  235  4e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.978999  normal 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05860  Succinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase, putative  55.77 
 
 
561 aa  235  4e-61  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.124065  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3297  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  54.63 
 
 
218 aa  235  4e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1407  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  55.92 
 
 
268 aa  235  4e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000217887 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4284  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  57.07 
 
 
215 aa  235  4e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.18483 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3238  3-oxoacid CoA-transferase  56.25 
 
 
218 aa  234  7e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.507702  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0519  3-oxoacid CoA-transferase  53.85 
 
 
221 aa  234  8e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.216025 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51600  3-oxoacid CoA-transferase  56.25 
 
 
218 aa  234  8e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1139  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  54.33 
 
 
218 aa  233  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.477496 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1983  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  56.73 
 
 
212 aa  234  1.0000000000000001e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000315327 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2328  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  55.77 
 
 
218 aa  233  1.0000000000000001e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.208746 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2400  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  55.77 
 
 
218 aa  233  1.0000000000000001e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.724461  normal  0.313356 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1666  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  55.77 
 
 
218 aa  233  1.0000000000000001e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1452  3-oxoacid CoA-transferase  55.77 
 
 
218 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00341898  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3123  3-oxoacid CoA-transferase subunit B  55.29 
 
 
218 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.818708 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3456  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B family  56.25 
 
 
218 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2593  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  55.29 
 
 
218 aa  232  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2734  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  55.29 
 
 
218 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1982  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  53.77 
 
 
211 aa  233  2.0000000000000002e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0331  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  55.67 
 
 
214 aa  232  3e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1891  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase, beta subunit  55.29 
 
 
218 aa  231  4.0000000000000004e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1652  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  53.77 
 
 
211 aa  232  4.0000000000000004e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.200149  normal  0.0417322 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2059  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  54.68 
 
 
220 aa  231  4.0000000000000004e-60  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1713  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  55.29 
 
 
218 aa  231  5e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1962  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  54.72 
 
 
212 aa  231  5e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1763  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  54.72 
 
 
212 aa  231  5e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.255353  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2834  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  54.81 
 
 
218 aa  231  6e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1011  coenzyme A transferase  55.77 
 
 
216 aa  231  6e-60  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.185512 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1524  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  54.81 
 
 
218 aa  231  6e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2979  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  54.81 
 
 
218 aa  231  6e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08490  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  55.39 
 
 
224 aa  231  6e-60  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.506696 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2576  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  54.81 
 
 
218 aa  231  7.000000000000001e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4265  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  54.72 
 
 
212 aa  231  7.000000000000001e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0745238  normal  0.356459 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1356  3-oxoacid CoA-transferase  54.81 
 
 
218 aa  231  8.000000000000001e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.684977 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12525  succinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase beta subunit scoB  52.43 
 
 
218 aa  231  9e-60  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.288021  normal  0.0468104 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2852  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  54.81 
 
 
218 aa  230  9e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0826  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  54.03 
 
 
216 aa  230  1e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3468  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  53.85 
 
 
220 aa  230  1e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3292  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  53.85 
 
 
219 aa  229  1e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0655  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  53.85 
 
 
220 aa  230  1e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.994657 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0490  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  58.1 
 
 
234 aa  230  1e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.906071  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3054  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  53.85 
 
 
219 aa  229  2e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.178254 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3824  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  58.65 
 
 
212 aa  229  2e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1134  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  53.37 
 
 
208 aa  229  2e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.530595  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3848  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  55.07 
 
 
215 aa  229  2e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0238959  normal  0.733298 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2733  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  53.85 
 
 
218 aa  229  2e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3126  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  54.25 
 
 
213 aa  228  3e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.859515  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03100  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase, beta subunit  52.43 
 
 
217 aa  229  3e-59  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1476  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  53.66 
 
 
219 aa  229  3e-59  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.038287  normal  0.12448 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>