More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_0651 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004310  BR2047  acetyl-CoA-transferase subunit, putative  62 
 
 		 533 aa  640    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3173  coenzyme A transferase  63.95 
 
 		 539 aa  664    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3570  coenzyme A transferase  63.55 
 
 		 532 aa  674    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.276988  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0651  coenzyme A transferase  100 
 
 		 542 aa  1098    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.364545  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3939  propionate CoA-transferase  62.19 
 
 		 523 aa  644    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.438749 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1375  coenzyme A transferase  64.22 
 
 		 539 aa  644    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1479  coenzyme A transferase  62.57 
 
 		 537 aa  644    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.241297  normal  0.56391 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0872  coenzyme A transferase  62.19 
 
 		 533 aa  648    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2224  coenzyme A transferase  57.82 
 
 		 531 aa  621  1e-176  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.220629  normal  0.779665 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1859  propionate CoA-transferase  56.38 
 
 		 544 aa  585  1e-166  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.155788  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4049  propionate CoA-transferase  44.51 
 
 		 542 aa  418  9.999999999999999e-116  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0549  coenzyme A transferase  43.86 
 
 		 663 aa  400  9.999999999999999e-111  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0782  coenzyme A transferase  43.17 
 
 		 667 aa  393  1e-108  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0457  propionate CoA-transferase  41.73 
 
 		 667 aa  393  1e-108  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.460217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1267  coenzyme A transferase  41.17 
 
 		 666 aa  389  1e-107  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2401  coenzyme A transferase  42.3 
 
 		 670 aa  390  1e-107  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.706144 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2487  coenzyme A transferase  43 
 
 		 522 aa  389  1e-107  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1494  propionate CoA-transferase  43.45 
 
 		 669 aa  384  1e-105  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0767  coenzyme A transferase  41.98 
 
 		 650 aa  382  1e-105  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1555  coenzyme A transferase  41.62 
 
 		 532 aa  381  1e-104  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.431711  normal  0.989893 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0091  propionate CoA-transferase  41.78 
 
 		 516 aa  380  1e-104  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4273  coenzyme A transferase  42.07 
 
 		 673 aa  379  1e-103  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.335745  normal  0.912388 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3438  coenzyme A transferase  43.05 
 
 		 633 aa  370  1e-101  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1387  coenzyme A transferase  38.94 
 
 		 531 aa  370  1e-101  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1815  propionate CoA-transferase  39.02 
 
 		 531 aa  368  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.590331  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1488  propionate CoA-transferase  39.02 
 
 		 531 aa  368  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.361869  hitchhiker  0.00740492 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2684  coenzyme A transferase  41.49 
 
 		 646 aa  368  1e-100  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2345  coenzyme A transferase  40.91 
 
 		 660 aa  366  1e-100  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.41755 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1986  propionate CoA-transferase  39.02 
 
 		 531 aa  368  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000465126 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1453  propionate CoA-transferase  39.02 
 
 		 531 aa  368  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.298558  normal  0.217975 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2071  coenzyme A transferase  41.1 
 
 		 660 aa  369  1e-100  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.10059 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2599  propionate CoA-transferase  40.11 
 
 		 524 aa  369  1e-100  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0354  coenzyme A transferase  41.67 
 
 		 660 aa  367  1e-100  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0326072  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1469  propionate CoA-transferase  39.02 
 
 		 531 aa  368  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.442461  normal  0.0256592 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2031  coenzyme A transferase  40.91 
 
 		 660 aa  365  1e-99  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.287187 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1595  coenzyme A transferase  40.75 
 
 		 663 aa  363  3e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0936861  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1948  coenzyme A transferase  37.69 
 
 		 531 aa  363  4e-99  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0367833  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2410  propionate CoA-transferase  37.5 
 
 		 531 aa  363  5.0000000000000005e-99  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.407987 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1163  coenzyme A transferase  40.95 
 
 		 526 aa  363  6e-99  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.244215  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3933  coenzyme A transferase  40.95 
 
 		 526 aa  363  6e-99  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.60446  normal  0.509869 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0709  acyl CoA:acetate/3-ketoacid CoA transferase, alpha and beta subunit  42.02 
 
 		 648 aa  362  8e-99  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1502  propionate CoA-transferase  37.5 
 
 		 531 aa  362  1e-98  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00752619 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3536  acetate/3-ketoacid CoA transferase  37.83 
 
 		 529 aa  361  2e-98  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1937  coenzyme A transferase  37.5 
 
 		 531 aa  361  2e-98  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00260164 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1910  CoA-transferase  37.5 
 
 		 531 aa  361  2e-98  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1897  propionate CoA-transferase  37.31 
 
 		 531 aa  359  6e-98  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.951112  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1259  propionate CoA-transferase  39.2 
 
 		 527 aa  359  6e-98  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00406341 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01663  fused predicted acetyl-CoA:acetoacetyl-CoA transferase: alpha subunit/beta subunit  37.31 
 
 		 531 aa  359  7e-98  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01652  hypothetical protein  37.31 
 
 		 531 aa  359  7e-98  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2996  coenzyme A transferase  39.1 
 
 		 663 aa  352  8.999999999999999e-96  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3280  coenzyme A transferase  39.24 
 
 		 522 aa  349  9e-95  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1337  coenzyme A transferase  39.12 
 
 		 526 aa  347  3e-94  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.132649 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3022  coenzyme A transferase  38.74 
 
 		 521 aa  344  2e-93  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.119963 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1212  coenzyme A transferase  38.67 
 
 		 523 aa  343  4e-93  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4180  coenzyme A transferase  43.03 
 
 		 520 aa  340  5e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.307102  hitchhiker  0.000449682 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2700  coenzyme A transferase  38.2 
 
 		 526 aa  333  6e-90  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.517315  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6427  propionate CoA-transferase  38.02 
 
 		 522 aa  331  2e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.395247  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0883  coenzyme A transferase  40.81 
 
 		 509 aa  328  1.0000000000000001e-88  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.021218  normal  0.461656 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4742  CoA-transferase  40.5 
 
 		 513 aa  326  6e-88  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.213334  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1541  coenzyme A transferase  39.31 
 
 		 508 aa  323  7e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8049  coenzyme A transferase  36.64 
 
 		 530 aa  322  9.000000000000001e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.205109  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2585  propionate CoA-transferase  38.18 
 
 		 547 aa  318  1e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.206611  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4678  CoA-transferase  40.69 
 
 		 513 aa  317  5e-85  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.696656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4768  CoA-transferase  40.5 
 
 		 513 aa  313  3.9999999999999997e-84  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0105899  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04073  putative acetyl-CoA:acetoacetyl-CoA transferase  40.31 
 
 		 513 aa  311  2e-83  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.544432  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4451  CoA-transferase  40.5 
 
 		 513 aa  311  2e-83  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000533967  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04035  hypothetical protein  40.31 
 
 		 513 aa  311  2e-83  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.566302  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0263  coenzyme A transferase  36.81 
 
 		 544 aa  306  7e-82  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0346  coenzyme A transferase  37.14 
 
 		 554 aa  303  5.000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0471  putative transferase protein  37.3 
 
 		 553 aa  302  1e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0887  coenzyme A transferase  36.45 
 
 		 543 aa  296  6e-79  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.499816  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0361  coenzyme A transferase  36.87 
 
 		 554 aa  295  1e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_21350  predicted protein  37.63 
 
 		 557 aa  290  7e-77  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00403963  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0219  coenzyme A transferase  34.42 
 
 		 520 aa  286  7e-76  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0225  coenzyme A transferase  34.42 
 
 		 520 aa  286  7e-76  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1547  coenzyme A transferase  37.5 
 
 		 433 aa  285  2.0000000000000002e-75  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0421  coenzyme A transferase  34.45 
 
 		 543 aa  274  3e-72  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.521688  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1306  3-oxoacid CoA-transferase, subunit B  25.69 
 
 		 453 aa  90.9  5e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_33142  3-oxoacid CoA-transferase Succinyl-CoA:alpha-ketoacid-CoA transferase  23.6 
 
 		 505 aa  89.7  1e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2696  3-oxoacid CoA-transferase B subunit  24.9 
 
 		 448 aa  87.4  7e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.494818  normal  0.507072 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09394  coenzyme A transferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G04030)  27.2 
 
 		 439 aa  78.2  0.0000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.504569  normal  0.0471262 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1855  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  28.92 
 
 		 217 aa  75.9  0.000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.945952 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10495  coenzyme A transferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G04120)  23.78 
 
 		 506 aa  74.7  0.000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00529511  normal  0.309681 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1533  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  28.51 
 
 		 447 aa  74.7  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.172337 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05860  Succinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase, putative  25.11 
 
 		 561 aa  73.6  0.00000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.124065  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05669  succinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase (ScoT), putative (AFU_orthologue; AFUA_6G12250)  25.69 
 
 		 519 aa  71.6  0.00000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0331  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  27.88 
 
 		 214 aa  71.6  0.00000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2836  coenzyme A transferase  27.76 
 
 		 251 aa  70.1  0.00000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.478676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7913  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  28.57 
 
 		 221 aa  70.1  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7413  ScoB  29.07 
 
 		 461 aa  68.2  0.0000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.811733  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3273  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  29.2 
 
 		 225 aa  68.2  0.0000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1962  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  25.42 
 
 		 212 aa  67.8  0.0000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1763  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  25.42 
 
 		 212 aa  67.8  0.0000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.255353  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1013  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  25.74 
 
 		 216 aa  67.4  0.0000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.300705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1403  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  29.36 
 
 		 229 aa  66.2  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0826  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  26.16 
 
 		 216 aa  66.6  0.000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3126  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  27.23 
 
 		 213 aa  66.2  0.000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.859515  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1075  coenzyme A transferase, beta subunit  29.41 
 
 		 220 aa  65.5  0.000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.425854 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1021  butyryl-CoA:acetate CoA transferase  24.76 
 
 		 463 aa  66.2  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2657  3-oxoacid CoA-transferase, B subunit  26.22 
 
 		 212 aa  66.2  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>