247 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_2585 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc0471  putative transferase protein  75.5 
 
 		 553 aa  790    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0346  coenzyme A transferase  75.69 
 
 		 554 aa  811    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2585  propionate CoA-transferase  100 
 
 		 547 aa  1103    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.206611  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0361  coenzyme A transferase  76.05 
 
 		 554 aa  804    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0767  coenzyme A transferase  49.19 
 
 		 650 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4049  propionate CoA-transferase  48.25 
 
 		 542 aa  465  1e-129  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0457  propionate CoA-transferase  46.47 
 
 		 667 aa  455  1e-127  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.460217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0549  coenzyme A transferase  47.56 
 
 		 663 aa  451  1e-125  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2599  propionate CoA-transferase  46.82 
 
 		 524 aa  449  1e-125  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4273  coenzyme A transferase  45.65 
 
 		 673 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.335745  normal  0.912388 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1267  coenzyme A transferase  44.54 
 
 		 666 aa  445  1e-123  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1494  propionate CoA-transferase  46.42 
 
 		 669 aa  432  1e-120  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1595  coenzyme A transferase  44.67 
 
 		 663 aa  429  1e-119  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0936861  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0782  coenzyme A transferase  46.45 
 
 		 667 aa  427  1e-118  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3438  coenzyme A transferase  48.82 
 
 		 633 aa  424  1e-117  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1163  coenzyme A transferase  45.77 
 
 		 526 aa  416  9.999999999999999e-116  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.244215  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3933  coenzyme A transferase  45.77 
 
 		 526 aa  416  9.999999999999999e-116  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.60446  normal  0.509869 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0709  acyl CoA:acetate/3-ketoacid CoA transferase, alpha and beta subunit  46.72 
 
 		 648 aa  417  9.999999999999999e-116  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0091  propionate CoA-transferase  42.44 
 
 		 516 aa  410  1e-113  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2401  coenzyme A transferase  44.26 
 
 		 670 aa  401  9.999999999999999e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.706144 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3536  acetate/3-ketoacid CoA transferase  42.36 
 
 		 529 aa  401  9.999999999999999e-111  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2031  coenzyme A transferase  42.62 
 
 		 660 aa  396  1e-109  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.287187 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2071  coenzyme A transferase  42.44 
 
 		 660 aa  394  1e-108  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.10059 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0354  coenzyme A transferase  42.08 
 
 		 660 aa  390  1e-107  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0326072  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2345  coenzyme A transferase  42.26 
 
 		 660 aa  392  1e-107  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.41755 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2487  coenzyme A transferase  43.46 
 
 		 522 aa  388  1e-106  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2996  coenzyme A transferase  41.53 
 
 		 663 aa  379  1e-104  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2684  coenzyme A transferase  41.13 
 
 		 646 aa  376  1e-103  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1547  coenzyme A transferase  43.54 
 
 		 433 aa  368  1e-100  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3022  coenzyme A transferase  40.11 
 
 		 521 aa  367  1e-100  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.119963 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1259  propionate CoA-transferase  38.53 
 
 		 527 aa  351  2e-95  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00406341 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1488  propionate CoA-transferase  38.18 
 
 		 531 aa  343  5e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.361869  hitchhiker  0.00740492 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1986  propionate CoA-transferase  38.18 
 
 		 531 aa  342  1e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000465126 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1453  propionate CoA-transferase  38.18 
 
 		 531 aa  342  1e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.298558  normal  0.217975 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1469  propionate CoA-transferase  38.18 
 
 		 531 aa  342  1e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.442461  normal  0.0256592 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1815  propionate CoA-transferase  38.18 
 
 		 531 aa  342  1e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.590331  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1502  propionate CoA-transferase  37.23 
 
 		 531 aa  340  4e-92  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00752619 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2410  propionate CoA-transferase  37.04 
 
 		 531 aa  340  5e-92  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.407987 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1937  coenzyme A transferase  37.04 
 
 		 531 aa  339  8e-92  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00260164 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01663  fused predicted acetyl-CoA:acetoacetyl-CoA transferase: alpha subunit/beta subunit  37.04 
 
 		 531 aa  339  9e-92  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01652  hypothetical protein  37.04 
 
 		 531 aa  339  9e-92  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1387  coenzyme A transferase  37.5 
 
 		 531 aa  338  9.999999999999999e-92  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1948  coenzyme A transferase  36.86 
 
 		 531 aa  338  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0367833  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1910  CoA-transferase  36.86 
 
 		 531 aa  337  3.9999999999999995e-91  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1897  propionate CoA-transferase  36.68 
 
 		 531 aa  335  1e-90  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.951112  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2700  coenzyme A transferase  38.98 
 
 		 526 aa  316  8e-85  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.517315  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0651  coenzyme A transferase  38 
 
 		 542 aa  316  9e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.364545  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1212  coenzyme A transferase  38.24 
 
 		 523 aa  315  1.9999999999999998e-84  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0883  coenzyme A transferase  39.16 
 
 		 509 aa  304  3.0000000000000004e-81  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.021218  normal  0.461656 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3570  coenzyme A transferase  37.23 
 
 		 532 aa  301  2e-80  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.276988  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1555  coenzyme A transferase  37.79 
 
 		 532 aa  296  5e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.431711  normal  0.989893 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6427  propionate CoA-transferase  37.14 
 
 		 522 aa  296  8e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.395247  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_21350  predicted protein  36.78 
 
 		 557 aa  296  9e-79  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00403963  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4742  CoA-transferase  36.13 
 
 		 513 aa  295  1e-78  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.213334  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4180  coenzyme A transferase  37.38 
 
 		 520 aa  293  5e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.307102  hitchhiker  0.000449682 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3280  coenzyme A transferase  37.75 
 
 		 522 aa  291  1e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2224  coenzyme A transferase  34.85 
 
 		 531 aa  291  2e-77  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.220629  normal  0.779665 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4678  CoA-transferase  36.26 
 
 		 513 aa  290  6e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.696656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1859  propionate CoA-transferase  35.03 
 
 		 544 aa  288  2e-76  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.155788  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0872  coenzyme A transferase  34.36 
 
 		 533 aa  287  2.9999999999999996e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4768  CoA-transferase  36.08 
 
 		 513 aa  286  5e-76  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0105899  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1337  coenzyme A transferase  36.67 
 
 		 526 aa  286  8e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.132649 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04035  hypothetical protein  36.08 
 
 		 513 aa  286  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.566302  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04073  putative acetyl-CoA:acetoacetyl-CoA transferase  36.08 
 
 		 513 aa  286  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.544432  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2047  acetyl-CoA-transferase subunit, putative  35.82 
 
 		 533 aa  284  3.0000000000000004e-75  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4451  CoA-transferase  35.9 
 
 		 513 aa  282  9e-75  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000533967  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1375  coenzyme A transferase  35.15 
 
 		 539 aa  281  2e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1479  coenzyme A transferase  34.91 
 
 		 537 aa  279  1e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.241297  normal  0.56391 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3173  coenzyme A transferase  34.78 
 
 		 539 aa  277  4e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3939  propionate CoA-transferase  34.35 
 
 		 523 aa  269  1e-70  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.438749 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8049  coenzyme A transferase  33.03 
 
 		 530 aa  265  1e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.205109  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0421  coenzyme A transferase  32.68 
 
 		 543 aa  249  1e-64  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.521688  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0263  coenzyme A transferase  32.96 
 
 		 544 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1541  coenzyme A transferase  36.3 
 
 		 508 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0219  coenzyme A transferase  31.07 
 
 		 520 aa  233  6e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0225  coenzyme A transferase  31.07 
 
 		 520 aa  233  6e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0887  coenzyme A transferase  32.68 
 
 		 543 aa  219  7.999999999999999e-56  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.499816  normal  1 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05860  Succinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase, putative  24.81 
 
 		 561 aa  93.2  1e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.124065  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1306  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  27.34 
 
 		 453 aa  91.7  3e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2696  3-oxoacid CoA-transferase B subunit  27.63 
 
 		 448 aa  85.9  0.000000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.494818  normal  0.507072 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1533  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  28.93 
 
 		 447 aa  80.5  0.00000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.172337 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_33142  3-oxoacid CoA-transferase Succinyl-CoA:alpha-ketoacid-CoA transferase  22.73 
 
 		 505 aa  68.9  0.0000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_23365  succinyl-coenzyme A:3-oxo-acid coenzyme a-transferase  26.41 
 
 		 511 aa  68.6  0.0000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0212  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  26.77 
 
 		 217 aa  65.1  0.000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1136  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  26.69 
 
 		 217 aa  64.3  0.000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09394  coenzyme A transferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G04030)  23.94 
 
 		 439 aa  63.5  0.000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.504569  normal  0.0471262 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10495  coenzyme A transferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G04120)  25.83 
 
 		 506 aa  62.4  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00529511  normal  0.309681 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1430  coenzyme A transferase  26.12 
 
 		 237 aa  61.2  0.00000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.920311  normal  0.272732 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1021  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  25.36 
 
 		 463 aa  61.2  0.00000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1472  butyryl-CoA:acetoacetate CoA-transferase alpha subunit  25.98 
 
 		 220 aa  61.2  0.00000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.146026  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2836  coenzyme A transferase  27.39 
 
 		 251 aa  60.1  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.478676  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1108  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase alpha subunit  26.04 
 
 		 234 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.356707  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1550  3-oxoacid CoA-transferase subunit A  26.04 
 
 		 234 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0213  3-oxoacid CoA-transferase subunit A  26.04 
 
 		 234 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0677248  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1699  3-oxoacid CoA-transferase subunit A  26.04 
 
 		 234 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.288367  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1725  3-oxoacid CoA-transferase subunit A  26.04 
 
 		 234 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.796955  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0951  3-oxoacid CoA-transferase subunit A  26.04 
 
 		 234 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0890692  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1855  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  26.88 
 
 		 217 aa  59.3  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.945952 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1877  3-oxoadipate CoA-succinyl transferase alpha subunit  26.04 
 
 		 234 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0683608  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1594  3-oxoacid CoA-transferase, subunit A  26.39 
 
 		 237 aa  58.9  0.0000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>