More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_4180 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_0883  coenzyme A transferase  85.77 
 
 		 509 aa  856    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.021218  normal  0.461656 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4180  coenzyme A transferase  100 
 
 		 520 aa  1045    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.307102  hitchhiker  0.000449682 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4742  CoA-transferase  56.63 
 
 		 513 aa  564  1.0000000000000001e-159  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.213334  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4678  CoA-transferase  57.63 
 
 		 513 aa  542  1e-153  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.696656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4451  CoA-transferase  57.23 
 
 		 513 aa  535  1e-151  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000533967  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4768  CoA-transferase  57.23 
 
 		 513 aa  537  1e-151  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0105899  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04073  putative acetyl-CoA:acetoacetyl-CoA transferase  56.83 
 
 		 513 aa  533  1e-150  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.544432  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04035  hypothetical protein  56.83 
 
 		 513 aa  533  1e-150  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.566302  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1212  coenzyme A transferase  50.99 
 
 		 523 aa  483  1e-135  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2700  coenzyme A transferase  49.02 
 
 		 526 aa  481  1e-135  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.517315  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0549  coenzyme A transferase  46.99 
 
 		 663 aa  429  1e-119  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0767  coenzyme A transferase  46.65 
 
 		 650 aa  429  1e-119  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4049  propionate CoA-transferase  46.41 
 
 		 542 aa  430  1e-119  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0091  propionate CoA-transferase  45.77 
 
 		 516 aa  429  1e-119  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4273  coenzyme A transferase  46.49 
 
 		 673 aa  420  1e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.335745  normal  0.912388 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1267  coenzyme A transferase  46.05 
 
 		 666 aa  421  1e-116  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1259  propionate CoA-transferase  42.2 
 
 		 527 aa  416  9.999999999999999e-116  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00406341 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0782  coenzyme A transferase  46.86 
 
 		 667 aa  412  1e-113  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3022  coenzyme A transferase  42.8 
 
 		 521 aa  407  1.0000000000000001e-112  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.119963 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1494  propionate CoA-transferase  47.54 
 
 		 669 aa  408  1.0000000000000001e-112  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1163  coenzyme A transferase  45.34 
 
 		 526 aa  408  1.0000000000000001e-112  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.244215  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3933  coenzyme A transferase  45.34 
 
 		 526 aa  408  1.0000000000000001e-112  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.60446  normal  0.509869 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1595  coenzyme A transferase  45.28 
 
 		 663 aa  403  1e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0936861  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2599  propionate CoA-transferase  42.6 
 
 		 524 aa  402  1e-111  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0457  propionate CoA-transferase  44.14 
 
 		 667 aa  401  9.999999999999999e-111  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.460217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2487  coenzyme A transferase  43.16 
 
 		 522 aa  397  1e-109  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0709  acyl CoA:acetate/3-ketoacid CoA transferase, alpha and beta subunit  46.94 
 
 		 648 aa  395  1e-108  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3438  coenzyme A transferase  47.19 
 
 		 633 aa  389  1e-107  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2401  coenzyme A transferase  44.1 
 
 		 670 aa  385  1e-106  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.706144 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2071  coenzyme A transferase  44.95 
 
 		 660 aa  386  1e-106  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.10059 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2345  coenzyme A transferase  44.95 
 
 		 660 aa  387  1e-106  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.41755 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3536  acetate/3-ketoacid CoA transferase  41.73 
 
 		 529 aa  382  1e-105  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2031  coenzyme A transferase  44.73 
 
 		 660 aa  383  1e-105  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.287187 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2684  coenzyme A transferase  43.5 
 
 		 646 aa  379  1e-104  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0354  coenzyme A transferase  43.87 
 
 		 660 aa  378  1e-103  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0326072  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2996  coenzyme A transferase  41.18 
 
 		 663 aa  367  1e-100  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1910  CoA-transferase  38.59 
 
 		 531 aa  364  2e-99  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1555  coenzyme A transferase  42.52 
 
 		 532 aa  358  9.999999999999999e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.431711  normal  0.989893 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1897  propionate CoA-transferase  38.18 
 
 		 531 aa  357  2.9999999999999997e-97  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.951112  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2410  propionate CoA-transferase  38.38 
 
 		 531 aa  356  5e-97  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.407987 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1502  propionate CoA-transferase  38.18 
 
 		 531 aa  355  1e-96  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00752619 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1948  coenzyme A transferase  37.98 
 
 		 531 aa  355  1e-96  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0367833  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1387  coenzyme A transferase  38.09 
 
 		 531 aa  355  1e-96  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01663  fused predicted acetyl-CoA:acetoacetyl-CoA transferase: alpha subunit/beta subunit  37.98 
 
 		 531 aa  354  2e-96  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01652  hypothetical protein  37.98 
 
 		 531 aa  354  2e-96  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1937  coenzyme A transferase  37.98 
 
 		 531 aa  354  2e-96  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00260164 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1986  propionate CoA-transferase  38.1 
 
 		 531 aa  352  7e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000465126 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1453  propionate CoA-transferase  38.1 
 
 		 531 aa  352  7e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.298558  normal  0.217975 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1469  propionate CoA-transferase  38.1 
 
 		 531 aa  352  7e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.442461  normal  0.0256592 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1815  propionate CoA-transferase  38.1 
 
 		 531 aa  352  8.999999999999999e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.590331  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1488  propionate CoA-transferase  38.1 
 
 		 531 aa  352  8.999999999999999e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.361869  hitchhiker  0.00740492 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0651  coenzyme A transferase  42.83 
 
 		 542 aa  346  5e-94  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.364545  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2224  coenzyme A transferase  40.48 
 
 		 531 aa  343  5.999999999999999e-93  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.220629  normal  0.779665 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3173  coenzyme A transferase  40.79 
 
 		 539 aa  333  4e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3939  propionate CoA-transferase  41.02 
 
 		 523 aa  328  1.0000000000000001e-88  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.438749 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1541  coenzyme A transferase  40.98 
 
 		 508 aa  327  4.0000000000000003e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8049  coenzyme A transferase  37.55 
 
 		 530 aa  326  8.000000000000001e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.205109  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3570  coenzyme A transferase  39.88 
 
 		 532 aa  324  3e-87  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.276988  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3280  coenzyme A transferase  39.09 
 
 		 522 aa  322  9.999999999999999e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1859  propionate CoA-transferase  39.09 
 
 		 544 aa  322  9.999999999999999e-87  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.155788  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1479  coenzyme A transferase  40 
 
 		 537 aa  320  5e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.241297  normal  0.56391 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0872  coenzyme A transferase  39 
 
 		 533 aa  318  2e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1375  coenzyme A transferase  40.17 
 
 		 539 aa  315  1.9999999999999998e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6427  propionate CoA-transferase  38.05 
 
 		 522 aa  312  6.999999999999999e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.395247  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2047  acetyl-CoA-transferase subunit, putative  38.8 
 
 		 533 aa  312  1e-83  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1337  coenzyme A transferase  38.49 
 
 		 526 aa  311  1e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.132649 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1547  coenzyme A transferase  41.03 
 
 		 433 aa  309  8e-83  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_21350  predicted protein  39.58 
 
 		 557 aa  309  9e-83  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00403963  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2585  propionate CoA-transferase  37.86 
 
 		 547 aa  306  8.000000000000001e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.206611  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0346  coenzyme A transferase  38.51 
 
 		 554 aa  299  1e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0361  coenzyme A transferase  38.42 
 
 		 554 aa  297  3e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0471  putative transferase protein  37.33 
 
 		 553 aa  286  5e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0225  coenzyme A transferase  35.77 
 
 		 520 aa  275  1.0000000000000001e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0219  coenzyme A transferase  35.77 
 
 		 520 aa  275  1.0000000000000001e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0263  coenzyme A transferase  34.24 
 
 		 544 aa  262  1e-68  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0887  coenzyme A transferase  33.27 
 
 		 543 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.499816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0421  coenzyme A transferase  32.77 
 
 		 543 aa  237  4e-61  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.521688  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2696  3-oxoacid CoA-transferase B subunit  25.81 
 
 		 448 aa  97.8  5e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.494818  normal  0.507072 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3273  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  30.64 
 
 		 225 aa  94.7  4e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05860  Succinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase, putative  26.56 
 
 		 561 aa  92  2e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.124065  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1306  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  25.55 
 
 		 453 aa  80.9  0.00000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_33142  3-oxoacid CoA-transferase Succinyl-CoA:alpha-ketoacid-CoA transferase  23.2 
 
 		 505 aa  79  0.0000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09394  coenzyme A transferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G04030)  26.58 
 
 		 439 aa  77.4  0.0000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.504569  normal  0.0471262 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1021  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  25.12 
 
 		 463 aa  73.9  0.000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_23365  succinyl-coenzyme A:3-oxo-acid coenzyme a-transferase  25.1 
 
 		 511 aa  73.6  0.000000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5885  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  30.99 
 
 		 235 aa  73.2  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0829  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  32.14 
 
 		 200 aa  72.4  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.201615 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1855  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  27.46 
 
 		 217 aa  71.2  0.00000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.945952 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1533  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  24.48 
 
 		 447 aa  70.5  0.00000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.172337 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5092  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  29.36 
 
 		 235 aa  69.3  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10495  coenzyme A transferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G04120)  23.11 
 
 		 506 aa  69.3  0.0000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00529511  normal  0.309681 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6799  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  28.93 
 
 		 235 aa  68.6  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.704148  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5020  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  29.51 
 
 		 249 aa  67.8  0.0000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.363473  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6120  3-oxoadipate CoA-transferase subunit A  28.09 
 
 		 235 aa  67.4  0.0000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.756785  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3720  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  28.57 
 
 		 235 aa  67.4  0.0000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7913  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  29.36 
 
 		 221 aa  66.6  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05669  succinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase (ScoT), putative (AFU_orthologue; AFUA_6G12250)  22.69 
 
 		 519 aa  65.5  0.000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1472  butyryl-CoA:acetoacetate CoA-transferase alpha subunit  27.32 
 
 		 220 aa  65.9  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.146026  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0867  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  30.18 
 
 		 216 aa  65.9  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5059  acetyl-CoA:acetoacetyl-CoA transferase subunit alpha  32.35 
 
 		 226 aa  65.9  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00434544  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>