More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNL05860 on replicon NC_006681
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006681  CNL05860  Succinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase, putative  100 
 
 
561 aa  1141    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.124065  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05669  succinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase (ScoT), putative (AFU_orthologue; AFUA_6G12250)  54.64 
 
 
519 aa  512  1e-144  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09394  coenzyme A transferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G04030)  55.82 
 
 
439 aa  493  9.999999999999999e-139  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.504569  normal  0.0471262 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_33142  3-oxoacid CoA-transferase Succinyl-CoA:alpha-ketoacid-CoA transferase  52.12 
 
 
505 aa  482  1e-135  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10495  coenzyme A transferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G04120)  51.55 
 
 
506 aa  467  9.999999999999999e-131  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00529511  normal  0.309681 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1021  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  47.24 
 
 
463 aa  426  1e-118  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_23365  succinyl-coenzyme A:3-oxo-acid coenzyme a-transferase  46.18 
 
 
511 aa  428  1e-118  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2696  3-oxoacid CoA-transferase B subunit  41.06 
 
 
448 aa  338  1.9999999999999998e-91  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.494818  normal  0.507072 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1306  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  41.91 
 
 
453 aa  330  4e-89  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1533  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  40.21 
 
 
447 aa  300  4e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.172337 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1705  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  63.11 
 
 
209 aa  271  2.9999999999999997e-71  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17560  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  63.94 
 
 
202 aa  271  2.9999999999999997e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03176  succinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase subunit B  61.9 
 
 
209 aa  268  2e-70  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.303462  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7413  ScoB  34.42 
 
 
461 aa  267  4e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.811733  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18940  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  63.55 
 
 
217 aa  266  7e-70  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0409943  normal  0.556426 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1619  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  61.65 
 
 
218 aa  265  1e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0809  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  60.38 
 
 
209 aa  265  2e-69  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1429  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  61.43 
 
 
209 aa  264  4e-69  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.164203 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1593  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  62.14 
 
 
209 aa  263  4.999999999999999e-69  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1141  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  60.65 
 
 
220 aa  261  2e-68  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.115046  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0518  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  61.43 
 
 
210 aa  261  2e-68  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.19694 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1783  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  58.69 
 
 
213 aa  261  2e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0490  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  60.65 
 
 
234 aa  261  3e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.906071  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3848  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  58.57 
 
 
215 aa  261  3e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0238959  normal  0.733298 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1270  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  60.28 
 
 
212 aa  260  4e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0647  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  60.83 
 
 
227 aa  261  4e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1391  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  58.69 
 
 
213 aa  260  6e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.755461  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01940  3-oxoacid CoA-transferase subunit B family enzyme  61.35 
 
 
217 aa  259  1e-67  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0468596  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1154  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  60.75 
 
 
212 aa  259  1e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4611  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  57.75 
 
 
213 aa  258  2e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00383872  normal  0.923474 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1407  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  60.48 
 
 
268 aa  257  3e-67  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000217887 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1466  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  58.22 
 
 
213 aa  258  3e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4355  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  59.91 
 
 
218 aa  257  3e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0984  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  58.22 
 
 
213 aa  258  3e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1444  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  58.22 
 
 
213 aa  258  3e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.085725  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2576  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  57.48 
 
 
218 aa  257  4e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1351  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  57.75 
 
 
213 aa  257  5e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.897973  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1700  succinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase subunit B  57.75 
 
 
213 aa  256  6e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.375649  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0212  3-oxoacid CoA-transferase subunit B  57.75 
 
 
213 aa  256  6e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00734779  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1107  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase beta subunit  57.75 
 
 
213 aa  256  6e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.485565  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1878  succinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase subunit B  57.75 
 
 
213 aa  256  6e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0343592  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1562  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  58.37 
 
 
213 aa  256  6e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1726  3-oxoacid CoA-transferase subunit B  57.75 
 
 
213 aa  256  6e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.445298  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0952  3-oxoacid CoA-transferase subunit B  57.75 
 
 
213 aa  256  6e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.334541  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1549  3-oxoacid CoA-transferase subunit B  57.75 
 
 
213 aa  256  6e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1367  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  58.02 
 
 
213 aa  256  7e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2760  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  58.49 
 
 
213 aa  256  7e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2607  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase beta subunit  57.75 
 
 
213 aa  256  1.0000000000000001e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3292  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  56.54 
 
 
219 aa  255  2.0000000000000002e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0655  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  56.54 
 
 
220 aa  255  2.0000000000000002e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.994657 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1597  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase, beta subunit  58.74 
 
 
218 aa  254  3e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.237466  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3468  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  56.54 
 
 
220 aa  254  3e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3044  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  57.94 
 
 
241 aa  254  4.0000000000000004e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2733  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  57.01 
 
 
218 aa  254  4.0000000000000004e-66  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1011  coenzyme A transferase  58.14 
 
 
216 aa  253  7e-66  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.185512 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1571  succinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase subunit B protein  57.94 
 
 
212 aa  253  8.000000000000001e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1983  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  56.81 
 
 
212 aa  252  1e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000315327 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12525  succinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase beta subunit scoB  58.14 
 
 
218 aa  251  2e-65  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.288021  normal  0.0468104 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1356  3-oxoacid CoA-transferase  57.01 
 
 
218 aa  251  3e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.684977 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1139  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  56.54 
 
 
218 aa  250  4e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.477496 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4634  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  58.96 
 
 
216 aa  250  4e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1435  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  58.96 
 
 
216 aa  250  6e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2920  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  57.01 
 
 
219 aa  250  6e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.911892  normal  0.370214 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5857  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  57.48 
 
 
221 aa  249  7e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.336903  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3146  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  56.54 
 
 
219 aa  249  7e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.163127  normal  0.346959 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7913  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  57.55 
 
 
221 aa  249  9e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0519  3-oxoacid CoA-transferase  55.14 
 
 
221 aa  248  1e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.216025 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3297  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  57.99 
 
 
218 aa  249  1e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1459  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  58.49 
 
 
216 aa  248  1e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.961201 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2252  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  56.13 
 
 
218 aa  249  1e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08490  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  60.38 
 
 
224 aa  248  2e-64  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.506696 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07620  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  60.48 
 
 
221 aa  248  2e-64  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1389  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  55.6 
 
 
255 aa  248  2e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5000  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  57.48 
 
 
220 aa  247  3e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.54991  hitchhiker  0.00178091 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4891  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  57.82 
 
 
211 aa  248  3e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.690445  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3949  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  58.02 
 
 
216 aa  248  3e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2075  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  55.66 
 
 
221 aa  247  4e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1891  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase, beta subunit  56.13 
 
 
218 aa  246  4.9999999999999997e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6365  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  57.01 
 
 
221 aa  246  4.9999999999999997e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0457042  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1476  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  57.87 
 
 
219 aa  247  4.9999999999999997e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.038287  normal  0.12448 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3229  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  56.13 
 
 
218 aa  246  6.999999999999999e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0245093 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1134  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  56.67 
 
 
208 aa  246  6.999999999999999e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.530595  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1247  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  58.02 
 
 
216 aa  246  8e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.272064  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2350  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  57.55 
 
 
214 aa  246  9e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1666  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  56.13 
 
 
218 aa  246  9.999999999999999e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1524  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  55.61 
 
 
218 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2852  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  55.61 
 
 
218 aa  246  9.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2834  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  55.61 
 
 
218 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2979  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  55.61 
 
 
218 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2970  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  57.41 
 
 
220 aa  246  9.999999999999999e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.421723 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2328  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  56.13 
 
 
218 aa  246  9.999999999999999e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.208746 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2400  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  56.13 
 
 
218 aa  246  9.999999999999999e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.724461  normal  0.313356 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2804  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  54.75 
 
 
218 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.753217  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51600  3-oxoacid CoA-transferase  55.4 
 
 
218 aa  245  1.9999999999999999e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4163  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  57.69 
 
 
215 aa  244  1.9999999999999999e-63  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1013  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  58.22 
 
 
216 aa  244  3e-63  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.300705  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1713  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  55.66 
 
 
218 aa  244  3.9999999999999997e-63  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2657  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  57.48 
 
 
212 aa  244  3.9999999999999997e-63  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2344  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  59.71 
 
 
215 aa  243  5e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000606975  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2258  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  54.59 
 
 
226 aa  243  5e-63  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.545318  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>