More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1533 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_1533  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  100 
 
 
447 aa  902    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.172337 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1306  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  75.28 
 
 
453 aa  659    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2696  3-oxoacid CoA-transferase B subunit  77.25 
 
 
448 aa  704    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.494818  normal  0.507072 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1021  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  48.55 
 
 
463 aa  387  1e-106  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_33142  3-oxoacid CoA-transferase Succinyl-CoA:alpha-ketoacid-CoA transferase  40.35 
 
 
505 aa  326  4.0000000000000003e-88  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05860  Succinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase, putative  40.41 
 
 
561 aa  324  2e-87  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.124065  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_23365  succinyl-coenzyme A:3-oxo-acid coenzyme a-transferase  41.21 
 
 
511 aa  323  3e-87  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05669  succinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase (ScoT), putative (AFU_orthologue; AFUA_6G12250)  41.16 
 
 
519 aa  322  9.999999999999999e-87  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10495  coenzyme A transferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G04120)  38.66 
 
 
506 aa  296  7e-79  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00529511  normal  0.309681 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09394  coenzyme A transferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G04030)  39.87 
 
 
439 aa  271  1e-71  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.504569  normal  0.0471262 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7413  ScoB  37.64 
 
 
461 aa  257  2e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.811733  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0566  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  52.07 
 
 
219 aa  221  1.9999999999999999e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0809  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  53.62 
 
 
209 aa  219  1e-55  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2124  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  53.14 
 
 
211 aa  216  5e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3848  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  53.85 
 
 
215 aa  215  9.999999999999999e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0238959  normal  0.733298 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2059  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  50.24 
 
 
220 aa  215  1.9999999999999998e-54  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2350  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  52.15 
 
 
214 aa  214  3.9999999999999995e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2247  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  52.66 
 
 
219 aa  211  1e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2128  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  51.47 
 
 
228 aa  211  2e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1164  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  48.65 
 
 
229 aa  211  2e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18940  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  52.15 
 
 
217 aa  211  2e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0409943  normal  0.556426 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2106  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  53.62 
 
 
215 aa  210  5e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.422134  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02149  acetyl-CoA:acetoacetyl-CoA transferase, beta subunit  50.72 
 
 
216 aa  209  6e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.746207  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1436  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  50.72 
 
 
216 aa  209  6e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.633734  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02108  hypothetical protein  50.72 
 
 
216 aa  209  6e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.796966  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2363  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  50.72 
 
 
216 aa  209  6e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1428  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  50.72 
 
 
216 aa  209  6e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.773263  hitchhiker  0.000356142 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2371  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  50.72 
 
 
216 aa  209  6e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0826912  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2278  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  51.46 
 
 
208 aa  209  1e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1476  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  50.48 
 
 
219 aa  208  1e-52  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.038287  normal  0.12448 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1011  coenzyme A transferase  50.71 
 
 
216 aa  207  4e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.185512 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2344  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  53.3 
 
 
215 aa  206  5e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000606975  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4552  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  50.25 
 
 
209 aa  206  5e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.208312  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1572  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  50.49 
 
 
213 aa  206  6e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.494559 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2432  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  49.27 
 
 
218 aa  206  7e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03176  succinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase subunit B  52.91 
 
 
209 aa  206  8e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.303462  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2258  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  51.92 
 
 
226 aa  205  1e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.545318  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2883  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  54.68 
 
 
236 aa  205  1e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.182423  normal  0.207239 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01940  3-oxoacid CoA-transferase subunit B family enzyme  49.75 
 
 
217 aa  206  1e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0468596  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7913  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  51.44 
 
 
221 aa  205  1e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4163  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  52.22 
 
 
215 aa  205  1e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3294  putative CoA transferase, subunit B  49.28 
 
 
218 aa  204  2e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.15294  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0867  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  49.53 
 
 
216 aa  204  2e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1350  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  51.94 
 
 
228 aa  204  2e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.596228 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38640  putative CoA transferase, subunit B  49.28 
 
 
218 aa  204  2e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.426102  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0331  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  52.24 
 
 
214 aa  205  2e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0518  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  51.71 
 
 
210 aa  204  3e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.19694 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4165  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  51.21 
 
 
211 aa  204  4e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.829628  normal  0.185202 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2734  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  48.78 
 
 
218 aa  204  4e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4355  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  49.28 
 
 
218 aa  204  4e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2593  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  48.78 
 
 
218 aa  204  4e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1571  succinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase subunit B protein  52.63 
 
 
212 aa  203  5e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1141  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  53.55 
 
 
220 aa  203  5e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.115046  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0350  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  51.49 
 
 
223 aa  203  5e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0790399 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4891  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  52.22 
 
 
211 aa  203  6e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.690445  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51600  3-oxoacid CoA-transferase  49.27 
 
 
218 aa  202  7e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3456  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B family  49.27 
 
 
218 aa  202  7e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1407  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  47.98 
 
 
268 aa  202  7e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000217887 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1452  3-oxoacid CoA-transferase  47.85 
 
 
218 aa  202  7e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00341898  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1389  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  51.2 
 
 
255 aa  202  8e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4338  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  49.28 
 
 
222 aa  202  9e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0323675  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2291  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  49.29 
 
 
226 aa  202  9e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3123  3-oxoacid CoA-transferase subunit B  48.29 
 
 
218 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.818708 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3229  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  48.78 
 
 
218 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0245093 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1909  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  49.03 
 
 
219 aa  201  1.9999999999999998e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0212  3-oxoacid CoA-transferase subunit B  52.15 
 
 
213 aa  200  3e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00734779  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1107  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase beta subunit  52.15 
 
 
213 aa  200  3e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.485565  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1700  succinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase subunit B  52.15 
 
 
213 aa  200  3e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.375649  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0952  3-oxoacid CoA-transferase subunit B  52.15 
 
 
213 aa  200  3e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.334541  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1878  succinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase subunit B  52.15 
 
 
213 aa  200  3e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0343592  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2075  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  48.78 
 
 
221 aa  201  3e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1726  3-oxoacid CoA-transferase subunit B  52.15 
 
 
213 aa  200  3e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.445298  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1435  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  51.66 
 
 
216 aa  201  3e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2607  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  52.68 
 
 
213 aa  201  3e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.348685 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1549  3-oxoacid CoA-transferase subunit B  52.15 
 
 
213 aa  200  3e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1783  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  52.15 
 
 
213 aa  201  3e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0591  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  48.78 
 
 
217 aa  201  3e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0211  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  51.9 
 
 
216 aa  200  3.9999999999999996e-50  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2079  aetate CoA-transferase, beta subunit  46.41 
 
 
220 aa  200  3.9999999999999996e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2321  CoA-transferase, beta subunit  46.41 
 
 
220 aa  200  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07620  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  53.62 
 
 
221 aa  200  3.9999999999999996e-50  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07040  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  50.96 
 
 
222 aa  200  5e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.238632 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2141  CoA-transferase subunit beta  46.63 
 
 
220 aa  199  6e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.356261  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2075  aetate CoA-transferase, beta subunit  46.63 
 
 
220 aa  199  6e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1429  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  49.75 
 
 
209 aa  199  6e-50  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.164203 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2296  CoA-transferase subunit beta  46.63 
 
 
220 aa  199  6e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.489848  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1139  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  47.37 
 
 
218 aa  199  6e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.477496 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3238  3-oxoacid CoA-transferase  48.78 
 
 
218 aa  199  7e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.507702  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1593  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  48.54 
 
 
209 aa  199  7.999999999999999e-50  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3846  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  53.4 
 
 
223 aa  199  9e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2804  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  46.89 
 
 
218 aa  199  9e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.753217  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1351  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  50.96 
 
 
213 aa  199  9e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.897973  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2277  CoA-transferase, beta subunit  46.89 
 
 
220 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4611  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  50.48 
 
 
213 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00383872  normal  0.923474 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2607  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase beta subunit  50.96 
 
 
213 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4634  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  51.66 
 
 
216 aa  199  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1391  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  50.96 
 
 
213 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.755461  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4284  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  48.56 
 
 
215 aa  198  1.0000000000000001e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.18483 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2330  CoA-transferase, beta subunit  46.15 
 
 
220 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0269075  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0573  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  50 
 
 
211 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.109491  normal  0.423863 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>