More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_0830 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007925  RPC_0830  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  100 
 
 
218 aa  433  1e-120  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.127359 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2004  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  73.15 
 
 
239 aa  318  5e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.725633  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1471  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  72.48 
 
 
219 aa  317  9e-86  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.155964  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1382  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  73.39 
 
 
218 aa  311  4.999999999999999e-84  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2491  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  72.9 
 
 
219 aa  306  2.0000000000000002e-82  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000498099 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0211  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  67.3 
 
 
216 aa  292  3e-78  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1135  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  64.49 
 
 
214 aa  288  3e-77  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1856  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  64.22 
 
 
222 aa  276  2e-73  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0867  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  63.43 
 
 
216 aa  275  3e-73  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2278  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  65.7 
 
 
208 aa  268  5e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1572  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  64.25 
 
 
213 aa  263  2e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.494559 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1076  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  57.01 
 
 
216 aa  263  2e-69  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3274  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  60.09 
 
 
218 aa  248  5e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.948556 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1909  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  54.67 
 
 
219 aa  244  9.999999999999999e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1161  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  57.08 
 
 
215 aa  241  5e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3170  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  57.55 
 
 
215 aa  240  1e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2247  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  53.74 
 
 
219 aa  236  1e-61  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1075  coenzyme A transferase, beta subunit  56.6 
 
 
220 aa  236  2e-61  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.425854 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02149  acetyl-CoA:acetoacetyl-CoA transferase, beta subunit  57.55 
 
 
216 aa  235  5.0000000000000005e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.746207  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1436  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  57.55 
 
 
216 aa  235  5.0000000000000005e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.633734  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2363  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  57.55 
 
 
216 aa  235  5.0000000000000005e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1428  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  57.55 
 
 
216 aa  235  5.0000000000000005e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.773263  hitchhiker  0.000356142 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2371  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  57.55 
 
 
216 aa  235  5.0000000000000005e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0826912  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02108  hypothetical protein  57.55 
 
 
216 aa  235  5.0000000000000005e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.796966  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1164  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  52.8 
 
 
229 aa  230  1e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51600  3-oxoacid CoA-transferase  52.36 
 
 
218 aa  224  5.0000000000000005e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2432  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  53.11 
 
 
218 aa  223  2e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12525  succinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase beta subunit scoB  59.41 
 
 
218 aa  223  2e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.288021  normal  0.0468104 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1139  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  52.15 
 
 
218 aa  221  6e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.477496 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4338  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  54.63 
 
 
222 aa  221  7e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0323675  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3123  3-oxoacid CoA-transferase subunit B  52.15 
 
 
218 aa  220  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.818708 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4284  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  58.74 
 
 
215 aa  220  9.999999999999999e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.18483 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3294  putative CoA transferase, subunit B  52.63 
 
 
218 aa  219  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.15294  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38640  putative CoA transferase, subunit B  52.63 
 
 
218 aa  219  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.426102  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2734  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  52.15 
 
 
218 aa  219  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2593  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  52.15 
 
 
218 aa  219  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01940  3-oxoacid CoA-transferase subunit B family enzyme  51.42 
 
 
217 aa  218  7e-56  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0468596  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0591  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  52.15 
 
 
217 aa  217  7.999999999999999e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3238  3-oxoacid CoA-transferase  50.71 
 
 
218 aa  217  1e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.507702  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7913  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  55.12 
 
 
221 aa  216  2e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3456  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B family  51.2 
 
 
218 aa  216  2e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2075  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  50.93 
 
 
221 aa  216  2e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6962  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  51.9 
 
 
219 aa  216  2e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.978999  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1367  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  52.45 
 
 
213 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2330  CoA-transferase, beta subunit  50.72 
 
 
220 aa  214  8e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0269075  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17560  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  55.05 
 
 
202 aa  214  8e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2277  CoA-transferase, beta subunit  51.2 
 
 
220 aa  214  9e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03100  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase, beta subunit  51.89 
 
 
217 aa  214  9.999999999999999e-55  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1549  3-oxoacid CoA-transferase subunit B  51.44 
 
 
213 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1107  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase beta subunit  51.44 
 
 
213 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.485565  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0952  3-oxoacid CoA-transferase subunit B  51.44 
 
 
213 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.334541  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1878  succinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase subunit B  51.44 
 
 
213 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0343592  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3297  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  49.07 
 
 
218 aa  213  1.9999999999999998e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07040  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  57.64 
 
 
222 aa  213  1.9999999999999998e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.238632 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1726  3-oxoacid CoA-transferase subunit B  51.44 
 
 
213 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.445298  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0212  3-oxoacid CoA-transferase subunit B  51.44 
 
 
213 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00734779  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1669  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  50.72 
 
 
218 aa  213  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1700  succinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase subunit B  51.44 
 
 
213 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.375649  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3046  CoA-transferase, beta subunit  51.2 
 
 
220 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2321  CoA-transferase, beta subunit  50.72 
 
 
220 aa  212  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2141  CoA-transferase subunit beta  50.72 
 
 
220 aa  212  2.9999999999999995e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.356261  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2079  aetate CoA-transferase, beta subunit  50.72 
 
 
220 aa  212  2.9999999999999995e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2075  aetate CoA-transferase, beta subunit  50.72 
 
 
220 aa  212  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2296  CoA-transferase subunit beta  50.72 
 
 
220 aa  212  2.9999999999999995e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.489848  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2404  CoA-transferase, beta subunit  50.24 
 
 
220 aa  212  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3229  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  51.46 
 
 
218 aa  212  2.9999999999999995e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0245093 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2760  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  51.96 
 
 
213 aa  212  2.9999999999999995e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1389  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  54.76 
 
 
255 aa  211  4.9999999999999996e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2607  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase beta subunit  50.96 
 
 
213 aa  211  7e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1452  3-oxoacid CoA-transferase  51.46 
 
 
218 aa  211  7.999999999999999e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00341898  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1407  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  54.33 
 
 
268 aa  210  1e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000217887 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2114  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  51.67 
 
 
220 aa  210  1e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.300708  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3054  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  49.53 
 
 
219 aa  209  2e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.178254 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2804  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  50.49 
 
 
218 aa  209  2e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.753217  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0655  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  52.4 
 
 
220 aa  209  2e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.994657 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4891  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  56.12 
 
 
211 aa  209  2e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.690445  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0887  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  50.47 
 
 
217 aa  209  2e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3292  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  52.4 
 
 
219 aa  209  3e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3468  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  52.4 
 
 
220 aa  208  4e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2834  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  51.94 
 
 
218 aa  208  5e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2979  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  51.94 
 
 
218 aa  208  5e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1524  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  51.94 
 
 
218 aa  208  5e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1154  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  53.17 
 
 
212 aa  208  5e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0519  3-oxoacid CoA-transferase  51.46 
 
 
221 aa  208  5e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.216025 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1783  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  50.48 
 
 
213 aa  208  6e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2852  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  51.94 
 
 
218 aa  208  6e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2576  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  50.97 
 
 
218 aa  207  7e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1713  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  51.94 
 
 
218 aa  207  7e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1597  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase, beta subunit  50.49 
 
 
218 aa  207  8e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.237466  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1684  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  49.3 
 
 
220 aa  207  8e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.49616  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4892  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  56.31 
 
 
218 aa  207  8e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2328  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  51.94 
 
 
218 aa  207  9e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.208746 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2400  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  51.94 
 
 
218 aa  207  9e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.724461  normal  0.313356 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1666  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  51.94 
 
 
218 aa  207  9e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2917  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  51.17 
 
 
219 aa  207  1e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000753738 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1619  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  50.72 
 
 
218 aa  207  1e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1356  3-oxoacid CoA-transferase  51.46 
 
 
218 aa  206  2e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.684977 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4611  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  50.49 
 
 
213 aa  206  2e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00383872  normal  0.923474 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1891  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase, beta subunit  51.46 
 
 
218 aa  206  3e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1562  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  50.49 
 
 
213 aa  206  3e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>